HHsearch 1.5 NAME c5i4qB_ FAM FILE c5i4qB_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5i4qB_.a3m DATE Sat Jul 1 09:02:51 2017 LENG 107 match states, 107 columns in multiple alignment FILT 4 out of 8 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.0 EVD 0.4214 -0.3236 SEQ >ss_dssp CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSCCCCCHHHHHHHHHTCCCSHHHHHHHHHHHHT TCCSCCC >sa_dssp EEEDDDDDEEDDEEEDDCDDCEEDBEEDCDDADDBAEDACEDEBEEACECADDAADBADDABDCCEEEECEBEEDACDAAECAEEDCDEBBDDBCECBDE ECEBAEE >ss_pred CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHC CCCCCCC >ss_conf 9643699999999999999999999999999999999985305021205799999766787655665304877899999998420068999999999740 1237469 >Consensus xxxwxefxxxlxxyrdxxxsixrxLxayexxixeLixqixxxnxdxsxxxFdeLfeIQxxLatakxKYefxxnxxLxdfiYxfDRdDxyxxxywxkkFqq xxxwPxx >c5i4qB_ XDIWPEFQRDLEXYRDVVLSIKRNLRLYEECIESLVHQIGSTNFDNAQPLFDDLFRXQSELATXLYKYEYKPGKRIQDLIYHLDRDDFYSRKYWHKKFSD GLAWPEA >UniRef50_C4SCF9(3-89:90) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Yersinia mollaretii ATCC 43969 RepID=C4SCF9_YERMO E=1e-26 s/c=1.38 id=47% cov=82% -------------------SIRQCLIKYENLCAELIVRIASKEFDSCQSDFDELFDIQGKLATAKYKYEFQLSTKLQDFVYYMDRDDLYSRRFWHKKFQE GQTWPK- >UniRef50_B2I074(5-109:114) Putative uncharacterized protein n=2 Tax=Acinetobacter baumannii RepID=B2I074_ACIBC E=1e-26 s/c=1.14 id=35% cov=96% ---WDEFEQRLITYRDAWIDLARILDAYEHQIKELLQQIQLLTYEDSLPVFNQLYEIQDHLATAKFRYDLDLNEALDIFVYHFDRDDkALISQYWYKKFK QNkdILWP-- >UniRef50_C0DSP1(21-107:108) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Eikenella corrodens ATCC 23834 RepID=C0DSP1_EIKCO E=3e-05 s/c=0.57 id=29% cov=77% ------------------------LRACQAKITELIHSLKQVNINESNHIFEELFEIQIILSEIKNKYlfEFNFNDFLNDFIYFFDRQDEYNVHYLYAHF QQSDEFP-- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * X 1 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 1 * * * * * * * 0 0 0 D 2 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 I 3 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 W 4 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 4 0 * * * * * * 1534 0 0 P 5 * * 958 * * * * * * * * * 1043 * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1534 0 0 E 6 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1534 0 0 F 7 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1534 0 0 Q 8 * * * 958 * * * * * * * * * 1043 * * * * * * 8 0 * * * * * * 1534 0 0 R 9 * * * * * * * * * * * * * 958 1043 * * * * * 9 0 * * * * * * 1534 0 0 D 10 * * 1043 * * * * * * * * * * * 958 * * * * * 10 0 * * * * * * 1534 0 0 L 11 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1534 0 0 E 12 * * * 1043 * * * 958 * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1534 0 0 X 13 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 14 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 14 0 * * * * * * 1534 0 0 R 15 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 15 0 * * * * * * 1534 0 0 D 16 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1534 0 0 V 17 958 * * * * * * * * * * * * * * * * 1043 * * 17 0 * * * * * * 1534 0 0 V 18 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1043 958 * 18 0 * * * * * * 1534 0 0 L 19 * * * * * * * 958 * 1043 * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1534 0 0 S 20 * * 1472 * * * * * * * * * * * * 645 * * * * 20 0 * * * * * * 1858 0 0 I 21 * * * * * * * 645 * 1472 * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1858 0 0 K 22 1472 * * * * * * * 1671 * * * * * 1619 * * * * * 22 0 * * * * * * 1858 0 0 R 23 * * * * * * * * * * * * * 1619 568 * * * * * 23 0 * * * * * * 1858 0 0 N 24 * 1619 * * * * * 1472 * * * 1671 * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1858 0 0 L 25 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 2211 0 0 R 26 * * 1959 * * * * 2092 * * * * * * 976 * * * * * 26 0 * * * * * * 2211 0 0 L 27 911 * * * * * * * 2092 2098 * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 2211 0 0 Y 28 * 1864 * * * * * * * * * * * * * * * * * 463 28 0 * * * * * * 2211 0 0 E 29 * * * 463 * * * * * * * * * 1864 * * * * * * 29 0 * * * * * * 2211 0 0 E 30 1864 * * 2098 * * 1959 * * * * 2092 * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 2211 0 0 C 31 * 2098 * * * * * * 1864 2092 * * * 1959 * * * * * * 31 0 * * * * * * 2211 0 0 I 32 * 2092 * * * * * 386 * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 2211 0 0 E 33 2092 * * 2098 * * * * 1959 * * * * * * * 1864 * * * 33 0 * * * * * * 2211 0 0 S 34 * * * 384 * * * * * * * * * * * 2098 * * * * 34 0 * * * * * * 2211 0 0 L 35 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 2211 0 0 V 36 * * * * * * * 974 * 1959 * * * * * * * 2098 * * 36 0 * * * * * * 2211 0 0 H 37 * * * * * * 976 * * * * * * 1959 * * * 2092 * * 37 0 * * * * * * 2211 0 0 Q 38 * * * * * * * * * * * * * 1027 2092 1864 * * * * 38 0 * * * * * * 2211 0 0 I 39 * * * * * * * 463 * 1864 * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 2211 0 0 G 40 2092 * * * * 2098 * * 1864 * * * * 1959 * * * * * * 40 0 * * * * * * 2211 0 0 S 41 * * * * * * * * * 1959 * * * 1864 * 1095 * * * * 41 0 * * * * * * 2211 0 0 T 42 * * * * * * * * 2092 1959 * * * * * * 2098 1864 * * 42 0 * * * * * * 2211 0 0 N 43 * * * 2092 * * * * * * * 976 * * * * 1959 * * * 43 0 * * * * * * 2211 0 0 F 44 * * * * 1095 * * 1864 * * * * * * * * * * * 1959 44 0 * * * * * * 2211 0 0 D 45 * * 1095 1959 * * * * * * * 1864 * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 2211 0 0 N 46 * * 1959 1864 * * * * * * * 2098 * * * 2092 * * * * 46 0 * * * * * * 2211 0 0 A 47 2098 2092 * * * * * * * * * * * * * 911 * * * * 47 0 * * * * * * 2211 0 0 Q 48 * * * * * * * * * 1959 * 1864 * 1095 * * * * * * 48 0 * * * * * * 2211 0 0 P 49 * * * * * * 1864 * * * * * 1027 * * 2092 * * * * 49 0 * * * * * * 2211 0 0 L 50 * * 2092 * * * * 1864 * 2098 * * * * * * * 1959 * * 50 0 * * * * * * 2211 0 0 F 51 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 2211 0 0 D 52 * * 1095 1864 * * * * * * * 1959 * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 2211 0 0 D 53 * * 2098 974 * * * * * * * * * 1959 * * * * * * 53 0 * * * * * * 2211 0 0 L 54 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 2211 0 0 F 55 * * * * 429 * * * * * * * * * * * * * * 1959 55 0 * * * * * * 2211 0 0 R 56 * * 2092 911 * * * * * * * * * * 2098 * * * * * 56 0 * * * * * * 2211 0 0 X 57 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1970 0 0 Q 58 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 58 0 * * * * * * 2211 0 0 S 59 * * 1959 * * 2092 * 1864 * * * * * * * 2098 * * * * 59 0 * * * * * * 2211 0 0 E 60 * * * 2098 * * 1959 1864 2092 * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 2211 0 0 L 61 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 2211 0 0 A 62 463 * * * * * * * * * * * * * * 1864 * * * * 62 0 * * * * * * 2211 0 0 T 63 * * * 1864 * * * * * * * * * * * * 463 * * * 63 0 * * * * * * 2211 0 0 X 64 603 * * * * * * 1550 * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1970 0 0 L 65 * * * * * * * * 384 2098 * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 2211 0 0 Y 66 * * * * 1959 * * * * * * 1864 * * * * * * * 1095 66 0 * * * * * * 2211 0 0 K 67 * * * * * * * * 429 * * * * * 1959 * * * * * 67 0 * * * * * * 2211 0 0 Y 68 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 68 463 1864 * 1000 1000 * * 2211 1000 0 E 69 * * 1959 429 * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 2211 0 0 Y 70 * * * * 974 * * * * 1959 * * * * * * * * * 2098 70 0 * * * * * * 2211 0 0 K 71 * * 1959 * * * * * 2098 * * 1864 * 2092 * * * * * * 71 0 * * * * * * 2211 0 0 P 72 * * * * 1864 * * * * 1024 * * 2098 * * * * * * * 72 0 * * * * * * 2211 0 0 G 73 * * * * * 2098 * * * * * 911 * * * 2092 * * * * 73 0 * * * * * * 2211 0 0 K 74 * * 1864 1959 * * * * 2098 * * * * * * * 2092 * * * 74 0 * * * * * * 2211 0 0 R 75 1959 * * * 1864 * * * 2092 * * * * * 2098 * * * * * 75 0 * * * * * * 2211 0 0 I 76 * * * * * * * 2098 * 384 * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 2211 0 0 Q 77 * * 1959 * * * * * * * * 1864 * 1095 * * * * * * 77 0 * * * * * * 2211 0 0 D 78 * * 429 * * * * 1959 * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 2211 0 0 L 79 * * * * 384 * * * * 2098 * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 2211 0 0 I 80 * * * * * * * 976 * * * * * * * * * 1024 * * 80 0 * * * * * * 2211 0 0 Y 81 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 81 0 * * * * * * 2211 0 0 H 82 * * * * 1864 * 1027 * * * * * * * * * * * * 2092 82 0 * * * * * * 2211 0 0 L 83 * * * * 911 * * * * 2098 2092 * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 2211 0 0 D 84 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 2211 0 0 R 85 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 85 0 * * * * * * 2211 0 0 D 86 * * 463 * * * * * * * * * * 1864 * * * * * * 86 0 * * * * * * 2211 0 0 D 87 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 87 429 1959 * 0 * * * 2211 1000 0 F 88 1959 * * 1864 2098 * * * * 2092 * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 2211 0 0 Y 89 * * * * * * * * * 1959 * * * * * * * * * 429 89 0 * * * * * * 2211 0 0 S 90 * * * * * * * 1959 * * * 1864 * * * 1095 * * * * 90 0 * * * * * * 2211 0 0 R 91 * * * * * * * * * * * * * * 1095 1959 * 1864 * * 91 0 * * * * * * 2211 0 0 K 92 * * * * * * 1864 * 2098 * * * * 1959 2092 * * * * * 92 0 * * * * * * 2211 0 0 Y 93 * * * * 2092 * * * * * * * * * * * * * * 386 93 0 * * * * * * 2211 0 0 W 94 * * * * * * * * * 1864 * * * * * * * * 463 * 94 0 * * * * * * 2211 0 0 H 95 * * * * * * 1095 * * * * * * * * * * * * 911 95 0 * * * * * * 2211 0 0 K 96 1864 * * * * * * * 463 * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 2211 0 0 K 97 * * * * * * 1864 * 463 * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 2211 0 0 F 98 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 2211 0 0 S 99 * * * * * * * * 1959 * * * * 974 * 2098 * * * * 99 0 * * * * * * 2211 0 0 D 100 * * 2098 2092 * * * * * * * * * 911 * * * * * * 100 0 * * * * * * 2211 0 0 G 101 * * * * * 1095 * * * * * 1959 * * * 1864 * * * * 101 429 1959 * 1000 1000 * * 2211 1000 0 L 102 * * 1864 * * * * 1959 * 2098 * * * 2092 * * * * * * 102 0 * * * * * * 2211 0 0 A 103 2098 * * 1864 * * * * * 1959 * * * * * * 2092 * * * 103 0 * * * * * * 2211 0 0 W 104 * * * * 1864 * * * * * * * * * * * * * 463 * 104 0 * * * * * * 2211 0 0 P 105 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 105 0 * * * * * * 2211 0 0 E 106 * * * 1034 * * * * 967 * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1420 0 0 A 107 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //