HHsearch 1.5 NAME c5ihfA_ FAM FILE c5ihfA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5ihfA_.a3m DATE Tue Mar 14 09:58:23 2017 LENG 105 match states, 105 columns in multiple alignment FILT 4 out of 8 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.6 EVD 0.4331 0.9182 SEQ >ss_dssp CCCCCCCGGGCGGGTTSCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCHHHHHHHHHH HHHHC >sa_dssp ECCEBDEADEAEBAEEAECEEEBCEEADCCBEEBDEDCDEBEEECDEDBEDDECEDDECBECCEEDEDDCCECADECCEDBAEBABECBEEEBDECAEEC CEDDE >ss_pred CCCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH HHHHC >ss_conf 9988886530616777420547889999999997652874463147888740666758999999977622655453124444327774297889999999 87509 >Consensus xvxxxpxpxqdpivqxlklxndqixkikxlhxqlexxvxkixxGalixVixSgkWDexaVkxqlAafsxieqQarYyRxkYyFdvxqvLTPEQrtqvqkx xaxal >c5ihfA_ AVPNPPLPAQDPIVQHLKLTNDQITRIKKLHQQLETDVSQISMGALIEVIKSGKWDDAAVKQQLAAFSNIEQQARYYRVKYYFDLSKVLTPEQRQQVQQD LAQAL >UniRef50_A4WET8(26-134:136) VirG-like protein n=35 Tax=Enterobacteriaceae RepID=A4WET8_ENT38 E=7e-33 s/c=1.29 id=65% cov=100% -VETAPEPTQDPIVQQLKLNNDQIAKIKALHKQLEADVFKIPTdsvknGSLINVIQSGKWDEKAVREQLAAFSHIEEQARYYRMKYYFDVSQILTPEQRA EVRSQFAQAM >UniRef50_A6TEE5(26-134:136) Periplasmic protein n=7 Tax=Klebsiella RepID=A6TEE5_KLEP7 E=8e-37 s/c=1.41 id=72% cov=100% -VKAAPAPAQDPIVQHLKLTNDQVAKIKSLHQQLESNVQQISQqeikdGALINVIDSGKWDEKAVNDQLAAFSKIDQQVRYYRVKYYFEVNKVLTPEQRT QVKKDLADAL >UniRef50_A8GI53(47-123:126) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Serratia proteamaculans 568 RepID=A8GI53_SERP5 E=5e-07 s/c=0.72 id=38% cov=58% ---------------------------------------KVDNGAILKVLGSSQWDEPTVKKRIAEMGIYQQQAEYIRYRYLFDVMQTLTPEQKTKLQK- ----- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * A 1 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 V 2 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 2 0 * * * * * * 1385 0 0 P 3 * * * 1531 * * * * 1613 * * * 1613 * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1385 0 0 N 4 1613 * * * * * * * * * * 1613 * * * * 1531 * * * 4 0 * * * * * * 1385 0 0 P 5 571 * * * * * * * * * * * 1613 * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1385 0 0 P 6 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1385 0 0 L 7 1613 * * 1531 * * * * * 1613 * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1385 0 0 P 8 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1385 0 0 A 9 613 * * * * * * * * * * * * * * * 1531 * * * 9 0 * * * * * * 1385 0 0 Q 10 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 10 0 * * * * * * 1385 0 0 D 11 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1385 0 0 P 12 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1385 0 0 I 13 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1385 0 0 V 14 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 14 0 * * * * * * 1385 0 0 Q 15 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 15 0 * * * * * * 1385 0 0 H 16 * * * * * * 613 * * * * * * 1531 * * * * * * 16 0 * * * * * * 1385 0 0 L 17 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1385 0 0 K 18 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1385 0 0 L 19 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1385 0 0 T 20 * * * * * * * * * * * 1531 * * * * 613 * * * 20 0 * * * * * * 1385 0 0 N 21 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1385 0 0 D 22 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1385 0 0 Q 23 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 23 0 * * * * * * 1385 0 0 I 24 * * * * * * * 571 * * * * * * * * * 1613 * * 24 0 * * * * * * 1385 0 0 T 25 571 * * * * * * * * * * * * * * * 1613 * * * 25 0 * * * * * * 1385 0 0 R 26 * * * * * * * * 571 * * * * * 1613 * * * * * 26 0 * * * * * * 1385 0 0 I 27 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1385 0 0 K 28 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1385 0 0 K 29 1531 * * * * * * * 1613 * * * * * * 1613 * * * * 29 0 * * * * * * 1385 0 0 L 30 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1385 0 0 H 31 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1385 0 0 Q 32 * * * * * * * * 1531 * * * * 613 * * * * * * 32 0 * * * * * * 1385 0 0 Q 33 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 33 0 * * * * * * 1385 0 0 L 34 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1385 0 0 E 35 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1385 0 0 T 36 1531 * * * * * * * * * * * * * * 1613 1613 * * * 36 0 * * * * * * 1385 0 0 D 37 * * 571 * * * * * * * * 1613 * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1385 0 0 V 38 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 38 0 * * * * * * 1385 0 0 S 39 * * * * 1531 * * * * * * * * 1613 * 1613 * * * * 39 0 * * * * * * 1385 0 0 Q 40 * * * * * * * * 841 * * * * 1179 * * * * * * 40 0 * * * * * * 1779 0 0 I 41 * * * * * * * 570 * * * * * * * * * 1615 * * 41 0 * * * * * * 1779 0 0 S 42 * * 1615 * * * * * * * * * 2108 * * 1179 * * * * 42 0 * * * * * * 1779 0 0 M 43 * * * * * * * * * * 2179 1615 * 2179 * * 2108 * * * 43 870 1143 * 2322 322 * * 1779 1271 0 G 44 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1779 0 0 A 45 381 * * * * * * * * * * * * * * 2108 * * * * 45 0 * * * * * * 1779 0 0 L 46 * * * * * * * 1615 * 570 * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1779 0 0 I 47 * * * * * * * 570 * 1615 * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1779 0 0 E 48 * * * 2179 * * * * 1615 * * 1143 * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1779 0 0 V 49 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 49 0 * * * * * * 1779 0 0 I 50 * * * * * * * 570 * 1615 * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1779 0 0 K 51 * * 2179 * * 1615 * * 2179 * * * * 2108 * * * * * * 51 0 * * * * * * 1779 0 0 S 52 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 52 0 * * * * * * 1779 0 0 G 53 * * * * * 570 * * * * * * * * * 1615 * * * * 53 0 * * * * * * 1779 0 0 K 54 * * * * * * * * 570 * * * * 1615 * * * * * * 54 0 * * * * * * 1779 0 0 W 55 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 55 0 * * * * * * 1779 0 0 D 56 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1779 0 0 D 57 * * 2179 360 * * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1779 0 0 A 58 2179 * * * * * * * 1143 * * * 1615 * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1779 0 0 A 59 570 * * * * * * * * * * * * * * * 1615 * * * 59 0 * * * * * * 1779 0 0 V 60 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 60 0 * * * * * * 1779 0 0 K 61 * * * * * * * * 870 * * 2179 * * 2108 * * * * * 61 0 * * * * * * 1779 0 0 Q 62 * * 2179 2108 * * * * 1615 * * * * 2179 * * * * * * 62 0 * * * * * * 1779 0 0 Q 63 * * * * * * * * * * * * * 570 1615 * * * * * 63 0 * * * * * * 1779 0 0 L 64 * * * * * * * 1615 * 570 * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1779 0 0 A 65 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1779 0 0 A 66 570 * * 1615 * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1779 0 0 F 67 * * * * 570 * * * * * 1615 * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1779 0 0 S 68 * * * * * 1615 * * * * * * * * * 570 * * * * 68 0 * * * * * * 1779 0 0 N 69 * * * * * * 2108 1615 2179 * * 2179 * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1779 0 0 I 70 * * * * * * * 570 * * * * * * * * * * * 1615 70 0 * * * * * * 1779 0 0 E 71 * * 2179 1143 * * * * * * * * * 1615 * * * * * * 71 0 * * * * * * 1779 0 0 Q 72 * * * 2108 * * * * * * * * * 381 * * * * * * 72 0 * * * * * * 1779 0 0 Q 73 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 73 0 * * * * * * 1779 0 0 A 74 360 * * * * * * * * * * * * * * * * 2179 * * 74 0 * * * * * * 1779 0 0 R 75 * * * 1615 * * * * * * * * * * 570 * * * * * 75 0 * * * * * * 1779 0 0 Y 76 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 76 0 * * * * * * 1779 0 0 Y 77 * * * * * * * 1615 * * * * * * * * * * * 570 77 0 * * * * * * 1779 0 0 R 78 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 78 0 * * * * * * 1779 0 0 V 79 * * * * * * * * * * 2108 * * * * * * 1179 * 1615 79 0 * * * * * * 1779 0 0 K 80 * * * * * * * * 570 * * * * * 1615 * * * * * 80 0 * * * * * * 1779 0 0 Y 81 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 81 0 * * * * * * 1779 0 0 Y 82 * * * * * * * * * 1615 * * * * * * * * * 570 82 0 * * * * * * 1779 0 0 F 83 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1779 0 0 D 84 * * 360 2179 * * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1779 0 0 L 85 * * * * * * * * * 2179 * * * * * * * 360 * * 85 0 * * * * * * 1779 0 0 S 86 * * * * * * * * * * 1615 2179 * * * 1143 * * * * 86 0 * * * * * * 1779 0 0 K 87 * * * * * * * * 1179 * * * * 841 * * * * * * 87 0 * * * * * * 1779 0 0 V 88 * * * * * * * 2108 * * * * * * * * 1615 1179 * * 88 0 * * * * * * 1779 0 0 L 89 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1779 0 0 T 90 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 90 0 * * * * * * 1779 0 0 P 91 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1779 0 0 E 92 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1779 0 0 Q 93 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 93 0 * * * * * * 1779 0 0 R 94 * * * * * * * * 1615 * * * * * 570 * * * * * 94 0 * * * * * * 1779 0 0 Q 95 2108 * * * * * * * * * * * * 2179 * * 870 * * * 95 0 * * * * * * 1779 0 0 Q 96 * * * 2108 * * * * 1615 * * * * 1179 * * * * * * 96 0 * * * * * * 1779 0 0 V 97 * * * * * * * * * 1615 * * * * * * * 570 * * 97 0 * * * * * * 1779 0 0 Q 98 * * * * * * * * 2179 * * * * 870 2108 * * * * * 98 0 * * * * * * 1779 0 0 Q 99 * * * * * * * * 870 * * * * 2179 * 2108 * * * * 99 0 * * * * * * 1779 0 0 D 100 * * 613 * * * * * * * * * * 1531 * * * * * * 100 0 * * * * * * 1385 0 0 L 101 * * * * 1531 * * * * 613 * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1385 0 0 A 102 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1385 0 0 Q 103 * * 1613 * * * * * * * * * * 571 * * * * * * 103 0 * * * * * * 1385 0 0 A 104 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1385 0 0 L 105 * * * * * * * * * 613 1531 * * * * * * * * * 105 0 * * 0 * * * 1385 0 0 //