HHsearch 1.5 NAME c6eluJ_ FAM FILE c6eluJ_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6eluJ_.a3m DATE Sat Jan 27 08:25:54 2018 LENG 172 match states, 172 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4145 -1.2826 SEQ >ss_dssp CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCHHHHHHHHHHHHHHHHTTTCC CSSHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCSSSSCCHHHHHHHHHHHHHHHSCSCCHHHHHHHHHHHHHHTTTTC >sa_dssp EEDEEBDDDBEDCCDDBDDBCEBADDADDCADEBCEEDEEEDBCDABDCACEBADDBCEDBDEBCEDBDDCCEDCDEEEECCEDBEEDCDDCDEECEEDB BDDCCDAADBABECDEBCDCBBDCBDEEEEECDEECADEBADDBBECABDEEDEEBDEBCDEBCEDBDEECE >ss_pred CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC >ss_conf 9335766446998999999865442233333222113451046899887777899999999987752100233220026999999987512445301320 214999999999789999999999627789974023899999996100767514579999999985405309 >Consensus knladvagialakinnlikqvsaateaearmtlaaastdhsnisalyaaasnivtrcvlnavhaltslapialtaatntvairqlynkigdlekqttnnc gtsvtevlehilkqealkeallsivkkpkgapdktaadelvtalingvvpnstaqtqklkekilntlvpklv >c6eluJ_ KNLADVAGIALAKINNLIKQVSAATEAEARMTLAAASTDHSNISALYAAASNIVTRCVLNAVHALTSLAPIALTAATNTVAIRQLYNKIGDLEKQTTNNC GTSVTEVLEHILKQEALKEALLSIVKKPKGAPDKTAADELVTALINGVVPNSTAQTQKLKEKILNTLVPKLV # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * K 1 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 N 2 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 L 3 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 A 4 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 D 5 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 V 6 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 A 7 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 G 8 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 I 9 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 A 10 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 L 11 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 A 12 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 K 13 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 I 14 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 N 15 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 N 16 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 L 17 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 I 18 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 K 19 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 20 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 V 21 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 S 22 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 A 23 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 A 24 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 T 25 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 E 26 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 A 27 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 E 28 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 A 29 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 R 30 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 M 31 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 T 32 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 L 33 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 A 34 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 A 35 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 A 36 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 S 37 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 T 38 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 D 39 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 H 40 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 S 41 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 N 42 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 I 43 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 S 44 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 A 45 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 L 46 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 47 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 47 0 * * * * * * 1000 0 0 A 48 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 A 49 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 A 50 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 S 51 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 N 52 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 I 53 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 V 54 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 T 55 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 R 56 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 C 57 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 V 58 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 L 59 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 N 60 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 A 61 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 V 62 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 H 63 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 A 64 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 L 65 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 T 66 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 S 67 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 L 68 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 A 69 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 P 70 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 I 71 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 A 72 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 L 73 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 T 74 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 A 75 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 A 76 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 T 77 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 N 78 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 T 79 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 V 80 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 A 81 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 I 82 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 R 83 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 84 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 L 85 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 86 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 86 0 * * * * * * 1000 0 0 N 87 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 K 88 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 I 89 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 G 90 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 D 91 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 L 92 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 E 93 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 K 94 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 95 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 T 96 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 T 97 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 N 98 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 N 99 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 C 100 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 G 101 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 T 102 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 S 103 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 V 104 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 T 105 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 E 106 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 V 107 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 L 108 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 E 109 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 H 110 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 I 111 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 L 112 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 K 113 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 114 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 E 115 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 A 116 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 L 117 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 K 118 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 E 119 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 A 120 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 L 121 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 L 122 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 S 123 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 I 124 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 V 125 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 K 126 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 K 127 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 P 128 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 K 129 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 G 130 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 A 131 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 P 132 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 D 133 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 K 134 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 T 135 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 A 136 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 A 137 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 D 138 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 E 139 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 L 140 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 V 141 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 T 142 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 A 143 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 L 144 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 I 145 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 N 146 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 G 147 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1000 0 0 V 148 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 148 0 * * * * * * 1000 0 0 V 149 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 149 0 * * * * * * 1000 0 0 P 150 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1000 0 0 N 151 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1000 0 0 S 152 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 152 0 * * * * * * 1000 0 0 T 153 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 153 0 * * * * * * 1000 0 0 A 154 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 154 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 155 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 155 0 * * * * * * 1000 0 0 T 156 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 156 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 157 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 157 0 * * * * * * 1000 0 0 K 158 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 158 0 * * * * * * 1000 0 0 L 159 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 159 0 * * * * * * 1000 0 0 K 160 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 160 0 * * * * * * 1000 0 0 E 161 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 161 0 * * * * * * 1000 0 0 K 162 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 162 0 * * * * * * 1000 0 0 I 163 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 163 0 * * * * * * 1000 0 0 L 164 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 164 0 * * * * * * 1000 0 0 N 165 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 165 0 * * * * * * 1000 0 0 T 166 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 166 0 * * * * * * 1000 0 0 L 167 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 167 0 * * * * * * 1000 0 0 V 168 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 168 0 * * * * * * 1000 0 0 P 169 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 169 0 * * * * * * 1000 0 0 K 170 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 170 0 * * * * * * 1000 0 0 L 171 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 171 0 * * * * * * 1000 0 0 V 172 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 172 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //