HHsearch 1.5 NAME c6dmaD_ FAM FILE c6dmaD_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6dmaD_.a3m DATE Sat Dec 22 08:39:44 2018 LENG 68 match states, 68 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4033 -0.9517 SEQ >ss_dssp CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC >sa_dssp EDDDCDCCDCCCCCECCECDDCEBCCDCCDCDEEDDCCCDDCCBDEDCCCCECCCDECDCCCCEDDDD >ss_pred CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 96669887789999999999999999999999999999999999999999998898887788642049 >Consensus kllersrrlqeeskrlldemaeimrrikkllkkekvldelrkiierirelldrsrkiherseeiayke >c6dmaD_ KLLERSRRLQEESKRLLDEMAEIMRRIKKLLKKEKVLDELRKIIERIRELLDRSRKIHERSEEIAYKE # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * K 1 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 L 2 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 L 3 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 E 4 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 R 5 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 S 6 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 R 7 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 R 8 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 L 9 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 10 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 E 11 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 E 12 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 S 13 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 K 14 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 R 15 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 L 16 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 L 17 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 D 18 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 E 19 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 M 20 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 A 21 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 E 22 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 I 23 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 M 24 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 R 25 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 R 26 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 I 27 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 K 28 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 K 29 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 L 30 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 L 31 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 K 32 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 K 33 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 E 34 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 K 35 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 V 36 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 L 37 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 D 38 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 E 39 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 L 40 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 R 41 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 K 42 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 I 43 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 I 44 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 E 45 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 R 46 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 I 47 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 R 48 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 E 49 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 L 50 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 L 51 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 D 52 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 R 53 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 S 54 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 R 55 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 K 56 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 I 57 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 H 58 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 E 59 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 R 60 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 S 61 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 E 62 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 E 63 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 I 64 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 A 65 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 66 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 66 0 * * * * * * 1000 0 0 K 67 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 E 68 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //