HHsearch 1.5 NAME c6dhxC_ FAM FILE c6dhxC_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6dhxC_.a3m DATE Sat Sep 22 08:34:26 2018 LENG 177 match states, 177 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.6 EVD 0.3959 -1.8818 SEQ >ss_dssp CCSCSBHHHHHHHHHHHHTTTSCGGGGCTTEEEEEEECSSCTTCEEEEEEETTCCEEEEEEEEECSSSSCEEEEEEEEEEETTEEEEEEEEEETTTTEEE EEEEEEEEETTEEEEECCHHHHHHHHHHTTCCHHHHHHHHHHHTTTTHHHHHHHHSCCSSBTTBCBSCEEEETTTTC >sa_dssp EECCDAAAABBACCADEBCEEEBBBEEBEDBDDCEDDBDECEEDDCABACBDEDECDDAAACACBCEDCCBABABABCCCCEEBBABACADACCDDDBAD BCABAACCDEEDDCDCEEDEDADECBEECECDBCDADDCBCDBABDCBADCACECCECECCCEEBDECDDECCAEDD >ss_pred CCCHHHHHHHHHHCCCCEEECCCHHCCCCCEEEEEHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEECCCEEEEEEHHHCCCEEEEEEEEEEECCCHHHH HHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEEECCC >ss_conf 9741347888741211035214620012100210034311232213688750135125665446552177067885011087048999864311300211 11000012478468874489999999981983878899999998889986698874044580014057997630269 >Consensus xxxxKNIFDExYxxxxKxYrxNxxFxxixDxxVxSxxExSDxxxxxxxxxxKxxxxxKIxIxFxFixxxxxIxIxxxKxixxxixxxIxxKYxxxxrxlx xxVxxxxxKxxxxxxIxxxsxirxYLxkygIsaKDLdxxydeivnqKVlkDWcsiyxSkYSpxnyGxvkiexqxexw >c6dhxC_ XNQPKNIFDEIYQETEKTYRLNNIFNKLTDVEVHSYQEYSDDSKFYPSILYKDINYTKIAIDFSFLNKNNNILIYFEKEIGPNVRVRIWNKYTRQDRTLT KSVKIALEKGDSDKYIEDETQVRAYLKKYGITAKDLDAHYEKIVNQKVLKDWCSIYKSKYSPKDYGQVTVKXQWEKW >UniRef50_C8NHD3(116-166:166) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Granulicatella adiacens ATCC 49175 RepID=C8NHD3_9LACT E=3e-20 s/c=1.96 id=62% cov=29% ---------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------QQYGISAKDLDSYYDEVVNQKVLKDWCSIYDSKYSPSNYGDIKIEPQRENW >UniRef50_A8SJC5(32-216:225) Putative uncharacterized protein n=2 Tax=Parvimonas micra ATCC 33270 RepID=A8SJC5_9FIRM E=1e-39 s/c=0.89 id=28% cov=96% --KEKNIFDEMYYGEKKVYKrgANTPFRNIpgihqwnrNDFMVNpSVKELSDRNNTVEERYKKKYKTKKIGewdIGFKFIYDKKKIDIsFYNKILEKKIT FSIHYKYDIESKKMVENVDfFDNTKKMPEAEIDEISKIKEYLEKNNISIKDLKETADELLYEKVIGDWEKYTNSRYSKDNLGTVKIE------ # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * X 1 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 1 * * * * * * * 0 0 0 N 2 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 3 * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * 3 0 * * * * * * 1643 0 0 P 4 * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1643 0 0 K 5 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1643 0 0 N 6 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1643 0 0 I 7 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1643 0 0 F 8 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1643 0 0 D 9 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1643 0 0 E 10 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1643 0 0 I 11 * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1643 0 0 Y 12 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 12 0 * * * * * * 1643 0 0 Q 13 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 13 0 * * * * * * 1643 0 0 E 14 * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1643 0 0 T 15 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 15 0 * * * * * * 1643 0 0 E 16 * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1643 0 0 K 17 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1643 0 0 T 18 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * 18 0 * * * * * * 1643 0 0 Y 19 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 19 0 * * * * * * 1643 0 0 R 20 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 20 1000 1000 * 1000 1000 * * 1643 1000 0 L 21 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1643 0 0 N 22 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1643 0 0 N 23 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * 23 0 * * * * * * 1643 0 0 I 24 * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1643 0 0 F 25 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1643 0 0 N 26 * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * 26 0 * * * * * * 1643 0 0 K 27 * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1643 0 0 L 28 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 28 1000 1000 * 3000 193 * * 1643 1000 0 T 29 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * 29 0 * * * * * * 1643 0 0 D 30 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1643 0 0 V 31 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * 31 0 * * * * * * 1643 0 0 E 32 * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1643 0 0 V 33 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 33 0 * * * * * * 1643 0 0 H 34 * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * 34 1000 1000 * 0 * * * 1643 1000 0 S 35 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 35 0 * * * * * * 1643 0 0 Y 36 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 36 0 * * * * * * 1643 0 0 Q 37 * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * 37 0 * * * * * * 1643 0 0 E 38 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1643 0 0 Y 39 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 39 0 * * * * * * 1643 0 0 S 40 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 40 0 * * * * * * 1643 0 0 D 41 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1643 0 0 D 42 * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * 42 0 * * * * * * 1643 0 0 S 43 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 43 0 * * * * * * 1643 0 0 K 44 * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1643 0 0 F 45 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 45 0 * * * * * * 1643 0 0 Y 46 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 46 0 * * * * * * 1643 0 0 P 47 * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1643 0 0 S 48 * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 48 0 * * * * * * 1643 0 0 I 49 * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * 49 0 * * * * * * 1643 0 0 L 50 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 50 0 * * * * * * 1643 0 0 Y 51 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 1000 51 0 * * * * * * 1643 0 0 K 52 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1643 0 0 D 53 * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1643 0 0 I 54 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 54 0 * * * * * * 1643 0 0 N 55 * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1643 0 0 Y 56 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 56 0 * * * * * * 1643 0 0 T 57 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * 57 0 * * * * * * 1643 0 0 K 58 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1643 0 0 I 59 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1643 0 0 A 60 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 60 1000 1000 * 1585 585 * * 1643 1000 0 I 61 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1643 0 0 D 62 * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1643 0 0 F 63 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1643 0 0 S 64 * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * 64 0 * * * * * * 1643 0 0 F 65 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1643 0 0 L 66 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1643 0 0 N 67 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 67 0 * * * * * * 1643 0 0 K 68 * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1643 0 0 N 69 * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1643 0 0 N 70 * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1643 0 0 N 71 * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1643 0 0 I 72 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1643 0 0 L 73 * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1643 0 0 I 74 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 74 1000 1000 * 0 * * * 1643 1000 0 Y 75 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 75 0 * * * * * * 1643 0 0 F 76 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 76 0 * * * * * * 1643 0 0 E 77 * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1643 0 0 K 78 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1643 0 0 E 79 * * * 1000 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1643 0 0 I 80 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1643 0 0 G 81 * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1643 0 0 P 82 * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1643 0 0 N 83 * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1643 0 0 V 84 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 84 0 * * * * * * 1643 0 0 R 85 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * 85 0 * * * * * * 1643 0 0 V 86 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * 86 0 * * * * * * 1643 0 0 R 87 * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * 87 0 * * * * * * 1643 0 0 I 88 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1643 0 0 W 89 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * 89 0 * * * * * * 1643 0 0 N 90 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 90 0 * * * * * * 1643 0 0 K 91 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1643 0 0 Y 92 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 92 0 * * * * * * 1643 0 0 T 93 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 93 0 * * * * * * 1643 0 0 R 94 * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * 94 0 * * * * * * 1643 0 0 Q 95 * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 95 0 * * * * * * 1643 0 0 D 96 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 96 0 * * * * * * 1643 0 0 R 97 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 97 0 * * * * * * 1643 0 0 T 98 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * 98 0 * * * * * * 1643 0 0 L 99 * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1643 0 0 T 100 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * 100 0 * * * * * * 1643 0 0 K 101 * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1643 0 0 S 102 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 102 0 * * * * * * 1643 0 0 V 103 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 103 0 * * * * * * 1643 0 0 K 104 * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 104 1000 1000 * 0 * * * 1643 1000 0 I 105 * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1643 0 0 A 106 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1643 0 0 L 107 * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1643 0 0 E 108 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 108 0 * * * * * * 1643 0 0 K 109 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1643 0 0 G 110 * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1643 0 0 D 111 * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1643 0 0 S 112 * * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * 112 0 * * * * * * 1643 0 0 D 113 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1643 0 0 K 114 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1643 0 0 Y 115 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 115 0 * * * * * * 1643 0 0 I 116 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1643 0 0 E 117 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1643 0 0 D 118 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1643 0 0 E 119 * * * 1000 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1643 0 0 T 120 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 120 0 * * * * * * 1643 0 0 Q 121 * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * 121 0 * * * * * * 1643 0 0 V 122 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 122 0 * * * * * * 1643 0 0 R 123 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 123 0 * * * * * * 1643 0 0 A 124 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1643 0 0 Y 125 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 125 0 * * * * * * 1643 0 0 L 126 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1643 0 0 K 127 * * * 1397 * * * * 1626 * * * * 1755 * * * * * * 127 0 * * * * * * 1726 0 0 K 128 * * * * * * * * 507 * * * * 1755 * * * * * * 128 0 * * * * * * 1726 0 0 Y 129 * * * * * * * * * * * 1397 * * * * * * * 689 129 0 * * * * * * 1726 0 0 G 130 * * * * * 689 * * * * * 1397 * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1726 0 0 I 131 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1726 0 0 T 132 * * * * * * * * * * * * * * * 565 1626 * * * 132 0 * * * * * * 1726 0 0 A 133 689 * * * * * * 1397 * * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1726 0 0 K 134 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1726 0 0 D 135 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1726 0 0 L 136 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1726 0 0 D 137 * * 689 * * * * * 1397 * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1726 0 0 A 138 1626 * * 1397 * * * * * * * * * * * 1755 * * * * 138 0 * * * * * * 1726 0 0 H 139 * * * * * * 1626 * * * * * * * * * 1397 * * 1755 139 0 * * * * * * 1726 0 0 Y 140 1397 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 689 140 0 * * * * * * 1726 0 0 E 141 * * 565 1626 * * * * * * * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1726 0 0 K 142 * * * 565 * * * * 1626 * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1726 0 0 I 143 * * * * * * * 1626 * 1397 * * * * * * * 1755 * * 143 0 * * * * * * 1726 0 0 V 144 * * * * * * * * * 1397 * * * * * * * 689 * * 144 0 * * * * * * 1726 0 0 N 145 * * * * * * * * * * * 689 * * * * * * * 1397 145 0 * * * * * * 1726 0 0 Q 146 * * * 1397 * * * * * * * * * 689 * * * * * * 146 0 * * * * * * 1726 0 0 K 147 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1726 0 0 V 148 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 148 0 * * * * * * 1726 0 0 L 149 * * * * * * * 1397 * 689 * * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1726 0 0 K 150 * * * * * 1397 * * 689 * * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1726 0 0 D 151 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1726 0 0 W 152 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 152 0 * * * * * * 1726 0 0 C 153 * 689 * 1397 * * * * * * * * * * * * * * * * 153 0 * * * * * * 1726 0 0 S 154 * * * * * * * * 1397 * * * * * * 689 * * * * 154 0 * * * * * * 1726 0 0 I 155 * * * * * * * 689 * * * * * * * * * * * 1397 155 0 * * * * * * 1726 0 0 Y 156 * * * * * * * * * * * * * * * * 1397 * * 689 156 0 * * * * * * 1726 0 0 K 157 * * 1755 * * * * * 1626 * * 1397 * * * * * * * * 157 0 * * * * * * 1726 0 0 S 158 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 158 0 * * * * * * 1726 0 0 K 159 * * * * * * * * 689 * * * * * 1397 * * * * * 159 0 * * * * * * 1726 0 0 Y 160 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 160 0 * * * * * * 1726 0 0 S 161 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 161 0 * * * * * * 1726 0 0 P 162 * * * * * * * * 1397 * * * 689 * * * * * * * 162 0 * * * * * * 1726 0 0 K 163 * * 1397 * * * * * 1626 * * * * * * 1755 * * * * 163 0 * * * * * * 1726 0 0 D 164 * * 1626 * * * * * * * * 565 * * * * * * * * 164 0 * * * * * * 1726 0 0 Y 165 * * * * * * * * * 1397 * * * * * * * * * 689 165 0 * * * * * * 1726 0 0 G 166 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 166 0 * * * * * * 1726 0 0 Q 167 * * 1755 * * * * * * * * * * 1626 * * 1397 * * * 167 0 * * * * * * 1726 0 0 V 168 * * * * * * * 1755 * * * * * * * * * 507 * * 168 0 * * * * * * 1726 0 0 T 169 * * * * * * * * 565 * * * * * * * 1626 * * * 169 0 * * * * * * 1726 0 0 V 170 * * * * * * * 565 * * * * * * * * * 1626 * * 170 0 * * * * * * 1726 0 0 K 171 * * * 565 * * * * 1626 * * * * * * * * * * * 171 0 * * * * * * 1726 0 0 X 172 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 172 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 173 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 173 0 * * * * * * 1277 0 0 W 174 * * * * * * * * * * * * * * 972 * * * 1029 * 174 0 * * * * * * 1277 0 0 E 175 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 175 0 * * * * * * 1277 0 0 K 176 * * * * * * * * 1029 * * 972 * * * * * * * * 176 0 * * * * * * 1277 0 0 W 177 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 177 0 * * 0 * * * 1277 0 0 //