HHsearch 1.5 NAME c5ubmI_ FAM FILE c5ubmI_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5ubmI_.a3m DATE Sat Nov 11 08:15:23 2017 LENG 113 match states, 113 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.3 EVD 0.4528 0.6250 SEQ >ss_dssp CCCCCCSSHHHHCSTTEECCSCCCEECCCCCSSCCSTTCEEECTTCCEEEEETTCCCCCCCCCCTTCEEECSSCCEEEEEECCTTTTTSSCCCCTTCEEE TTTTEEECTTCCC >sa_dssp DDDCDBDCCDDAECECACDDEDEBDCCECDBDBBBBDDDCCECECDACCDCBDEBEDECCEEEBECCBDBDEDBCDCEDDDBEEECADDCCCCEEECCCC EEBADBCCEEEEE >ss_pred CCCCCCHHHCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCEEEEEEECCCEEEC CCCCCCCCCCCCC >ss_conf 9663100000246412354135622216507876862101113310234633378885367851123120534520224216753044788975970716 7777558875469 >Consensus kklpkcqkqedcgswdlkCxxxxxxCxNxxCxRxCPxErYxxDxxGCxxCLCKGCxxxxCRlxCxxGFxTDxxGCEaFCTCNTxETxCxNixCtxxxxCN PxSGRCEdpneee >c5ubmI_ KKLPKCQKQEDCGSWDLKCNNVTCECRNQVCGRGCPKERYQRDKYGCRKCLCKGCDGFKCRLGCTYGFKTDKKGCEAFCTCNTKETACVNIWCTDPYKCN PESGRCEDPNEEE >UniRef50_Q9NBW4(14-101:101) Therostasin n=2 Tax=Theromyzon tessulatum RepID=THST_THETS E=2e-12 s/c=0.84 id=53% cov=79% ------------------CSVAFGDCENTECPRACPGE-YEFDEDGCNTCLCKGCNDAQCRIYCPLGFTTDANGCESFCTCNTRETVCQNVVCSGKRVCN PRSGRCE------ # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * K 1 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 K 2 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 L 3 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 P 4 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 K 5 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 C 6 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 7 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 K 8 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 9 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 E 10 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 D 11 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 C 12 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 G 13 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 S 14 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 W 15 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 D 16 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 L 17 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 K 18 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 C 19 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1376 0 0 N 20 * * * * * * * * * * * 984 * * * 1016 * * * * 20 0 * * * * * * 1376 0 0 N 21 * * * * * * * * * * * 984 * * * * * 1016 * * 21 0 * * * * * * 1376 0 0 V 22 1016 * * * * * * * * * * * * * * * * 984 * * 22 0 * * * * * * 1376 0 0 T 23 * * * * 1016 * * * * * * * * * * * 984 * * * 23 0 * * * * * * 1376 0 0 C 24 * 984 * * * 1016 * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1376 0 0 E 25 * * 1016 984 * * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1376 0 0 C 26 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1376 0 0 R 27 * * * 1016 * * * * * * * * * * 984 * * * * * 27 0 * * * * * * 1376 0 0 N 28 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1376 0 0 Q 29 * * * * * * * * * * * * * 984 * * 1016 * * * 29 0 * * * * * * 1376 0 0 V 30 * * * 1016 * * * * * * * * * * * * * 984 * * 30 0 * * * * * * 1376 0 0 C 31 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1376 0 0 G 32 * * * * * 984 * * * * * * 1016 * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1376 0 0 R 33 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 33 0 * * * * * * 1376 0 0 G 34 1016 * * * * 984 * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1376 0 0 C 35 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1376 0 0 P 36 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1376 0 0 K 37 * * * * * 1016 * * 984 * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1376 0 0 E 38 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 38 984 * 1016 * * * * 1376 0 0 R 39 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 39 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 Y 40 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 40 0 * * * * * * 1376 0 0 Q 41 * * * 1016 * * * * * * * * * 984 * * * * * * 41 0 * * * * * * 1376 0 0 R 42 * * * * 1016 * * * * * * * * * 984 * * * * * 42 0 * * * * * * 1376 0 0 D 43 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1376 0 0 K 44 * * * 1016 * * * * 984 * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1376 0 0 Y 45 * * 1016 * * * * * * * * * * * * * * * * 984 45 0 * * * * * * 1376 0 0 G 46 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1376 0 0 C 47 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1376 0 0 R 48 * * * * * * * * * * * 1016 * * 984 * * * * * 48 0 * * * * * * 1376 0 0 K 49 * * * * * * * * 984 * * * * * * * 1016 * * * 49 0 * * * * * * 1376 0 0 C 50 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1376 0 0 L 51 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1376 0 0 C 52 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1376 0 0 K 53 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1376 0 0 G 54 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1376 0 0 C 55 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1376 0 0 D 56 * * 984 * * * * * * * * 1016 * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1376 0 0 G 57 * * 1016 * * 984 * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1376 0 0 F 58 1016 * * * 984 * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1376 0 0 K 59 * * * * * * * * 984 * * * * 1016 * * * * * * 59 0 * * * * * * 1376 0 0 C 60 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1376 0 0 R 61 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 61 0 * * * * * * 1376 0 0 L 62 * * * * * * * 1016 * 984 * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1376 0 0 G 63 * * * * * 984 * * * * * * * * * * * * * 1016 63 0 * * * * * * 1376 0 0 C 64 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1376 0 0 T 65 * * * * * * * * * * * * 1016 * * * 984 * * * 65 0 * * * * * * 1376 0 0 Y 66 * * * * * * * * * 1016 * * * * * * * * * 984 66 0 * * * * * * 1376 0 0 G 67 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1376 0 0 F 68 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1376 0 0 K 69 * * * * * * * * 984 * * * * * * * 1016 * * * 69 0 * * * * * * 1376 0 0 T 70 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 70 0 * * * * * * 1376 0 0 D 71 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1376 0 0 K 72 1016 * * * * * * * 984 * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1376 0 0 K 73 * * * * * * * * 984 * * 1016 * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1376 0 0 G 74 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1376 0 0 C 75 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1376 0 0 E 76 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1376 0 0 A 77 984 * * * * * * * * * * * * * * 1016 * * * * 77 0 * * * * * * 1376 0 0 F 78 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1376 0 0 C 79 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1376 0 0 T 80 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 80 0 * * * * * * 1376 0 0 C 81 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1376 0 0 N 82 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1376 0 0 T 83 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 83 0 * * * * * * 1376 0 0 K 84 * * * * * * * * 984 * * * * * 1016 * * * * * 84 0 * * * * * * 1376 0 0 E 85 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1376 0 0 T 86 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 86 0 * * * * * * 1376 0 0 A 87 984 * * * * * * * * * * * * * * * * 1016 * * 87 0 * * * * * * 1376 0 0 C 88 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1376 0 0 V 89 * * * * * * * * * * * * * 1016 * * * 984 * * 89 0 * * * * * * 1376 0 0 N 90 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1376 0 0 I 91 * * * * * * * 984 * * * * * * * * * 1016 * * 91 0 * * * * * * 1376 0 0 W 92 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1016 984 * 92 0 * * * * * * 1376 0 0 C 93 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1376 0 0 T 94 * * * * * * * * * * * * * * * 1016 984 * * * 94 0 * * * * * * 1376 0 0 D 95 * * 984 * * 1016 * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1376 0 0 P 96 * * * * * * * * 1016 * * * 984 * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1376 0 0 Y 97 * * * * * * * * * * * * * * 1016 * * * * 984 97 0 * * * * * * 1376 0 0 K 98 * * * * * * * * 984 * * * * * * * * 1016 * * 98 0 * * * * * * 1376 0 0 C 99 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1376 0 0 N 100 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1376 0 0 P 101 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1376 0 0 E 102 * * * 984 * * * * * * * * * * 1016 * * * * * 102 0 * * * * * * 1376 0 0 S 103 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 103 0 * * * * * * 1376 0 0 G 104 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1376 0 0 R 105 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 105 0 * * * * * * 1376 0 0 C 106 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1376 0 0 E 107 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1376 0 0 D 108 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 P 109 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 N 110 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 E 111 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 E 112 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 E 113 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //