HHsearch 1.5 NAME c5tf3A_ FAM FILE c5tf3A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5tf3A_.a3m DATE Thu Feb 9 13:12:58 2017 LENG 131 match states, 131 columns in multiple alignment FILT 4 out of 8 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.1 EVD 0.4181 0.3519 SEQ >ss_dssp CHHHHHHHHHHHHHHHHTCCTHHHHHHHHTSCHHHHHHHHHHHHHSCHHHHHHHHHHHHHHHTTTTCCCHHHHHHHHHHHHHTTCCCCCCHHHHHHHHHH TGGGCCCHHHHHHHHHHHHHHHSCSSTTCCC >sa_dssp EEEECCDDABDDABECBECEDDDACCABECBBEEBCDDBBECBBEDDEEDBDDBABBAAABBACCDDDDEECBEDBBDBBCECEADCEACDDBBEDACDC ADEDECEDEDADCCCDDBCEECCCEDEEDEE >ss_pred CCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHEEEEHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHH HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC >ss_conf 9720478999999985288850003577650436678799986189988972000573032227405987799999999986077756899999999999 8744959899999999986520857884379 >Consensus xxxsgtRkAxxxlSxrLxixpVxVESmlxxmGkxxxxxFxryxxxxxexhlxnaAxvllIxqxxIvngxdxNlxxWxxxLxrAxxsxxixxxqxxlAlxf lrelepdxxemxxfrxxynxxFxPxxgxxxx >c5tf3A_ SNASDTRKAIDTISNLLKIKPIYIESXLQEXGPRQTQXFIRSTSNGSAEEVRKAAYLVFIYHTFIKNPSDENVELWRNTLIRAQISPILAAEHTDAALFY FAELDLDAFELAQFRRHYNLHFNPEPGTLLH >UniRef50_D0ZD34(24-143:161) Putative uncharacterized protein n=2 Tax=Edwardsiella RepID=D0ZD34_EDWTE E=9e-14 s/c=0.65 id=31% cov=92% -----TRRACQRLTQRLNIEPVHVESLLSQMGKTQGEAFVRYLQCGGESHLNNGAIVLLIYQTFIVNGDDDNLRYWRSLLRKAGFNADINPHQVRLALDF LRDLEPDTDEMLAFRLHYQQFFAPQ------ >UniRef50_C8Q3Z1(22-142:166) Putative inner membrane protein n=2 Tax=Enterobacteriaceae RepID=C8Q3Z1_9ENTR E=8e-08 s/c=0.48 id=25% cov=93% ---AGSRHAAQALSKRLQLPPVHVESMLSLMGKEAAKEFTDYITGDNENHLQNAAAVLLIWQVCIVDGGEANMRRWHQILSRAHFSPMITPQQLLLAMGF LRELEPDREEMNMMRERFNGAFLP------- >UniRef50_P0ADL5(22-146:150) Uncharacterized protein yicN n=99 Tax=Enterobacteriaceae RepID=YICN_ECO57 E=1e-45 s/c=1.47 id=25% cov=96% ---SGARKAIRRLSDRLNIDVVPVESMVDQMGKSAGDEFLRYLHRPDESHLQNAAQVLLIWQIVIVDGSEQNLLQWHRILQKARLAAPITDAQVRLALGF LRETEPEMQDINAFQMRYNAFFQPAEGV--- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 N 2 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 A 3 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 S 4 1649 * * * * * * * * * * * * * * 554 * * * * 4 0 * * * * * * 1969 0 0 D 5 * * 1465 * * 649 * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1969 0 0 T 6 2087 * * * * * * * * * * * * * * 2054 933 * * * 6 0 * * * * * * 2148 0 0 R 7 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 7 0 * * * * * * 2148 0 0 K 8 * * * * * * 2054 * 918 * * * * * 2122 * * * * * 8 0 * * * * * * 2148 0 0 A 9 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 2148 0 0 I 10 2054 2122 * * * * * 918 * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 2148 0 0 D 11 * * 1766 * * * * * * * * * * 1087 2087 * * * * * 11 0 * * * * * * 2148 0 0 T 12 2054 * * * * * * * * * * * * * 1105 * 1766 * * * 12 0 * * * * * * 2148 0 0 I 13 * * * * * * * 1766 * 502 * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 2148 0 0 S 14 * * * * * * * * * * * * * * * 376 2122 * * * 14 0 * * * * * * 2148 0 0 N 15 * * 2087 * * * * * 2054 * * 1766 * 2122 * * * * * * 15 0 * * * * * * 2148 0 0 L 16 * * * * * * * * * 1766 * * * * 502 * * * * * 16 0 * * * * * * 2148 0 0 L 17 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 2148 0 0 K 18 * * * * * * * * 1766 * * 1105 * 2054 * * * * * * 18 0 * * * * * * 2148 0 0 I 19 * * * * * * * 398 * 2054 * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 2148 0 0 K 20 * * 2087 2122 * * * * 1766 * * * 2054 * * * * * * * 20 0 * * * * * * 2148 0 0 P 21 * * * * * * * * * * * * 387 * * * * 2087 * * 21 0 * * * * * * 2148 0 0 I 22 * * * * * * * 1766 * * * * * * * * * 502 * * 22 0 * * * * * * 2148 0 0 Y 23 * * * * * * 1087 * * * * * 2087 * * * * * * 1766 23 0 * * * * * * 2148 0 0 I 24 * * * * * * * 1766 * * * * * * * * * 502 * * 24 0 * * * * * * 2148 0 0 E 25 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 2148 0 0 S 26 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 26 0 * * * * * * 2148 0 0 X 27 * * * * * * * * * 1576 590 * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1690 0 0 L 28 * * * * * * * * * 387 * * * * * * * 2087 * * 28 0 * * * * * * 2148 0 0 Q 29 * * 2087 * * * * * * * * * * 1766 * 1087 * * * * 29 0 * * * * * * 2148 0 0 E 30 * * * 1766 * * * * * 2054 * * * 1105 * * * * * * 30 0 * * * * * * 2148 0 0 X 31 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1690 0 0 G 32 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 2148 0 0 P 33 * * * * * * * * 502 * * * 1766 * * * * * * * 33 0 * * * * * * 2148 0 0 R 34 * * * 2054 * * * * * * * * * * 1766 2087 2122 * * * 34 0 * * * * * * 2148 0 0 Q 35 1070 * * * * * * * * * * * * 933 * * * * * * 35 0 * * * * * * 2148 0 0 T 36 2054 * * * * 1105 * * * * * * * * * * 1766 * * * 36 0 * * * * * * 2148 0 0 Q 37 * * 2087 2122 * * * * 2054 * * * * 1766 * * * * * * 37 0 * * * * * * 2148 0 0 X 38 1576 * * 590 * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1690 0 0 F 39 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 2148 0 0 I 40 * * * * * * * 1766 * 2087 * * * * * * 2054 2122 * * 40 0 * * * * * * 2148 0 0 R 41 * * 2054 * * * * * * * * * * * 398 * * * * * 41 0 * * * * * * 2148 0 0 S 42 * * * * * * * * * * * * * * * 1766 * * * 502 42 0 * * * * * * 2148 0 0 T 43 * * * * * * * 2054 * 1105 * * * * * * 1766 * * * 43 0 * * * * * * 2148 0 0 S 44 * * * * * * 2087 * * * * * * 2122 * 1766 2054 * * * 44 0 * * * * * * 2148 0 0 N 45 * 2122 * * * 2054 * * * * * 1766 * * 2087 * * * * * 45 0 * * * * * * 2148 0 0 G 46 * * 2054 * * 933 * * * * * * 2087 * * * * * * * 46 0 * * * * * * 2148 0 0 S 47 * * 2087 * * 2122 * * * * * 2054 * * * 1766 * * * * 47 0 * * * * * * 2148 0 0 A 48 1766 * * 502 * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 2148 0 0 E 49 * * * 1766 * * * * * * * 2054 * * * 1105 * * * * 49 0 * * * * * * 2148 0 0 E 50 * * * 1766 * * 502 * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 2148 0 0 V 51 * * * * * * * * * 502 * * * * * * * 1766 * * 51 0 * * * * * * 2148 0 0 R 52 * * * * * * * * * * * 2122 * 1070 1766 * * * * * 52 0 * * * * * * 2148 0 0 K 53 * * * * * * * * 1766 * * 502 * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 2148 0 0 A 54 376 * * * * 2122 * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 2148 0 0 A 55 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 2148 0 0 Y 56 2054 * * * * * * 2122 * * * * * 2087 * * * * * 1766 56 0 * * * * * * 2148 0 0 L 57 * * * * * * * * * 1766 * * * * * * * 502 * * 57 0 * * * * * * 2148 0 0 V 58 * * * * * * * * * 502 * * * * * * * 1766 * * 58 0 * * * * * * 2148 0 0 F 59 * * * * 1766 * * * * 502 * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 2148 0 0 I 60 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 2148 0 0 Y 61 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1070 933 61 0 * * * * * * 2148 0 0 H 62 * * * * * * 1766 * * * * * * 502 * * * * * * 62 0 * * * * * * 2148 0 0 T 63 * * * * * * * 2087 * * * * * * * * 933 2054 * * 63 0 * * * * * * 2148 0 0 F 64 * 2054 * * 933 * * * * * * * * * * * * 2087 * * 64 0 * * * * * * 2148 0 0 I 65 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 2148 0 0 K 66 * * * * * * * * 1766 * * * * * * * * 502 * * 66 0 * * * * * * 2148 0 0 N 67 * * 1070 * * * * * * * * 933 * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 2148 0 0 P 68 * * * * * 502 * * * * * * 1766 * * * * * * * 68 0 * * * * * * 2148 0 0 S 69 * * 2122 * * 2054 * * * * * * * * * 918 * * * * 69 0 * * * * * * 2148 0 0 D 70 * * 933 1070 * * * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 2148 0 0 E 71 2054 * 2122 1766 * * * * * * * * * 2087 * * * * * * 71 0 * * * * * * 2148 0 0 N 72 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 2148 0 0 V 73 * * * * * * * * * 1105 2054 * * * * * * 1766 * * 73 0 * * * * * * 2148 0 0 E 74 * * * 1766 * * * * * 2087 * * * * 1087 * * * * * 74 0 * * * * * * 2148 0 0 L 75 * * * * * * * * * 1766 * * * 2087 2054 * * * * 2122 75 0 * * * * * * 2148 0 0 W 76 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 76 0 * * * * * * 2148 0 0 R 77 * * * * * * 1070 * * * * * * * 933 * * * * * 77 0 * * * * * * 2148 0 0 N 78 * * * * * * * * * * * 1766 * 2054 2087 2122 * * * * 78 0 * * * * * * 2148 0 0 T 79 * * * * * * * 1070 * 2122 * * * * * * 1766 * * * 79 0 * * * * * * 2148 0 0 L 80 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 2148 0 0 I 81 * * * * * * * 1766 * * * * * 2087 2122 2054 * * * * 81 0 * * * * * * 2148 0 0 R 82 * * * * * * * * 1105 * * * * * 902 * * * * * 82 0 * * * * * * 2148 0 0 A 83 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 2148 0 0 Q 84 * * * * * 2122 2054 * * * * * * 1766 2087 * * * * * 84 0 * * * * * * 2148 0 0 I 85 * * * * 1087 * * 1766 * 2087 * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 2148 0 0 S 86 2087 * * * * * * * * * * 2122 * * * 902 * * * * 86 0 * * * * * * 2148 0 0 P 87 1105 * * * * * * * * * * * 902 * * * * * * * 87 0 * * * * * * 2148 0 0 I 88 * * 2122 * * * * 1766 * * 2054 * 2087 * * * * * * * 88 0 * * * * * * 2148 0 0 L 89 * * * * * * * 502 * 1766 * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 2148 0 0 A 90 1766 * * * * * * * * * * 2122 * * * * 1070 * * * 90 0 * * * * * * 2148 0 0 A 91 1766 * 2087 * * * * * * * * * 1087 * * * * * * * 91 0 * * * * * * 2148 0 0 E 92 2087 * * 1766 * * 2122 * * * * * * 2054 * * * * * * 92 0 * * * * * * 2148 0 0 H 93 * * * * * * 1766 * * * * * * 502 * * * * * * 93 0 * * * * * * 2148 0 0 T 94 * * * * * * * * * 2054 * * * * * * 1766 1105 * * 94 0 * * * * * * 2148 0 0 D 95 * * 1766 * * * * * * 2054 * * * * 1105 * * * * * 95 0 * * * * * * 2148 0 0 A 96 1766 * * * * * * * * 502 * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 2148 0 0 A 97 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 2148 0 0 L 98 * * * * * * * * * 398 2054 * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 2148 0 0 F 99 * * 2122 * 1766 1070 * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 2148 0 0 Y 100 * * * * 502 * * * * * * * * * * * * * * 1766 100 0 * * * * * * 2148 0 0 F 101 * * * * 1766 * * * * 502 * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 2148 0 0 A 102 1766 * * * * * * * * * * * * * 502 * * * * * 102 0 * * * * * * 2148 0 0 E 103 * * 2122 376 * * * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 2148 0 0 L 104 * * * * * * * * * 387 * * * * * * 2087 * * * 104 0 * * * * * * 2148 0 0 D 105 * * 1766 502 * * * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 2148 0 0 L 106 * * * * * * * * * 1766 * * 502 * * * * * * * 106 0 * * * * * * 2148 0 0 D 107 * * 387 2087 * * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 2148 0 0 A 108 1766 * * * * * * * * * 2087 * * * 2054 * 2122 * * * 108 0 * * * * * * 2148 0 0 F 109 * * 2122 2054 1766 * * * * * * * * 2087 * * * * * * 109 0 * * * * * * 2148 0 0 E 110 * * 2087 387 * * * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 2148 0 0 L 111 * * * * * * * 2087 * 1766 1087 * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 2148 0 0 A 112 1766 * * * * * * * * 2122 * 1070 * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 2148 0 0 Q 113 1105 * * * * * * * * * 2054 * * 1766 * * * * * * 113 0 * * * * * * 2148 0 0 F 114 * * * * 398 * * * * * 2054 * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 2148 0 0 R 115 * * * * * * * * * * * * * 2087 387 * * * * * 115 0 * * * * * * 2148 0 0 R 116 * * * 2054 * * * * * 2122 2087 * * * 1766 * * * * * 116 0 * * * * * * 2148 0 0 H 117 * * * * * * 933 * * * * * * * 1070 * * * * * 117 0 * * * * * * 2148 0 0 Y 118 * * * * 2054 * * * * * * * * * * * * * * 398 118 0 * * * * * * 2148 0 0 N 119 * * * * * * * * * * * 376 * 2122 * * * * * * 119 0 * * * * * * 2148 0 0 L 120 2087 * * * * 2054 * * * 1766 * * * 2122 * * * * * * 120 0 * * * * * * 2148 0 0 H 121 2054 * * * 1105 * 1766 * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 2148 0 0 F 122 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 2148 0 0 N 123 2122 * * * * * * * * 2054 * 1766 * 2087 * * * * * * 123 0 * * * * * * 2148 0 0 P 124 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 124 0 * * * * * * 2148 0 0 E 125 1603 * * 1472 * * * * * * * * * 1688 * * * * * * 125 0 * * * * * * 1922 0 0 P 126 * * * 966 * * * * * * * * 1035 * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1656 0 0 G 127 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1656 0 0 T 128 * * * * * * * * * * * * * * * * 1035 966 * * 128 0 * * * * * * 1656 0 0 L 129 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 L 130 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 H 131 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 131 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //