HHsearch 1.5 NAME c6bmtB_ FAM FILE c6bmtB_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6bmtB_.a3m DATE Sat Jan 6 08:13:55 2018 LENG 70 match states, 70 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.4 EVD 0.4707 2.8524 SEQ >ss_dssp CEEEETTEEEEETTSCCHHHHTTHHHHTCTTSCHHHHHHHHHHHHHTTCCSHHHHHHHHHHTTCCCTTCC >sa_dssp EDDDEEEEEEDCEDDBDDEBADDACCCDDEEBEEEDCEEBECDAEEDEBDDDEDABECAEEBECEBDECE >ss_pred CCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCC >ss_conf 9215575288033256652355446322589898789999999853370259999998864276300259 >Consensus xvxsqngxilhddxxxlxhelxyidvlxxxnaxxxtkxxlxxyfxxxglxsixxiixkakqdgxdxskyx >c6bmtB_ QVTSQNGIILHDDSRMLDHELQYVDVLINPNANPQTKERLKAYFESQGLNTVSEIVQKAKQDGLDTSKYD >UniRef50_Q2YVR2(30-99:102) Probable exported protein n=51 Tax=Staphylococcus aureus RepID=Q2YVR2_STAAB E=2e-17 s/c=1.29 id=52% cov=101% KVYSQNGLVLHDDANFLEHELSYIDVLLDKNADQATKDNLRSYFADKGLHSINDIINKAKQDGFDVSKYE # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * Q 1 * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * 1 0 * * * * * * 1386 0 0 V 2 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 2 0 * * * * * * 1386 0 0 T 3 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 3 0 * * * * * * 1386 0 0 S 4 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 4 0 * * * * * * 1386 0 0 Q 5 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 5 0 * * * * * * 1386 0 0 N 6 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1386 0 0 G 7 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1386 0 0 I 8 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1386 0 0 I 9 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 9 0 * * * * * * 1386 0 0 L 10 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1386 0 0 H 11 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1386 0 0 D 12 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1386 0 0 D 13 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1386 0 0 S 14 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 14 0 * * * * * * 1386 0 0 R 15 * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * 15 0 * * * * * * 1386 0 0 M 16 * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1386 0 0 L 17 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1386 0 0 D 18 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1386 0 0 H 19 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1386 0 0 E 20 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1386 0 0 L 21 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1386 0 0 Q 22 * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * 22 0 * * * * * * 1386 0 0 Y 23 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 23 0 * * * * * * 1386 0 0 V 24 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 24 0 * * * * * * 1386 0 0 D 25 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1386 0 0 V 26 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 26 0 * * * * * * 1386 0 0 L 27 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1386 0 0 I 28 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1386 0 0 N 29 * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1386 0 0 P 30 * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1386 0 0 N 31 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1386 0 0 A 32 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1386 0 0 N 33 * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1386 0 0 P 34 * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * 34 0 * * * * * * 1386 0 0 Q 35 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 35 0 * * * * * * 1386 0 0 T 36 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 36 0 * * * * * * 1386 0 0 K 37 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1386 0 0 E 38 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1386 0 0 R 39 * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * 39 0 * * * * * * 1386 0 0 L 40 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1386 0 0 K 41 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 41 0 * * * * * * 1386 0 0 A 42 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 42 0 * * * * * * 1386 0 0 Y 43 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 43 0 * * * * * * 1386 0 0 F 44 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1386 0 0 E 45 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1386 0 0 S 46 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 46 0 * * * * * * 1386 0 0 Q 47 * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * 47 0 * * * * * * 1386 0 0 G 48 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1386 0 0 L 49 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1386 0 0 N 50 * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1386 0 0 T 51 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 51 0 * * * * * * 1386 0 0 V 52 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 52 0 * * * * * * 1386 0 0 S 53 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 53 0 * * * * * * 1386 0 0 E 54 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1386 0 0 I 55 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1386 0 0 V 56 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 56 0 * * * * * * 1386 0 0 Q 57 * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * 57 0 * * * * * * 1386 0 0 K 58 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1386 0 0 A 59 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1386 0 0 K 60 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1386 0 0 Q 61 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 61 0 * * * * * * 1386 0 0 D 62 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1386 0 0 G 63 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1386 0 0 L 64 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1386 0 0 D 65 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1386 0 0 T 66 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * 66 0 * * * * * * 1386 0 0 S 67 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 67 0 * * * * * * 1386 0 0 K 68 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1386 0 0 Y 69 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 69 0 * * * * * * 1386 0 0 D 70 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * 0 * * * 1386 0 0 //