HHsearch 1.5 NAME c6anzA_ FAM FILE c6anzA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c6anzA_.a3m DATE Sat Sep 2 08:24:44 2017 LENG 144 match states, 144 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.1 EVD 0.3976 -1.4412 SEQ >ss_dssp CCCCCCGGGCEEEEEEEEECTTCCEEEEEEEESCCHHHHHHHHHHTTGGGCEEEEEEEEESCCSSEEEEEEEEEETTEEEEEEEEECTTSCEEEECSCCS CCCSCEEEETTEEEEGGGCBCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC >sa_dssp EEDDCEEDEBCACBBCDBCDEEDEEDEBEECEDADDECBDDBBEEBEBCDDBABACADBDDDBDDCBACABADADDBDBABCCCBBDDEDEEDEDDCDCE EEDEEECEADEEECCDCBBCEDCDDACECACEBBEECCCDEEEE >ss_pred CCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCEEEEEEECCCCHHHHHCCCCHHHEECCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEECCEEHHHHHHHHCCCCEEEEEEECC CCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEC >ss_conf 9753344100378867898248868896520589853421000022200125469999704876587179999816513377887423894467654304 66786688751444187753117899999999974078843129 >Consensus hhhhhxmktstvvfggffmadngeriqipvlenpxireinxffxxxxxxkkxgvlvfriipepefgnteltiyfekgyylpxiqtilexgdievknlkte nysgntmeixgdxypiehisknisxiqxiisefixkxxpxxixi >c6anzA_ HHHHHHMKTSTIVFGGFFITDNGERIQIPILENPNIKEINNFFSVSNFEKKAGVLVFRIIPEPEFGNTELTIYFEKGYYLPIIQTILEDGDIEVKNLKTE NYSGNTMEILGDVYPIEHISKNISIIQDIISEFIMKNKPITIMI >UniRef50_A1KRZ0(3-141:141) Putative uncharacterized protein n=45 Tax=Neisseria RepID=A1KRZ0_NEIMF E=5e-65 s/c=1.78 id=83% cov=97% -----NMKTSTVVFGGFFMADNGERIQIPVLENPDIREINHFFSVSNFEKKTGVLVFRIIPEPEFGNTELTVYFEKGYYLPMIQTILEGGDIEVKNLKTE NYSGNTMEIWGDSYPIEHISKNISTIQNIISEFmIQKQTPAPII- >UniRef50_A9M144(3-52:66) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Neisseria meningitidis 053442 RepID=A9M144_NEIM0 E=4e-14 s/c=1.58 id=68% cov=33% -----NMKTSTVVFGGFFMADNGERIQIPVLENPDIREINHFFPYQILRKK------------------------------------------------- -------------------------------------------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * H 1 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 H 2 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 H 3 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 H 4 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 H 5 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 H 6 * * * * * * 1509 * * * * 625 * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1217 0 0 M 7 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1217 0 0 K 8 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1217 0 0 T 9 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 9 0 * * * * * * 1217 0 0 S 10 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 10 0 * * * * * * 1217 0 0 T 11 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 11 0 * * * * * * 1217 0 0 I 12 * * * * * * * 1509 * * * * * * * * * 625 * * 12 0 * * * * * * 1217 0 0 V 13 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 13 0 * * * * * * 1217 0 0 F 14 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1217 0 0 G 15 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1217 0 0 G 16 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1217 0 0 F 17 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1217 0 0 F 18 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1217 0 0 I 19 * * * * * * * 1509 * * 625 * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1217 0 0 T 20 625 * * * * * * * * * * * * * * * 1509 * * * 20 0 * * * * * * 1217 0 0 D 21 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1217 0 0 N 22 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1217 0 0 G 23 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1217 0 0 E 24 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1217 0 0 R 25 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 25 0 * * * * * * 1217 0 0 I 26 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1217 0 0 Q 27 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 27 0 * * * * * * 1217 0 0 I 28 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1217 0 0 P 29 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1217 0 0 I 30 * * * * * * * 1509 * * * * * * * * * 625 * * 30 0 * * * * * * 1217 0 0 L 31 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1217 0 0 E 32 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1217 0 0 N 33 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1217 0 0 P 34 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1217 0 0 N 35 * * 625 * * * * * * * * 1509 * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1217 0 0 I 36 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1217 0 0 K 37 * * * * * * * * 1509 * * * * * 625 * * * * * 37 0 * * * * * * 1217 0 0 E 38 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1217 0 0 I 39 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1217 0 0 N 40 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1217 0 0 N 41 * * * * * * 625 * * * * 1509 * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1217 0 0 F 42 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1217 0 0 F 43 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1217 0 0 S 44 * * * * * * * * * * * * 1554 * * 601 * * * * 44 0 * * * * * * 1217 0 0 V 45 * * * * * * * * * * * * * * * * * 601 * 1554 45 0 * * * * * * 1217 0 0 S 46 * * * * * * * * * * * * * 1554 * 601 * * * * 46 0 * * * * * * 1217 0 0 N 47 * * * * * * * 1554 * * * 601 * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1217 0 0 F 48 * * * * 601 * * * * 1554 * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1217 0 0 E 49 * * * 601 * * * * * * * * * * 1554 * * * * * 49 0 * * * * * * 1217 0 0 K 50 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1217 0 0 K 51 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1217 0 0 A 52 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 52 0 * * * * * * 1117 0 0 G 53 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1117 0 0 V 54 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 54 0 * * * * * * 1117 0 0 L 55 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1117 0 0 V 56 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 56 0 * * * * * * 1117 0 0 F 57 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1117 0 0 R 58 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 58 0 * * * * * * 1117 0 0 I 59 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1117 0 0 I 60 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1117 0 0 P 61 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1117 0 0 E 62 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1117 0 0 P 63 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1117 0 0 E 64 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1117 0 0 F 65 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1117 0 0 G 66 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1117 0 0 N 67 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1117 0 0 T 68 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 68 0 * * * * * * 1117 0 0 E 69 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1117 0 0 L 70 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1117 0 0 T 71 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 71 0 * * * * * * 1117 0 0 I 72 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 72 0 * * * * * * 1117 0 0 Y 73 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 73 0 * * * * * * 1117 0 0 F 74 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1117 0 0 E 75 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1117 0 0 K 76 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1117 0 0 G 77 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1117 0 0 Y 78 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 78 0 * * * * * * 1117 0 0 Y 79 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 79 0 * * * * * * 1117 0 0 L 80 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1117 0 0 P 81 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1117 0 0 I 82 * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1117 0 0 I 83 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1117 0 0 Q 84 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 84 0 * * * * * * 1117 0 0 T 85 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 85 0 * * * * * * 1117 0 0 I 86 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1117 0 0 L 87 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1117 0 0 E 88 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1117 0 0 D 89 * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1117 0 0 G 90 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1117 0 0 D 91 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1117 0 0 I 92 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1117 0 0 E 93 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1117 0 0 V 94 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 94 0 * * * * * * 1117 0 0 K 95 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1117 0 0 N 96 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1117 0 0 L 97 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1117 0 0 K 98 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1117 0 0 T 99 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 99 0 * * * * * * 1117 0 0 E 100 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1117 0 0 N 101 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1117 0 0 Y 102 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 102 0 * * * * * * 1117 0 0 S 103 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 103 0 * * * * * * 1117 0 0 G 104 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1117 0 0 N 105 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1117 0 0 T 106 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 106 0 * * * * * * 1117 0 0 M 107 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1117 0 0 E 108 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1117 0 0 I 109 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1117 0 0 L 110 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * 110 0 * * * * * * 1117 0 0 G 111 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1117 0 0 D 112 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1117 0 0 V 113 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * 113 0 * * * * * * 1117 0 0 Y 114 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 114 0 * * * * * * 1117 0 0 P 115 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1117 0 0 I 116 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1117 0 0 E 117 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1117 0 0 H 118 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1117 0 0 I 119 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1117 0 0 S 120 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 120 0 * * * * * * 1117 0 0 K 121 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1117 0 0 N 122 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1117 0 0 I 123 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1117 0 0 S 124 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 124 0 * * * * * * 1117 0 0 I 125 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * 125 0 * * * * * * 1117 0 0 I 126 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1117 0 0 Q 127 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 127 0 * * * * * * 1117 0 0 D 128 * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1117 0 0 I 129 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1117 0 0 I 130 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1117 0 0 S 131 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 131 0 * * * * * * 1117 0 0 E 132 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1117 0 0 F 133 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 133 1000 1000 * 0 * * * 1117 1000 0 I 134 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1117 0 0 M 135 * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * 135 0 * * * * * * 1117 0 0 K 136 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1117 0 0 N 137 * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * 137 0 * * * * * * 1117 0 0 K 138 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * 138 0 * * * * * * 1117 0 0 P 139 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1117 0 0 I 140 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1117 0 0 T 141 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * 141 0 * * * * * * 1117 0 0 I 142 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1117 0 0 M 143 * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1117 0 0 I 144 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 144 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //