HHsearch 1.5 NAME c6h3aB_ FAM FILE c6h3aB_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6h3aB_.a3m DATE Sat Jun 29 08:26:30 2019 LENG 57 match states, 57 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.3 EVD 0.4877 3.4030 SEQ >ss_dssp CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSCSSCHHHHHHHHHHTTSCTTHHHHHHHHSSCCC >sa_dssp EEEEDDDDEEEEDDDBBDDADEECDECEDEDADCBAEEBEDDEDDBCDCBEEDEEEE >ss_pred CCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC >ss_conf 903567751151167899999862466889999999622223456787887743789 >Consensus seledlsexxxxkxxklqslkexfpxxxxxxllxlieststxdgaiaaxxxxfxxxg >c6h3aB_ SELEDLSELEDLKDAKLQTLKELFPQRSDNDLLKLIESTSTMDGAIAAALLMFGDAG >UniRef50_Q6GPJ7(133-182:326) LOC443627 protein (Fragment) n=1 Tax=Xenopus laevis RepID=Q6GPJ7_XENLA E=5e-13 s/c=1.51 id=51% cov=89% -------EMDGSKYKKLQSLKEIFPKQNNEELLQLIESTSTLDGAVAAGVVLFNKKG # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 E 2 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 L 3 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 E 4 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 D 5 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 L 6 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 S 7 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 E 8 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1395 0 0 L 9 * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1395 0 0 E 10 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1395 0 0 D 11 * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1395 0 0 L 12 * * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * 12 0 * * * * * * 1395 0 0 K 13 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1395 0 0 D 14 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 14 0 * * * * * * 1395 0 0 A 15 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1395 0 0 K 16 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1395 0 0 L 17 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1395 0 0 Q 18 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 18 0 * * * * * * 1395 0 0 T 19 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 19 0 * * * * * * 1395 0 0 L 20 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1395 0 0 K 21 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1395 0 0 E 22 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1395 0 0 L 23 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1395 0 0 F 24 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1395 0 0 P 25 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1395 0 0 Q 26 * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * 26 0 * * * * * * 1395 0 0 R 27 * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * 27 0 * * * * * * 1395 0 0 S 28 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 28 0 * * * * * * 1395 0 0 D 29 * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1395 0 0 N 30 * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1395 0 0 D 31 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1395 0 0 L 32 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1395 0 0 L 33 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1395 0 0 K 34 * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * 34 0 * * * * * * 1395 0 0 L 35 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1395 0 0 I 36 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1395 0 0 E 37 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1395 0 0 S 38 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 38 0 * * * * * * 1395 0 0 T 39 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 39 0 * * * * * * 1395 0 0 S 40 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 40 0 * * * * * * 1395 0 0 T 41 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 41 0 * * * * * * 1395 0 0 M 42 * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1395 0 0 D 43 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1395 0 0 G 44 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1395 0 0 A 45 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1395 0 0 I 46 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 46 0 * * * * * * 1395 0 0 A 47 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1395 0 0 A 48 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1395 0 0 A 49 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1395 0 0 L 50 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 50 0 * * * * * * 1395 0 0 L 51 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 51 0 * * * * * * 1395 0 0 M 52 * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1395 0 0 F 53 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1395 0 0 G 54 * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1395 0 0 D 55 * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1395 0 0 A 56 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1395 0 0 G 57 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * 0 * * * 1395 0 0 //