HHsearch 1.5 NAME c6gsiI_ FAM FILE c6gsiI_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6gsiI_.a3m DATE Sat Jan 19 08:20:27 2019 LENG 82 match states, 82 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4437 1.0219 SEQ >ss_dssp CCHHHHHHTTSSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTCCCCTTTSCCCSGGGGGGTSCCCCC >sa_dssp EEEDEDEEDECEEEDEDDEEEDEDDDDEDEBEEDCEDBEEDCEDBBEDDDEEBEEEEEEDDEEEDDDDEECDCBEEAEEEEE >ss_pred CCCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECC >ss_conf 9420026541447888999865248988658999999999985270356454553073006651355441110001254049 >Consensus qqieldkaalgqqrelalkrmkldhqalnnqveqfnkileqrvqgpiqsvrlaraagfrvdpysytdqnfyddqlnairlsy >c6gsiI_ QQIELDKAALGQQRELALKRMKLDHQALNNQVEQFNKILEQRVQGPIQSVRLARAAGFRVDPYSYTDQNFYDDQLNAIRLSY # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * Q 1 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 2 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 I 3 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 E 4 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 L 5 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 D 6 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 K 7 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 A 8 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 A 9 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 L 10 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 G 11 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 12 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 13 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 R 14 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 E 15 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 L 16 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 A 17 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 L 18 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 K 19 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 R 20 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 M 21 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 K 22 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 L 23 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 D 24 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 H 25 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 26 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 A 27 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 L 28 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 N 29 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 N 30 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 31 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 V 32 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 E 33 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 34 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 F 35 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 N 36 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 K 37 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 I 38 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 L 39 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 E 40 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 41 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 R 42 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 V 43 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 44 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 G 45 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 P 46 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 I 47 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 48 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 S 49 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 V 50 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 R 51 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 L 52 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 A 53 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 R 54 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 A 55 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 A 56 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 G 57 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 F 58 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 R 59 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 V 60 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 D 61 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 P 62 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 63 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 63 0 * * * * * * 1000 0 0 S 64 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 65 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 65 0 * * * * * * 1000 0 0 T 66 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 D 67 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 68 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 N 69 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 F 70 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 71 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 71 0 * * * * * * 1000 0 0 D 72 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 D 73 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 74 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 L 75 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 N 76 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 A 77 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 I 78 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 R 79 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 L 80 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 S 81 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 82 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 82 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //