HHsearch 1.5 NAME c5irxE_ FAM FILE c5irxE_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5irxE_.a3m DATE Sat May 28 08:27:54 2016 LENG 75 match states, 75 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4897 2.6086 SEQ >ss_dssp CCBCTTSBTTTTCCBSCTTTCBCCSSSSCBCBCCCCCCCCCSSCBCTTSBBTTTBCBCTTCBCCSSSSCBCBCCC >sa_dssp EDBEDDDDADEECEBDDDECBDCDEDEDBDBCCDDEDEEDDEECBEDEDDAEEECECCDEBDCDEEEDBEBCDEE >ss_pred CCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCEEHHHHHHCCC >ss_conf 931217620133310260012151554201010467322103411227502331221033368520100022039 >Consensus dcakegevcswgkkccdldnfycpmefiphckkykpyvpvttncakegevcgwgskcchgldcplafipycekyr >c5irxE_ DCAKEGEVCSWGKKCCDLDNFYCPMEFIPHCKKYKPYVPVTTNCAKEGEVCGWGSKCCHGLDCPLAFIPYCEKYR # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * D 1 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 C 2 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 A 3 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 K 4 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 E 5 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 G 6 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 E 7 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 V 8 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 C 9 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 S 10 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 W 11 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 G 12 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 K 13 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 K 14 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 C 15 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 C 16 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 D 17 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 L 18 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 D 19 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 N 20 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 F 21 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 22 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 22 0 * * * * * * 1000 0 0 C 23 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 P 24 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 M 25 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 E 26 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 F 27 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 I 28 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 P 29 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 H 30 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 C 31 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 K 32 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 K 33 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 34 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 34 0 * * * * * * 1000 0 0 K 35 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 P 36 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 37 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 37 0 * * * * * * 1000 0 0 V 38 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 P 39 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 V 40 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 T 41 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 T 42 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 N 43 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 C 44 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 A 45 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 K 46 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 E 47 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 G 48 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 E 49 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 V 50 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 C 51 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 G 52 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 W 53 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 G 54 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 S 55 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 K 56 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 C 57 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 C 58 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 H 59 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 G 60 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 L 61 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 D 62 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 C 63 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 P 64 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 L 65 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 A 66 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 F 67 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 I 68 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 P 69 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 70 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 70 0 * * * * * * 1000 0 0 C 71 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 E 72 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 K 73 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 74 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 74 0 * * * * * * 1000 0 0 R 75 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 75 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //