HHsearch 1.5 NAME c5wcoC_ FAM FILE c5wcoC_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5wcoC_.a3m DATE Sat Aug 19 08:29:07 2017 LENG 196 match states, 196 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.3927 -2.0684 SEQ >ss_dssp CCHHHHHHHHCGGGTTSCSSHHHHHHHHHHSCCCHHHHHHHHHHHHHHTCSCGGGGSCCCSSSCCCCCSHHHHHHHTTTCHHHHHHHHHHSCCCSHHHHH HHHHHHHHHHTTSSSCSCCCCTHHHHHHHHHSCSSCCSSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCHHHHHHHHHHHHHHHHHSCSTTHHHHHHHHHHHC >sa_dssp EDBBDBACECACCAEEBDEECCCAADCADEDECEDCBABAAAAABBCEECECABECBEEBEEEEEEBECCECADEBBEEDACBBABBABEEDCEDEDBDD ACDCABDBADEECCCDEEDECCECBDDACDDBDEEEBECEDBCEDACECADCBCDCEEEEDDEEDBDECCEDACDAADEBDEECDEDCEDBCEDBE >ss_pred CCHHHHHHHHCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEECCCCCCHHHHH HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECC >ss_conf 9877889862204540899879999999720048057876467886147786268831689975643209989864532110347777548998518999 999999886444087545575001221221137102457889999999998567777503323688878999999986424343632033432029 >Consensus mnesqwiqkhlpcmreanpkprelirhalkkkkrpevvyamgvlltlggesgltvefpvpegktvkvktlnqlvngmisratmtlycvmkdppsgsmatl mrdhirnwlkeesgcqdadggeekwamvygmispdmaeektmlkelktmlhsrmqmyalgasskalenlekaivaavhrlpascstekmvllgylk >c5wcoC_ MNESQWIQKHLPCMREANPKPRELIRHALKKKKRPEVVYAMGVLLTLGGESGLTVEFPVPEGKTVKVKTLNQLVNGMISRATMTLYCVMKDPPSGSMATL MRDHIRNWLKEESGCQDADGGEEKWAMVYGMISPDMAEEKTMLKELKTMLHSRMQMYALGASSKALENLEKAIVAAVHRLPASCSTEKMVLLGYLK # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 N 2 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 E 3 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 S 4 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 5 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 W 6 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 I 7 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 8 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 K 9 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 H 10 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 L 11 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 P 12 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 C 13 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 M 14 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 R 15 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 E 16 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 A 17 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 N 18 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 P 19 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 K 20 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 P 21 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 R 22 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 E 23 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 L 24 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 I 25 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 R 26 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 H 27 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 A 28 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 L 29 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 K 30 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 K 31 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 K 32 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 K 33 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 R 34 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 P 35 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 E 36 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 V 37 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 V 38 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 39 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 39 0 * * * * * * 1000 0 0 A 40 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 M 41 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 G 42 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 V 43 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 L 44 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 L 45 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 T 46 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 L 47 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 G 48 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 G 49 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 E 50 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 S 51 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 G 52 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 L 53 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 T 54 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 V 55 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 E 56 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 F 57 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 P 58 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 V 59 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 P 60 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 E 61 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 G 62 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 K 63 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 T 64 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 V 65 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 K 66 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 V 67 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 K 68 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 T 69 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 L 70 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 N 71 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 72 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 L 73 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 V 74 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 N 75 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 G 76 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 M 77 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 I 78 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 S 79 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 R 80 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 A 81 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 T 82 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 M 83 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 T 84 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 L 85 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 86 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 86 0 * * * * * * 1000 0 0 C 87 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 V 88 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 M 89 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 K 90 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 D 91 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 P 92 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 P 93 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 S 94 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 G 95 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 S 96 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 M 97 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 A 98 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 T 99 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 L 100 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 M 101 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 R 102 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 D 103 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 H 104 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 I 105 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 R 106 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 N 107 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 W 108 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 L 109 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 K 110 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 E 111 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 E 112 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 S 113 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 G 114 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 C 115 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 116 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 D 117 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 A 118 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 D 119 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 G 120 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 G 121 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 E 122 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 E 123 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 K 124 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 W 125 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 A 126 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 M 127 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 V 128 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 129 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 129 0 * * * * * * 1000 0 0 G 130 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 M 131 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 I 132 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 S 133 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 P 134 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 D 135 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 M 136 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 A 137 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 E 138 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 E 139 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 K 140 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 T 141 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 M 142 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 L 143 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 K 144 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 E 145 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 L 146 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 K 147 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1000 0 0 T 148 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 148 0 * * * * * * 1000 0 0 M 149 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1000 0 0 L 150 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1000 0 0 H 151 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1000 0 0 S 152 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 152 0 * * * * * * 1000 0 0 R 153 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 153 0 * * * * * * 1000 0 0 M 154 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 154 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 155 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 155 0 * * * * * * 1000 0 0 M 156 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 156 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 157 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 157 0 * * * * * * 1000 0 0 A 158 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 158 0 * * * * * * 1000 0 0 L 159 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 159 0 * * * * * * 1000 0 0 G 160 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 160 0 * * * * * * 1000 0 0 A 161 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 161 0 * * * * * * 1000 0 0 S 162 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 162 0 * * * * * * 1000 0 0 S 163 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 163 0 * * * * * * 1000 0 0 K 164 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 164 0 * * * * * * 1000 0 0 A 165 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 165 0 * * * * * * 1000 0 0 L 166 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 166 0 * * * * * * 1000 0 0 E 167 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 167 0 * * * * * * 1000 0 0 N 168 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 168 0 * * * * * * 1000 0 0 L 169 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 169 0 * * * * * * 1000 0 0 E 170 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 170 0 * * * * * * 1000 0 0 K 171 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 171 0 * * * * * * 1000 0 0 A 172 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 172 0 * * * * * * 1000 0 0 I 173 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 173 0 * * * * * * 1000 0 0 V 174 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 174 0 * * * * * * 1000 0 0 A 175 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 175 0 * * * * * * 1000 0 0 A 176 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 176 0 * * * * * * 1000 0 0 V 177 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 177 0 * * * * * * 1000 0 0 H 178 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 178 0 * * * * * * 1000 0 0 R 179 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 179 0 * * * * * * 1000 0 0 L 180 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 180 0 * * * * * * 1000 0 0 P 181 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 181 0 * * * * * * 1000 0 0 A 182 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 182 0 * * * * * * 1000 0 0 S 183 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 183 0 * * * * * * 1000 0 0 C 184 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 184 0 * * * * * * 1000 0 0 S 185 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 185 0 * * * * * * 1000 0 0 T 186 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 186 0 * * * * * * 1000 0 0 E 187 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 187 0 * * * * * * 1000 0 0 K 188 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 188 0 * * * * * * 1000 0 0 M 189 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 189 0 * * * * * * 1000 0 0 V 190 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 190 0 * * * * * * 1000 0 0 L 191 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 191 0 * * * * * * 1000 0 0 L 192 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 192 0 * * * * * * 1000 0 0 G 193 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 193 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 194 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 194 0 * * * * * * 1000 0 0 L 195 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 195 0 * * * * * * 1000 0 0 K 196 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 196 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //