HHsearch 1.5 NAME c5whvF_ FAM FILE c5whvF_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5whvF_.a3m DATE Sat Oct 28 08:55:04 2017 LENG 119 match states, 119 columns in multiple alignment FILT 4 out of 8 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.0 EVD 0.4244 0.1827 SEQ >ss_dssp CCTTCSCEEEEEEEEEEEEEEEEETTEEEEEEEEEEEBTTBCCSSCEEEEETTSSSCCTTHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEESSCCCCHHHHHHSCSCE EEEEEEEEETTEESSCCCC >sa_dssp EDECCDDCCCCABBCECDDCECEBEEDEBCBAAABACDDEDECECDCAAAACCCCDCDEDBEECBDDADECDEDDCDABAABCDECBECEEBCEEDBCBA ABBBCCCECEEDBEDDEDE >ss_pred CCCCCCCEECCEEEEEEEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCEEEEEECCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHCCCC EEEEEECCCCCCCCCCCCC >ss_conf 9422221003537753322476077755506998850578767606899861343310048989840125565086289997278336831553216771 3789722576500277899 >Consensus xxxxxxxYxSxvxitxfxxGxixxGxxxxxyFCvxxkxxxqxxxxxxaCxvxnxsxwxxsfxxxxxqAxYyYxTgqxvRiYykxnVWTxxxFtxafSxna lvgxstCtssxxCxGPtxp >c5whvF_ NMADYNTYQSNVQINNLSYGVYRSGDKESQFFCVGLKRGSQVPNVHTICKIDVFGTHKQGFDNMLATARYYYATGEDVRIYYKENVWTDRNFTAAFSGNE LIAITTCTSSDYCMGPTLP >UniRef50_A9ML83(31-141:151) Putative uncharacterized protein n=6 Tax=Salmonella enterica RepID=A9ML83_SALAR E=1e-16 s/c=0.79 id=33% cov=92% ------SYFSHEVISEFHVGQIDGGA----YFCIkAVKADGSSSTPLIACSVSNKSVWAPSFKVLLEQARYFYVTEQSVRIYYDHNVWTNQPFVNTFSTN ALVGLSSCSSaATDCFGPGKP >UniRef50_Q6EZC3(34-135:141) SubB n=20 Tax=Enterobacteriaceae RepID=Q6EZC3_ECOLX E=7e-16 s/c=0.84 id=33% cov=87% --------FSGVVITQFHTGQIDN----KPYFCIEGKQSA--GSSISACSMKNSSVWGASFSTLYNQALYFYTTGQPVRIYYKPGVWTYPPFVKALTSNA LVGLSTCTTSTECFGP--- >UniRef50_C0B0U4(29-131:133) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Proteus penneri ATCC 35198 RepID=C0B0U4_9ENTR E=6e-32 s/c=1.34 id=33% cov=86% -------YYSNVTLTDFNSGKIEDG----RYFCVkAMNHGGQF----IACAVSNKSDWASSYEHFFQQAHYYYTTGKSFRLYVQPNVWTHPKFTRVYSNK AIAGFASCHNSR-CMGPT-- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * N 1 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 M 2 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 A 3 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 D 4 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 5 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 5 0 * * * * * * 1000 0 0 N 6 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 T 7 * * * * * * * * * * * * * * * 1052 950 * * * 7 0 * * * * * * 1564 0 0 Y 8 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 8 0 * * * * * * 1882 0 0 Q 9 * * * * 1140 * * * * * * * * 1721 * * * * * 2041 9 0 * * * * * * 2100 0 0 S 10 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 10 0 * * * * * * 2100 0 0 N 11 * * * * * 2150 2130 * * * * 872 * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 2100 0 0 V 12 * * * 2130 * * * * * * * * * * * * * 374 * * 12 0 * * * * * * 2100 0 0 Q 13 * * * * * * * * * * * * * 1721 * * 2041 1140 * * 13 0 * * * * * * 2100 0 0 I 14 * * * * * * * 402 * 2041 * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 2100 0 0 N 15 * * * * * * * * * * * 1721 * * * 2130 1094 * * * 15 0 * * * * * * 2100 0 0 N 16 * * 2041 2130 * * * * * * * 1721 * 2150 * * * * * * 16 0 * * * * * * 2100 0 0 L 17 * * * * 521 * * * * 1721 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 2100 0 0 S 18 * * * * * * 1140 * * * * 2041 * * * 1721 * * * * 18 0 * * * * * * 2100 0 0 Y 19 * * * * * * * * * * * * * * * 2041 2150 2130 * 1721 19 0 * * * * * * 2100 0 0 G 20 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 2100 0 0 V 21 * * * * * * * * 2041 * * * * 1140 * * * 1721 * * 21 0 * * * * * * 2100 0 0 Y 22 * * * * * * * 521 * * * * * * * * * * * 1721 22 0 * * * * * * 2100 0 0 R 23 * * 1140 2041 * * * * * * * * * * 1721 * * * * * 23 0 * * * * * * 2100 0 0 S 24 * * 2041 * * 2130 * * * * * 2150 * * * 1721 * * * * 24 368 * 2150 * * * * 2100 0 0 G 25 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 25 519 * 1726 * * * 0 1882 0 1000 D 26 1052 * 950 * * * * * * * * * * * * * * * * * 26 950 * 1052 * * * 0 1564 0 1476 K 27 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * 0 1000 0 1708 E 28 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * 1609 573 1000 0 1708 S 29 * * * * * * * * 1082 * * * * * * 922 * * * * 29 0 * * * * 1069 934 1546 0 1446 Q 30 * * * * * * * * * * * * 1664 1421 1685 * * * * * 30 0 * * * * 0 * 1910 0 1000 F 31 * * * * 1721 * * * * * * * * * * * * * * 521 31 0 * * * * * * 2100 0 0 F 32 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 2100 0 0 C 33 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 2100 0 0 V 34 * * * * * * * 1140 * * * * * * * * * 872 * * 34 920 1085 * 0 * * * 2100 1446 0 G 35 1085 * * 2150 * 1721 * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 2100 0 0 L 36 * * * * * 2150 * * * 1721 2041 * * * * * * 2130 * * 36 0 * * * * * * 2100 0 0 K 37 * * * * * * * * 402 * * 2041 * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 2100 0 0 R 38 2130 * * * * * 2041 * * * * * * 2150 1721 * * * * * 38 0 * * * * * * 2100 0 0 G 39 * * 2130 * * 872 * * * * * * * * * 2150 * * * * 39 0 * * * * * * 2100 0 0 S 40 2150 * * * * 1085 * * * * * * * * * 1721 * * * * 40 368 * 2150 * * * * 2100 0 0 Q 41 * * * * * * * * * * * * * 562 * 1632 * * * * 41 0 * * * * * 0 1882 0 1000 V 42 * * * * 1726 * * * * * * * * * * 1632 * 1415 * * 42 519 * 1726 * * 0 * 1882 0 1000 P 43 * * * * * 1740 * * * * * * 1360 * * 1685 * * * * 43 0 * * * * * 0 1820 0 1000 N 44 * * * * * * * * * * * 1360 * * * 1740 1685 * * * 44 0 * * * * * 0 1820 0 1000 V 45 * * * * * * * * * * * * 1685 * * 1740 * 1360 * * 45 0 * * * * * 0 1820 0 1000 H 46 * * * * * * 1360 1740 * 1685 * * * * * * * * * * 46 0 * * * * 0 * 1820 0 1000 T 47 * * * * * * * 1085 * * * * * * * 2150 1721 * * * 47 0 * * * * * * 2100 0 0 I 48 521 * * * * * * 1721 * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 2100 0 0 C 49 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 2100 0 0 K 50 2041 * * * * * * * 1721 * * * * * * 1140 * * * * 50 0 * * * * * * 2100 0 0 I 51 * * * * * * * 1721 * * 2150 * * * * * * 1085 * * 51 0 * * * * * * 2100 0 0 D 52 * * 1721 * * * * * 2150 * * * * * * 1085 * * * * 52 0 * * * * * * 2100 0 0 V 53 * * * * * * * * * * * 521 * * * * * 1721 * * 53 0 * * * * * * 2100 0 0 F 54 * * * * 1721 * * * 1085 * * * * * * 2150 * * * * 54 0 * * * * * * 2100 0 0 G 55 * * * * * 1721 * * * * * * * * * 521 * * * * 55 0 * * * * * * 2100 0 0 T 56 * * 2041 * * * * * * * * * * * * * 1721 1140 * * 56 0 * * * * * * 2100 0 0 H 57 * * * * * * 1721 * * * * * * * * * * * 521 * 57 0 * * * * * * 2100 0 0 K 58 1085 * * * * 2150 * * 1721 * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 2100 0 0 Q 59 2150 * * * * * * * * * * * 2130 1721 * 2041 * * * * 59 0 * * * * * * 2100 0 0 G 60 * * * * * 1721 * * * * * * * * * 521 * * * * 60 0 * * * * * * 2100 0 0 F 61 * * * * 402 * * * * * * * * * * * * * * 2041 61 0 * * * * * * 2100 0 0 D 62 * * 1721 2041 * * * * 2130 * * * * * * 2150 * * * * 62 0 * * * * * * 2100 0 0 N 63 * * * * * * 2041 * * * * 1721 * * * * 2150 2130 * * 63 0 * * * * * * 2100 0 0 M 64 * * * * 2041 * * * * 1140 1721 * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 2100 0 0 L 65 * * * * 2041 * * * * 911 * * * * * * * * * 2150 65 0 * * * * * * 2100 0 0 A 66 1721 * * 2130 * * * * * * * 2150 * 2041 * * * * * * 66 0 * * * * * * 2100 0 0 T 67 * * * * * * * * * * * * * 521 * * 1721 * * * 67 0 * * * * * * 2100 0 0 A 68 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 2100 0 0 R 69 * * * * * * 2041 * * 2150 * * * * 911 * * * * * 69 0 * * * * * * 2100 0 0 Y 70 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 70 0 * * * * * * 2100 0 0 Y 71 * * * * 1140 * * * * * * * * * * * * * * 872 71 0 * * * * * * 2100 0 0 Y 72 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 72 0 * * * * * * 2100 0 0 A 73 1721 * * * * * * * * * * * * * * * 1094 2130 * * 73 0 * * * * * * 2100 0 0 T 74 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 74 0 * * * * * * 2100 0 0 G 75 * * * 2130 * 374 * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 2100 0 0 E 76 * * * 1721 * * * * 2041 * * * * 1140 * * * * * * 76 0 * * * * * * 2100 0 0 D 77 * * 1721 * * * * * * * * * 2150 * * 1085 * * * * 77 0 * * * * * * 2100 0 0 V 78 * * * * 2041 * * * * * * * * * * * * 402 * * 78 0 * * * * * * 2100 0 0 R 79 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 79 0 * * * * * * 2100 0 0 I 80 * * * * * * * 402 * 2041 * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 2100 0 0 Y 81 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 81 0 * * * * * * 2100 0 0 Y 82 * * * * * * * * * * * * * * * * * 2041 * 402 82 0 * * * * * * 2100 0 0 K 83 * * 2130 * * * * * 920 * * * * 2041 * * * * * * 83 0 * * * * * * 2100 0 0 E 84 * * * 1721 * * 2130 * * * * * 1094 * * * * * * * 84 0 * * * * * * 2100 0 0 N 85 * * * * * 2150 * * * * * 368 * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 2100 0 0 V 86 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 86 0 * * * * * * 2100 0 0 W 87 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 87 0 * * * * * * 2100 0 0 T 88 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 88 0 * * * * * * 2100 0 0 D 89 * * 1721 * * * 2041 * * * * 2130 * * * * * * * 2150 89 0 * * * * * * 2100 0 0 R 90 * * * * * * * * * * * * 1094 2130 1721 * * * * * 90 0 * * * * * * 2100 0 0 N 91 * * * * * * * * 2041 * * 1721 1140 * * * * * * * 91 0 * * * * * * 2100 0 0 F 92 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 2100 0 0 T 93 * * * * * * * * * * * * * * * * 872 1140 * * 93 0 * * * * * * 2100 0 0 A 94 1721 * * * * * * * 2150 * * 2130 * * 2041 * * * * * 94 0 * * * * * * 2100 0 0 A 95 920 * * * * * * * * * * * * * * * 2130 2041 * * 95 0 * * * * * * 2100 0 0 F 96 * * * * 911 * * * * 2150 * * * * * * * * * 2041 96 0 * * * * * * 2100 0 0 S 97 * * * * * * * * * * * * * * * 368 2150 * * * 97 0 * * * * * * 2100 0 0 G 98 * * * * * 1721 * * * * * 2041 * * * 2150 2130 * * * 98 0 * * * * * * 2100 0 0 N 99 * * * * * * * * 2041 * * 402 * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 2100 0 0 E 100 521 * * 1721 * * * * * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 2100 0 0 L 101 * * * * * * * 2041 * 402 * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 2100 0 0 I 102 2041 * * * * * * 1721 * * * * * * * * * 1140 * * 102 0 * * * * * * 2100 0 0 A 103 1721 * * * * 521 * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 2100 0 0 I 104 * * * * 2041 * * 1721 * 1140 * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 2100 0 0 T 105 2041 * * * * * * * * * * * * * * 1140 1721 * * * 105 0 * * * * * * 2100 0 0 T 106 * * * * * * * * * * * * * * * 1085 920 * * * 106 0 * * * * * * 2100 0 0 C 107 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 2100 0 0 T 108 * * * * * * 2041 * * * * * * * * 2130 920 * * * 108 0 * * * * * * 2100 0 0 S 109 * * * * * * * * * * * 2041 * * * 911 2150 * * * 109 374 2130 * 0 * * * 2100 1000 0 S 110 2130 * * * * * * * * * * * * * * 374 * * * * 110 0 * * * * * * 2100 0 0 D 111 * * 1721 * * * * * * * * * * * 2041 * 1140 * * * 111 402 * 2041 * * * * 2100 0 0 Y 112 * * 1685 1740 * * * * * * * * * * * * * * * 1360 112 0 * * * * 0 * 1820 0 1000 C 113 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 2100 0 0 M 114 * * * * 1140 * * * * * 872 * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 2100 0 0 G 115 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 2100 0 0 P 116 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 116 0 * * * * * * 2100 0 0 T 117 * * * * * 1632 * * * * * * * * * * 562 * * * 117 0 * * * * * * 1882 0 0 L 118 * * * * * * * * 1052 950 * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1564 0 0 P 119 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 119 0 * * 0 * * * 1564 0 0 //