HHsearch 1.5 NAME c5mtwD_ FAM FILE c5mtwD_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5mtwD_.a3m DATE Sat Oct 27 08:24:57 2018 LENG 136 match states, 136 columns in multiple alignment FILT 4 out of 8 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.4 EVD 0.3993 -1.5383 SEQ >ss_dssp CHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEEEEECSCCCTTSCEEEEEEEEEEEEEETTTEEEEEEEEEEEEEEEECCEEEEEEEEEEEEEEECCCCCCCCHHHHH HHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSCCCCCCCC >sa_dssp EEDCCDADCBDEDCEDEECEDDDDEDDDDEECEEEEEDDCDBECECDCDDDCEEDDBACACACBCADBDDEDCAACADABBBADACBEDEDEDBDEDBBD ABACCDADECABDEACECADCBADECEBEDCEAEED >ss_pred CCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEECCCCCEEEEEEEEEEEEEECCCCCCCCHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCC >ss_conf 9056778777433220360321002231267787666058888423567882102148999999984337530322324456676641686574788887 554666888663899999996653117677202029 >Consensus xxlxxxxArlxxxaeLxxIxxxxxxaarhxxxxpxxxxtxdixletaxsaxxxxxxayxxxxxcqxxixxxdxxxvadxxxxxlxxyxfxxddxxexxie aygxxxxxxaxxPYlRExvxxLagrlglpxltLxxL >c5mtwD_ LDLQRVGARLAARAQIRDIRLLRTQAAVHRAPKPAQGLTYDLEFEPAVDADPATISAFVVRISCHLRIQNQQDVATADFEFAALFDYHLGEDDPTEEELT AYAATTGRFALYPYIREYVYDLTGRLALPPLTLEIL >UniRef50_B5HVM5(12-134:152) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Streptomyces sviceus ATCC 29083 RepID=B5HVM5_9ACTO E=8e-41 s/c=1.36 id=23% cov=91% -------SNFVARVDLRGIVAQECHAVRHSGAAPERA---DVSLDTALSSRPGAVD-YRFTLACQAFDASEELV--ADLSVVLLTSFLFEGDEVSESVYE SFGTNIAVMTAYPYLRQHIHDLAGRIGLANFTLGLL >UniRef50_Q0RTF8(14-135:157) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Frankia alni ACN14a RepID=Q0RTF8_FRAAA E=8e-07 s/c=0.45 id=24% cov=89% -------AQILQSAELYDISTQSCHATRHTEAPPA---LIDIELNTNASLEAAGLD---VTVTCQCAIRGDDQSSVADIGLTILVRYAFPADfNRAAFSI DQEGELHVLRASFPYLREGIQSLAARLGIPGIAL--- >UniRef50_UPI0001B55762(8-138:151) hypothetical protein StreC_11512 n=1 Tax=Streptomyces sp. C RepID=UPI0001B55762 E=2e-05 s/c=0.38 id=23% cov=97% -ELLKGAARLHRSAELGGV-LLESVEARAPGRHLDPPFTVEIAIESSYSAPMEGKLAYTFRYDVQAK---SDDKIVMQVKALYRVKYSFDLEDVPEDVIE AYGENVALATVHPYVRELVRRISGDFGFPPLTLDNL # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * L 1 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 D 2 * * 958 1043 * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1670 0 0 L 3 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1670 0 0 Q 4 * * * * * * * * * 1043 * * * 958 * * * * * * 4 0 * * * * * * 1670 0 0 R 5 * * * * * * * * 1043 * * * * * 958 * * * * * 5 0 * * * * * * 1670 0 0 V 6 * * * * * 1043 * * * * * * * * * * * 958 * * 6 0 * * * * * * 1670 0 0 G 7 1043 * * * * 958 * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1670 0 0 A 8 395 * * * * * * * * * * * * * * 2062 * * * * 8 0 * * * * * * 2551 0 0 R 9 * * * * * * * * * * * 2062 * 2066 938 * * * * * 9 0 * * * * * * 2551 0 0 L 10 * * * * 2062 * * 2066 * 938 * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 2551 0 0 A 11 1922 * * * * * 1955 * * 2066 * * * * * * * 2062 * * 11 0 * * * * * * 2551 0 0 A 12 990 * * * * * * * * * * * * 2066 1955 * * * * * 12 0 * * * * * * 2551 0 0 R 13 * * * * * * * * * * * * * * 990 1010 * * * * 13 0 * * * * * * 2551 0 0 A 14 395 * * * * * * * * * * * * * * * * 2062 * * 14 0 * * * * * * 2551 0 0 Q 15 * * 2062 1010 * * * * * * * * * 1922 * * * * * * 15 0 * * * * * * 2551 0 0 I 16 * * * * * * * 1922 * 442 * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 2551 0 0 R 17 * * * * * 1955 * * * * * * * * 990 * * * * 2066 17 0 * * * * * * 2551 0 0 D 18 * * 992 * * 1008 * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 2551 0 0 I 19 * * * * * * * 430 * * * * * * * * * 1955 * * 19 430 * 1955 * * * * 2551 0 0 R 20 * * * * * * * * * * * * * * 1467 1652 * 1643 * * 20 0 * * * * 0 * 2134 0 1000 L 21 2062 * * * * * * * * 938 * * * * * * 2066 * * * 21 0 * * * * * * 2551 0 0 L 22 * * * * * * * * * 938 * * * 1064 * * * * * * 22 0 * * * * * * 2551 0 0 R 23 * * * 1008 * * * * * * * * * * 1922 2066 * * * * 23 0 * * * * * * 2551 0 0 T 24 * 1064 * * * * * * * * * * * * * 1955 1922 * * * 24 0 * * * * * * 2551 0 0 Q 25 * * * * * * 1064 * * * * * * 1922 * * * 1955 * * 25 0 * * * * * * 2551 0 0 A 26 430 * * 1955 * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 2551 0 0 A 27 938 * * * * * * * * * * * * * * * 2066 2062 * * 27 0 * * * * * * 2551 0 0 V 28 * * * * * * * * * * * * * * 442 * * 1922 * * 28 0 * * * * * * 2551 0 0 H 29 1955 * * * * * 430 * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 2551 0 0 R 30 * * * * * * * * * * * * 1955 * 1922 2062 2066 * * * 30 0 * * * * * * 2551 0 0 A 31 1922 * * 2066 * 1008 * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 2551 0 0 P 32 1064 * * * * * * * * * * * 1922 * 1955 * * * * * 32 0 * * * * * * 2551 0 0 K 33 2062 * * * * * 1955 * 1922 * * * 2066 * * * * * * * 33 0 * * * * * * 2551 0 0 P 34 * * * * * * * * * 1955 * * 430 * * * * * * * 34 0 * * * * * * 2551 0 0 A 35 992 * 1955 2062 * * * * * * * * * * * * * * * * 35 394 * 2066 * * * * 2551 0 0 Q 36 * * * * * * * * * * * * 1588 1538 1630 * * * * * 36 0 * * * * * 0 2166 0 1000 G 37 1630 * * * * 1538 * * * * * * 1588 * * * * * * * 37 563 * 1630 * * * 0 2166 0 1000 L 38 * * * * 1043 * * * * 958 * * * * * * * * * * 38 0 * * * * 1000 1000 1670 0 1581 T 39 * * * * * * * * * 1626 * * * * * * 565 * * * 39 0 * * * * * 0 2170 0 1000 Y 40 * * * * * * * 1626 * * * * * * * * * 1591 * 1540 40 0 * * * * 0 * 2170 0 1000 D 41 * * 430 1955 * * * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 2551 0 0 L 42 * * * * * * * 1010 * 1922 * * * * * * * 2062 * * 42 0 * * * * * * 2551 0 0 E 43 1955 * * 992 * * * * * * * * * * * 2062 * * * * 43 0 * * * * * * 2551 0 0 F 44 * * * * 1922 * * 1955 * 1064 * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 2551 0 0 E 45 * * 2062 938 * * * * * * * 2066 * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 2551 0 0 P 46 * * * * * * * * * * * * 1922 * * 1955 1064 * * * 46 0 * * * * * * 2551 0 0 A 47 990 * * * * * * * * * * 2066 * * * 1955 * * * * 47 0 * * * * * * 2551 0 0 V 48 2066 * * * * * * * * 2062 * * * * * * * 1922 * 1955 48 0 * * * * * * 2551 0 0 D 49 * * 1922 * * * * * * * * * * * * 442 * * * * 49 0 * * * * * * 2551 0 0 A 50 938 * * * * * * * * 2066 * * * * * 2062 * * * * 50 0 * * * * * * 2551 0 0 D 51 * * 1922 2066 * * * * * * * * 1955 * 2062 * * * * * 51 0 * * * * * * 2551 0 0 P 52 2066 * * * * * * * * * 1955 * 990 * * * * * * * 52 0 * * * * * * 2551 0 0 A 53 992 * * 1955 * 2062 * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 2551 0 0 T 54 2062 * * * * 1010 * * * * * * * * * * 1922 * * * 54 0 * * * * * * 2551 0 0 I 55 * * * * * * * 1922 1955 2066 * * * * * * * 2062 * * 55 0 * * * * * * 2551 0 0 S 56 * * 1064 * * * * * * 1955 * * * * * 1922 * * * * 56 938 * 1064 * * * * 2551 0 0 A 57 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * 1000 1000 1670 0 1581 F 58 * * * * 1538 * * * * * * * * * * * * * * 609 58 0 * * * * * 0 2166 0 1000 V 59 * * * * * * * * * * * * * * 1630 * 1588 1538 * * 59 0 * * * * 0 * 2166 0 1000 V 60 * * * * 1008 * * * * * * * * * * * * 992 * * 60 0 * * * * * * 2551 0 0 R 61 * * * * * * * * * * * * * * 938 * 1064 * * * 61 0 * * * * * * 2551 0 0 I 62 * * * * * * * 1922 * 2062 * * * * * * * 2066 * 1955 62 0 * * * * * * 2551 0 0 S 63 2062 * 1955 * * * * * * * * * * * * 1922 2066 * * * 63 0 * * * * * * 2551 0 0 C 64 * 430 * * * * * * * * * * * * * * * 1955 * * 64 0 * * * * * * 2551 0 0 H 65 * * * * * * 1922 * * * * * * 442 * * * * * * 65 0 * * * * * * 2551 0 0 L 66 1008 2066 * * * * * * * 1922 * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 2551 0 0 R 67 2066 * * * 2062 * * * 1955 * * * * * 1922 * * * * * 67 430 * 1955 * * * * 2551 0 0 I 68 * * 1643 * * * * 557 * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * 0 2134 0 1000 Q 69 1643 * * * * * * * * * * * * 1467 1652 * * * * * 69 0 * * * * * 0 2134 0 1000 N 70 * * * * * 1652 * * * * * 1467 * * * 1643 * * * * 70 0 * * * * 0 * 2134 0 1000 Q 71 * * 2066 2062 * * * * * * * * * 1922 * 1955 * * * * 71 0 * * * * * * 2551 0 0 Q 72 * * 1010 2062 * * * * * * * * * 1922 * * * * * * 72 0 * * * * * * 2551 0 0 D 73 * * 938 * * * * * * 2062 * * * 2066 * * * * * * 73 0 * * * * * * 2551 0 0 V 74 * * * * * * * * 1955 * * * * * * 2066 * 990 * * 74 395 * 2062 * * * * 2551 0 0 A 75 1540 * * * * * * 1591 * * * * * * * 1626 * * * * 75 0 * * * * * 0 2170 0 1000 T 76 * * * * * * * * * * * * * * * * 1540 608 * * 76 0 * * * * 0 * 2170 0 1000 A 77 430 * * * * * * * * * 1955 * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 2551 0 0 D 78 * * 430 * * * * * * * * * * 1955 * * * * * * 78 0 * * * * * * 2551 0 0 F 79 * * * * 1922 * * 2066 * 2062 * * * * * * * 1955 * * 79 0 * * * * * * 2551 0 0 E 80 * * * 1922 * 2066 * * 1955 * * * * * * 2062 * * * * 80 0 * * * * * * 2551 0 0 F 81 1955 * * * 1922 * * * * 2066 * * * * * * * 2062 * * 81 0 * * * * * * 2551 0 0 A 82 1922 * * * * * * * * 1955 * * * * * * 2066 2062 * * 82 0 * * * * * * 2551 0 0 A 83 1922 * * * * * * 2066 * 2062 * * * * * * * * * 1955 83 0 * * * * * * 2551 0 0 L 84 * * * * * * * * * 430 * * * * 1955 * * * * * 84 0 * * * * * * 2551 0 0 F 85 * * * * 1922 * * * * * * * * * * * 2062 1010 * * 85 0 * * * * * * 2551 0 0 D 86 * * 1922 * * * * * 1955 * * * * * 2066 2062 * * * * 86 0 * * * * * * 2551 0 0 Y 87 * * * * 2062 * * * * * * * * * * * * * * 395 87 0 * * * * * * 2551 0 0 H 88 2066 * * * * * 1922 * * 2062 * * * * * 1955 * * * * 88 0 * * * * * * 2551 0 0 L 89 * * * * 442 * * * * 1922 * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 2551 0 0 G 90 * * 1955 2062 * 1922 * * * * * * 2066 * * * * * * * 90 0 * * * * * * 2551 0 0 E 91 2066 * * 1922 * 2062 * * * 1955 * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 2551 0 0 D 92 * * 430 1955 * * * * * * * * * * * * * * * * 92 394 2066 * 0 * * * 2551 1000 0 D 93 * * 938 2062 * * * * * * * 2066 * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 2551 0 0 P 94 * * * * * * * * * * * * 1922 * 2066 * * 1008 * * 94 0 * * * * * * 2551 0 0 T 95 2066 * * * * * * * * * * * 1955 * * 2062 1922 * * * 95 0 * * * * * * 2551 0 0 E 96 2066 * * 394 * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 2551 0 0 E 97 * * 1955 1922 2066 * * * * * * * * * * 2062 * * * * 97 0 * * * * * * 2551 0 0 E 98 * * * 1922 * * * * * * * * * * * 2066 * 1008 * * 98 0 * * * * * * 2551 0 0 L 99 * * * * * * * 1010 * 1922 * * * * * * * * * 2062 99 0 * * * * * * 2551 0 0 T 100 * * 2066 1008 * * * * * * * * * * * * 1922 * * * 100 0 * * * * * * 2551 0 0 A 101 938 * * * * * * * * * * * * 2066 * 2062 * * * * 101 0 * * * * * * 2551 0 0 Y 102 * * * 2066 2062 * * * * * * * * * * * * * * 938 102 0 * * * * * * 2551 0 0 A 103 1922 * * * * 442 * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 2551 0 0 A 104 1922 * * 1010 * * * * * * * * * * * * 2062 * * * 104 0 * * * * * * 2551 0 0 T 105 * * * * * * * * * 2066 * 1008 * * * * 1922 * * * 105 0 * * * * * * 2551 0 0 T 106 * * * * * * 2066 2062 * * * * * * * * 1922 1955 * * 106 0 * * * * * * 2551 0 0 G 107 1008 * * * * 1922 * * * * * * * * * * * 2066 * * 107 0 * * * * * * 2551 0 0 R 108 * * * * * * * * * 1010 * * * * 1922 * * 2062 * * 108 0 * * * * * * 2551 0 0 F 109 1955 * * * 1922 * * * * * 2062 * * * 2066 * * * * * 109 0 * * * * * * 2551 0 0 A 110 992 * * * * * * * * * * * * * * * 1008 * * * 110 0 * * * * * * 2551 0 0 L 111 2062 * * * * * * * * 1922 * * * * * 2066 * 1955 * * 111 0 * * * * * * 2551 0 0 Y 112 * * * * 2066 * 1955 * * * * * * * * * * * * 990 112 0 * * * * * * 2551 0 0 P 113 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 113 0 * * * * * * 2551 0 0 Y 114 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 114 0 * * * * * * 2551 0 0 I 115 * * * * * * * 1922 * 1064 * * * * * * * 1955 * * 115 0 * * * * * * 2551 0 0 R 116 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 116 0 * * * * * * 2551 0 0 E 117 * * * 395 * * * * * * * * * 2062 * * * * * * 117 0 * * * * * * 2551 0 0 Y 118 * * * * * 2066 2062 * * 1955 * * * * * * * * * 1922 118 0 * * * * * * 2551 0 0 V 119 * * * * * * * 1064 * * * * * * * * * 938 * * 119 0 * * * * * * 2551 0 0 Y 120 * * * * * * 2062 * * * * * * 2066 1955 * * * * 1922 120 0 * * * * * * 2551 0 0 D 121 * * 990 * * * * * * * * * * * 1955 2066 * * * * 121 0 * * * * * * 2551 0 0 L 122 * * * * * * * 1955 * 430 * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 2551 0 0 T 123 1064 * * * * * * * * * * * * * * 1955 1922 * * * 123 0 * * * * * * 2551 0 0 G 124 2066 * * * * 394 * * * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 2551 0 0 R 125 * * 1955 * * * * * * * * * * * 430 * * * * * 125 0 * * * * * * 2551 0 0 L 126 * * * * 1955 * * 2062 * 992 * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 2551 0 0 A 127 1922 * * * * 442 * * * * * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 2551 0 0 L 128 * * * * 1955 * * 2066 * 990 * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 2551 0 0 P 129 2062 * * * * * * * * * * * 395 * * * * * * * 129 0 * * * * * * 2551 0 0 P 130 * * * * * 2066 * * * * * 2062 938 * * * * * * * 130 0 * * * * * * 2551 0 0 L 131 * * * * 2062 * * 2066 * 938 * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 2551 0 0 T 132 2066 * * * * * * * * * * * * * * * 394 * * * 132 0 * * * * * * 2551 0 0 L 133 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 2551 0 0 E 134 * * 1588 1538 * 1630 * * * * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 2166 0 0 I 135 * * * * * * * 1538 * 1630 * 1588 * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 2166 0 0 L 136 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 136 0 * * 0 * * * 2166 0 0 //