HHsearch 1.5 NAME c5tugA_ FAM FILE c5tugA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5tugA_.a3m DATE Sat Jan 13 08:16:24 2018 LENG 115 match states, 115 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.5 EVD 0.4273 -0.4099 SEQ >ss_dssp CCCCSSCSSCCCCCSEEEEEEEESSSSEEEEEEEECSSSCEECGGGCEEEEEETTCCEEEEETCSSSSEEEESCSEECTTCEEEEEEECSSCCCTTCCEE EEEECTTCCEEEEEC >sa_dssp EEEEEEDEEDEEEDDADBDDACDEDDDCABADBCADCEEDBDEBCEBDADBBCDEECEEBDDEDEEDDCBCBEDDCADDEDDBDBCACBEEECDEEDEBC ACACBDEDCDBECDC >ss_pred CCCCHHHHHHCEEEEEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCEEEEECCCEEEECCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEE EEEECCCCEEEEEEC >ss_conf 9510013410102346899862466647999996068514666214169982663246631058899636876424438866999999648655662699 999807870777769 >Consensus MsSxSixxSQKlxTdLqIxYATNxSStTVvxYlxNxGEtxIxxlxnSvlYFGxxxqLQpxGYnssSxPxWtxxxxxLxPGSvaKIxixLxsPLsxxQYYx xxxVtxNGYxvsYxF >c5tugA_ MSSYSIQQSQKMLTQLQIDYATNTSSNTVVAYLHNVGETTISYLQNSVVYFGPNGQLQPVGYNSGSSPYWTVTSNSLQPGSVVKIIIYLSSPLSSNQYYT IQIVTPNGYTVSYMF >UniRef50_C3MJJ5(37-152:155) Flagellin n=8 Tax=Sulfolobus RepID=C3MJJ5_SULIL E=4e-33 s/c=1.22 id=71% cov=101% MVSYSILQSQKLVTDLQIDYATNASSTTVIVYLHNIGESTIFNLKNSVLYFGPQGNLQQIGYNSSSTlPYWVVNTNTLYPGSVAKIIIYLSSPLSTTQYY TVQLVTPNGYSVSYTF >UniRef50_A4YGD4(1-152:153) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Metallosphaera sedula DSM 5348 RepID=A4YGD4_METS5 E=4e-36 s/c=1.10 id=50% cov=100% MSSMSLSLSQKLTTDLKIVYATNVSSTTVVIYIQNTGETDI-FMSSSTLYFGKVYQLQPTGYSTSSPPNWTSSVAVLSPGSTAKITLTLPAPLQQYQYYE AMFVAQNGYETDYVF # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1551 0 0 S 2 * * * * * * * * * * * * * * * 549 * 1659 * * 2 0 * * * * * * 1551 0 0 S 3 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 3 0 * * * * * * 1551 0 0 Y 4 * * * * * * * * * * 1447 * * * * * * * * 659 4 0 * * * * * * 1551 0 0 S 5 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 5 0 * * * * * * 1551 0 0 I 6 * * * * * * * 659 * 1447 * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1551 0 0 Q 7 * * * * * * * * * 1659 * * * 1659 * 1447 * * * * 7 0 * * * * * * 1551 0 0 Q 8 * * * * * * * * * 1447 * * * 659 * * * * * * 8 0 * * * * * * 1551 0 0 S 9 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 9 0 * * * * * * 1551 0 0 Q 10 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 10 0 * * * * * * 1551 0 0 K 11 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1551 0 0 M 12 * * * * * * * * * 549 1659 * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1551 0 0 L 13 * * * * * * * * * 1659 * * * * * * 1447 1659 * * 13 0 * * * * * * 1551 0 0 T 14 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 14 0 * * * * * * 1551 0 0 Q 15 * * 549 * * * * * * * * * * 1659 * * * * * * 15 0 * * * * * * 1551 0 0 L 16 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1551 0 0 Q 17 * * * * * * * * 1447 * * * * 659 * * * * * * 17 0 * * * * * * 1551 0 0 I 18 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1551 0 0 D 19 * * 659 * * * * * * * * * * * * * * 1447 * * 19 0 * * * * * * 1551 0 0 Y 20 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 20 0 * * * * * * 1551 0 0 A 21 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1551 0 0 T 22 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 22 0 * * * * * * 1551 0 0 N 23 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1551 0 0 T 24 1659 * * * * * * * * * * * * * * * 1659 1447 * * 24 0 * * * * * * 1551 0 0 S 25 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 25 0 * * * * * * 1551 0 0 S 26 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 26 0 * * * * * * 1551 0 0 N 27 * * * * * * * * * * * 1659 * * * * 549 * * * 27 0 * * * * * * 1551 0 0 T 28 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 28 0 * * * * * * 1551 0 0 V 29 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 29 0 * * * * * * 1551 0 0 V 30 * * * * * * * 1659 * * * * * * * * * 549 * * 30 0 * * * * * * 1551 0 0 A 31 1659 * * * * * * 1447 * * * * * * * * * 1659 * * 31 0 * * * * * * 1551 0 0 Y 32 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 32 0 * * * * * * 1551 0 0 L 33 * * * * * * * 1447 * 659 * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1551 0 0 H 34 * * * * * * 659 * * * * * * 1447 * * * * * * 34 0 * * * * * * 1551 0 0 N 35 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1551 0 0 V 36 * * * * * * * 1659 * * * * * * * * 1447 1659 * * 36 0 * * * * * * 1551 0 0 G 37 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1551 0 0 E 38 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1551 0 0 T 39 * * * * * * * * * * * * * * * 1659 549 * * * 39 0 * * * * * * 1551 0 0 T 40 * * 1447 * * * * * * * * * * * * * 659 * * * 40 0 * * * * * * 1551 0 0 I 41 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 41 659 * 1447 * * * * 1551 0 0 S 42 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 1000 * * * * 42 0 * * * * 0 * 1220 0 1000 Y 43 * * * * 1447 * * * * * * 1659 * * * * * * * 1659 43 0 * * * * * * 1551 0 0 L 44 * * * * * * * * * 659 1447 * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1551 0 0 Q 45 * * * * * * * * 1659 * * * * 1659 * 1447 * * * * 45 0 * * * * * * 1551 0 0 N 46 * * * * * * * * * * * 659 * * * 1447 * * * * 46 0 * * * * * * 1551 0 0 S 47 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 47 0 * * * * * * 1551 0 0 V 48 * * * * * * * * * * * * * * * * 1447 659 * * 48 0 * * * * * * 1551 0 0 V 49 * * * * * * * * * 549 * * * * * * * 1659 * * 49 0 * * * * * * 1551 0 0 Y 50 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 50 0 * * * * * * 1551 0 0 F 51 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1551 0 0 G 52 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1551 0 0 P 53 * * * * * * * * 1447 * * * 659 * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1551 0 0 N 54 * * * * * * * * * * * 1659 * 1659 * * * 1447 * * 54 0 * * * * * * 1551 0 0 G 55 * * * * * 659 * * * * * * * * * * * * * 1447 55 0 * * * * * * 1551 0 0 Q 56 * * * * * * * * * * * 1659 * 549 * * * * * * 56 0 * * * * * * 1551 0 0 L 57 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1551 0 0 Q 58 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 58 0 * * * * * * 1551 0 0 P 59 * * * * * * * * * * * * 549 1659 * * * * * * 59 0 * * * * * * 1551 0 0 V 60 * * * * * * * 1659 * * * * * * * * 1447 1659 * * 60 0 * * * * * * 1551 0 0 G 61 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1551 0 0 Y 62 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 62 0 * * * * * * 1551 0 0 N 63 * * * * * * * * * * * 659 * * * 1447 * * * * 63 0 * * * * * * 1551 0 0 S 64 * * * * * * * * * * * * * * * 659 1447 * * * 64 0 * * * * * * 1551 0 0 G 65 * * * * * 1659 * * * * * * * * * 549 * * * * 65 0 * * * * * * 1551 0 0 S 66 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 66 0 * * * * * * 1551 0 0 S 67 * * * * * * * * * * * * 1447 * * 1659 1659 * * * 67 549 1659 * 0 * * * 1551 1000 0 P 68 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1551 0 0 Y 69 * * * * * * * * * * * 1447 * * * * * * * 659 69 0 * * * * * * 1551 0 0 W 70 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 70 0 * * * * * * 1551 0 0 T 71 * * * * * * * * * * * * * * * * 549 1659 * * 71 0 * * * * * * 1551 0 0 V 72 * * * * * * * * * * * * * * * 1447 * 659 * * 72 0 * * * * * * 1551 0 0 T 73 * * * * * * * * * * * 1659 * * * 1447 1659 * * * 73 0 * * * * * * 1551 0 0 S 74 * * * * * * * * * * * * * * * 1659 1659 1447 * * 74 0 * * * * * * 1551 0 0 N 75 1447 * * * * * * * * * * 659 * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1551 0 0 S 76 * * * * * * * * * * * * * * * 1659 1659 1447 * * 76 0 * * * * * * 1551 0 0 L 77 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1551 0 0 Q 78 * * * * * * * * * * * * * 1659 * 1447 * * * 1659 78 0 * * * * * * 1551 0 0 P 79 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1551 0 0 G 80 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1551 0 0 S 81 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 81 0 * * * * * * 1551 0 0 V 82 * * * * * * * * * * * * * * * * 1447 659 * * 82 0 * * * * * * 1551 0 0 V 83 549 * * * * * * * * * * * * * * * * 1659 * * 83 0 * * * * * * 1551 0 0 K 84 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1551 0 0 I 85 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1551 0 0 I 86 * * * * * * * 659 * * * * * * * * 1447 * * * 86 0 * * * * * * 1551 0 0 I 87 * * * * * * * 659 * 1447 * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1551 0 0 Y 88 * * * * * * * * * * * * * * * * 1447 * * 659 88 0 * * * * * * 1551 0 0 L 89 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1551 0 0 S 90 * * * * * * * * * * * * 1447 * * 659 * * * * 90 0 * * * * * * 1551 0 0 S 91 1447 * * * * * * * * * * * * * * 659 * * * * 91 0 * * * * * * 1551 0 0 P 92 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1551 0 0 L 93 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1551 0 0 S 94 * * * * * * * * * * * * * 1447 * 659 * * * * 94 0 * * * * * * 1551 0 0 S 95 * * * * * * * * * * * * * 1447 * 1659 1659 * * * 95 0 * * * * * * 1551 0 0 N 96 * * * * * * * * * * * 1659 * * * * 1659 * * 1447 96 0 * * * * * * 1551 0 0 Q 97 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 97 0 * * * * * * 1551 0 0 Y 98 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 98 0 * * * * * * 1551 0 0 Y 99 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 99 0 * * * * * * 1551 0 0 T 100 * * * 1447 * * * * * * * * * * * * 659 * * * 100 0 * * * * * * 1551 0 0 I 101 1447 * * * * * * 1659 * * * * * * * * * 1659 * * 101 0 * * * * * * 1551 0 0 Q 102 * * * * * * * * * * 1447 * * 659 * * * * * * 102 0 * * * * * * 1551 0 0 I 103 * * * * 1447 * * 1659 * 1659 * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1551 0 0 V 104 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 104 0 * * * * * * 1551 0 0 T 105 1447 * * * * * * * * * * * * * * * 659 * * * 105 0 * * * * * * 1551 0 0 P 106 * * * * * * * * * * * * 659 1447 * * * * * * 106 0 * * * * * * 1551 0 0 N 107 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1551 0 0 G 108 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1551 0 0 Y 109 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 109 0 * * * * * * 1551 0 0 T 110 * * * 1447 * * * * * * * * * * * 1659 1659 * * * 110 0 * * * * * * 1551 0 0 V 111 * * * * * * * * * * * * * * * * 1447 659 * * 111 0 * * * * * * 1551 0 0 S 112 * * 1447 * * * * * * * * * * * * 659 * * * * 112 0 * * * * * * 1551 0 0 Y 113 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 113 0 * * * * * * 1551 0 0 M 114 * * * * * * * * * * 1659 * * * * * 1659 1447 * * 114 0 * * * * * * 1551 0 0 F 115 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * 0 * * * 1551 0 0 //