HHsearch 1.5 NAME c6i2oA_ FAM FILE c6i2oA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6i2oA_.a3m DATE Sat Mar 16 08:31:21 2019 LENG 113 match states, 113 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.3 EVD 0.4231 0.0096 SEQ >ss_dssp CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSSCTTSCCCCCHHHHGGGCCSSCCSHHHHHHHSCBCSSCTTCCSSTTBSCCCBTTTTEECCCBCCTTCSSCBC CCEESSCTTTTTC >sa_dssp EDDECDDEDADDCBECACDAAEDBBEECEDDEEBEDABACDAAEDBEBEBEEEECABECBBCBEDCECEBDADDAAACACDEEBCACABBBCEEEDEBCD CDCCCDCEEEEEE >ss_pred CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEEECCCCCEEEE EEEECCCCCCCCC >ss_conf 9522566666688999999999873386789884363599743554114577660223442047886544567530356237861676650578982478 9973201385789 >Consensus hqdxarksrixsehrxlvsaiqsyxgxqxdpxnpsextlxklxpyxxknxxxxxxxxxslaxdxxxxxstsapgxahxidttxxklistxtpxxggxaxx xtydwxxngvnsn >c6i2oA_ HQDNARKSRIQSEHRELVSAIQSYIGAQDDPTNPSEITLAKLAPYMSKNAKNEDGIVNSLAKDKSGNSSTSAPGSAHQIDTTNHKLISTFTPSNGGQATV LTYDWSANGVNSN >UniRef50_A3CR70(46-145:152) Conserved uncharacterized protein n=3 Tax=Streptococcus sanguinis SK36 RepID=A3CR70_STRSV E=3e-22 s/c=1.06 id=56% cov=88% -QDSARKSRIETEHRQLVSAIQSYLGSQVDPENPTEApTLEKLRPYIAKNSQGKGTLADTLATDGKDKH------AAHVI--TGNKLISTYTPASGGTAK TWTYDWKEN----- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * H 1 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 2 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 2 0 * * * * * * 1320 0 0 D 3 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1320 0 0 N 4 * * * * * * * * * * * 896 * * * 1112 * * * * 4 0 * * * * * * 1320 0 0 A 5 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1320 0 0 R 6 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 6 0 * * * * * * 1320 0 0 K 7 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1320 0 0 S 8 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 8 0 * * * * * * 1320 0 0 R 9 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 9 0 * * * * * * 1320 0 0 I 10 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1320 0 0 Q 11 * * * 1112 * * * * * * * * * 896 * * * * * * 11 0 * * * * * * 1320 0 0 S 12 * * * * * * * * * * * * * * * 896 1112 * * * 12 0 * * * * * * 1320 0 0 E 13 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1320 0 0 H 14 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1320 0 0 R 15 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 15 0 * * * * * * 1320 0 0 E 16 * * * 896 * * * * * * * * * 1112 * * * * * * 16 0 * * * * * * 1320 0 0 L 17 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1320 0 0 V 18 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 18 0 * * * * * * 1320 0 0 S 19 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 19 0 * * * * * * 1320 0 0 A 20 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1320 0 0 I 21 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1320 0 0 Q 22 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 22 0 * * * * * * 1320 0 0 S 23 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 23 0 * * * * * * 1320 0 0 Y 24 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 24 0 * * * * * * 1320 0 0 I 25 * * * * * * * 896 * 1112 * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1320 0 0 G 26 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1320 0 0 A 27 896 * * * * * * * * * * * * * * 1112 * * * * 27 0 * * * * * * 1320 0 0 Q 28 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 28 0 * * * * * * 1320 0 0 D 29 * * 896 * * * * * * * * * * * * * * 1112 * * 29 0 * * * * * * 1320 0 0 D 30 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1320 0 0 P 31 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1320 0 0 T 32 * * * 1112 * * * * * * * * * * * * 896 * * * 32 0 * * * * * * 1320 0 0 N 33 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1320 0 0 P 34 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1320 0 0 S 35 * * * * * * * * * * * * * * * 896 1112 * * * 35 0 * * * * * * 1320 0 0 E 36 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1320 0 0 I 37 1112 * * * * * * 896 * * * * * * * * * * * * 37 896 1112 * 0 * * * 1320 1000 0 T 38 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 38 0 * * * * * * 1320 0 0 L 39 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1320 0 0 A 40 896 * * 1112 * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1320 0 0 K 41 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1320 0 0 L 42 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1320 0 0 A 43 896 * * * * * * * * * * * * * 1112 * * * * * 43 0 * * * * * * 1320 0 0 P 44 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1320 0 0 Y 45 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 45 0 * * * * * * 1320 0 0 M 46 * * * * * * * 1112 * * 896 * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1320 0 0 S 47 1112 * * * * * * * * * * * * * * 896 * * * * 47 0 * * * * * * 1320 0 0 K 48 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1320 0 0 N 49 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1320 0 0 A 50 896 * * * * * * * * * * * * * * 1112 * * * * 50 0 * * * * * * 1320 0 0 K 51 * * * * * * * * 896 * * * * 1112 * * * * * * 51 0 * * * * * * 1320 0 0 N 52 * * * * * 1112 * * * * * 896 * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1320 0 0 E 53 * * * 896 * * * * 1112 * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1320 0 0 D 54 * * 896 * * 1112 * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1320 0 0 G 55 * * * * * 896 * * * * * * * * * * 1112 * * * 55 0 * * * * * * 1320 0 0 I 56 * * * * * * * 896 * 1112 * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1320 0 0 V 57 1112 * * * * * * * * * * * * * * * * 896 * * 57 0 * * * * * * 1320 0 0 N 58 * * 1112 * * * * * * * * 896 * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1320 0 0 S 59 * * * * * * * * * * * * * * * 896 1112 * * * 59 0 * * * * * * 1320 0 0 L 60 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1320 0 0 A 61 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1320 0 0 K 62 * * * * * * * * 896 * * * * * * * 1112 * * * 62 0 * * * * * * 1320 0 0 D 63 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1320 0 0 K 64 * * * * * 1112 * * 896 * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1320 0 0 S 65 * * * * * * * * 1112 * * * * * * 896 * * * * 65 0 * * * * * * 1320 0 0 G 66 * * 1112 * * 896 * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1320 0 0 N 67 * * * * * * * * 1112 * * 896 * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1320 0 0 S 68 * * * * * * 1112 * * * * * * * * 896 * * * * 68 896 * 1112 * * * * 1320 0 0 S 69 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 69 0 * * * * * 0 1000 0 1000 T 70 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 70 0 * * * * * 0 1000 0 1000 S 71 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 71 0 * * * * * 0 1000 0 1000 A 72 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * 0 1000 0 1000 P 73 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 73 0 * * * * * 0 1000 0 1000 G 74 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 S 75 1112 * * * * * * * * * * * * * * 896 * * * * 75 0 * * * * * * 1320 0 0 A 76 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1320 0 0 H 77 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1320 0 0 Q 78 * * * * * * * * * * * * * 896 * * * 1112 * * 78 0 * * * * * * 1320 0 0 I 79 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 79 896 * 1112 * * * * 1320 0 0 D 80 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * 0 1000 0 1000 T 81 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 81 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 T 82 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 82 0 * * * * * * 1320 0 0 N 83 * * * * * 1112 * * * * * 896 * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1320 0 0 H 84 * * * * * * 896 * * * * 1112 * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1320 0 0 K 85 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1320 0 0 L 86 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1320 0 0 I 87 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1320 0 0 S 88 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 88 0 * * * * * * 1320 0 0 T 89 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 89 0 * * * * * * 1320 0 0 F 90 * * * * 896 * * * * * * * * * * * * * * 1112 90 0 * * * * * * 1320 0 0 T 91 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 91 0 * * * * * * 1320 0 0 P 92 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1320 0 0 S 93 1112 * * * * * * * * * * * * * * 896 * * * * 93 0 * * * * * * 1320 0 0 N 94 * * * * * * * * * * * 896 * * * 1112 * * * * 94 0 * * * * * * 1320 0 0 G 95 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1320 0 0 G 96 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1320 0 0 Q 97 * * * * * * * * * * * * * 896 * * 1112 * * * 97 0 * * * * * * 1320 0 0 A 98 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1320 0 0 T 99 * * * * * * * * 1112 * * * * * * * 896 * * * 99 0 * * * * * * 1320 0 0 V 100 * * * * * * * * * * * * * * * * 1112 896 * * 100 0 * * * * * * 1320 0 0 L 101 * * * * * * * * * 896 * * * * * * * * 1112 * 101 0 * * * * * * 1320 0 0 T 102 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 102 0 * * * * * * 1320 0 0 Y 103 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 103 0 * * * * * * 1320 0 0 D 104 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1320 0 0 W 105 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 105 0 * * * * * * 1320 0 0 S 106 * * * * * * * * 1112 * * * * * * 896 * * * * 106 0 * * * * * * 1320 0 0 A 107 896 * * 1112 * * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1320 0 0 N 108 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1320 0 0 G 109 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 V 110 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 N 111 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 S 112 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 N 113 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 113 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //