HHsearch 1.5 NAME c5ofxF_ FAM FILE c5ofxF_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5ofxF_.a3m DATE Sat Oct 7 08:32:18 2017 LENG 121 match states, 121 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.6 EVD 0.3762 -1.8208 SEQ >ss_dssp CCEEEEEETTCTTCEEEEEEECTTCEEEEEEECCEESSSSTTCEEETTEECTTSCCSTTTTSEEEEETTEEEECTTEEEEEECCSCEEEEEEECCCTTCG GGCEEEEEEEEEEEECCCCCC >sa_dssp EDCDCCACAECDECCDBDBEAEECACBBADBECEACBAEEECCDACBEBCCEECEDEEDCACABACBEEDDCEBBDDCEEEEBDCECDACABABBDEEDB ECBDDDADBDADBDDDEEDEE >ss_pred CCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEEHHHHHCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCEEEECCCEEEEEEECCCEEEEEEECCCCCC CCCCCEEEEEEEEECCCCCCC >ss_conf 9765443244557835468862896999751013220888741126568889876764112013001472034067418877403760999993587311 478870899999721335679 >Consensus xdWsGsVpANaenGkxTglIlkqGDxIsvvAxGWvkyGrxxxxWaapxGpxpxxxxpssxaxLvaKIgnktxxignGvlhktvPVdGeliLlfNDvPgty GdNSgxFxVxviiesrysplk >c5ofxF_ SDWSGSVPANAENGKSTGLILKQGDTISVVAHGWVKYGRDNVEWAAPDGPVPNNPQPSSIATLVAKIANKKFAIGNGVLHKTVPVDGELILLFNDVPGTF GDNSGEFQVEVIIESRYSPLK >UniRef50_Q05097(3-117:122) PA-I galactophilic lectin n=6 Tax=Pseudomonas aeruginosa RepID=PA1L_PSEAE E=1e-10 s/c=0.59 id=42% cov=87% --WKGEVLANNEAGQVTSIIYNPGDVITIVAAGWASYGPTQ-KW----GPQGDREHPDQglichdafCGALVMKIGNSgTIPVNTGLFRWVAPnnVQGAI TLIYNDVPGTYGNNSGSFSVNI---------- >UniRef50_B6VKY9(3-121:124) Similar to pa-i galactophilic lectin of pseudomonas aeruginosa n=2 Tax=Photorhabdus asymbiotica subsp. asymbiotica ATCC 43949 RepID=B6VKY9_PHOAA E=1e-49 s/c=1.66 id=72% cov=99% -DWSGSVPANAKNGKPTGLILKQGDIISVIAKGWVKFGRGDNQWAAPQGSIPTYQLNSSDA-LSAKIGDKTYDIGNGVLHKTVPVDGELILLFNDAPRYY GDNSDKFLVDVIIESRYSPLK # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 D 2 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1210 0 0 W 3 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 3 0 * * * * * * 1658 0 0 S 4 * * * * * * * * 1440 * * * * * * 663 * * * * 4 0 * * * * * * 1658 0 0 G 5 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1658 0 0 S 6 * * * 1440 * * * * * * * * * * * 663 * * * * 6 0 * * * * * * 1658 0 0 V 7 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 7 0 * * * * * * 1658 0 0 P 8 * * * * * * * * * 1440 * * 663 * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1658 0 0 A 9 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1658 0 0 N 10 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1658 0 0 A 11 663 * * * * * * * * * * 1440 * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1658 0 0 E 12 * * * 562 * * * * 1632 * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1658 0 0 N 13 1440 * * * * * * * * * * 663 * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1658 0 0 G 14 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1658 0 0 K 15 * * * * * * * * 663 * * * * 1440 * * * * * * 15 0 * * * * * * 1658 0 0 S 16 * * * * * * * * * * * * 1632 * * 1695 * 1440 * * 16 0 * * * * * * 1658 0 0 T 17 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 17 0 * * * * * * 1658 0 0 G 18 * * * * * 663 * * * * * * * * * 1440 * * * * 18 0 * * * * * * 1658 0 0 L 19 * * * * * * * 1440 * 663 * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1658 0 0 I 20 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1658 0 0 L 21 * * * * * * * * * 663 * * * * * * * * * 1440 21 0 * * * * * * 1658 0 0 K 22 * * * * * * * * 663 * * 1440 * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1658 0 0 Q 23 * * * * * * * * * * * * 1440 663 * * * * * * 23 0 * * * * * * 1658 0 0 G 24 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1658 0 0 D 25 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1658 0 0 T 26 * * * * * * * 1632 * * * * * * * * 1695 1440 * * 26 0 * * * * * * 1658 0 0 I 27 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1658 0 0 S 28 * * * * * * * * * * * * * * * 663 1440 * * * 28 0 * * * * * * 1658 0 0 V 29 * * * * * * * 1440 * * * * * * * * * 663 * * 29 0 * * * * * * 1658 0 0 V 30 * * * * * * * 1632 * * * * * * * * * 562 * * 30 0 * * * * * * 1658 0 0 A 31 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1658 0 0 H 32 1440 * * * * * 1695 * 1632 * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1658 0 0 G 33 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1658 0 0 W 34 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 34 0 * * * * * * 1658 0 0 V 35 1440 * * * * * * * * * * * * * * * * 663 * * 35 0 * * * * * * 1658 0 0 K 36 * * * * * * * * 663 * * * * * * 1440 * * * * 36 0 * * * * * * 1658 0 0 Y 37 * * * * 1632 * * * * * * * * * * * * * * 562 37 0 * * * * * * 1658 0 0 G 38 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1658 0 0 R 39 * * * * * * * * * * * * 1440 * 663 * * * * * 39 0 * * * * * * 1658 0 0 D 40 * * 1695 * * 1632 * * * * * * * * * * 1440 * * * 40 0 * * * * * * 1658 0 0 N 41 * * 1632 * * * * * * * * 1695 * 1440 * * * * * * 41 663 * 1440 * * * * 1658 0 0 V 42 * * * * * * * * * * * 1012 * * * * * 988 * * 42 0 * * * * 0 * 1210 0 1000 E 43 * * * 1695 * * * * 1440 * * * * 1632 * * * * * * 43 0 * * * * * * 1658 0 0 W 44 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 44 663 * 1440 * * * * 1658 0 0 A 45 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * 0 1210 0 1000 A 46 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * 0 1210 0 1000 P 47 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 47 0 * * * * * 0 1210 0 1000 D 48 * * 988 * * * * * * * * * * 1012 * * * * * * 48 0 * * * * 0 * 1210 0 1000 G 49 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1658 0 0 P 50 * * * * * * * * * * * * 562 * * 1632 * * * * 50 0 * * * * * * 1658 0 0 V 51 * * * * * * * 1632 * * * * * 1440 * * * 1695 * * 51 0 * * * * * * 1658 0 0 P 52 * * * * * 1440 * * * * * * 663 * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1658 0 0 N 53 * * 1440 * * * * * * * * 1695 * * * * 1632 * * * 53 0 * * * * * * 1658 0 0 N 54 * * * * * * * * * * * 1695 * * 1440 * * * * 1632 54 0 * * * * * * 1658 0 0 P 55 * * * 1440 * * * * * * * * 1695 1632 * * * * * * 55 0 * * * * * * 1658 0 0 Q 56 * * * * * * 1440 * * 1632 * * * 1695 * * * * * * 56 0 * * * * * * 1658 0 0 P 57 * * * * * * * * * * * 1632 562 * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1658 0 0 S 58 * * 1440 * * * * * * * * * * * * 663 * * * * 58 0 * * * * * * 1658 0 0 S 59 * * * * * * * * * * * * * 1440 * 663 * * * * 59 663 1440 * 3000 193 * * 1658 1000 0 I 60 * 1440 1632 * * * * 1695 * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1658 0 0 A 61 663 * * * * 1440 * * * * * * * * * * * * * * 61 562 * 1632 * * * * 1658 0 0 T 62 1068 * * * * * * * * * * * * * * * 935 * * * 62 0 * * * * 0 * 1464 0 1000 L 63 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1658 0 0 V 64 * * * * * * * * * * * * * * * 1632 * 562 * * 64 0 * * * * * * 1658 0 0 A 65 663 * * * * * * * * * 1440 * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1658 0 0 K 66 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1658 0 0 I 67 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1658 0 0 A 68 1695 * * * * 533 * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1658 0 0 N 69 * * 1632 * * * * * * * * 562 * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1658 0 0 K 70 * * * * * * * * 663 * * * * * * 1440 * * * * 70 663 1440 * 0 * * * 1658 1000 0 K 71 * * * * * * * * 1695 * * * * * * * 533 * * * 71 0 * * * * * * 1658 0 0 F 72 * * * * 1695 * * 1440 * * * * * * * * * * * 1632 72 0 * * * * * * 1658 0 0 A 73 1695 * 1632 * * * * * * * * * 1440 * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1658 0 0 I 74 * * * * * * * 663 * * * * * * * * * 1440 * * 74 0 * * * * * * 1658 0 0 G 75 * * * * * 663 * * * * * 1440 * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1658 0 0 N 76 * * * * * * * * * * * 663 * * * * 1440 * * * 76 0 * * * * * * 1658 0 0 G 77 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1658 0 0 V 78 * * * * * * * * * 1440 * * * * * * * 663 * * 78 0 * * * * * * 1658 0 0 L 79 * * * * 1440 * * * * 663 * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1658 0 0 H 80 * * * * * * 663 * * * * * * * 1440 * * * * * 80 0 * * * * * * 1658 0 0 K 81 * * * * * * * * 663 * * * * * * * * * 1440 * 81 0 * * * * * * 1658 0 0 T 82 * * * * * * * * * * * * * * * * 663 1440 * * 82 0 * * * * * * 1658 0 0 V 83 1440 * * * * * * * * * * * * * * * * 663 * * 83 0 * * * * * * 1658 0 0 P 84 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 84 663 1440 * 1000 1000 * * 1658 1000 0 V 85 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 85 0 * * * * * * 1658 0 0 D 86 * * 663 * * * * * * * * * * 1440 * * * * * * 86 0 * * * * * * 1658 0 0 G 87 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1658 0 0 E 88 1440 * * 663 * * * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1658 0 0 L 89 * * * * * * * 1440 * 663 * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1658 0 0 I 90 * * * * * * * 663 * * * * * * * * 1440 * * * 90 0 * * * * * * 1658 0 0 L 91 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1658 0 0 L 92 * * * * * * * 1440 * 663 * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1658 0 0 F 93 * * * * 663 * * * * * * * * * * * * * * 1440 93 0 * * * * * * 1658 0 0 N 94 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1658 0 0 D 95 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1658 0 0 V 96 1632 * * * * * * * * * * * * * * * * 562 * * 96 0 * * * * * * 1658 0 0 P 97 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1658 0 0 G 98 * * * * * 562 * * * * * * * * 1632 * * * * * 98 0 * * * * * * 1658 0 0 T 99 * * * * * * * * * * * * * * * * 562 * * 1632 99 0 * * * * * * 1658 0 0 F 100 * * * * 1695 * * * * * * * * * * * * * * 533 100 0 * * * * * * 1658 0 0 G 101 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1658 0 0 D 102 * * 663 * * * * * * * * 1440 * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1658 0 0 N 103 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1658 0 0 S 104 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 104 0 * * * * * * 1658 0 0 G 105 * * 1632 * * 562 * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1658 0 0 E 106 * * * 1695 * * * * 1632 * * * * * * 1440 * * * * 106 0 * * * * * * 1658 0 0 F 107 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1658 0 0 Q 108 * * * * * * * * * 1632 * * * 1695 * 1440 * * * * 108 0 * * * * * * 1658 0 0 V 109 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 109 0 * * * * * * 1658 0 0 E 110 * * 1632 1695 * * * * * * * 1440 * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1658 0 0 V 111 * * * * * * * 1440 * * * * * * * * * 663 * * 111 0 * * * * * * 1658 0 0 I 112 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1210 0 0 I 113 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1210 0 0 E 114 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1210 0 0 S 115 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 115 0 * * * * * * 1210 0 0 R 116 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 116 0 * * * * * * 1210 0 0 Y 117 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 117 0 * * * * * * 1210 0 0 S 118 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 118 0 * * * * * * 1210 0 0 P 119 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1210 0 0 L 120 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1210 0 0 K 121 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 121 0 * * 0 * * * 1210 0 0 //