HHsearch 1.5 NAME c6d7yB_ FAM FILE c6d7yB_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6d7yB_.a3m DATE Sat May 4 08:14:25 2019 LENG 155 match states, 155 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.9 EVD 0.4358 0.5765 SEQ >ss_dssp CCEEEEEEEESCCTTTHHHHHHHHHTTSSEEEEEEESSCSSCSCCCSCCHHHHHHHHHCSSCEEEEEEEEEEEEETTEEEEEEEEEEEEETTEEEEEEEE EESSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCSEEEEEESSTTCGGGEEEETTEECSCC >sa_dssp EEDCABABACBBDDECACDAADCACECBEDBCEBDCDDECCDEECEEBDEEABEDACECEDEBCAABBADBACADEECDBEEADADACCDEECBBABABA ECEDDECACEBADCABEBADEBCEEBDBEDBBAACDDADDEECBBABCEEEBECE >ss_pred CHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCEECCCCEEHHHHHHEEHHCCCCEEEEEEE ECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCC >ss_conf 9037999996411014677877654335542033100220443256778777533541167468999624704167312045320001105740345675 2367552132679887666556676384765223575432231020188323469 >Consensus xxexxevvxxxvxxsxlxxlLexIexxsxxisxxxxseexxgdxvaxixxxLidxFxxfxgdxclxxxxxxFxvxxxixlPxvllRVxkyxGxvdvxLsF xxnDxxsagxvmlxxqxyxxxlsxxfgxxxfYGGlEPAxDxdTRfFTxnxlGPLx >c6d7yB_ XKELFEVIFEGVNTSRLFFLLKEIESKSDRIFDFNFSEDFFSSNVNVFSELLIDSFLGFNGDLYFGVSXEGFSVKDGLKLPVVLLRVLKYEGGVDVGLCF YXNDFNSAGKVXLEFQKYXNGISADFGFENFYGGLEPASDQETRFFTNNRLGPLL >UniRef50_Q1IE76(3-154:155) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Pseudomonas entomophila L48 RepID=Q1IE76_PSEE4 E=1e-59 s/c=1.51 id=41% cov=97% --ESYEVVLQQVAKSDLRVLLECIEMESQALSGLAVSEELGGDVSAGINKNLIDAFFAHQGDVCLMERLHEFNVSGTIRLPLVFLRVIKYKGEVDVELSF --NDAPSfdIDRVMLAMQGYADELSKKFHINEFYGGLEPAADTDTRYFTGNTLGPL- >UniRef50_B8L3F0(1-129:165) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Stenotrophomonas sp. SKA14 RepID=B8L3F0_9GAMM E=1e-08 s/c=0.47 id=25% cov=84% -------------------MLESIGCMAESVS----QTEVHGDPVA-IGDWLAGNFDEFACSSCLVQVINDFRLGSAVHIPTLLIRVFRFDGLASIDLSF DM-DWSNAGVAMPMLHRHFLKLKLLTGARAVYGGMEPAQDLDTRFFTDDECGPL- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * X 1 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 1 * * * * * * * 0 0 0 K 2 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 E 3 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1477 0 0 L 4 * * * * * * * * * 1019 * * * * * 981 * * * * 4 0 * * * * * * 1477 0 0 F 5 * * * * 1019 * * * * * * * * * * * * * * 981 5 0 * * * * * * 1477 0 0 E 6 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1477 0 0 V 7 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 7 0 * * * * * * 1477 0 0 I 8 * * * * * * * 1019 * * * * * * * * * 981 * * 8 0 * * * * * * 1477 0 0 F 9 * * * * 1019 * * * * 981 * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1477 0 0 E 10 * * * 1019 * * * * * * * * * 981 * * * * * * 10 0 * * * * * * 1477 0 0 G 11 * * * * * 1019 * * * * * * * 981 * * * * * * 11 0 * * * * * * 1477 0 0 V 12 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 12 0 * * * * * * 1477 0 0 N 13 981 * * * * * * * * * * 1019 * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1477 0 0 T 14 * * * * * * * * 981 * * * * * * * 1019 * * * 14 0 * * * * * * 1477 0 0 S 15 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 15 0 * * * * * * 1477 0 0 R 16 * * 981 * * * * * * * * * * * 1019 * * * * * 16 0 * * * * * * 1477 0 0 L 17 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1477 0 0 F 18 * * * * 1019 * * * * * * * * * 981 * * * * * 18 0 * * * * * * 1477 0 0 F 19 * * * * 1019 * * * * * * * * * * * * 981 * * 19 0 * * * * * * 1477 0 0 L 20 * * * * * * * * * 627 1504 * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1965 0 0 L 21 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1965 0 0 K 22 * * * 566 * * * * 1623 * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1965 0 0 E 23 * 1631 * 1623 * * * * * * * * * * * 1504 * * * * 23 0 * * * * * * 1965 0 0 I 24 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1965 0 0 E 25 * * * 627 * 1504 * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1965 0 0 S 26 * 1504 * * * * * * * * 1631 * * * * 1623 * * * * 26 0 * * * * * * 1965 0 0 K 27 * * * 1631 * * * * 1623 * 1504 * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1965 0 0 S 28 1504 * * * * * * * * * * * * * * 627 * * * * 28 0 * * * * * * 1965 0 0 D 29 * * 1623 1504 * * * * * * * * * 1631 * * * * * * 29 0 * * * * * * 1965 0 0 R 30 1631 * * * * * * * * * * * * * 1623 1504 * * * * 30 0 * * * * * * 1965 0 0 I 31 * * * * * * * 1623 * 1631 * * * * * * * 1504 * * 31 0 * * * * * * 1965 0 0 F 32 * * * * 1623 * * * * * * * * * * 566 * * * * 32 627 * 1504 * * * * 1965 0 0 D 33 * * 1019 * * 981 * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * 0 1477 0 1000 F 34 * * * * 1019 * * * * 981 * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * 0 1477 0 1000 N 35 981 * * * * * * * * * * 1019 * * * * * * * * 35 0 * * * * * 0 1477 0 1000 F 36 * * * * 1019 * * * * * * * * * * * * 981 * * 36 0 * * * * 0 * 1477 0 1000 S 37 * * * * * * * * * * * * * 1504 * 627 * * * * 37 0 * * * * * * 1965 0 0 E 38 * * * 627 * * * * * * * * * * * * 1504 * * * 38 0 * * * * * * 1965 0 0 D 39 * * 1623 566 * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1965 0 0 F 40 * * * * 1623 * * * * 1631 * * * * * * * 1504 * * 40 0 * * * * * * 1965 0 0 F 41 * * * * 1623 1631 1504 * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1965 0 0 S 42 * * * * * 566 * * * * * * * * * 1623 * * * * 42 0 * * * * * * 1965 0 0 S 43 * * 566 * * * * * * * * * * * * 1623 * * * * 43 0 * * * * * * 1965 0 0 N 44 * * * * * * * * * * * 1623 1504 * * * * 1631 * * 44 0 * * * * * * 1965 0 0 V 45 * * * * * * * * * * * * * * * 1631 * 562 * * 45 0 * * * * * * 1965 0 0 N 46 566 * * * * * * * * * * 1623 * * * * * * * * 46 627 * 1504 * * * * 1965 0 0 V 47 * * * * * 981 * * * * * * * * * * * 1019 * * 47 0 * * * * 0 * 1477 0 1000 F 48 * * * * 1623 * * 566 * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1965 0 0 S 49 * * * * * 1504 * * * * * 1631 * * * 1623 * * * * 49 0 * * * * * * 1965 0 0 E 50 * * 1504 1623 * * * * 1631 * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1965 0 0 L 51 * * * * * * * * * 1623 * 1631 * * * * * * 1504 * 51 0 * * * * * * 1965 0 0 L 52 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1965 0 0 I 53 1504 * * * * * * 627 * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1965 0 0 D 54 * * 627 * * 1504 * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1965 0 0 S 55 1631 * * * * * * * * * * 1504 * * * 1623 * * * * 55 0 * * * * * * 1965 0 0 F 56 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1965 0 0 L 57 * * 1504 * 1631 * * * * 1623 * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1965 0 0 G 58 1631 * * 1504 * 1623 * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1965 0 0 F 59 * * * * 562 * 1631 * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1965 0 0 N 60 1504 * * * * * * * * * * 1623 * 1631 * * * * * * 60 0 * * * * * * 1965 0 0 G 61 * 1504 * * * 627 * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1965 0 0 D 62 * * 627 * * * * * * * * * * * * 1504 * * * * 62 0 * * * * * * 1965 0 0 L 63 * * * * * * * * * 1623 * * * * * 1504 * 1631 * * 63 0 * * * * * * 1965 0 0 Y 64 * 566 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1623 64 0 * * * * * * 1965 0 0 F 65 * * * * 1623 * * * * 566 * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1965 0 0 G 66 * * * * * 1623 * * * * 1631 * * * * * * 1504 * * 66 0 * * * * * * 1965 0 0 V 67 * * * 1631 * * * * * * * * * 1504 * * * 1623 * * 67 0 * * * * * * 1965 0 0 S 68 * * * * * * * * * * * * * * 1631 1623 * 1504 * * 68 0 * * * * * * 1965 0 0 X 69 * * * * * * * 1043 * 958 * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1571 0 0 E 70 * * * 1623 * * 1631 * * * * 1504 * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1965 0 0 G 71 * * 1504 1631 * 1623 * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1965 0 0 F 72 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1965 0 0 S 73 * * * * * * * * * * * 1631 * * 1504 1623 * * * * 73 0 * * * * * * 1965 0 0 V 74 * * * * * * * * * 1504 * * * * * * * 627 * * 74 0 * * * * * * 1965 0 0 K 75 * * * * * 1504 * * 1623 * * * * * * 1631 * * * * 75 0 * * * * * * 1965 0 0 D 76 * * 1623 * * 1631 * * * * * * * * * 1504 * * * * 76 0 * * * * * * 1965 0 0 G 77 1504 * * * * 1623 * * * * * * * * * * 1631 * * * 77 0 * * * * * * 1965 0 0 L 78 * * * * * * * 1631 * 1623 * * * * * * * 1504 * * 78 0 * * * * * * 1965 0 0 K 79 * * * * * * 1504 * 1623 * * * * * 1631 * * * * * 79 0 * * * * * * 1965 0 0 L 80 * * * * * * * 1504 * 627 * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1965 0 0 P 81 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1965 0 0 V 82 * * * * * * * * * 1631 * * * * * * 1504 1623 * * 82 0 * * * * * * 1965 0 0 V 83 * * * * * * * * * 1504 * * * * * * * 627 * * 83 0 * * * * * * 1965 0 0 L 84 * * * * 1631 * * * * 562 * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1965 0 0 L 85 * * * * * * * 1504 * 627 * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1965 0 0 R 86 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 86 0 * * * * * * 1965 0 0 V 87 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 87 0 * * * * * * 1965 0 0 L 88 * * * * 1504 * * 1631 * 1623 * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1965 0 0 K 89 * * * * * * * * 627 * * * * * 1504 * * * * * 89 0 * * * * * * 1965 0 0 Y 90 * * * * 1504 * * * * * * * * * * * * * * 627 90 0 * * * * * * 1965 0 0 E 91 * * 1504 1623 * * * * 1631 * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1965 0 0 G 92 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1965 0 0 G 93 * * * 1631 * 1623 * * * 1504 * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1965 0 0 V 94 1504 * * * * * * * * * * * * * * * * 627 * * 94 0 * * * * * * 1965 0 0 D 95 * * 627 * * * * * * * * * * * * 1504 * * * * 95 0 * * * * * * 1965 0 0 V 96 * * * * * * * 1504 * * * * * * * * * 627 * * 96 0 * * * * * * 1965 0 0 G 97 * * 1504 1631 * 1623 * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1965 0 0 L 98 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1965 0 0 C 99 * 1623 * * * * * * * * * * * * * 566 * * * * 99 0 * * * * * * 1965 0 0 F 100 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 100 562 * 1631 * * * * 1965 0 0 Y 101 * * 1022 * * * * * * * * * * * * * * * * 979 101 0 * * * * * 0 1604 0 1000 X 102 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 102 * * 0 * * 0 * 1000 0 1000 N 103 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 103 0 * * * * 0 * 1477 0 1000 D 104 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1965 0 0 F 105 1631 * * * 1623 * * * * * * * * * * * * * 1504 * 105 0 * * * * * * 1965 0 0 N 106 * * * * * * * * * * * 1623 1631 * * 1504 * * * * 106 0 * * * * * * 1965 0 0 S 107 * * * * * * * * * * * 1504 * * * 627 * * * * 107 562 1631 * 1000 1000 * * 1965 1000 0 A 108 562 * * * * * * 1631 * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1965 0 0 G 109 * * 1631 * * 562 * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1965 0 0 K 110 * * * * * * * * 1623 * * * * * 1631 * * 1504 * * 110 0 * * * * * * 1965 0 0 V 111 1504 * * * * * * * * * * * * * * * * 627 * * 111 0 * * * * * * 1965 0 0 X 112 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1571 0 0 L 113 * * * * * * * * * 627 * * 1504 * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1965 0 0 E 114 1631 * * 1623 * * * * * * 1504 * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1965 0 0 F 115 * * * * 1623 * * * * 1504 1631 * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1965 0 0 Q 116 * * * * * * 1504 * * * * * * 627 * * * * * * 116 0 * * * * * * 1965 0 0 K 117 * * * * * 1631 * * 1623 * * * * * 1504 * * * * * 117 0 * * * * * * 1965 0 0 Y 118 * * * * * * 1504 * * * * * * * * * * * * 627 118 0 * * * * * * 1965 0 0 X 119 958 * * * 1043 * * * * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1571 0 0 N 120 * * 1631 * * * * * * 1504 * 1623 * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1965 0 0 G 121 * * * 1631 * 1623 * * 1504 * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1965 0 0 I 122 * * * * * * * 1623 * 566 * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1965 0 0 S 123 * * * * * * * * 1504 * * * * * * 627 * * * * 123 0 * * * * * * 1965 0 0 A 124 1623 * * * * * * * 1631 1504 * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1965 0 0 D 125 * * 1623 * * * * * 1631 1504 * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1965 0 0 F 126 * * * * 627 * * * * * * * * * * * 1504 * * * 126 0 * * * * * * 1965 0 0 G 127 * * * * * 562 1631 * * * * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1965 0 0 F 128 1504 * * * 1623 * * 1631 * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1965 0 0 E 129 * * * 1623 * * * * * * * 1631 * * 1504 * * * * * 129 0 * * * * * * 1965 0 0 N 130 1504 * * 1631 * * * * * * * 1623 * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1965 0 0 F 131 * * * * 627 * * * * * * * * * * * * 1504 * * 131 0 * * * * * * 1965 0 0 Y 132 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 132 0 * * * * * * 1965 0 0 G 133 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1965 0 0 G 134 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1965 0 0 L 135 * * * * * * * * * 627 1504 * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1965 0 0 E 136 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1965 0 0 P 137 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1965 0 0 A 138 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1965 0 0 S 139 1631 * * * * * * * * * * * * 1504 * 1623 * * * * 139 0 * * * * * * 1965 0 0 D 140 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1965 0 0 Q 141 * * * * * * * * * 1504 * * * 1623 * * 1631 * * * 141 0 * * * * * * 1965 0 0 E 142 * * 566 1623 * * * * * * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1965 0 0 T 143 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 143 0 * * * * * * 1965 0 0 R 144 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 144 0 * * * * * * 1965 0 0 F 145 * * * * 562 * * * * * * * * * * * * * * 1631 145 0 * * * * * * 1965 0 0 F 146 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1965 0 0 T 147 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 147 0 * * * * * * 1965 0 0 N 148 * * 1504 * * 1631 * * * * * 1623 * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1965 0 0 N 149 * * 1504 * * * * * * * * 627 * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1965 0 0 R 150 * * * 1504 * * * * * * * * * * 1623 * 1631 * * * 150 0 * * * * * * 1965 0 0 L 151 * 1504 * * * * * * * 627 * * * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1965 0 0 G 152 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 152 0 * * * * * * 1965 0 0 P 153 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 153 0 * * * * * * 1965 0 0 L 154 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 154 0 * * * * * * 1965 0 0 L 155 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 155 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //