HHsearch 1.5 NAME c5kevB_ FAM FILE c5kevB_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5kevB_.a3m DATE Sat Jul 23 08:26:58 2016 LENG 126 match states, 126 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.6 EVD 0.4254 -0.2715 SEQ >ss_dssp CCEEEEEEEEEECTTSSCEEEEEEEEEECSSEEEEEEEEEEESSSSEEEEEEEEEEEEEEEEETTEEEEEEEEEEEEECSCCCCCSSCHHHHTTSCEEEE EEEECSSEEEEEESGGGSEEEEEEEC >sa_dssp EEDCBDCEBECECEEDDBCACADBDBCCEDEDADBCBEBDABDEEEEDCDCCBCADACBDDEEECDCCBDBEEBDDECBEEEEDDBBCCDDAEEEDBEBE BDDECEEDBCBDBCACEECEBDBDDD >ss_pred CCEEEEECCCEECCCCCEEEEEEEEEEEECCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCEEEEECEEEEEEECCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHCCCCCEE EEEECCCEEEEEEEEECCEEEEEEEC >ss_conf 9137740111111356423689998786057630101223203445663689984474366522068886313366635676213310667623888369 99951868999999728879999729 >Consensus PxxxxxxSYxxxxxDxxxxxxxxINxxIxxNxFxxDxxixExxxxxxxNYYxvvGxGxxIxkxTHQxYLxFDNxDVxxGxxxxkxpxxIxxilNxsNxvx VVxxtxeyiVxxFFFxxGQIlaxxkx >c5kevB_ PVHFYETSYKYQAADSTYMHDVAINVSIKGNHFTSDIIIRELVKSENKNYYNVIGHGDIIQKNTHQYYLNFDNIDVYTGTNKYKEPTSISSLINKSNNIR VVYLSEEYVVVEFFFYDGQIITLHRY >UniRef50_B9A7X4(28-156:157) Putative uncharacterized protein n=2 Tax=Vibrio parahaemolyticus RepID=B9A7X4_VIBPA E=1e-38 s/c=1.24 id=35% cov=100% PTLYFKASYNSLDIDNNFSYYTLINMDILHNNFDIDMAVMEYPTEKETNYYKVVGDGSTITKKTHQHYLLFDNFDVFKGKRPVFRlgeyRNEINNILNSA NPVQVVSETNEYIVMKFFFHGGQILAFKK- >UniRef50_A2P3F9(1-90:91) Putative uncharacterized protein n=2 Tax=Vibrio cholerae RepID=A2P3F9_VIBCH E=5e-22 s/c=1.17 id=40% cov=66% ---------------------------------------MEYPTEKETNYYKIVGDGSSIITKTHQHYLLFDNFDVFKG----KRPVfrlgedrnEINNI LNSSNPVQVVSETDHFIVMKFFFHGGQILAFKK- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * P 1 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1567 0 0 V 2 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * 2 0 * * * * * * 1567 0 0 H 3 * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1567 0 0 F 4 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 4 0 * * * * * * 1567 0 0 Y 5 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 5 0 * * * * * * 1567 0 0 E 6 * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1567 0 0 T 7 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 7 0 * * * * * * 1567 0 0 S 8 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 8 0 * * * * * * 1567 0 0 Y 9 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 9 0 * * * * * * 1567 0 0 K 10 * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1567 0 0 Y 11 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 11 0 * * * * * * 1567 0 0 Q 12 * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * * * 12 0 * * * * * * 1567 0 0 A 13 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1567 0 0 A 14 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1567 0 0 D 15 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1567 0 0 S 16 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 16 0 * * * * * * 1567 0 0 T 17 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * 17 0 * * * * * * 1567 0 0 Y 18 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 18 0 * * * * * * 1567 0 0 M 19 * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * 19 0 * * * * * * 1567 0 0 H 20 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 20 0 * * * * * * 1567 0 0 D 21 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 21 0 * * * * * * 1567 0 0 V 22 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * 22 0 * * * * * * 1567 0 0 A 23 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1567 0 0 I 24 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1567 0 0 N 25 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1567 0 0 V 26 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * 26 0 * * * * * * 1567 0 0 S 27 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 27 0 * * * * * * 1567 0 0 I 28 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1567 0 0 K 29 * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1567 0 0 G 30 * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1567 0 0 N 31 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1567 0 0 H 32 * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1567 0 0 F 33 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1567 0 0 T 34 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 34 0 * * * * * * 1567 0 0 S 35 * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * 35 0 * * * * * * 1567 0 0 D 36 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1567 0 0 I 37 * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1567 0 0 I 38 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1567 0 0 I 39 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 39 0 * * * * * * 1567 0 0 R 40 * * * * * * * * * * 770 * * * 1273 * * * * * 40 0 * * * * * * 1575 0 0 E 41 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1575 0 0 L 42 * * * * * * * * * 1273 * * * * * * * * * 770 42 0 * * * * * * 1575 0 0 V 43 * * * * * * * * * * * * 770 * * * * 1273 * * 43 0 * * * * * * 1575 0 0 K 44 * * * * * * * * 1273 * * * * * * * 770 * * * 44 0 * * * * * * 1575 0 0 S 45 * * * 770 * * * * * * * * * * * 1273 * * * * 45 0 * * * * * * 1575 0 0 E 46 * * * 1273 * * * * 770 * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1575 0 0 N 47 * * * 770 * * * * * * * 1273 * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1575 0 0 K 48 * * * * * * * * 1273 * * * * * * * 770 * * * 48 0 * * * * * * 1575 0 0 N 49 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1575 0 0 Y 50 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 50 0 * * * * * * 1575 0 0 Y 51 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 51 0 * * * * * * 1575 0 0 N 52 * * * * * * * * 770 * * 1273 * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1575 0 0 V 53 * * * * * * * 1821 * * * * * * * * * 480 * * 53 0 * * * * * * 1575 0 0 I 54 * * * * * * * 1273 * * * * * * * * * 770 * * 54 0 * * * * * * 1575 0 0 G 55 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1575 0 0 H 56 * * 770 * * * 1273 * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1575 0 0 G 57 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1575 0 0 D 58 * * 1273 * * * * * * * * * * * * 770 * * * * 58 0 * * * * * * 1575 0 0 I 59 * * * * * * * 1273 * * * * * * * 1821 1721 * * * 59 0 * * * * * * 1575 0 0 I 60 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1575 0 0 Q 61 * * * * * * * 1821 * * * * * 1273 * * 1721 * * * 61 0 * * * * * * 1575 0 0 K 62 * * * * * * * * 480 * * * * * * * 1821 * * * 62 0 * * * * * * 1575 0 0 N 63 * * * * * * * * 770 * * 1273 * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1575 0 0 T 64 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 64 0 * * * * * * 1575 0 0 H 65 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1575 0 0 Q 66 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 66 0 * * * * * * 1575 0 0 Y 67 * * * * * * 770 * * * * * * * * * * * * 1273 67 0 * * * * * * 1575 0 0 Y 68 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 68 0 * * * * * * 1575 0 0 L 69 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1575 0 0 N 70 * * * * * * * * * 770 * 1273 * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1575 0 0 F 71 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1575 0 0 D 72 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1575 0 0 N 73 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1575 0 0 I 74 * * * * 770 * * 1273 * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1575 0 0 D 75 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1575 0 0 V 76 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 76 0 * * * * * * 1575 0 0 Y 77 * * * * 770 * * * * * * * * * * * * * * 1273 77 0 * * * * * * 1575 0 0 T 78 * * * * * * * * 770 * * * * * * * 1273 * * * 78 0 * * * * * * 1575 0 0 G 79 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 79 480 * 1821 * * * * 1575 0 0 T 80 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * 80 0 * * * * * 0 1567 0 1000 N 81 * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * 81 0 * * * * * 0 1567 0 1000 K 82 * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * * * * 82 0 * * * * * 0 1567 0 1000 Y 83 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 83 0 * * * * 0 * 1567 0 1000 K 84 * * * * 1721 * * * 521 * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1575 0 0 E 85 * * * 1273 * * * * * * * * * * 770 * * * * * 85 521 1721 * 2000 415 * * 1575 1000 0 P 86 * * * * * * * * * * * * 521 * 1721 * * * * * 86 0 * * * * * * 1575 0 0 T 87 * * * * * * * * * * * 1721 * * * * 1273 1821 * * 87 480 1821 * 3000 193 * * 1575 1000 0 S 88 * * * 770 * * * * * * * * * * * 1273 * * * * 88 0 * * * * * * 1575 0 0 I 89 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1575 0 0 S 90 * * * * * * * * * * * 770 * * * 1273 * * * * 90 0 * * * * * * 1575 0 0 S 91 * * * * * * * * * * * 770 * * * 1273 * * * * 91 0 * * * * * * 1575 0 0 L 92 * * * * * * * 770 * 1273 * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1575 0 0 I 93 * * * * * * * 1273 * 770 * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1575 0 0 N 94 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1575 0 0 K 95 * * * * * * * * 1273 * * * * * * 770 * * * * 95 0 * * * * * * 1575 0 0 S 96 1721 * * * * * * * * * * * * * * 521 * * * * 96 0 * * * * * * 1575 0 0 N 97 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1575 0 0 N 98 * * * * * * * * * * * 1273 770 * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1575 0 0 I 99 * * * * * * * 1273 * * * * * * * * * 770 * * 99 0 * * * * * * 1575 0 0 R 100 * * * * * * * * * * * * * 770 1273 * * * * * 100 0 * * * * * * 1575 0 0 V 101 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 101 0 * * * * * * 1575 0 0 V 102 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 102 0 * * * * * * 1575 0 0 Y 103 * * * * * * * * * * * * * * * 770 * * * 1273 103 0 * * * * * * 1575 0 0 L 104 * * * 770 * * * * * 1273 * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1575 0 0 S 105 * * * * * * * * * * * * * * * 1273 770 * * * 105 0 * * * * * * 1575 0 0 E 106 * * 1821 1273 * * * * * * * 1721 * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1575 0 0 E 107 * * * 480 * * 1821 * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1575 0 0 Y 108 * * * * 1821 * * * * * * * * * * * * * * 480 108 0 * * * * * * 1575 0 0 V 109 * * * * * * * 770 * * * * * * * * * 1273 * * 109 0 * * * * * * 1575 0 0 V 110 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 110 0 * * * * * * 1575 0 0 V 111 * * * * * * * * * * 770 * * * * * * 1273 * * 111 0 * * * * * * 1575 0 0 E 112 * * * 1273 * * * * 770 * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1575 0 0 F 113 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1575 0 0 F 114 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1575 0 0 F 115 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1575 0 0 Y 116 * * * * * * 770 * * * * * * * * * * * * 1273 116 0 * * * * * * 1575 0 0 D 117 * * 1273 * * 770 * * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1575 0 0 G 118 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1575 0 0 Q 119 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 119 0 * * * * * * 1575 0 0 I 120 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1575 0 0 I 121 * * * * * * * 1273 * 770 * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1575 0 0 T 122 770 * * * * * * * * * * * * * * * 1273 * * * 122 0 * * * * * * 1575 0 0 L 123 * * * * 770 * * * * 1273 * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1575 0 0 H 124 * * * * * * 1273 * 770 * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1575 0 0 R 125 * * * * * * * * 770 * * * * * 1273 * * * * * 125 0 * * * * * * 1575 0 0 Y 126 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 126 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //