HHsearch 1.5 NAME c5ukzA_ FAM FILE c5ukzA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5ukzA_.a3m DATE Sat Jun 30 08:20:17 2018 LENG 44 match states, 44 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.2 EVD 0.4901 2.9973 SEQ >ss_dssp CCBTTTEEECSSCEEECTTSCCHHHHHHHHHHHHHTCCTTTCCC >sa_dssp EDEEECBECEEDDBDCEEEDEDDBCEDABDEBEEEECDCCECEC >ss_pred CCCCCCEECCCCCCEEECCCEEEEEEECCHHHHHCCCCCCCCCC >ss_conf 90257303278620110133479997161111001223455679 >Consensus kyygngvscxkxxcsvdwgkaxxxixnnxaxxxatggxxgnhkc >c5ukzA_ KYYGNGVTCGKHSCSVDWGKATTCIINNGALAWATGGHQGNHKC >UniRef50_P80925(1-40:43) Bacteriocin mundticin n=9 Tax=Bacilli RepID=MUTI_ENTMU E=5e-05 s/c=1.22 id=63% cov=93% KYYGNGVSCNKKGCSVDWGKAIGIIGNNSAANLATGGAAG---- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * K 1 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1275 0 0 Y 2 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 2 0 * * * * * * 1275 0 0 Y 3 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 3 0 * * * * * * 1275 0 0 G 4 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1275 0 0 N 5 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1275 0 0 G 6 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1275 0 0 V 7 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 7 0 * * * * * * 1275 0 0 T 8 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 8 0 * * * * * * 1275 0 0 C 9 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1275 0 0 G 10 * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1275 0 0 K 11 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1275 0 0 H 12 * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1275 0 0 S 13 * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * 13 0 * * * * * * 1275 0 0 C 14 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1275 0 0 S 15 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 15 0 * * * * * * 1275 0 0 V 16 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 16 0 * * * * * * 1275 0 0 D 17 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1275 0 0 W 18 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 18 0 * * * * * * 1275 0 0 G 19 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1275 0 0 K 20 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1275 0 0 A 21 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1275 0 0 T 22 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * 22 0 * * * * * * 1275 0 0 T 23 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 1000 * * * 23 0 * * * * * * 1275 0 0 C 24 * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1275 0 0 I 25 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1275 0 0 I 26 * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1275 0 0 N 27 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1275 0 0 N 28 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1275 0 0 G 29 * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * 29 0 * * * * * * 1275 0 0 A 30 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1275 0 0 L 31 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1275 0 0 A 32 1000 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1275 0 0 W 33 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * 33 0 * * * * * * 1275 0 0 A 34 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1275 0 0 T 35 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 35 0 * * * * * * 1275 0 0 G 36 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1275 0 0 G 37 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1275 0 0 H 38 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1275 0 0 Q 39 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 39 0 * * * * * * 1275 0 0 G 40 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1275 0 0 N 41 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 H 42 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 K 43 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 C 44 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //