HHsearch 1.5 NAME c6bl5A_ FAM FILE c6bl5A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6bl5A_.a3m DATE Sat Feb 24 08:29:10 2018 LENG 129 match states, 129 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.1 EVD 0.4177 -0.4529 SEQ >ss_dssp CCCCCGGGCCEEEEEEBCTTSCGGGGCCSSSCCBEEEEECCSSTTTTCEEECCTTCHHHHHTEEEEECSCCCTTTCSEEEEEEEEEEEGGGBCCSSSSCT TSCCHHHHHHHHHHTCEEETTEEEEETTC >sa_dssp EBCBDEECCDDCEEBDABDECEBEDBDCEEDCBAAAAACCEEEECDDCACBBDCEDEEACEDBCAAAADDBDCEEDEEBDAABCAAABCDCAABCEECDD DECBEDADEABEDAEBEDEECCABACBEE >ss_pred CCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHCCCCCC CCCCHHHHCCCCEEEEEEECCEEEEEEEC >ss_conf 9863232124530246899867666105898617999870478866603125778878899888766336544568845999971354778750878888 88654341703245799970125643319 >Consensus rvprlhaygvfalpfpmdpdvxwxxwfxgphpxaflvsihxxgpkaghvyptxlxdxdxxxnvigmvldghdyexdxnvtvtlxaavpieyvqqxxxapx lqpxxavlxaaxxlklkvikghyffdytr >c6bl5A_ RVPRLHAYGVFALPFPMDPDVEWGNWFAGPHPKAFLVSVHPSGPKAGHVYPTDLSDPDSVANVIGMVLDGHDYEADHNVTVTLRAAVPIEYVQQGIEAPP LQPDPAVLNAAPQLKLKVIKGHYFFDYTR >UniRef50_A7XXC1(18-146:146) Putative uncharacterized protein n=2 Tax=unclassified Siphoviridae RepID=A7XXC1_9CAUD E=2e-64 s/c=1.91 id=79% cov=101% RVPRLHAYGVFALPFPMDPDVNWAQWFTGPHPRAFLVSIHKYGPKAGHVYPTNLTDEDALLNVIGMVLDGHDYENDPNVTVTLKAAVPIEYVQQDPQAPA LQPHQAVLDAAEVLKLKVIKGHYFFDYTR # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * R 1 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 1 0 * * * * * * 1150 0 0 V 2 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 2 0 * * * * * * 1150 0 0 P 3 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1150 0 0 R 4 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 4 0 * * * * * * 1150 0 0 L 5 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1150 0 0 H 6 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1150 0 0 A 7 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1150 0 0 Y 8 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 8 0 * * * * * * 1150 0 0 G 9 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1150 0 0 V 10 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 10 0 * * * * * * 1150 0 0 F 11 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1150 0 0 A 12 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1150 0 0 L 13 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1150 0 0 P 14 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1150 0 0 F 15 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1150 0 0 P 16 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1150 0 0 M 17 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1150 0 0 D 18 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1150 0 0 P 19 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1150 0 0 D 20 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1150 0 0 V 21 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 21 0 * * * * * * 1150 0 0 E 22 * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1150 0 0 W 23 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 23 0 * * * * * * 1150 0 0 G 24 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1150 0 0 N 25 * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * 25 0 * * * * * * 1150 0 0 W 26 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 26 0 * * * * * * 1150 0 0 F 27 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1150 0 0 A 28 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 28 0 * * * * * * 1150 0 0 G 29 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1150 0 0 P 30 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1150 0 0 H 31 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1150 0 0 P 32 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1150 0 0 K 33 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 33 0 * * * * * * 1150 0 0 A 34 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1150 0 0 F 35 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1150 0 0 L 36 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1150 0 0 V 37 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 37 0 * * * * * * 1150 0 0 S 38 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 38 0 * * * * * * 1150 0 0 V 39 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 39 0 * * * * * * 1150 0 0 H 40 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1150 0 0 P 41 * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1150 0 0 S 42 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 42 0 * * * * * * 1150 0 0 G 43 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1150 0 0 P 44 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1150 0 0 K 45 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1150 0 0 A 46 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1150 0 0 G 47 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1150 0 0 H 48 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1150 0 0 V 49 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 49 0 * * * * * * 1150 0 0 Y 50 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 50 0 * * * * * * 1150 0 0 P 51 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1150 0 0 T 52 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 52 0 * * * * * * 1150 0 0 D 53 * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1150 0 0 L 54 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1150 0 0 S 55 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 55 0 * * * * * * 1150 0 0 D 56 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1150 0 0 P 57 * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1150 0 0 D 58 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1150 0 0 S 59 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 59 0 * * * * * * 1150 0 0 V 60 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 60 0 * * * * * * 1150 0 0 A 61 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1150 0 0 N 62 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1150 0 0 V 63 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 63 0 * * * * * * 1150 0 0 I 64 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1150 0 0 G 65 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1150 0 0 M 66 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1150 0 0 V 67 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 67 0 * * * * * * 1150 0 0 L 68 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1150 0 0 D 69 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1150 0 0 G 70 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1150 0 0 H 71 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1150 0 0 D 72 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1150 0 0 Y 73 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 73 0 * * * * * * 1150 0 0 E 74 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1150 0 0 A 75 1000 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1150 0 0 D 76 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1150 0 0 H 77 * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1150 0 0 N 78 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1150 0 0 V 79 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 79 0 * * * * * * 1150 0 0 T 80 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 80 0 * * * * * * 1150 0 0 V 81 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 81 0 * * * * * * 1150 0 0 T 82 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 82 0 * * * * * * 1150 0 0 L 83 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1150 0 0 R 84 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 84 0 * * * * * * 1150 0 0 A 85 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1150 0 0 A 86 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1150 0 0 V 87 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 87 0 * * * * * * 1150 0 0 P 88 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1150 0 0 I 89 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1150 0 0 E 90 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1150 0 0 Y 91 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 91 0 * * * * * * 1150 0 0 V 92 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 92 0 * * * * * * 1150 0 0 Q 93 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 93 0 * * * * * * 1150 0 0 Q 94 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 94 0 * * * * * * 1150 0 0 G 95 * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1150 0 0 I 96 * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1150 0 0 E 97 * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 97 0 * * * * * * 1150 0 0 A 98 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1150 0 0 P 99 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1150 0 0 P 100 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1150 0 0 L 101 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1150 0 0 Q 102 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 102 0 * * * * * * 1150 0 0 P 103 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1150 0 0 D 104 * * 1000 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1150 0 0 P 105 * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * 105 0 * * * * * * 1150 0 0 A 106 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1150 0 0 V 107 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 107 0 * * * * * * 1150 0 0 L 108 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1150 0 0 N 109 * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1150 0 0 A 110 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1150 0 0 A 111 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1150 0 0 P 112 * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1150 0 0 Q 113 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * 113 0 * * * * * * 1150 0 0 L 114 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1150 0 0 K 115 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1150 0 0 L 116 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1150 0 0 K 117 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1150 0 0 V 118 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 118 0 * * * * * * 1150 0 0 I 119 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1150 0 0 K 120 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1150 0 0 G 121 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1150 0 0 H 122 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1150 0 0 Y 123 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 123 0 * * * * * * 1150 0 0 F 124 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1150 0 0 F 125 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1150 0 0 D 126 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1150 0 0 Y 127 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 127 0 * * * * * * 1150 0 0 T 128 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 128 0 * * * * * * 1150 0 0 R 129 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 129 0 * * 0 * * * 1150 0 0 //