HHsearch 1.5 NAME c5u0pT_ FAM FILE c5u0pT_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5u0pT_.a3m DATE Tue Mar 14 09:59:45 2017 LENG 179 match states, 179 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.3 EVD 0.4049 -0.6931 SEQ >ss_dssp CCCEEEECSCCSCHHHHHHHCCSCCCCCCEEECCCCBCSSTTSCSTTSCSCCCCCEETTTTCCBCCCSSSCCCCBCCSHHHHHHHTTCCBCCCCCCEECC CBCCSSEEEECCCCCCSSSCCCCEEEEEECCCSCGGGTHHHHHHTSSTTCCCSCCCCCCCCCTTHHHHHHHHHHGGGTC >sa_dssp CBBCBBDBEDDDDBEECDEDCEEDDCDECBBCBBCBCBDDEEDEEEEDADDBBBADBEDEDCCAACBCDEDDEDBECDECBDECEEECBDEDCBBCCECC BBDDEECDCBBBCBDCEDECCBACBCBBDEBEEDCEEBDDDBDDDCEEDECEEDDEDCDDDEDECBBDBCCECCEDCEE >ss_pred CCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCC EEEECCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHCCC >ss_conf 9526898538431333234666789999999976422212344225788899999722880254202524420244125776665643103330451331 2430001455888865310013899999758654114579999999997510578501165287899999997431149 >Consensus pvhgviyysspsmatflxxaqdxlxxxxxaqxlxkwxvxyklyrnavtpkxleflxqnxxpxmxaxvxexxxidxexxlexiivrtklwxfrqxxxxegx iyevgxfxvxianxlqksxwkgxlxhvxxxgtxxxxxaxpiixxxxxxcfxxxnkxxxpvyxxxkxlxxlfkqridtvs >c5u0pT_ PVHGVIYYSSPSMATFLSPAQDNLVRTYFAQHLKKWVVQYKLYRNAVTPKTLEFLKQNINPSMLACVDEATMIDAEPELEDIIVRTKLWNFRQSFTIEGS IYEVGSFKVAIANVLQKSVWKGILFHVTYDGTESVDLARPIIQEFFLKCFLQNNKSVTPVYLDSKLLLQLFKQRIDTVS >UniRef50_B6K5X4(1-171:259) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Schizosaccharomyces japonicus yFS275 RepID=B6K5X4_SCHJY E=2e-42 s/c=1.01 id=53% cov=90% ------------MATFLAVAQDRLLKQHHAQFLRKWNVHYKLYRNAISPKVLEFLYQNTQPNMMASInNEEAVVDTETDLEAIIVRTKLWTFRQHLCAEG AIYEVGDFVIGVANLLQKTTWKGFLVHVVFKGSDDMSIAQPIIRDLCESCFFRD--PTVPVhesyyiseqqYASPKTLQSLFKQR----- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * P 1 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 V 2 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 H 3 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 G 4 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 V 5 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 I 6 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 7 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 7 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 8 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 8 0 * * * * * * 1000 0 0 S 9 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 S 10 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 P 11 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 S 12 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 M 13 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1378 0 0 A 14 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1378 0 0 T 15 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 15 0 * * * * * * 1378 0 0 F 16 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1378 0 0 L 17 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1378 0 0 S 18 1018 * * * * * * * * * * * * * * 982 * * * * 18 0 * * * * * * 1378 0 0 P 19 * * * * * * * * * * * * 982 * * * * 1018 * * 19 0 * * * * * * 1378 0 0 A 20 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1378 0 0 Q 21 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 21 0 * * * * * * 1378 0 0 D 22 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1378 0 0 N 23 * * * * * * * * * * * 982 * * 1018 * * * * * 23 0 * * * * * * 1378 0 0 L 24 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1378 0 0 V 25 * * * * * * * * * 1018 * * * * * * * 982 * * 25 0 * * * * * * 1378 0 0 R 26 * * * * * * * * 1018 * * * * * 982 * * * * * 26 0 * * * * * * 1378 0 0 T 27 * * * * * * * * * * * * * 1018 * * 982 * * * 27 0 * * * * * * 1378 0 0 Y 28 * * * * * * 1018 * * * * * * * * * * * * 982 28 0 * * * * * * 1378 0 0 F 29 * * * * 982 * 1018 * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1378 0 0 A 30 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1378 0 0 Q 31 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 31 0 * * * * * * 1378 0 0 H 32 * * * * 1018 * 982 * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1378 0 0 L 33 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1378 0 0 K 34 * * * * * * * * 982 * * * * * 1018 * * * * * 34 0 * * * * * * 1378 0 0 K 35 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1378 0 0 W 36 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 36 0 * * * * * * 1378 0 0 V 37 * * * * * * * * * * * 1018 * * * * * 982 * * 37 0 * * * * * * 1378 0 0 V 38 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 38 0 * * * * * * 1378 0 0 Q 39 * * * * * * 1018 * * * * * * 982 * * * * * * 39 0 * * * * * * 1378 0 0 Y 40 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 40 0 * * * * * * 1378 0 0 K 41 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1378 0 0 L 42 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1378 0 0 Y 43 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 43 0 * * * * * * 1378 0 0 R 44 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 44 0 * * * * * * 1378 0 0 N 45 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1378 0 0 A 46 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1378 0 0 V 47 * * * * * * * 1018 * * * * * * * * * 982 * * 47 0 * * * * * * 1378 0 0 T 48 * * * * * * * * * * * * * * * 1018 982 * * * 48 0 * * * * * * 1378 0 0 P 49 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1378 0 0 K 50 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1378 0 0 T 51 * * * * * * * * * * * * * * * * 982 1018 * * 51 0 * * * * * * 1378 0 0 L 52 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1378 0 0 E 53 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1378 0 0 F 54 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1378 0 0 L 55 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1378 0 0 K 56 * * * * * * * * 982 * * * * * * * * * * 1018 56 0 * * * * * * 1378 0 0 Q 57 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 57 0 * * * * * * 1378 0 0 N 58 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1378 0 0 I 59 * * * * * * * 982 * * * * * * * * 1018 * * * 59 0 * * * * * * 1378 0 0 N 60 * * * * * * * * * * * 982 * 1018 * * * * * * 60 0 * * * * * * 1378 0 0 P 61 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1378 0 0 S 62 * * * * * * * * * * * 1018 * * * 982 * * * * 62 0 * * * * * * 1378 0 0 M 63 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1378 0 0 L 64 * * * * * * * * * 982 1018 * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1378 0 0 A 65 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1378 0 0 C 66 * 982 * * * * * * * * * * * * * 1018 * * * * 66 0 * * * * * * 1378 0 0 V 67 * * * * * * * 1018 * * * * * * * * * 982 * * 67 982 1018 * 0 * * * 1378 1000 0 D 68 * * 982 * * * * * * * * 1018 * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1378 0 0 E 69 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1378 0 0 A 70 982 * * 1018 * * * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1378 0 0 T 71 1018 * * * * * * * * * * * * * * * 982 * * * 71 0 * * * * * * 1378 0 0 M 72 * * * * * * * * * * 982 * * * * * * 1018 * * 72 0 * * * * * * 1378 0 0 I 73 * * * * * * * 982 * * * * * * * * * 1018 * * 73 0 * * * * * * 1378 0 0 D 74 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1378 0 0 A 75 982 * * * * * * * * * * * * * * * 1018 * * * 75 0 * * * * * * 1378 0 0 E 76 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1378 0 0 P 77 * * * * * * * * * * * * 982 * * * 1018 * * * 77 0 * * * * * * 1378 0 0 E 78 * * 1018 982 * * * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1378 0 0 L 79 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1378 0 0 E 80 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1378 0 0 D 81 1018 * 982 * * * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1378 0 0 I 82 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1378 0 0 I 83 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1378 0 0 V 84 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 84 0 * * * * * * 1378 0 0 R 85 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 85 0 * * * * * * 1378 0 0 T 86 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 86 0 * * * * * * 1378 0 0 K 87 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1378 0 0 L 88 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1378 0 0 W 89 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 89 0 * * * * * * 1378 0 0 N 90 * * * * * * * * * * * 982 * * * * 1018 * * * 90 0 * * * * * * 1378 0 0 F 91 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1378 0 0 R 92 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 92 0 * * * * * * 1378 0 0 Q 93 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 93 0 * * * * * * 1378 0 0 S 94 * * * * * * 1018 * * * * * * * * 982 * * * * 94 0 * * * * * * 1378 0 0 F 95 * * * * 982 * * * * 1018 * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1378 0 0 T 96 * 1018 * * * * * * * * * * * * * * 982 * * * 96 0 * * * * * * 1378 0 0 I 97 1018 * * * * * * 982 * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1378 0 0 E 98 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1378 0 0 G 99 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1378 0 0 S 100 1018 * * * * * * * * * * * * * * 982 * * * * 100 0 * * * * * * 1378 0 0 I 101 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1378 0 0 Y 102 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 102 0 * * * * * * 1378 0 0 E 103 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1378 0 0 V 104 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 104 0 * * * * * * 1378 0 0 G 105 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1378 0 0 S 106 * * 1018 * * * * * * * * * * * * 982 * * * * 106 0 * * * * * * 1378 0 0 F 107 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1378 0 0 K 108 * * * * * * * * 982 * * * * * * * * 1018 * * 108 0 * * * * * * 1378 0 0 V 109 * * * * * * * 1018 * * * * * * * * * 982 * * 109 0 * * * * * * 1378 0 0 A 110 982 * * * * 1018 * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1378 0 0 I 111 * * * * * * * 982 * * * * * * * * * 1018 * * 111 0 * * * * * * 1378 0 0 A 112 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1378 0 0 N 113 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1378 0 0 V 114 * * * * * * * * * 1018 * * * * * * * 982 * * 114 0 * * * * * * 1378 0 0 L 115 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1378 0 0 Q 116 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 116 0 * * * * * * 1378 0 0 K 117 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1378 0 0 S 118 * * * * * * * * * * * * * * * 982 1018 * * * 118 0 * * * * * * 1378 0 0 V 119 * * * * * * * * * * * * * * * * 1018 982 * * 119 0 * * * * * * 1378 0 0 W 120 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 120 0 * * * * * * 1378 0 0 K 121 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1378 0 0 G 122 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1378 0 0 I 123 * * * * 1018 * * 982 * * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1378 0 0 L 124 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1378 0 0 F 125 * * * * 982 * * * * * * * * * * * * 1018 * * 125 0 * * * * * * 1378 0 0 H 126 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1378 0 0 V 127 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 127 0 * * * * * * 1378 0 0 T 128 * * * * * * * * * * * * * * * * 982 1018 * * 128 0 * * * * * * 1378 0 0 Y 129 * * * * 1018 * * * * * * * * * * * * * * 982 129 0 * * * * * * 1378 0 0 D 130 * * 982 * * * * * 1018 * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1378 0 0 G 131 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1378 0 0 T 132 * * * * * * * * * * * * * * * 1018 982 * * * 132 0 * * * * * * 1378 0 0 E 133 * * 1018 982 * * * * * * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1378 0 0 S 134 * * 1018 * * * * * * * * * * * * 982 * * * * 134 0 * * * * * * 1378 0 0 V 135 * * * * * * * * * * 1018 * * * * * * 982 * * 135 0 * * * * * * 1378 0 0 D 136 * * 982 * * * * * * * * * * * * 1018 * * * * 136 0 * * * * * * 1378 0 0 L 137 * * * * * * * 1018 * 982 * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1378 0 0 A 138 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1378 0 0 R 139 * * * * * * * * * * * * * 1018 982 * * * * * 139 0 * * * * * * 1378 0 0 P 140 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1378 0 0 I 141 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1378 0 0 I 142 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1378 0 0 Q 143 * * * * * * * * * * * * * 982 1018 * * * * * 143 0 * * * * * * 1378 0 0 E 144 * * 1018 982 * * * * * * * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1378 0 0 F 145 * * * * 982 * * * * 1018 * * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1378 0 0 F 146 * 1018 * * 982 * * * * * * * * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1378 0 0 L 147 * * * 1018 * * * * * 982 * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1378 0 0 K 148 * * * * * * * * 982 * * * * * * 1018 * * * * 148 0 * * * * * * 1378 0 0 C 149 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1378 0 0 F 150 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1378 0 0 L 151 * * * * 1018 * * * * 982 * * * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1378 0 0 Q 152 * * * * * * * * * * * * * 982 1018 * * * * * 152 0 * * * * * * 1378 0 0 N 153 * * 1018 * * * * * * * * 982 * * * * * * * * 153 982 * 1018 * * * * 1378 0 0 N 154 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 154 0 * * * * * 0 1000 0 1000 K 155 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 155 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 S 156 * * * * * * * * * * * * 1018 * * 982 * * * * 156 0 * * * * * * 1378 0 0 V 157 * * * * * * * * * * * * * * * * 1018 982 * * 157 0 * * * * * * 1378 0 0 T 158 * * * * * * * * * * * * * * * * 982 1018 * * 158 0 * * * * * * 1378 0 0 P 159 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 159 0 * * * * * * 1378 0 0 V 160 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 160 982 1018 * 3322 152 * * 1378 1000 0 Y 161 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 161 0 * * * * * * 1378 0 0 L 162 1018 * * * * * * * * 982 * * * * * * * * * * 162 0 * * * * * * 1378 0 0 D 163 * * 982 * * * * * * * * * * * * 1018 * * * * 163 0 * * * * * * 1378 0 0 S 164 * * * * * * * * * * * * 1018 * * 982 * * * * 164 0 * * * * * * 1378 0 0 K 165 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 165 0 * * * * * * 1378 0 0 L 166 * * * * * * * * * 982 * * * * * * 1018 * * * 166 0 * * * * * * 1378 0 0 L 167 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 167 0 * * * * * * 1378 0 0 L 168 * * * * * * * * * 982 * * * 1018 * * * * * * 168 0 * * * * * * 1378 0 0 Q 169 * * * * * * * * * * * * * 982 * 1018 * * * * 169 0 * * * * * * 1378 0 0 L 170 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 170 0 * * * * * * 1378 0 0 F 171 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 171 0 * * * * * * 1378 0 0 K 172 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 172 0 * * * * * * 1378 0 0 Q 173 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 173 0 * * * * * * 1378 0 0 R 174 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 174 0 * * * * * * 1378 0 0 I 175 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 175 0 * * * * * * 1000 0 0 D 176 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 176 0 * * * * * * 1000 0 0 T 177 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 177 0 * * * * * * 1000 0 0 V 178 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 178 0 * * * * * * 1000 0 0 S 179 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 179 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //