HHsearch 1.5 NAME c5vi4A_ FAM FILE c5vi4A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5vi4A_.a3m DATE Sat Sep 30 08:15:36 2017 LENG 146 match states, 146 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.3 EVD 0.4043 -1.3049 SEQ >ss_dssp CCCEEEEEEEEETTSCEEEEECCCEEEEECCCTTCCCCCEEEEEEEEEEECTTSCTTCCCEEEEEEEEESSCTTCEEEECTTTCBEEEECCCCGGGCEEE EECSSSCEEEEESSSTTEEEEEETTEEEEEECCTTTGGGGCEEEEC >sa_dssp EDEEDDDBCBCADDECBBCBDEEDEBDADEDDEEEEDCCBBABCBEAECECEEDDEEEECDCDBAAAAADECDEBBABACDDEDCBCCDEECDDCABABC BEDCEDCBAACACDCEDBBAACDEDEBBBCECEEECCCCABACCCE >ss_pred CCHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEEEEECCCCCHHHCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEECCCCEEEEEE EECCCCEEEEEECCCCEEEEEEECCCEEEEEECCCCCCEEEEEECC >ss_conf 9311100100124774379999999983003563010023434323888865456875621899984556562178962586015897636863047777 6155753555413687048875067078774035443214545429 >Consensus sxxtxxxaslstyndqsvsfxleyxixvxdxxkdxxxdxvllxyyesxxpxxxsgdgvdgkxlmvxxspxkdtdxwlhanxkxxsvelxxxxpxqaffvl hxxxsxxvsfexkxxpgxxigvkdnxlalvxxxxxxsxnixfklsx >c5vi4A_ SLLTQSPASLSTYNDQSVSFVLEYVINVDDSGKDQEQDQVLLRYYESPSPASQSGDGVDGKKLMVNMSPIKDTDIWLHANDKDYSVELQRSPPEQAFFVL HKKSSDFVSFESKNLPGTYIGVKDNQLALVEEKDESSNNIMFKLSK >UniRef50_O95760(117-269:270) Interleukin-33 n=11 Tax=Eutheria RepID=IL33_HUMAN E=2e-57 s/c=1.45 id=59% cov=99% SPITEYLASLSTYNDQSITFALEdesYEIYVEDLKKDEKKDKVLLSYYESQHPSNESGDGVDGKMLMVTLSPTK--DFWLHANNKEHSVELHKCEkplPD QAFFVLHNMHSNCVSFECKTDPGVFIGVKDNHLALIKvdsSENLCTENILFKLSE # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 1 0 * * * * * * 1317 0 0 L 2 * * * * * * * * * 980 * * 1020 * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1317 0 0 L 3 * * * * * * * 1020 * 980 * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1317 0 0 T 4 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 4 0 * * * * * * 1317 0 0 Q 5 * * * 1020 * * * * * * * * * 980 * * * * * * 5 0 * * * * * * 1317 0 0 S 6 * * * * * * * * * * * * * * * 980 * * * 1020 6 0 * * * * * * 1317 0 0 P 7 * * * * * * * * * 1020 * * 980 * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1317 0 0 A 8 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1317 0 0 S 9 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 9 0 * * * * * * 1317 0 0 L 10 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1317 0 0 S 11 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 11 0 * * * * * * 1317 0 0 T 12 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 12 0 * * * * * * 1317 0 0 Y 13 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 13 0 * * * * * * 1317 0 0 N 14 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1317 0 0 D 15 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1317 0 0 Q 16 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 16 0 * * * * * * 1317 0 0 S 17 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 17 0 * * * * * * 1317 0 0 V 18 * * * * * * * 1020 * * * * * * * * * 980 * * 18 0 * * * * * * 1317 0 0 S 19 * * * * * * * * * * * * * * * 980 1020 * * * 19 0 * * * * * * 1317 0 0 F 20 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1317 0 0 V 21 1020 * * * * * * * * * * * * * * * * 980 * * 21 0 * * * * * * 1317 0 0 L 22 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1317 0 0 E 23 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 23 980 1020 * 1585 585 * * 1317 1000 0 Y 24 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 24 0 * * * * * * 1317 0 0 V 25 * * * 1020 * * * * * * * * * * * * * 980 * * 25 0 * * * * * * 1317 0 0 I 26 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1317 0 0 N 27 * * * * * * * * * * * 980 * * * * * * * 1020 27 0 * * * * * * 1317 0 0 V 28 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 28 0 * * * * * * 1317 0 0 D 29 * * 980 1020 * * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1317 0 0 D 30 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1317 0 0 S 31 * * * * * * * * * 1020 * * * * * 980 * * * * 31 0 * * * * * * 1317 0 0 G 32 * * * * * 980 * * 1020 * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1317 0 0 K 33 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1317 0 0 D 34 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1317 0 0 Q 35 * * * 1020 * * * * * * * * * 980 * * * * * * 35 0 * * * * * * 1317 0 0 E 36 * * * 980 * * * * 1020 * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1317 0 0 Q 37 * * * * * * * * 1020 * * * * 980 * * * * * * 37 0 * * * * * * 1317 0 0 D 38 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1317 0 0 Q 39 * * * * * * * * 1020 * * * * 980 * * * * * * 39 0 * * * * * * 1317 0 0 V 40 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 40 0 * * * * * * 1317 0 0 L 41 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1317 0 0 L 42 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1317 0 0 R 43 * * * * * * * * * * * * * * 980 1020 * * * * 43 0 * * * * * * 1317 0 0 Y 44 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 44 0 * * * * * * 1317 0 0 Y 45 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 45 0 * * * * * * 1317 0 0 E 46 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1317 0 0 S 47 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 47 0 * * * * * * 1317 0 0 P 48 * * * * * * * * * * * * 980 1020 * * * * * * 48 0 * * * * * * 1317 0 0 S 49 * * * * * * 1020 * * * * * * * * 980 * * * * 49 0 * * * * * * 1317 0 0 P 50 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1317 0 0 A 51 980 * * * * * * * * * * * * * * 1020 * * * * 51 0 * * * * * * 1317 0 0 S 52 * * * * * * * * * * * 1020 * * * 980 * * * * 52 0 * * * * * * 1317 0 0 Q 53 * * * 1020 * * * * * * * * * 980 * * * * * * 53 0 * * * * * * 1317 0 0 S 54 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 54 0 * * * * * * 1317 0 0 G 55 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1317 0 0 D 56 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1317 0 0 G 57 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1317 0 0 V 58 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 58 0 * * * * * * 1317 0 0 D 59 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1317 0 0 G 60 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1317 0 0 K 61 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1317 0 0 K 62 * * * * * * * * 980 * 1020 * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1317 0 0 L 63 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1317 0 0 M 64 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1317 0 0 V 65 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 65 0 * * * * * * 1317 0 0 N 66 * * * * * * * * * * * 980 * * * * 1020 * * * 66 0 * * * * * * 1317 0 0 M 67 * * * * * * * * * 1020 980 * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1317 0 0 S 68 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 68 0 * * * * * * 1317 0 0 P 69 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1317 0 0 I 70 * * * * * * * 980 * * * * * * * * 1020 * * * 70 0 * * * * * * 1317 0 0 K 71 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 71 980 * 1020 * * * * 1317 0 0 D 72 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * 0 1000 0 1000 T 73 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 73 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 D 74 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1317 0 0 I 75 * * * * 1020 * * 980 * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1317 0 0 W 76 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 76 0 * * * * * * 1317 0 0 L 77 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1317 0 0 H 78 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1317 0 0 A 79 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1317 0 0 N 80 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1317 0 0 D 81 * * 980 * * * * * * * * 1020 * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1317 0 0 K 82 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1317 0 0 D 83 * * 980 1020 * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1317 0 0 Y 84 * * * * * * 1020 * * * * * * * * * * * * 980 84 0 * * * * * * 1317 0 0 S 85 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 85 0 * * * * * * 1317 0 0 V 86 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 86 0 * * * * * * 1317 0 0 E 87 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1317 0 0 L 88 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1317 0 0 Q 89 * * * * * * 1020 * * * * * * 980 * * * * * * 89 0 * * * * * * 1317 0 0 R 90 * * * * * * * * 1020 * * * * * 980 * * * * * 90 0 * * * * * * 1317 0 0 S 91 * 1020 * * * * * * * * * * * * * 980 * * * * 91 0 * * * * * * 1317 0 0 P 92 * * * 1020 * * * * * * * * 980 * * * * * * * 92 980 1020 * 1585 585 * * 1317 1000 0 P 93 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1317 0 0 E 94 * * 1020 980 * * * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1317 0 0 Q 95 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 95 0 * * * * * * 1317 0 0 A 96 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1317 0 0 F 97 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1317 0 0 F 98 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1317 0 0 V 99 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 99 0 * * * * * * 1317 0 0 L 100 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1317 0 0 H 101 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1317 0 0 K 102 * * * * * * * * 980 * * 1020 * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1317 0 0 K 103 * * * * * * * * 980 * 1020 * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1317 0 0 S 104 * * * * * * 1020 * * * * * * * * 980 * * * * 104 0 * * * * * * 1317 0 0 S 105 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 105 0 * * * * * * 1317 0 0 D 106 * * 980 * * * * * * * * 1020 * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1317 0 0 F 107 * 1020 * * 980 * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1317 0 0 V 108 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 108 0 * * * * * * 1317 0 0 S 109 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 109 0 * * * * * * 1317 0 0 F 110 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1317 0 0 E 111 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1317 0 0 S 112 * 1020 * * * * * * * * * * * * * 980 * * * * 112 0 * * * * * * 1317 0 0 K 113 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1317 0 0 N 114 * * * * * * * * * * * 980 * * * * 1020 * * * 114 0 * * * * * * 1317 0 0 L 115 * * 1020 * * * * * * 980 * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1317 0 0 P 116 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1317 0 0 G 117 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1317 0 0 T 118 * * * * * * * * * * * * * * * * 980 1020 * * 118 0 * * * * * * 1317 0 0 Y 119 * * * * 1020 * * * * * * * * * * * * * * 980 119 0 * * * * * * 1317 0 0 I 120 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1317 0 0 G 121 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1317 0 0 V 122 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 122 0 * * * * * * 1317 0 0 K 123 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1317 0 0 D 124 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1317 0 0 N 125 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1317 0 0 Q 126 * * * * * * 1020 * * * * * * 980 * * * * * * 126 0 * * * * * * 1317 0 0 L 127 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1317 0 0 A 128 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1317 0 0 L 129 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1317 0 0 V 130 * * * * * * * 1020 * * * * * * * * * 980 * * 130 0 * * * * * * 1317 0 0 E 131 * * * 980 * * * * 1020 * * * * * * * * * * * 131 980 1020 * 1585 585 * * 1317 1000 0 E 132 * * * 980 * * * * * * * * * * * 1020 * * * * 132 0 * * * * * * 1317 0 0 K 133 * * * 1020 * * * * 980 * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1317 0 0 D 134 * * 980 * * * * * * * * 1020 * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1317 0 0 E 135 * * * 980 * * * * * 1020 * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1317 0 0 S 136 * 1020 * * * * * * * * * * * * * 980 * * * * 136 0 * * * * * * 1317 0 0 S 137 * * * * * * * * * * * * * * * 980 1020 * * * 137 0 * * * * * * 1317 0 0 N 138 * * * 1020 * * * * * * * 980 * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1317 0 0 N 139 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1317 0 0 I 140 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1317 0 0 M 141 * * * * * * * * * 1020 980 * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1317 0 0 F 142 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1317 0 0 K 143 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1317 0 0 L 144 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1317 0 0 S 145 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 145 0 * * * * * * 1317 0 0 K 146 * * * 1020 * * * * 980 * * * * * * * * * * * 146 0 * * 0 * * * 1317 0 0 //