HHsearch 1.5 NAME c5zzaP_ FAM FILE c5zzaP_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5zzaP_.a3m DATE Sat Oct 13 08:31:48 2018 LENG 119 match states, 119 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4284 0.1176 SEQ >ss_dssp CCHHHHHHHTCSTTEEEEEEEETTSCEEEECTTCCCCHHHHHHHHHHTCSEEEETTEEEEEEEESSSEEEEEETTTTEEEEEEEETTTEEEEEEECTTSC HHHHHHHHHHHHHHHHTTC >sa_dssp EDCEDBACEBDEEDBCBAAAADCEBECDCCAEEBEBEBECAADABDEDCECADBEECEBCCEDCCEEDABACBEEDDABAAAABAEEDAAAAACACDEBD BEEBBEDACEBAEDACEDD >ss_pred CCHHHHHHEEECCCCCCEEEEEEEEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEEEEEEEEECCCEEEEEECCCCEEEEEEECCCCEEEEEEECCCCC CEEEEEEECHHHHHHHHCC >ss_conf 9976742000015555337799753588855985511057876540688308996325888870645178761377704888841773899999858987 1369999703477777409 >Consensus msleqlagrlisgdigatavikmtgeiiyqspnwsvdgvhainvyknrepsiiiqgvkysvidvnedrliatnvggqghivgavaggkalligyvspngd artayiqidktarqlskil >c5zzaP_ MSLEQLAGRLISGDIGATAVIKMTGEIIYQSPNWSVDGVHAINVYKNREPSIIIQGVKYSVIDVNEDRLIATNVGGQGHIVGAVAGGKALLIGYVSPNGD ARTAYIQIDKTARQLSKIL # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 S 2 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 L 3 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 E 4 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 5 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 L 6 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 A 7 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 G 8 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 R 9 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 L 10 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 I 11 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 S 12 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 G 13 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 D 14 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 I 15 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 G 16 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 A 17 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 T 18 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 A 19 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 V 20 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 I 21 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 K 22 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 M 23 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 T 24 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 G 25 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 E 26 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 I 27 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 I 28 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 29 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 29 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 30 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 S 31 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 P 32 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 N 33 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 W 34 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 S 35 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 V 36 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 D 37 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 G 38 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 V 39 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 H 40 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 A 41 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 I 42 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 N 43 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 V 44 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 45 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 45 0 * * * * * * 1000 0 0 K 46 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 N 47 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 R 48 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 E 49 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 P 50 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 S 51 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 I 52 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 I 53 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 I 54 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 55 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 G 56 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 V 57 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 K 58 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 59 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 59 0 * * * * * * 1000 0 0 S 60 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 V 61 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 I 62 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 D 63 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 V 64 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 N 65 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 E 66 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 D 67 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 R 68 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 L 69 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 I 70 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 A 71 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 T 72 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 N 73 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 V 74 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 G 75 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 G 76 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 77 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 G 78 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 H 79 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 I 80 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 V 81 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 G 82 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 A 83 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 V 84 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 A 85 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 G 86 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 G 87 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 K 88 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 A 89 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 L 90 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 L 91 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 I 92 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 G 93 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 94 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 94 0 * * * * * * 1000 0 0 V 95 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 S 96 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 P 97 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 N 98 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 G 99 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 D 100 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 A 101 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 R 102 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 T 103 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 A 104 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 105 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 105 0 * * * * * * 1000 0 0 I 106 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 107 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 I 108 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 D 109 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 K 110 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 T 111 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 A 112 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 R 113 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 114 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 L 115 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 S 116 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 K 117 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 I 118 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 L 119 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 119 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //