HHsearch 1.5 NAME c5ikfB_ FAM FILE c5ikfB_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5ikfB_.a3m DATE Sat Apr 23 08:18:41 2016 LENG 135 match states, 135 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.4 EVD 0.4001 -0.7671 SEQ >ss_dssp CCCCTTTHHHHHHHHHCCCCSSSTTSCCTTHHHHHHHHHTTTTSSTTGGGGGSCGGGSCCHHHHHHHHHHCTTSCGGGCCTTSCEECCTTHHHHHHHHHH HHHHHHHHSCCCHHHHHHHHHHTCEECCSSEEEEC >sa_dssp EEEDEEDEDECEEDDEBEDCEEECEDECEDCEDCDEBCEDEBCECDAEECCEDDDEEACDDECAEEACECAECBDDCBACCDAAABCBEEAEEBCDECEE DCEDCBEEEEDDEEECEECEEDCDCEDEDEBACBE >ss_pred CCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCCCCEEEEEEEEEEHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHCCCCHHEEEEEHHCCCEEECEEECCC >ss_conf 9767677456666530341001788972135555464210049888889878766534302235677642577762122756268887633478898899 99998755227801324322007813402252159 >Consensus PxLTPxNIASsILYsTxxxxRxxxxxPRLNLSLELxLxxxxLNxgxxxxxFxxDLRNxxDWNxLSxVxxxxPsLPxtxlxxDGSFxKHxxFxxExAxxxQ xlEKaixxLDLxxDkviqlreqngvavngrvcypt >c5ikfB_ PFLTPDNIASSILYSTASFSRSKPDRPRLNLSLELKLMQNELNKGQLKKQFKGDLRNLADWNNLSLVSSKFPSLPITNLRPDGSFLKHRRFNEEIAYNRQ TLEKAIKQLDLSPDKVIQLREQNGVAVNGRVCYPT >UniRef50_B6JX08(302-414:1317) Predicted protein n=1 Tax=Schizosaccharomyces japonicus yFS275 RepID=B6JX08_SCHJY E=1e-41 s/c=1.50 id=48% cov=84% PYLTPENIASAILYATNNRQRYRGKNPRLNLSLELLLNRKSLNI-DFNDAFDEDLRNMTDWNRLSEVCVRYPTLPTSSIKRDGSFYKHLLFEQEEAQYQQ AIEKSLNILDLKSD--------------------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * P 1 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1423 0 0 F 2 * * * * 987 * * * * * * * * * * * * * * 1013 2 0 * * * * * * 1423 0 0 L 3 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1423 0 0 T 4 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 4 0 * * * * * * 1423 0 0 P 5 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1423 0 0 D 6 * * 987 1013 * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1423 0 0 N 7 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1423 0 0 I 8 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1423 0 0 A 9 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1423 0 0 S 10 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 10 0 * * * * * * 1423 0 0 S 11 1013 * * * * * * * * * * * * * * 987 * * * * 11 0 * * * * * * 1423 0 0 I 12 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1423 0 0 L 13 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1423 0 0 Y 14 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 14 0 * * * * * * 1423 0 0 S 15 1013 * * * * * * * * * * * * * * 987 * * * * 15 0 * * * * * * 1423 0 0 T 16 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 16 0 * * * * * * 1423 0 0 A 17 987 * * * * * * * * * * 1013 * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1423 0 0 S 18 * * * * * * * * * * * 1013 * * * 987 * * * * 18 0 * * * * * * 1423 0 0 F 19 * * * * 987 * * * * * * * * * 1013 * * * * * 19 0 * * * * * * 1423 0 0 S 20 * * * * * * * * * * * * * 1013 * 987 * * * * 20 0 * * * * * * 1423 0 0 R 21 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 21 0 * * * * * * 1423 0 0 S 22 * * * * * * * * * * * * * * * 987 * * * 1013 22 0 * * * * * * 1423 0 0 K 23 * * * * * * * * 987 * * * * * 1013 * * * * * 23 0 * * * * * * 1423 0 0 P 24 * * * * * 1013 * * * * * * 987 * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1423 0 0 D 25 * * 987 * * * * * 1013 * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1423 0 0 R 26 * * * * * * * * * * * 1013 * * 987 * * * * * 26 0 * * * * * * 1423 0 0 P 27 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1423 0 0 R 28 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 28 0 * * * * * * 1423 0 0 L 29 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1423 0 0 N 30 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1423 0 0 L 31 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1423 0 0 S 32 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 32 0 * * * * * * 1423 0 0 L 33 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1423 0 0 E 34 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1423 0 0 L 35 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1423 0 0 K 36 * * * * * * * * 987 1013 * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1423 0 0 L 37 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1423 0 0 M 38 * * * * * * * * * * 987 1013 * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1423 0 0 Q 39 * * * * * * * * * * * * * 987 1013 * * * * * 39 0 * * * * * * 1423 0 0 N 40 * * * * * * * * 1013 * * 987 * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1423 0 0 E 41 * * * 987 * * * * * * * * * * * 1013 * * * * 41 0 * * * * * * 1423 0 0 L 42 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1423 0 0 N 43 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1423 0 0 K 44 * * * * * * * 1013 987 * * * * * * * * * * * 44 987 * 1013 * * * * 1423 0 0 G 45 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 Q 46 * * 1013 * * * * * * * * * * 987 * * * * * * 46 0 * * * * * * 1423 0 0 L 47 * * * * 1013 * * * * 987 * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1423 0 0 K 48 * * * * * * * * 987 * * 1013 * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1423 0 0 K 49 * * 1013 * * * * * 987 * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1423 0 0 Q 50 1013 * * * * * * * * * * * * 987 * * * * * * 50 0 * * * * * * 1423 0 0 F 51 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1423 0 0 K 52 * * 1013 * * * * * 987 * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1423 0 0 G 53 * * * 1013 * 987 * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1423 0 0 D 54 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1423 0 0 L 55 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1423 0 0 R 56 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 56 0 * * * * * * 1423 0 0 N 57 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1423 0 0 L 58 * * * * * * * * * 987 1013 * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1423 0 0 A 59 987 * * * * * * * * * * * * * * * 1013 * * * 59 0 * * * * * * 1423 0 0 D 60 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1423 0 0 W 61 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 61 0 * * * * * * 1423 0 0 N 62 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1423 0 0 N 63 * * * * * * * * * * * 987 * * 1013 * * * * * 63 0 * * * * * * 1423 0 0 L 64 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1423 0 0 S 65 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 65 0 * * * * * * 1423 0 0 L 66 * * * 1013 * * * * * 987 * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1423 0 0 V 67 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 67 0 * * * * * * 1423 0 0 S 68 * 1013 * * * * * * * * * * * * * 987 * * * * 68 0 * * * * * * 1423 0 0 S 69 * * * * * * * * * * * * * * * 987 * 1013 * * 69 0 * * * * * * 1423 0 0 K 70 * * * * * * * * 987 * * * * * 1013 * * * * * 70 0 * * * * * * 1423 0 0 F 71 * * * * 987 * * * * * * * * * * * * * * 1013 71 0 * * * * * * 1423 0 0 P 72 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1423 0 0 S 73 * * * * * * * * * * * * * * * 987 1013 * * * 73 0 * * * * * * 1423 0 0 L 74 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1423 0 0 P 75 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1423 0 0 I 76 * * * * * * * 987 * * * * * * * * 1013 * * * 76 0 * * * * * * 1423 0 0 T 77 * * * * * * * * * * * * * * * 1013 987 * * * 77 0 * * * * * * 1423 0 0 N 78 * * * * * * * * * * * 987 * * * 1013 * * * * 78 0 * * * * * * 1423 0 0 L 79 * * * * * * * 1013 * 987 * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1423 0 0 R 80 * * * * * * * * 1013 * * * * * 987 * * * * * 80 0 * * * * * * 1423 0 0 P 81 * * * * * * * * * * * * 987 * 1013 * * * * * 81 0 * * * * * * 1423 0 0 D 82 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1423 0 0 G 83 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1423 0 0 S 84 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 84 0 * * * * * * 1423 0 0 F 85 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1423 0 0 L 86 * * * * * * * * * 987 * * * * * * * * * 1013 86 0 * * * * * * 1423 0 0 K 87 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1423 0 0 H 88 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1423 0 0 R 89 * * * * * * * * * 1013 * * * * 987 * * * * * 89 0 * * * * * * 1423 0 0 R 90 * * * * * * * * * 1013 * * * * 987 * * * * * 90 0 * * * * * * 1423 0 0 F 91 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1423 0 0 N 92 * * * 1013 * * * * * * * 987 * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1423 0 0 E 93 * * * 987 * * * * * * * * * 1013 * * * * * * 93 0 * * * * * * 1423 0 0 E 94 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1423 0 0 I 95 * * * 1013 * * * 987 * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1423 0 0 A 96 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1423 0 0 Y 97 * * * * * * * * * * * * * 1013 * * * * * 987 97 0 * * * * * * 1423 0 0 N 98 * * * * * * * * * * * 987 * * * * * * * 1013 98 0 * * * * * * 1423 0 0 R 99 * * * * * * * * * * * * * 1013 987 * * * * * 99 0 * * * * * * 1423 0 0 Q 100 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 100 0 * * * * * * 1423 0 0 T 101 1013 * * * * * * * * * * * * * * * 987 * * * 101 0 * * * * * * 1423 0 0 L 102 * * * * * * * 1013 * 987 * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1423 0 0 E 103 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1423 0 0 K 104 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1423 0 0 A 105 987 * * * * * * * * * * * * * * 1013 * * * * 105 0 * * * * * * 1423 0 0 I 106 * * * * * * * 987 * 1013 * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1423 0 0 K 107 * * * * * * * * 987 * * 1013 * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1423 0 0 Q 108 * * * * * * * 1013 * * * * * 987 * * * * * * 108 0 * * * * * * 1423 0 0 L 109 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1423 0 0 D 110 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1423 0 0 L 111 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1423 0 0 S 112 * * * * * * * * 1013 * * * * * * 987 * * * * 112 0 * * * * * * 1423 0 0 P 113 * * * * * * * * * * * * 987 * * 1013 * * * * 113 0 * * * * * * 1423 0 0 D 114 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1423 0 0 K 115 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 V 116 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 I 117 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 118 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 L 119 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 R 120 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 E 121 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 122 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 N 123 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 G 124 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 V 125 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 A 126 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 V 127 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 N 128 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 G 129 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 R 130 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 V 131 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 C 132 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 133 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 133 0 * * * * * * 1000 0 0 P 134 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 T 135 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 135 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //