HHsearch 1.5 NAME c5ldxi_ FAM FILE c5ldxi_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5ldxi_.a3m DATE Fri Feb 10 12:22:49 2017 LENG 106 match states, 106 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.1 EVD 0.5133 1.4573 SEQ >ss_dssp CGGGHHHHHHHHHHHHHTCCCCSCCCCCCSHHHHHHTTTSSSSSSSSHHHHHHHHHHHHHHTSHHHHHHHHHHHTSSCCSSSCSCCCCCCCCSSCCCTTC CCCCCC >sa_dssp EEEEEEEEDEEEEDEEEEDDDEEEDDEEDDDDDDCDCCDDDDDECDDCCCDDDDDDDCCDDDCCCCDDDDCCCDDDCCDEDECDDDEDEDDDDDCEDEED DCDDDE >ss_pred CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC CCCCCC >ss_conf 9103599999999998443137788886322111000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000002 111479 >Consensus dxKLRxxQLxeLRRrWLKDQELSPRepxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx xxxxxx >c5ldxi_ EEKLRLQQLRELRRRWLKDQELSPREPXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXX >UniRef50_UPI00017EFCAB(17-41:71) PREDICTED: hypothetical protein n=1 Tax=Sus scrofa RepID=UPI00017EFCAB E=2e-06 s/c=2.14 id=85% cov=25% DKKLRLHQLRELRRRWLKDQELSPR--------------------------------------------------------------------------- ------ >UniRef50_Q6PBJ6(7-33:128) Zgc:73375 n=14 Tax=Euteleostomi RepID=Q6PBJ6_DANRE E=1e-05 s/c=1.90 id=71% cov=26% DQKLRFEQLVKLRRQWLKDQELSPREP------------------------------------------------------------------------- ------ # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * E 1 * * 571 1614 * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1243 0 0 E 2 * * * 1614 * * * * 1659 * * * * 1487 * * * * * * 2 0 * * * * * * 1243 0 0 K 3 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1243 0 0 L 4 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1243 0 0 R 5 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 5 0 * * * * * * 1243 0 0 L 6 * * * * 1487 * * * * 636 * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1243 0 0 Q 7 * * * 1487 * * 1659 * * * * * * 1614 * * * * * * 7 0 * * * * * * 1243 0 0 Q 8 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 8 0 * * * * * * 1243 0 0 L 9 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1243 0 0 R 10 * * * * * * * * * * * * * * 636 * * 1487 * * 10 0 * * * * * * 1243 0 0 E 11 * * * 636 * * * * 1487 * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1243 0 0 L 12 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1243 0 0 R 13 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 13 0 * * * * * * 1243 0 0 R 14 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 14 0 * * * * * * 1243 0 0 R 15 * * * * * * * * * * * * * 1487 636 * * * * * 15 0 * * * * * * 1243 0 0 W 16 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 16 0 * * * * * * 1243 0 0 L 17 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1243 0 0 K 18 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1243 0 0 D 19 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1243 0 0 Q 20 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 20 0 * * * * * * 1243 0 0 E 21 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1243 0 0 L 22 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1243 0 0 S 23 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 23 0 * * * * * * 1243 0 0 P 24 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1243 0 0 R 25 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 25 0 * * * * * * 1243 0 0 E 26 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1197 0 0 P 27 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1197 0 0 X 28 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 28 * * * * * * * 1000 0 0 X 29 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 29 * * * * * * * 1000 0 0 X 30 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 30 * * * * * * * 1000 0 0 X 31 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 31 * * * * * * * 1000 0 0 X 32 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 32 * * * * * * * 1000 0 0 X 33 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 33 * * * * * * * 1000 0 0 X 34 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 34 * * * * * * * 1000 0 0 X 35 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 35 * * * * * * * 1000 0 0 X 36 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 36 * * * * * * * 1000 0 0 X 37 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 37 * * * * * * * 1000 0 0 X 38 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 38 * * * * * * * 1000 0 0 X 39 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 39 * * * * * * * 1000 0 0 X 40 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 40 * * * * * * * 1000 0 0 X 41 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 41 * * * * * * * 1000 0 0 X 42 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 42 * * * * * * * 1000 0 0 X 43 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 43 * * * * * * * 1000 0 0 X 44 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 44 * * * * * * * 1000 0 0 X 45 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 45 * * * * * * * 1000 0 0 X 46 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 46 * * * * * * * 1000 0 0 X 47 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 47 * * * * * * * 1000 0 0 X 48 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 48 * * * * * * * 1000 0 0 X 49 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 49 * * * * * * * 1000 0 0 X 50 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 50 * * * * * * * 1000 0 0 X 51 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 51 * * * * * * * 1000 0 0 X 52 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 52 * * * * * * * 1000 0 0 X 53 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 53 * * * * * * * 1000 0 0 X 54 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 54 * * * * * * * 1000 0 0 X 55 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 55 * * * * * * * 1000 0 0 X 56 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 56 * * * * * * * 1000 0 0 X 57 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 57 * * * * * * * 1000 0 0 X 58 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 58 * * * * * * * 1000 0 0 X 59 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 59 * * * * * * * 1000 0 0 X 60 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 60 * * * * * * * 1000 0 0 X 61 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 61 * * * * * * * 1000 0 0 X 62 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 62 * * * * * * * 1000 0 0 X 63 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 63 * * * * * * * 1000 0 0 X 64 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 64 * * * * * * * 1000 0 0 X 65 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 65 * * * * * * * 1000 0 0 X 66 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 66 * * * * * * * 1000 0 0 X 67 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 67 * * * * * * * 1000 0 0 X 68 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 68 * * * * * * * 1000 0 0 X 69 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 69 * * * * * * * 1000 0 0 X 70 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 70 * * * * * * * 1000 0 0 X 71 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 71 * * * * * * * 1000 0 0 X 72 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 72 * * * * * * * 1000 0 0 X 73 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 73 * * * * * * * 1000 0 0 X 74 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 74 * * * * * * * 1000 0 0 X 75 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 75 * * * * * * * 1000 0 0 X 76 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 76 * * * * * * * 1000 0 0 X 77 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 77 * * * * * * * 1000 0 0 X 78 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 78 * * * * * * * 1000 0 0 X 79 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 79 * * * * * * * 1000 0 0 X 80 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 80 * * * * * * * 1000 0 0 X 81 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 81 * * * * * * * 1000 0 0 X 82 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 82 * * * * * * * 1000 0 0 X 83 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 83 * * * * * * * 1000 0 0 X 84 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 84 * * * * * * * 1000 0 0 X 85 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 85 * * * * * * * 1000 0 0 X 86 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 86 * * * * * * * 1000 0 0 X 87 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 87 * * * * * * * 1000 0 0 X 88 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 88 * * * * * * * 1000 0 0 X 89 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 89 * * * * * * * 1000 0 0 X 90 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 90 * * * * * * * 1000 0 0 X 91 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 91 * * * * * * * 1000 0 0 X 92 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 92 * * * * * * * 1000 0 0 X 93 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 93 * * * * * * * 1000 0 0 X 94 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 94 * * * * * * * 1000 0 0 X 95 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 95 * * * * * * * 1000 0 0 X 96 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 96 * * * * * * * 1000 0 0 X 97 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 97 * * * * * * * 1000 0 0 X 98 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 98 * * * * * * * 1000 0 0 X 99 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 99 * * * * * * * 1000 0 0 X 100 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 100 * * * * * * * 1000 0 0 X 101 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 101 * * * * * * * 1000 0 0 X 102 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 102 * * * * * * * 1000 0 0 X 103 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 103 * * * * * * * 1000 0 0 X 104 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 104 * * * * * * * 1000 0 0 X 105 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 105 * * * * * * * 1000 0 0 X 106 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 106 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //