HHsearch 1.5 NAME c6f5dI_ FAM FILE c6f5dI_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6f5dI_.a3m DATE Sat Feb 24 08:27:43 2018 LENG 66 match states, 66 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.3 EVD 0.4559 1.9257 SEQ >ss_dssp CCCTTTTSCCHHHHHHHHHHHHHHTSCGGGSHHHHTTTCCCCCCCCEETTTEECCCCCSCCSSTTC >sa_dssp EEDDEEEECDEECDDDDDDCDEBDECEEEECEEDDEECECEEEEDDEDEEEDDDEDEEECCECEEC >ss_pred CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHCCCCCCCC >ss_conf 983243104468887676999998777777776765227830244678650577886351200369 >Consensus ssxwrdxgisyxkylnvxtexlhxxxkxxxrakyxrxsxpxyxaxxxdgxgxxexixkvpxxtkdy >c6f5dI_ SSSWRDHGISYLKYLNVCTETLHSTVKESRRAKYERWSKPCYTAQRPDGAGGQETIDKVPIHTKDY >UniRef50_Q4Q214(124-187:187) Putative uncharacterized protein n=5 Tax=Trypanosomatidae RepID=Q4Q214_LEIMA E=2e-14 s/c=1.26 id=57% cov=98% --NWRDQGISYVKYLNVTTEALHMATKDKVRAKYSRFSAPNYVAVKNDGTGVMEEVKKVPAFTKDY # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 S 2 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 S 3 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 3 0 * * * * * * 1340 0 0 W 4 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 4 0 * * * * * * 1340 0 0 R 5 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 5 0 * * * * * * 1340 0 0 D 6 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1340 0 0 H 7 * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * 7 0 * * * * * * 1340 0 0 G 8 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1340 0 0 I 9 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1340 0 0 S 10 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 10 0 * * * * * * 1340 0 0 Y 11 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 11 0 * * * * * * 1340 0 0 L 12 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 12 0 * * * * * * 1340 0 0 K 13 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1340 0 0 Y 14 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 14 0 * * * * * * 1340 0 0 L 15 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1340 0 0 N 16 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1340 0 0 V 17 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 17 0 * * * * * * 1340 0 0 C 18 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 18 0 * * * * * * 1340 0 0 T 19 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 19 0 * * * * * * 1340 0 0 E 20 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1340 0 0 T 21 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 21 0 * * * * * * 1340 0 0 L 22 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1340 0 0 H 23 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1340 0 0 S 24 * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * 24 0 * * * * * * 1340 0 0 T 25 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 25 0 * * * * * * 1340 0 0 V 26 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * 26 0 * * * * * * 1340 0 0 K 27 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1340 0 0 E 28 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1340 0 0 S 29 * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * 29 0 * * * * * * 1340 0 0 R 30 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * 30 0 * * * * * * 1340 0 0 R 31 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 31 0 * * * * * * 1340 0 0 A 32 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1340 0 0 K 33 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1340 0 0 Y 34 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 34 0 * * * * * * 1340 0 0 E 35 * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 35 0 * * * * * * 1340 0 0 R 36 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 36 0 * * * * * * 1340 0 0 W 37 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * 37 0 * * * * * * 1340 0 0 S 38 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 38 0 * * * * * * 1340 0 0 K 39 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1340 0 0 P 40 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1340 0 0 C 41 * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1340 0 0 Y 42 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 42 0 * * * * * * 1340 0 0 T 43 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * 43 0 * * * * * * 1340 0 0 A 44 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1340 0 0 Q 45 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * 45 0 * * * * * * 1340 0 0 R 46 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 46 0 * * * * * * 1340 0 0 P 47 * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1340 0 0 D 48 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1340 0 0 G 49 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1340 0 0 A 50 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 50 0 * * * * * * 1340 0 0 G 51 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1340 0 0 G 52 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * 52 0 * * * * * * 1340 0 0 Q 53 * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * 53 0 * * * * * * 1340 0 0 E 54 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1340 0 0 T 55 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 55 0 * * * * * * 1340 0 0 I 56 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 56 0 * * * * * * 1340 0 0 D 57 * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1340 0 0 K 58 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1340 0 0 V 59 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 59 0 * * * * * * 1340 0 0 P 60 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1340 0 0 I 61 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1340 0 0 H 62 * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1340 0 0 T 63 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 63 0 * * * * * * 1340 0 0 K 64 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1340 0 0 D 65 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1340 0 0 Y 66 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 66 0 * * 0 * * * 1340 0 0 //