HHsearch 1.5 NAME c6gygA_ FAM FILE c6gygA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6gygA_.a3m DATE Sat Oct 20 08:37:21 2018 LENG 59 match states, 59 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.4 EVD 0.4536 1.5130 SEQ >ss_dssp CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHSCSCHHHHHHHHHHHHHHHTSCHHHHHHHHHHHHHHHTC >sa_dssp EEEEEDEEEDDEEBDDDCEEEECEDEDADEDDEDEEBDEECDEEDDDEDDEDCDCEEEE >ss_pred CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 98732188999999999878745413699999999862010488776345889986229 >Consensus RKNIKxsxxxxxKxKAixxxKDxKxYELIxxILDxYiTNKLxxxExxxxNyqleelrke >c6gygA_ RKNIKLTEPIFNKLKALMKVKDVKQYELIEIILDFYVTNKLSEKEREFFNYQLEELRKE >UniRef50_A0RLV1(32-81:88) Putative uncharacterized protein n=4 Tax=Bacillus cereus group RepID=A0RLV1_BACAH E=3e-06 s/c=1.06 id=49% cov=86% RKNIKVSPETLSKVKAISTMKDMKNYELIDEILDYYITNKLDAHEQNTLN--------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * R 1 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 1 0 * * * * * * 1414 0 0 K 2 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1414 0 0 N 3 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1414 0 0 I 4 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1414 0 0 K 5 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1414 0 0 L 6 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 6 0 * * * * * * 1414 0 0 T 7 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 7 0 * * * * * * 1414 0 0 E 8 * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1414 0 0 P 9 * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1414 0 0 I 10 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * 10 0 * * * * * * 1414 0 0 F 11 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1414 0 0 N 12 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 12 0 * * * * * * 1414 0 0 K 13 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1414 0 0 L 14 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 14 0 * * * * * * 1414 0 0 K 15 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1414 0 0 A 16 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1414 0 0 L 17 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1414 0 0 M 18 * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * 18 0 * * * * * * 1414 0 0 K 19 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * 19 0 * * * * * * 1414 0 0 V 20 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * 20 0 * * * * * * 1414 0 0 K 21 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1414 0 0 D 22 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1414 0 0 V 23 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * 23 0 * * * * * * 1414 0 0 K 24 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1414 0 0 Q 25 * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * 25 0 * * * * * * 1414 0 0 Y 26 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 26 0 * * * * * * 1414 0 0 E 27 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1414 0 0 L 28 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1414 0 0 I 29 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1414 0 0 E 30 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1414 0 0 I 31 * * * 1000 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1414 0 0 I 32 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1414 0 0 L 33 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1414 0 0 D 34 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1414 0 0 F 35 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 35 0 * * * * * * 1414 0 0 Y 36 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 36 0 * * * * * * 1414 0 0 V 37 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 37 0 * * * * * * 1414 0 0 T 38 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 38 0 * * * * * * 1414 0 0 N 39 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1414 0 0 K 40 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1414 0 0 L 41 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1414 0 0 S 42 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 42 0 * * * * * * 1414 0 0 E 43 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1414 0 0 K 44 * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1414 0 0 E 45 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1414 0 0 R 46 * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * 46 0 * * * * * * 1414 0 0 E 47 * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1414 0 0 F 48 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 48 0 * * * * * * 1414 0 0 F 49 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1414 0 0 N 50 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1414 0 0 Y 51 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 51 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 52 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 L 53 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 E 54 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 E 55 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 L 56 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 R 57 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 K 58 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 E 59 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //