HHsearch 1.5 NAME c6i52A_ FAM FILE c6i52A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6i52A_.a3m DATE Sat Dec 22 08:39:56 2018 LENG 122 match states, 122 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.6 EVD 0.4230 0.6799 SEQ >ss_dssp CCSCCCBCCGGGGGTSSSCEEEECCEEECCSSTTEEEEEECCSCSTTSCCCEEEEEECTTSCSTTCCCTTCEEEEEEEECSSSSCCEEEEEEEEECCCSS CCCCTHHHHHHHHHHHHCSCC- >sa_dssp EEEECDDCBBDBDEEDECCDBCACBCBDDCEDECDBCBDBDBDDEEDECEECECEBDBDEDCDECDBEDECBCBBCADBCDEEEDCACADDCDECEDEEE DEEEBDEBBDDBDECDDDEEE- >ss_pred CCCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEECCEEEECCCEEEHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCC CCEEHHHHHHHHHHHHHCCCCC >ss_conf 9876886588886113425888878764389832489844645887766135797322475223402268677655304687760157765255035899 8010136899999976452359 >Consensus MaxxTPRvDPxqIxxxnxpVFRiIaqvxaQPxxxqiixqSPTtxxxxxxxxEMitLxnvrvSxnxxfeixxWYEfVCRanDxGdxGflvLDsVxcxfxxx ExlSvxGVVALQqLcsKfpEiy >c6i52A_ MASETPRVDPTEISNVNAPVFRIIAQIKSQPTESQLILQSPTISSKNGSEVEMITLNNIRVSMNKTFEIDSWYEFVCRNNDDGELGFLILDAVLCKFKEN EDLSLNGVVALQRLCKKYPEIY >UniRef50_C5DKG1(1-115:116) KLTH0F04400p n=4 Tax=Saccharomycetaceae RepID=C5DKG1_LACTC E=5e-30 s/c=1.15 id=52% cov=95% MATSTPRVDPQQIGQLSSPVFRIIGQVTAQPQPTQIIVASPTTGG------EMISLTNVQTSSNVNYELQAWYELVCRANDFGDAGFLVLDSVKCVFPPG ESISVAGVVALQQLSSKFTEI- >UniRef50_Q757Z3(1-116:116) AEL133Cp n=1 Tax=Eremothecium gossypii RepID=Q757Z3_ASHGO E=6e-29 s/c=1.10 id=47% cov=96% MSHQTPRLDPAQIASTNHSVFRLIAKVVAQPKQEEITIQSPTTNR------EMVTLGSVRVSQLTKFKVEQWYEFVCRASDSGDAGVFVLDSVELPLPSG EELSVDGVVALQQLCSKFPEMY # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1618 0 0 A 2 558 * * * * * * * * * * * * * * 1640 * * * * 2 0 * * * * * * 1618 0 0 S 3 * * * * * * 1640 * * * * * * * * 1432 1696 * * * 3 0 * * * * * * 1618 0 0 E 4 * * * 1432 * * * * * * * * * 1640 * 1696 * * * * 4 0 * * * * * * 1618 0 0 T 5 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 5 0 * * * * * * 1618 0 0 P 6 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1618 0 0 R 7 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 7 0 * * * * * * 1618 0 0 V 8 * * * * * * * * * 1640 * * * * * * * 558 * * 8 0 * * * * * * 1618 0 0 D 9 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1618 0 0 P 10 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1618 0 0 T 11 1640 * * * * * * * * * * * * 1696 * * 1432 * * * 11 0 * * * * * * 1618 0 0 E 12 * * * 1432 * * * * * * * * * 668 * * * * * * 12 0 * * * * * * 1618 0 0 I 13 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1618 0 0 S 14 1640 * * * * 1696 * * * * * * * * * 1432 * * * * 14 0 * * * * * * 1618 0 0 N 15 * * * * * * * * * * * 1432 * 1696 * 1640 * * * * 15 0 * * * * * * 1618 0 0 V 16 * * * * * * * * * 1696 * * * * * * 1640 1432 * * 16 0 * * * * * * 1618 0 0 N 17 * * * * * * * * * * * 532 * * * 1696 * * * * 17 0 * * * * * * 1618 0 0 A 18 1432 * * * * * 1640 * * * * * * * * 1696 * * * * 18 0 * * * * * * 1618 0 0 P 19 * * * * * * * * * * * * 558 * * 1640 * * * * 19 0 * * * * * * 1618 0 0 V 20 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 20 0 * * * * * * 1618 0 0 F 21 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1618 0 0 R 22 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 22 0 * * * * * * 1618 0 0 I 23 * * * * * * * 558 * 1640 * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1618 0 0 I 24 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1618 0 0 A 25 532 * * * * 1696 * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1618 0 0 Q 26 * * * * * * * * 1640 * * * * 558 * * * * * * 26 0 * * * * * * 1618 0 0 I 27 * * * * * * * 1432 * * * * * * * * * 668 * * 27 0 * * * * * * 1618 0 0 K 28 * * * * * * * * 1432 * * * * * * * 1696 1640 * * 28 0 * * * * * * 1618 0 0 S 29 668 * * * * * * * * * * * * * * 1432 * * * * 29 0 * * * * * * 1618 0 0 Q 30 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 30 0 * * * * * * 1618 0 0 P 31 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1618 0 0 T 32 * * * * * * * * 1640 * * * * 1696 * * 1432 * * * 32 0 * * * * * * 1618 0 0 E 33 * * * 1432 * * * * * * * * 1696 1640 * * * * * * 33 0 * * * * * * 1618 0 0 S 34 * * * 1640 * * * * * * * * * * * 1432 1696 * * * 34 0 * * * * * * 1618 0 0 Q 35 * * * 1640 * * * * * * * * * 558 * * * * * * 35 0 * * * * * * 1618 0 0 L 36 * * * * * * * 668 * 1432 * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1618 0 0 I 37 * * * * * * * 558 * * * * * * * * 1640 * * * 37 0 * * * * * * 1618 0 0 L 38 * * * * * * * 1640 * 1432 * * * * * * * 1696 * * 38 0 * * * * * * 1618 0 0 Q 39 1696 * * * * * * * * * * * * 532 * * * * * * 39 0 * * * * * * 1618 0 0 S 40 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 40 0 * * * * * * 1618 0 0 P 41 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1618 0 0 T 42 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 42 0 * * * * * * 1618 0 0 I 43 * * * * * * * 1432 * * * * * * * * 668 * * * 43 0 * * * * * * 1618 0 0 S 44 * * * * * 1696 * * * * * 1640 * * * 1432 * * * * 44 0 * * * * * * 1618 0 0 S 45 * * * * * 1696 * * * * * * * * 1640 1432 * * * * 45 1432 * 668 * * * * 1618 0 0 K 46 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * 0 1000 0 1393 N 47 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 47 0 * * * * * 0 1000 0 1393 G 48 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * 0 1000 0 1393 S 49 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 49 0 * * * * * 0 1000 0 1393 E 50 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * 0 1000 0 1393 V 51 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 51 0 * * * * 0 * 1000 0 1393 E 52 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1618 0 0 M 53 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1618 0 0 I 54 * * * * * * * 558 * * * * * * * * * 1640 * * 54 0 * * * * * * 1618 0 0 T 55 * * * * * * * * * * * * * * * 1696 532 * * * 55 0 * * * * * * 1618 0 0 L 56 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1618 0 0 N 57 * * * * * 1640 * * * * * 1432 * * * * 1696 * * * 57 0 * * * * * * 1618 0 0 N 58 * * * * * * * * * * * 558 * * * 1640 * * * * 58 0 * * * * * * 1618 0 0 I 59 * * * * * * * 1432 * * * * * * * * * 668 * * 59 0 * * * * * * 1618 0 0 R 60 * * * * * * * * * * * * * 1696 532 * * * * * 60 0 * * * * * * 1618 0 0 V 61 * * * * * * * * * * * * * * * * 1696 532 * * 61 0 * * * * * * 1618 0 0 S 62 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 62 0 * * * * * * 1618 0 0 M 63 * * * * * * * * * * 1432 * * 1640 * 1696 * * * * 63 0 * * * * * * 1618 0 0 N 64 * * * * * * * * * 1640 * 558 * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1618 0 0 K 65 * * * * * * * * 1432 * * * * * * * 1640 1696 * * 65 0 * * * * * * 1618 0 0 T 66 * * * * * * * * 1640 * * 1696 * * * * 1432 * * * 66 0 * * * * * * 1618 0 0 F 67 * * * * 532 * * * * * * * * * * * * * * 1696 67 0 * * * * * * 1618 0 0 E 68 * * * 558 * * * * 1640 * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1618 0 0 I 69 * * * * * * * 1432 * 1696 * * * * * * * 1640 * * 69 0 * * * * * * 1618 0 0 D 70 * * 1432 1640 * * * * * * * * * 1696 * * * * * * 70 0 * * * * * * 1618 0 0 S 71 1696 * * * * * * * * * * * * 1640 * 1432 * * * * 71 0 * * * * * * 1618 0 0 W 72 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 72 0 * * * * * * 1618 0 0 Y 73 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 73 0 * * * * * * 1618 0 0 E 74 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1618 0 0 F 75 * * * * 532 * * * * 1696 * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1618 0 0 V 76 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 76 0 * * * * * * 1618 0 0 C 77 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1618 0 0 R 78 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 78 0 * * * * * * 1618 0 0 N 79 668 * * * * * * * * * * 1432 * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1618 0 0 N 80 * * * * * * * * * * * 558 * * * 1640 * * * * 80 0 * * * * * * 1618 0 0 D 81 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1618 0 0 D 82 * * 1432 * 1696 * * * * * * * * * * 1640 * * * * 82 0 * * * * * * 1618 0 0 G 83 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1618 0 0 E 84 * * 668 1432 * * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1618 0 0 L 85 668 * * * * * * * * 1432 * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1618 0 0 G 86 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1618 0 0 F 87 * * * * 558 * * * * * * * * * * * * 1640 * * 87 0 * * * * * * 1618 0 0 L 88 * * * * 1640 * * * * 558 * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1618 0 0 I 89 * * * * * * * 1432 * * * * * * * * * 668 * * 89 0 * * * * * * 1618 0 0 L 90 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1618 0 0 D 91 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1618 0 0 A 92 1432 * * * * * * * * * * * * * * 668 * * * * 92 0 * * * * * * 1618 0 0 V 93 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 93 0 * * * * * * 1618 0 0 L 94 * * * 1640 * * * * 1696 1432 * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1618 0 0 C 95 * 558 * * * * * * * 1640 * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1618 0 0 K 96 * * * * * * * * 1432 * * * 1640 * * * * 1696 * * 96 0 * * * * * * 1618 0 0 F 97 * * * * 558 * * * * 1640 * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1618 0 0 K 98 * * * * * * * * 1432 * * * 668 * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1618 0 0 E 99 * * * 1432 * * * * * * * * 1696 * * 1640 * * * * 99 0 * * * * * * 1618 0 0 N 100 * * * * * 668 * * * * * 1432 * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1618 0 0 E 101 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1618 0 0 D 102 * * 1432 1640 * * * * * * * * * * * 1696 * * * * 102 0 * * * * * * 1618 0 0 L 103 * * * * * * * 1696 * 532 * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1618 0 0 S 104 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 104 0 * * * * * * 1618 0 0 L 105 * * * * * * * * * 1432 * * * * * * * 668 * * 105 0 * * * * * * 1618 0 0 N 106 1696 * 1640 * * * * * * * * 1432 * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1618 0 0 G 107 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1618 0 0 V 108 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 108 0 * * * * * * 1618 0 0 V 109 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 109 0 * * * * * * 1618 0 0 A 110 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1618 0 0 L 111 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1618 0 0 Q 112 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 112 0 * * * * * * 1618 0 0 R 113 * * * * * * * * * * * * * 668 1432 * * * * * 113 0 * * * * * * 1618 0 0 L 114 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1618 0 0 C 115 * 532 * * * * * * * * * * * * * 1696 * * * * 115 0 * * * * * * 1618 0 0 K 116 * * * * * * * * 1432 * * * * * * 668 * * * * 116 0 * * * * * * 1618 0 0 K 117 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1618 0 0 Y 118 * * * * 668 * * * * * * * * * * * * * * 1432 118 0 * * * * * * 1618 0 0 P 119 * * * * * * * * * * * * 532 * * * 1696 * * * 119 0 * * * * * * 1618 0 0 E 120 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1618 0 0 I 121 * * * * * * * 558 * * 1640 * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1618 0 0 Y 122 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 122 0 * * 0 * * * 1413 0 0 //