HHsearch 1.5 NAME c6c3rB_ FAM FILE c6c3rB_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6c3rB_.a3m DATE Sat Oct 20 08:37:15 2018 LENG 141 match states, 141 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4172 0.0937 SEQ >ss_dssp CTHHHHHHHHHHHHHHSTTCCBCSSEEEEECSSCCTTTSCCCCCCSSSSCCSHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSSSCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCSSSCC CCCEEEEECHHHHHTCHHHHHHHHTCCSHHHHHHHHHSCCC >sa_dssp EDDECCECADECBEEEAEDCADCCCBBADACBECDCEEDDCEDEDEEEEEDDBEDDCDBBDACDDABEBADEEEDECCEAABBABDACECCDCEDEEDEE ECDBCAAABBEBACDCCEAADDBBEBECDEDBDDCADEECE >ss_pred CCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCCEECCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC CCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9707988676666775237754068999971796042012230121333345465321898878886420300257899766999999630852002221 16717786179999877788751321361479999876339 >Consensus insleelaaqeliaaqfegnldgffctfyvqskpqlldlesecycmddfdcgcdrikreeelrklifltsdvygynfeewkglvwkfvqnycpehrygst fgngllivsprffmdhldwfqqwklvssndecraflrkrtq >c6c3rB_ INSLEELAAQELIAAQFEGNLDGFFCTFYVQSKPQLLDLESECYCMDDFDCGCDRIKREEELRKLIFLTSDVYGYNFEEWKGLVWKFVQNYCPEHRYGST FGNGLLIVSPRFFMDHLDWFQQWKLVSSNDECRAFLRKRTQ # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * I 1 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 N 2 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 S 3 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 L 4 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 E 5 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 E 6 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 L 7 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 A 8 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 A 9 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 10 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 E 11 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 L 12 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 I 13 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 A 14 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 A 15 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 16 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 F 17 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 E 18 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 G 19 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 N 20 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 L 21 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 D 22 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 G 23 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 F 24 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 F 25 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 C 26 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 T 27 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 F 28 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 29 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 29 0 * * * * * * 1000 0 0 V 30 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 31 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 S 32 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 K 33 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 P 34 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 35 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 L 36 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 L 37 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 D 38 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 L 39 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 E 40 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 S 41 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 E 42 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 C 43 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 44 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 44 0 * * * * * * 1000 0 0 C 45 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 M 46 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 D 47 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 D 48 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 F 49 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 D 50 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 C 51 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 G 52 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 C 53 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 D 54 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 R 55 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 I 56 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 K 57 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 R 58 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 E 59 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 E 60 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 E 61 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 L 62 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 R 63 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 K 64 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 L 65 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 I 66 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 F 67 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 L 68 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 T 69 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 S 70 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 D 71 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 V 72 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 73 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 73 0 * * * * * * 1000 0 0 G 74 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 75 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 75 0 * * * * * * 1000 0 0 N 76 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 F 77 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 E 78 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 E 79 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 W 80 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 K 81 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 G 82 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 L 83 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 V 84 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 W 85 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 K 86 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 F 87 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 V 88 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 89 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 N 90 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 91 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 91 0 * * * * * * 1000 0 0 C 92 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 P 93 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 E 94 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 H 95 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 R 96 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 97 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 97 0 * * * * * * 1000 0 0 G 98 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 S 99 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 T 100 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 F 101 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 G 102 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 N 103 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 G 104 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 L 105 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 L 106 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 I 107 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 V 108 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 S 109 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 P 110 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 R 111 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 F 112 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 F 113 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 M 114 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 D 115 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 H 116 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 L 117 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 D 118 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 W 119 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 F 120 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 121 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 122 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 W 123 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 K 124 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 L 125 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 V 126 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 S 127 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 S 128 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 N 129 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 D 130 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 E 131 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 C 132 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 R 133 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 A 134 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 F 135 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 L 136 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 R 137 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 K 138 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 R 139 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 T 140 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 141 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 141 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //