HHsearch 1.5 NAME c5wk1L_ FAM FILE c5wk1L_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5wk1L_.a3m DATE Sat Jan 20 10:26:03 2018 LENG 148 match states, 148 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.3 EVD 0.4189 -0.4605 SEQ >ss_dssp CCSCCCCSCCCCSSCCCEEECCBCSSCCCTTCBEEECSTTBEEECCCCTTCCCCCCEEECCCCGGGTCCSSCCCCTTSBCCEEECCTTCEEEEEECSSEE CCSTTCEEEECTTSCEECCCTTTSCCCEEECCCCEECSTTEEEEEECC >sa_dssp EEEECEDACDAEEEDEDDDCECDAEDDBDBACABCDDEEEBACCCEDDCECEECDBAAABCBDEEEEBCCEDDBEEEDEBCAACBDECBDABABACDECE BEEEDCCAABCCEACACCCEEEDBCDBACACCECEBEEEDCBACACBE >ss_pred CCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEECCCCCEEECCCCEEEEECCCEEEEEEECCCEEEEEECCCCC EEECCEEEEEECCCCEECCCCCCCCEEEEEHEEEEEECCCEEEEEEEC >ss_conf 9866650798154107788976875204673022101488168887404432440578626842000245337865001214323137313542000110 010120578607875351683211000111100022034418998519 >Consensus mansknsifvggagrvkqtieGlaxxAxxxGqLlAxaxxDxixVTAxxxTtxGxExxxCdxQPqtlxxxtxVxxxAgdxxxxixVlxGxxVllsfAATqx VxxxGaAVAxxxDGxfklgnpateqtfavteeiinvttagtlvlcrai >c5wk1L_ MANSKNSIFVGGAGRVKQTIEGLAQSAFKPGQLLARAAGDAIDVTAKASTTYGNEFLICDDQPQTLGGGTDVAVTAGDTVQAISVLPGQYVLLSFAATQN VTTKGAAVASNGDGNFKLGNPATEQTFAVTEEIINVTTAGTLVLCRAI >UniRef50_A9V547(366-453:599) Predicted protein n=1 Tax=Monosiga brevicollis RepID=A9V547_MONBE E=3e-05 s/c=0.56 id=34% cov=60% ---------------------GITSLAYENGKLIAGSLDDRVTVTAVDGTAFGTESFACESQPKAVAVASGVIAVA--CFNHVMVIKGGAV----AATKS VDFEGSAVAVSNDGS--------------------------------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 A 2 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 N 3 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 S 4 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 K 5 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 N 6 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 S 7 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 I 8 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 F 9 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 V 10 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 G 11 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 G 12 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 A 13 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 G 14 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 R 15 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 V 16 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 K 17 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 18 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 T 19 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 I 20 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 E 21 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 G 22 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1532 0 0 L 23 * * * * * * * 1095 * 911 * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1532 0 0 A 24 911 * * * * * * * * * * * * * * * 1095 * * * 24 0 * * * * * * 1532 0 0 Q 25 * * * * * * * * * * * * * 911 * 1095 * * * * 25 0 * * * * * * 1532 0 0 S 26 * * * * * * * * * 1095 * * * * * 911 * * * * 26 0 * * * * * * 1532 0 0 A 27 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1532 0 0 F 28 * * * * 911 * * * * * * * * * * * * * * 1095 28 0 * * * * * * 1532 0 0 K 29 * * * 1095 * * * * 911 * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1532 0 0 P 30 * * * * * * * * * * * 1095 911 * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1532 0 0 G 31 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1532 0 0 Q 32 * * * * * * * * 1095 * * * * 911 * * * * * * 32 0 * * * * * * 1532 0 0 L 33 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1532 0 0 L 34 * * * * * * * 1095 * 911 * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1532 0 0 A 35 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1532 0 0 R 36 * * * * * 1095 * * * * * * * * 911 * * * * * 36 0 * * * * * * 1532 0 0 A 37 911 * * * * * * * * * * * * * * 1095 * * * * 37 0 * * * * * * 1532 0 0 A 38 911 * * * * * * * * 1095 * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1532 0 0 G 39 * * 1095 * * 911 * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1532 0 0 D 40 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1532 0 0 A 41 911 * * * * * * * * * * * * * 1095 * * * * * 41 0 * * * * * * 1532 0 0 I 42 * * * * * * * 911 * * * * * * * * * 1095 * * 42 0 * * * * * * 1532 0 0 D 43 * * 911 * * * * * * * * * * * * * 1095 * * * 43 0 * * * * * * 1532 0 0 V 44 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 44 0 * * * * * * 1532 0 0 T 45 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 45 0 * * * * * * 1532 0 0 A 46 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1532 0 0 K 47 * * * * * * * * 911 * * * * * * * * 1095 * * 47 0 * * * * * * 1532 0 0 A 48 911 * 1095 * * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1532 0 0 S 49 * * * * * 1095 * * * * * * * * * 911 * * * * 49 0 * * * * * * 1532 0 0 T 50 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 50 0 * * * * * * 1532 0 0 T 51 1095 * * * * * * * * * * * * * * * 911 * * * 51 0 * * * * * * 1532 0 0 Y 52 * * * * 1095 * * * * * * * * * * * * * * 911 52 0 * * * * * * 1532 0 0 G 53 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1532 0 0 N 54 * * * * * * * * * * * 911 * * * * 1095 * * * 54 0 * * * * * * 1532 0 0 E 55 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1532 0 0 F 56 * * * * 911 * * * * * * * * * * 1095 * * * * 56 0 * * * * * * 1532 0 0 L 57 * * * * 1095 * * * * 911 * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1532 0 0 I 58 1095 * * * * * * 911 * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1532 0 0 C 59 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1532 0 0 D 60 * * 911 1095 * * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1532 0 0 D 61 * * 911 * * * * * * * * * * * * 1095 * * * * 61 0 * * * * * * 1532 0 0 Q 62 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 62 0 * * * * * * 1532 0 0 P 63 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1532 0 0 Q 64 * * * * * * * * 1095 * * * * 911 * * * * * * 64 0 * * * * * * 1532 0 0 T 65 1095 * * * * * * * * * * * * * * * 911 * * * 65 0 * * * * * * 1532 0 0 L 66 * * * * * * * * * 911 * * * * * * * 1095 * * 66 0 * * * * * * 1532 0 0 G 67 1095 * * * * 911 * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1532 0 0 G 68 * * * * * 911 * * * * * * * * * * * 1095 * * 68 0 * * * * * * 1532 0 0 G 69 1095 * * * * 911 * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1532 0 0 T 70 * * * * * * * * * * * * * * * 1095 911 * * * 70 0 * * * * * * 1532 0 0 D 71 * * 911 * * 1095 * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1532 0 0 V 72 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 72 0 * * * * * * 1532 0 0 A 73 911 * * * * * * 1095 * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1532 0 0 V 74 1095 * * * * * * * * * * * * * * * * 911 * * 74 0 * * * * * * 1532 0 0 T 75 * * * * * * * * * * * * * * * * 911 1095 * * 75 0 * * * * * * 1532 0 0 A 76 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 76 911 * 1095 * * * * 1532 0 0 G 77 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * 0 1000 0 1000 D 78 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 T 79 * 1095 * * * * * * * * * * * * * * 911 * * * 79 0 * * * * * * 1532 0 0 V 80 * * * * 1095 * * * * * * * * * * * * 911 * * 80 0 * * * * * * 1532 0 0 Q 81 * * * * * * * * * * * 1095 * 911 * * * * * * 81 0 * * * * * * 1532 0 0 A 82 911 * * * * * 1095 * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1532 0 0 I 83 * * * * * * * 911 * * * * * * * * * 1095 * * 83 0 * * * * * * 1532 0 0 S 84 * * * * * * * * * * 1095 * * * * 911 * * * * 84 0 * * * * * * 1532 0 0 V 85 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 85 0 * * * * * * 1532 0 0 L 86 * * * * * * * 1095 * 911 * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1532 0 0 P 87 * * * * * * * * 1095 * * * 911 * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1532 0 0 G 88 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1532 0 0 Q 89 * * * * * 1095 * * * * * * * 911 * * * * * * 89 0 * * * * * * 1532 0 0 Y 90 1095 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 911 90 0 * * * * * * 1532 0 0 V 91 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 91 911 * 1095 * * * * 1532 0 0 L 92 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * 0 1000 0 1000 L 93 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * 0 1000 0 1000 S 94 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 94 0 * * * * * 0 1000 0 1000 F 95 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 A 96 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1532 0 0 A 97 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1532 0 0 T 98 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 98 0 * * * * * * 1532 0 0 Q 99 * * * * * * * * 1095 * * * * 911 * * * * * * 99 0 * * * * * * 1532 0 0 N 100 * * * * * * * * * * * 911 * * * 1095 * * * * 100 0 * * * * * * 1532 0 0 V 101 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 101 0 * * * * * * 1532 0 0 T 102 * * 1095 * * * * * * * * * * * * * 911 * * * 102 0 * * * * * * 1532 0 0 T 103 * * * * 1095 * * * * * * * * * * * 911 * * * 103 0 * * * * * * 1532 0 0 K 104 * * * 1095 * * * * 911 * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1532 0 0 G 105 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1532 0 0 A 106 911 * * * * * * * * * * * * * * 1095 * * * * 106 0 * * * * * * 1532 0 0 A 107 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1532 0 0 V 108 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 108 0 * * * * * * 1532 0 0 A 109 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1532 0 0 S 110 * * * * * * * * * * * * * * * 911 * 1095 * * 110 0 * * * * * * 1532 0 0 N 111 * * * * * * * * * * * 911 * * * 1095 * * * * 111 0 * * * * * * 1532 0 0 G 112 * * * * * 911 * * * * * 1095 * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1532 0 0 D 113 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1532 0 0 G 114 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1532 0 0 N 115 * * * * * * * * * * * 911 * * * 1095 * * * * 115 0 * * * * * * 1532 0 0 F 116 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 K 117 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 L 118 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 G 119 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 N 120 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 P 121 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 A 122 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 T 123 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 E 124 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 125 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 T 126 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 F 127 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 A 128 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 V 129 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 T 130 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 E 131 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 E 132 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 I 133 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 I 134 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 N 135 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 V 136 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 T 137 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 T 138 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 A 139 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 G 140 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 T 141 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 L 142 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 V 143 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 L 144 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 C 145 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 R 146 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 A 147 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1000 0 0 I 148 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 148 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //