HHsearch 1.5 NAME c5j0lC_ FAM FILE c5j0lC_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5j0lC_.a3m DATE Sat Jul 9 08:35:38 2016 LENG 118 match states, 118 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.3990 -2.3039 SEQ >ss_dssp CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHC >sa_dssp ECBEEBCEDADECBDDCCEDBDDDCEEACDCAEECDEEDCDDBCCDBDEDBEDBCDDBDDDBEECBDDADDDBEEDEEEEBDDBBDDBDDCBEEBCDEBD ECBEEABDDBCEDAEEDE >ss_pred CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHCCC >ss_conf 9256689996588878899852011346999999999999999999999999999887655789999999999999999999999999999999999988 776999999875310049 >Consensus ekaaraakelsresaraakeladsnakaaedlmreiaerllelmaeairelqkqaaesiadsqrlvveaiirlaeavekeideiveeakkrleelaersr qenkkiidrakyemdees >c5j0lC_ EKAARAAKELSRESARAAKELADSNAKAAEDLMREIAERLLELMAEAIRELQKQAAESIADSQRLVVEAIIRLAEAVEKEIDEIVEEAKKRLEELAERSR QENKKIIDRAKYEMDEES # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * E 1 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 K 2 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 A 3 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 A 4 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 R 5 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 A 6 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 A 7 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 K 8 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 E 9 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 L 10 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 S 11 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 R 12 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 E 13 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 S 14 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 A 15 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 R 16 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 A 17 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 A 18 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 K 19 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 E 20 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 L 21 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 A 22 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 D 23 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 S 24 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 N 25 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 A 26 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 K 27 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 A 28 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 A 29 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 E 30 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 D 31 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 L 32 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 M 33 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 R 34 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 E 35 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 I 36 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 A 37 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 E 38 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 R 39 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 L 40 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 L 41 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 E 42 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 L 43 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 M 44 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 A 45 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 E 46 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 A 47 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 I 48 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 R 49 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 E 50 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 L 51 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 52 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 K 53 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 54 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 A 55 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 A 56 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 E 57 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 S 58 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 I 59 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 A 60 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 D 61 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 S 62 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 63 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 R 64 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 L 65 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 V 66 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 V 67 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 E 68 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 A 69 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 I 70 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 I 71 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 R 72 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 L 73 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 A 74 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 E 75 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 A 76 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 V 77 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 E 78 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 K 79 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 E 80 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 I 81 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 D 82 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 E 83 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 I 84 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 V 85 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 E 86 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 E 87 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 A 88 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 K 89 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 K 90 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 R 91 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 L 92 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 E 93 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 E 94 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 L 95 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 A 96 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 E 97 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 R 98 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 S 99 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 R 100 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 101 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 E 102 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 N 103 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 K 104 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 K 105 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 I 106 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 I 107 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 D 108 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 R 109 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 A 110 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 K 111 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 112 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 112 0 * * * * * * 1000 0 0 E 113 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 M 114 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 D 115 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 E 116 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 E 117 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 S 118 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 118 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //