HHsearch 1.5 NAME c6ewvA_ FAM FILE c6ewvA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6ewvA_.a3m DATE Sat Nov 3 08:17:21 2018 LENG 99 match states, 99 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4190 0.2653 SEQ >ss_dssp CCCHHHHHHHHHHHTCEEEEETTEEEEEECSSCCCHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHSSCSSCCCCCCCCCCTHHHHHHHHSCCSCCSTTCEEEEC >sa_dssp EDDADEABEBAEEDCAEBCBCEEDACBCBCEEDBCEEBDECADECDECACDDADDDDEEEEEEEDEEEDEEEEEDEEEDEEEEEEEEEEEDEEDDECDC >ss_pred CCCHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >ss_conf 962999999998538379998460211000122408999999997999999997405145411577888877505789999854542310567751279 >Consensus gidaaqivdealeqgitlfvvnnrlqyetsrdsiptellnkwkqhkqelidflnqldseeqtkgsgsgsgsgsgsllkekrkhfqaeqnssqeylrgei >c6ewvA_ GIDAAQIVDEALEQGITLFVVNNRLQYETSRDSIPTELLNKWKQHKQELIDFLNQLDSEEQTKGSGSGSGSGSGSLLKEKRKHFQAEQNSSQEYLRGEI # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * G 1 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 I 2 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 D 3 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 A 4 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 A 5 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 6 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 I 7 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 V 8 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 D 9 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 E 10 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 A 11 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 L 12 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 E 13 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 14 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 G 15 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 I 16 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 T 17 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 L 18 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 F 19 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 V 20 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 V 21 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 N 22 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 N 23 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 R 24 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 L 25 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 26 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 27 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 27 0 * * * * * * 1000 0 0 E 28 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 T 29 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 S 30 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 R 31 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 D 32 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 S 33 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 I 34 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 P 35 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 T 36 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 E 37 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 L 38 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 L 39 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 N 40 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 K 41 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 W 42 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 K 43 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 44 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 H 45 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 K 46 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 47 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 E 48 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 L 49 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 I 50 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 D 51 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 F 52 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 L 53 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 N 54 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 55 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 L 56 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 D 57 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 S 58 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 E 59 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 E 60 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 61 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 T 62 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 K 63 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 G 64 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 S 65 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 G 66 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 S 67 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 G 68 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 S 69 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 G 70 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 S 71 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 G 72 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 S 73 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 G 74 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 S 75 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 L 76 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 L 77 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 K 78 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 E 79 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 K 80 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 R 81 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 K 82 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 H 83 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 F 84 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 85 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 A 86 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 E 87 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 88 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 N 89 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 S 90 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 S 91 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 92 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 E 93 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 94 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 94 0 * * * * * * 1000 0 0 L 95 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 R 96 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 G 97 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 E 98 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 I 99 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 99 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //