HHsearch 1.5 NAME c5xweB_ FAM FILE c5xweB_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5xweB_.a3m DATE Sat Jul 14 08:18:07 2018 LENG 52 match states, 52 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.3 EVD 0.5136 3.2610 SEQ >ss_dssp CEECCBCCCEECCTTCCCEEEEECCEEEEESCCSSSCCSEEEEECSTTCCCC >sa_dssp DDACDCEDECEBEEEDDBABCADCEECBABBCCEECEEEEDECBEEDDCAEE >ss_pred CCCCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCC >ss_conf 9001233310076741104332110011768877778845889722335579 >Consensus riclkqxtttxcxxgexxcyxxxwxxexgcgcpxxxpxxxlxcckxdxcnkg >c5xweB_ RICLKQETTTTCPEGEDACYNLFWKIEMGCGCPKTEPYTNLYCCKIDSCNKG >UniRef50_P25497(33-82:83) Short neurotoxin 1 n=65 Tax=Colubroidea RepID=NXS1_PSEAU E=0.0005 s/c=0.91 id=51% cov=87% ------KTTTICAGGESSCYKKTWsdhrgsRTERGCGCPHVKPGIKLTCCKTDECN-- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * R 1 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 I 2 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 C 3 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 L 4 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 K 5 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 6 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 E 7 * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1392 0 0 T 8 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 8 0 * * * * * * 1392 0 0 T 9 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 9 0 * * * * * * 1392 0 0 T 10 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 10 0 * * * * * * 1392 0 0 T 11 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * 11 0 * * * * * * 1392 0 0 C 12 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1392 0 0 P 13 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1392 0 0 E 14 * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1392 0 0 G 15 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1392 0 0 E 16 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1392 0 0 D 17 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 17 0 * * * * * * 1392 0 0 A 18 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 18 0 * * * * * * 1392 0 0 C 19 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1392 0 0 Y 20 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 20 0 * * * * * * 1392 0 0 N 21 * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1392 0 0 L 22 * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1392 0 0 F 23 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 23 0 * * * * * * 1392 0 0 W 24 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 24 1000 1000 * 2585 263 * * 1392 1000 0 K 25 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 25 0 * * * * * * 1392 0 0 I 26 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * 26 0 * * * * * * 1392 0 0 E 27 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1392 0 0 M 28 * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * * 28 0 * * * * * * 1392 0 0 G 29 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1392 0 0 C 30 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1392 0 0 G 31 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1392 0 0 C 32 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1392 0 0 P 33 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1392 0 0 K 34 * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1392 0 0 T 35 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * 35 0 * * * * * * 1392 0 0 E 36 * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1392 0 0 P 37 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1392 0 0 Y 38 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 38 0 * * * * * * 1392 0 0 T 39 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * 39 0 * * * * * * 1392 0 0 N 40 * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1392 0 0 L 41 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1392 0 0 Y 42 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 42 0 * * * * * * 1392 0 0 C 43 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1392 0 0 C 44 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1392 0 0 K 45 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1392 0 0 I 46 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * 46 0 * * * * * * 1392 0 0 D 47 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1392 0 0 S 48 * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 48 0 * * * * * * 1392 0 0 C 49 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1392 0 0 N 50 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1392 0 0 K 51 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 G 52 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //