HHsearch 1.5 NAME c5m4oC_ FAM FILE c5m4oC_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5m4oC_.a3m DATE Sat Sep 30 08:15:22 2017 LENG 167 match states, 167 columns in multiple alignment FILT 4 out of 8 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.7 EVD 0.4033 -0.5276 SEQ >ss_dssp CCCCCCCCCSSSCCCCCCCCSSSCGGGGCCCCHHHHHHHSCTTCEEEEEEETTEEEEEEEEEEECCEEECSSCEEEEEEESCEEEEEEEESCGGGTSCTT CCSCEEEESSCCSEEEEEEEEECTTCEEEECTTEEEEEEEEEEEEEEEEEESCSSEECCHHHHSCCC >sa_dssp EEEEEEECCCEEDEDEECEDEEDDBEEDDCCCCBCBADEBDDBCAAABCDEEDEBDAAABADDEBCBBABCCDACACACCCDACACBBDBEECEEDBEDE CDAACECDEEEBEDEEDDEDDBEDEDEBDACDCBAACADAEEDAAACAEBBDCECBCDCCEEBBCCE >ss_pred CCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCEEEEEECCEEEEEEEEECCCCCCCCCC CCCHHHHCCCCCCCCEEEEEEEECCCEEECCCCCEEEEECCCCCEEHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCC >ss_conf 9321201222001247158871660243677788775237874251100541564445441488872331033289997160799999805873123665 4301221344878760027888417333035541368743684100223422641188787753269 >Consensus xxvxTxFxslxxyxKGxiexixxxxxxYxFSNifEvAaxsaPYervvvgxNlxYviExxRAEGtSpWFacaHDEFxiamDgxvxvxflKLdxxxxxxDxd xeGxxxxgexlPxGxxMGxixLkRGHqaLLPxgxAYRFxAxxPxxllxQsixGxxsVqKWadICxxx >c5m4oC_ ADVVTEFGALTDYRKGGVEIIDDDPRNYVFSNVFEVAANAAPYERVAVGKNFEYVIESARAEGTSGWFSCAHDEFVLAMDGQIEVHLLKLDNSDAYVDPD SEGAVAIGEALPEGRKMGRIVLRRGHMALLPVGAAYRFYAEQPAAMLFQSIEGAVTVQKWGEICQTE >UniRef50_Q7NA08(7-164:166) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Photorhabdus luminescens subsp. laumondii RepID=Q7NA08_PHOLL E=2e-47 s/c=1.20 id=53% cov=95% ----TAFASIDNYHKGGIQALVEDPKRYVFSNMYEIAATSAPYDRIVAAINLDYTIEIARAEGTSPWFACAHDEFVVAMDYDVEVHFVKL-TDESVIDED KDGAVKLN-GTPDGQKMGCIYLKRGHQALLPEKVAYRFHADKPATLMIQSILGDVSVQKWADIC--- >UniRef50_C1I210(6-162:164) Hydroquinone dioxygenase small subunit n=11 Tax=Proteobacteria RepID=C1I210_9PSED E=6e-71 s/c=1.71 id=53% cov=95% --VNTVFASLDNFRKGTVEIISGEARHYAFSNIFEVAQNSKPYEKVVVGLNLGYVVETLRAEGQSPWFTAAHDEFAIVMDGEVRVEFLKLDAPSKH---- GEGTHLAGE-LPVGKPMGYVLLKRGHQCLLPAGSAYRFEASRPGVILQQTIKGPLSVEKWAEIC--- >UniRef50_B1GRL8(9-163:165) Hydroquinone dioxygenase small subunit n=12 Tax=Proteobacteria RepID=B1GRL8_PSEFL E=3e-70 s/c=1.72 id=51% cov=93% ----TVFGSLAQYTKGSIELVTGKKAHYAFSNIFEVAAKSAPYEKVVVGANLGYVIETLRAEGTSPWFACSHDEFLISVDGSVRIDFLKLDETPLAGD-- --GTRLAGE-LPKGKPMGYVLLKRGHQALLPAGCAYRFEASNPCVLLQQTVLGPLSVEKWADIC--- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * A 1 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 D 2 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 V 3 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 3 0 * * * * * * 1366 0 0 V 4 * * * * * * * * * * * 1045 * * * * * 956 * * 4 0 * * * * * * 1366 0 0 T 5 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 5 0 * * * * * * 1724 0 0 E 6 1879 * * 1910 * * * * * * * * * * * * * 1114 * * 6 0 * * * * * * 1724 0 0 F 7 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1724 0 0 G 8 990 * * * * 1011 * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1724 0 0 A 9 1910 * * * * * * * * * * * * * * 446 * * * * 9 0 * * * * * * 1724 0 0 L 10 * * * * * * * 1879 * 458 * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1724 0 0 T 11 2119 * 990 * * * * * * * * * * * * * 1910 * * * 11 0 * * * * * * 1724 0 0 D 12 * * 1910 * * * * * * * * 990 * 2119 * * * * * * 12 0 * * * * * * 1724 0 0 Y 13 * * * * 2109 * * * * * * * * * * * * * * 380 13 0 * * * * * * 1724 0 0 R 14 * * * * * * 1879 * * * * * * * 1006 * 2119 * * * 14 0 * * * * * * 1724 0 0 K 15 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1724 0 0 G 16 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1724 0 0 G 17 * * * * * 894 * * * * * * * * * 2119 2109 * * * 17 0 * * * * * * 1724 0 0 V 18 * * * * * * * 994 * * * * * * * * * 1006 * * 18 0 * * * * * * 1724 0 0 E 19 * * * 458 * * * * * * * * * 1879 * * * * * * 19 0 * * * * * * 1724 0 0 I 20 1879 * * * * * * 1006 * 2119 * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1724 0 0 I 21 * * * * * * * 1006 * 1879 * * * * * * * 2119 * * 21 0 * * * * * * 1724 0 0 D 22 * * 1910 * * * * * * * * * * * * 2109 2119 1879 * * 22 0 * * * * * * 1724 0 0 D 23 * * 1910 1879 * 1114 * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1724 0 0 D 24 * * 894 2109 * * * * 2119 * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1724 0 0 P 25 2109 * * * * * * * 2119 * * * 894 * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1724 0 0 R 26 2119 * * * * * * * 1879 * * * * * 1006 * * * * * 26 0 * * * * * * 1724 0 0 N 27 * * * * * * 1114 * * * * 1910 * * 1879 * * * * * 27 0 * * * * * * 1724 0 0 Y 28 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 28 0 * * * * * * 1724 0 0 V 29 1114 * * * * * * * * * * * * * * * * 894 * * 29 0 * * * * * * 1724 0 0 F 30 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1724 0 0 S 31 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 31 0 * * * * * * 1724 0 0 N 32 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1724 0 0 V 33 * * * * * * * 1114 * * 1879 * * * * * * 1910 * * 33 0 * * * * * * 1724 0 0 F 34 * * * * 458 * * * * * * * * * * * * * * 1879 34 0 * * * * * * 1724 0 0 E 35 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1724 0 0 V 36 * * * * * * * 1879 * * * * * * * * * 458 * * 36 0 * * * * * * 1724 0 0 A 37 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1724 0 0 A 38 380 * * * * * * * * * * * * 2109 * * * * * * 38 0 * * * * * * 1724 0 0 N 39 * * * * * * * * 2119 * * 1006 * * * * 1879 * * * 39 0 * * * * * * 1724 0 0 A 40 1910 * * * * * * * * * * * * * * 446 * * * * 40 0 * * * * * * 1724 0 0 A 41 380 * * * * * * * 2109 * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1724 0 0 P 42 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1724 0 0 Y 43 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 43 0 * * * * * * 1724 0 0 E 44 * * 1879 458 * * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1724 0 0 R 45 * * * * * * * * 1114 * * * * * 894 * * * * * 45 0 * * * * * * 1724 0 0 V 46 * * * * * * * 1879 * * * * * * * * * 458 * * 46 0 * * * * * * 1724 0 0 A 47 1910 * * * * * * * * * * * * * * * * 446 * * 47 0 * * * * * * 1724 0 0 V 48 1879 * * * * * * * * * * * * * * * * 458 * * 48 0 * * * * * * 1724 0 0 G 49 1879 * * * * 458 * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1724 0 0 K 50 2119 * * * * * * 1879 1910 2109 * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1724 0 0 N 51 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1724 0 0 F 52 * * * * 1910 * * * * 446 * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1724 0 0 E 53 * * 1879 1910 * 1114 * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1724 0 0 Y 54 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 54 0 * * * * * * 1724 0 0 V 55 * * * * * * * * * * * * * * * * 1879 458 * * 55 0 * * * * * * 1724 0 0 I 56 * * * * * * * 380 * * * * * * * * * 2109 * * 56 0 * * * * * * 1724 0 0 E 57 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1724 0 0 S 58 * * * * * * * 1879 * * * * * * * 1910 1114 * * * 58 0 * * * * * * 1724 0 0 A 59 894 * * * * * * * * 1114 * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1724 0 0 R 60 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 60 0 * * * * * * 1724 0 0 A 61 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1724 0 0 E 62 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1724 0 0 G 63 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1724 0 0 T 64 * * * * * * * * * * * * * 2109 * * 380 * * * 64 0 * * * * * * 1724 0 0 S 65 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 65 0 * * * * * * 1724 0 0 G 66 * * * * * 1910 * * * * * * 446 * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1724 0 0 W 67 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 67 0 * * * * * * 1724 0 0 F 68 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1724 0 0 S 69 994 * * * * * * * * * * * * * * 1910 2109 * * * 69 0 * * * * * * 1724 0 0 C 70 2109 380 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1724 0 0 A 71 377 * * * * * * * * * * * * * * 2119 * * * * 71 0 * * * * * * 1724 0 0 H 72 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1724 0 0 D 73 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1724 0 0 E 74 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1724 0 0 F 75 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1724 0 0 V 76 2109 * * * * * * * * 2119 * * * * * * * 894 * * 76 0 * * * * * * 1724 0 0 L 77 * * * * * * * 1114 * 1910 * * * * * * * 1879 * * 77 0 * * * * * * 1724 0 0 A 78 894 * * * * * * * * * * * * * * 2119 * 2109 * * 78 0 * * * * * * 1724 0 0 M 79 * * * * * * * * * * 377 * * * * * * 2119 * * 79 0 * * * * * * 1724 0 0 D 80 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1724 0 0 G 81 * * * * * 458 * * * * * * * * * * * * * 1879 81 0 * * * * * * 1724 0 0 Q 82 * * 1879 2109 * * * * * * * * * 1910 * 2119 * * * * 82 0 * * * * * * 1724 0 0 I 83 * * * * * * * 1910 * * * * * * * * * 446 * * 83 0 * * * * * * 1724 0 0 E 84 * * * 894 * * * * * * * * * * 1114 * * * * * 84 0 * * * * * * 1724 0 0 V 85 * * * * * * * 2119 * * * * * * * * * 377 * * 85 0 * * * * * * 1724 0 0 H 86 * * 2119 2109 * * 894 * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1724 0 0 L 87 * * * * 446 * * * * 1910 * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1724 0 0 L 88 * * * * * * * * * 458 * * * * * * * 1879 * * 88 0 * * * * * * 1724 0 0 K 89 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1724 0 0 L 90 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 90 458 * 1879 * * * * 1724 0 0 D 91 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * 0 * 1504 0 1000 N 92 2109 * * 2119 * * * * * * * 1910 * * * * 1879 * * * 92 0 * * * * * * 1724 0 0 S 93 * * 1879 * * * * * * * * * 2109 * * 1910 2119 * * * 93 0 * * * * * * 1724 0 0 D 94 * * 1910 1879 * * * * * * * * 2119 * * 2109 * * * * 94 0 * * * * * * 1724 0 0 A 95 1910 * * * * * * * 2109 2119 * * * * * 1879 * * * * 95 0 * * * * * * 1724 0 0 Y 96 2119 * * * * * 2109 * * * * * * * * * * 1879 * 1910 96 380 * 2109 * * * * 1724 0 0 V 97 * * * * * 1594 * 1594 * * * * * * * * * 1567 * * 97 0 * * * * * 0 1626 0 1000 D 98 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 98 580 * 1594 * * * 0 1626 0 1000 P 99 * * * 1018 * * * * * * * * 982 * * * * * * * 99 0 * * * * * 0 1372 0 1209 D 100 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * 1000 1000 1372 0 1209 S 101 * * * * * 1592 * * 1565 * * * * * * 1599 * * * * 101 0 * * * * * 0 1626 0 1000 E 102 * * 1565 595 * * * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * 0 * 1626 0 1000 G 103 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1724 0 0 A 104 894 * * * * * * * * * * * * * * * 1114 * * * 104 0 * * * * * * 1724 0 0 V 105 * * * * * * 2109 * * * * * * * 2119 * * 894 * * 105 0 * * * * * * 1724 0 0 A 106 1910 * * * * * * * 1879 1114 * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1724 0 0 I 107 1114 * * * * * * 1910 * 1879 * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1724 0 0 G 108 * * * * * 458 * * * * * 1879 * * * * * * * * 108 458 * 1879 * * * * 1724 0 0 E 109 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 109 1393 * 691 * * 0 * 1504 0 1000 A 110 982 * * * * 1018 * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * 0 * 1372 0 1209 L 111 * * * * * * * * * 458 * * * * * * 1879 * * * 111 0 * * * * * * 1724 0 0 P 112 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1724 0 0 E 113 * * 1879 1910 * * * * 2119 * * * * * * * * 2109 * * 113 0 * * * * * * 1724 0 0 G 114 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1724 0 0 R 115 * * * * * * * * 1114 * * * * 1879 1910 * * * * * 115 0 * * * * * * 1724 0 0 K 116 * * * * * * * * 894 * * * 1114 * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1724 0 0 M 117 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1724 0 0 G 118 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1724 0 0 R 119 * 1879 * * * * * * * * * * * * 1910 * * * * 1114 119 0 * * * * * * 1724 0 0 I 120 * * * * * * * 894 * * * * * * * * * 1114 * * 120 0 * * * * * * 1724 0 0 V 121 * * * * * * * * * 1114 * * * * * * * 1910 * 1879 121 0 * * * * * * 1724 0 0 L 122 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1724 0 0 R 123 * * * * * * * * 446 * * * * * 1910 * * * * * 123 0 * * * * * * 1724 0 0 R 124 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 124 0 * * * * * * 1724 0 0 G 125 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1724 0 0 H 126 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1724 0 0 M 127 * * * * * * * * * * 1910 * * 446 * * * * * * 127 0 * * * * * * 1724 0 0 A 128 380 2109 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1724 0 0 L 129 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1724 0 0 L 130 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1724 0 0 P 131 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1724 0 0 V 132 1114 * * 1879 * * * * * * * * * * * * * 1910 * * 132 0 * * * * * * 1724 0 0 G 133 * * * * * 458 * * 1879 * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1724 0 0 A 134 1910 2119 * * * * * * * * * * * * * 2109 * 1879 * * 134 0 * * * * * * 1724 0 0 A 135 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1724 0 0 Y 136 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 136 0 * * * * * * 1724 0 0 R 137 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 137 0 * * * * * * 1724 0 0 F 138 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1724 0 0 Y 139 * * * 1114 * * 1879 * * * * * * * * * * * * 1910 139 0 * * * * * * 1724 0 0 A 140 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1724 0 0 E 141 * * 1879 1910 * * * * * * * * * * * 1114 * * * * 141 0 * * * * * * 1724 0 0 Q 142 * * * * * * * * 1879 * * 2119 * 1910 2109 * * * * * 142 0 * * * * * * 1724 0 0 P 143 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1724 0 0 A 144 894 2119 * * * 2109 * * * * * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1724 0 0 A 145 1910 * * * * * * * * * * * * * * * 1879 1114 * * 145 0 * * * * * * 1724 0 0 M 146 * * * * * * * 2109 * 994 1910 * * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1724 0 0 L 147 * * * * * * * * * 458 1879 * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1724 0 0 F 148 * * * * 1910 * * 1879 * * * * * 1114 * * * * * * 148 0 * * * * * * 1724 0 0 Q 149 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 149 0 * * * * * * 1724 0 0 S 150 * * * * * * * * * * * * * * * 894 1114 * * * 150 0 * * * * * * 1724 0 0 I 151 * * * * * * * 377 * * * * * * * * * 2119 * * 151 0 * * * * * * 1724 0 0 E 152 * * * 1910 * * * * 2109 994 * * * * * * * * * * 152 0 * * * * * * 1724 0 0 G 153 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 153 0 * * * * * * 1724 0 0 A 154 1910 * 1879 * * * * * * * * * 1114 * * * * * * * 154 0 * * * * * * 1724 0 0 V 155 * * * * * * * * * 1114 * * * * * * * 894 * * 155 0 * * * * * * 1724 0 0 T 156 * * * * * * * * * * * * * * * 446 1910 * * * 156 0 * * * * * * 1724 0 0 V 157 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 157 0 * * * * * * 1724 0 0 Q 158 * * * 1114 * * * * * * * * * 894 * * * * * * 158 0 * * * * * * 1724 0 0 K 159 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 159 0 * * * * * * 1724 0 0 W 160 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 160 0 * * * * * * 1724 0 0 G 161 446 * * * * 1910 * * * * * * * * * * * * * * 161 0 * * * * * * 1724 0 0 E 162 * * 994 1006 * * * * * * * * * * * * * * * * 162 0 * * * * * * 1724 0 0 I 163 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 163 0 * * * * * * 1724 0 0 C 164 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 164 0 * * * * * * 1724 0 0 Q 165 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 165 0 * * * * * * 1000 0 0 T 166 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 166 0 * * * * * * 1000 0 0 E 167 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 167 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //