HHsearch 1.5 NAME c5utvA_ FAM FILE c5utvA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5utvA_.a3m DATE Sat Jun 24 08:26:16 2017 LENG 77 match states, 77 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4234 -0.0030 SEQ >ss_dssp CCTTHHHHHHHHHHTTCCSSSEECCCEEEETTEEEEEEEEETTEEEEECSSCEEEEETTEEEECSSSHHHHHHHTCC >sa_dssp EEEEDBDEABDDADEECCEEBEDDDDEBECDEDEACAAACDEEBCAABBEEBABAACDEECEEBEDBDDADDCBEEE >ss_pred CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHEEEHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCEEEEEEEEEEEEEEHHHHHHHHCCC >ss_conf 90367899999987616433011000010017999999517986898705846788702143541112333332049 >Consensus shmtavqdfvvdillngardwdvlqttctvdrkvyktickrgntylcfddtnlyaitgdvvlkfatvskarayletk >c5utvA_ SHMTAVQDFVVDILLNGARDWDVLQTTCTVDRKVYKTICKRGNTYLCFDDTNLYAITGDVVLKFATVSKARAYLETK # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 H 2 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 M 3 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 T 4 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 A 5 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 V 6 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 7 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 D 8 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 F 9 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 V 10 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 V 11 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 D 12 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 I 13 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 L 14 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 L 15 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 N 16 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 G 17 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 A 18 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 R 19 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 D 20 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 W 21 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 D 22 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 V 23 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 L 24 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 25 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 T 26 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 T 27 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 C 28 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 T 29 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 V 30 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 D 31 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 R 32 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 K 33 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 V 34 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 35 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 35 0 * * * * * * 1000 0 0 K 36 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 T 37 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 I 38 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 C 39 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 K 40 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 R 41 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 G 42 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 N 43 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 T 44 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 45 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 45 0 * * * * * * 1000 0 0 L 46 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 C 47 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 F 48 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 D 49 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 D 50 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 T 51 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 N 52 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 L 53 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 54 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 54 0 * * * * * * 1000 0 0 A 55 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 I 56 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 T 57 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 G 58 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 D 59 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 V 60 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 V 61 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 L 62 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 K 63 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 F 64 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 A 65 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 T 66 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 V 67 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 S 68 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 K 69 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 A 70 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 R 71 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 A 72 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 73 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 73 0 * * * * * * 1000 0 0 L 74 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 E 75 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 T 76 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 K 77 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 77 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //