HHsearch 1.5 NAME c5hljA_ FAM FILE c5hljA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5hljA_.a3m DATE Thu Feb 9 11:09:50 2017 LENG 169 match states, 169 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.3857 -2.3134 SEQ >ss_dssp CCCCCSCEEEEEEEEEETTTTEEEECCEEEECSSSCEEEECCTTCCHHHHTTSSSSEEEEECCSTTCCSSCCCTTSSSEEEEEEEEEECSSSCEEEEEEE EEECBCTTSSCBCCCCEEEECCCEEECTTEEEEEEEEEEESSCCCTTSCEEEEEEEEEESCCCCCCCCC >sa_dssp EBEAEECBDAEBDACBCDEBBAABBDEDEDEBECACDACBBDEECDDEDADECECCAAAAACCDEECCECEBDDEDBCDAAACACABADBECBABADDCD BDCBEDEDDEEECEBECECDCEDCCADDEECBDACABADBDEDADEECDDADACADABCBDEEEEEEEE >ss_pred CCCCCCCEEEEEEEEEEEECCEEEEEEEEEEECCCEEEEEEECCCCHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCEEEECCCCCCEEEEEEEEECCCCCEEEEEEEE ECCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCHHHHCCC >ss_conf 9665541479899822450650144420686234126999616887578654028689974314875136403113320024434305863115663366 166866555300254589998210011464015897201233444666069999974687403131269 >Consensus daypveseiinltingvargnhfnfvngtlqtrnygkvyvagqgtsdselvkkkgdiiltsllgdgdhtlnvnkaeskelelyarvynntkrditvdsvs lspglnatgrefsankfvlyfkptvlkknrintlvfgatfdediddtnrhyllsmrfspgndlfkvgek >c5hljA_ DAYPVESEIINLTINGVARGNHFNFVNGTLQTRNYGKVYVAGQGTSDSELVKKKGDIILTSLLGDGDHTLNVNKAESKELELYARVYNNTKRDITVDSVS LSPGLNATGREFSANKFVLYFKPTVLKKNRINTLVFGATFDEDIDDTNRHYLLSMRFSPGNDLFKVGEK # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * D 1 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 A 2 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 3 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 3 0 * * * * * * 1000 0 0 P 4 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 V 5 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 E 6 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 S 7 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 E 8 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 I 9 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 I 10 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 N 11 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 L 12 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 T 13 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 I 14 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 N 15 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 G 16 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 V 17 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 A 18 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 R 19 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 G 20 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 N 21 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 H 22 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 F 23 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 N 24 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 F 25 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 V 26 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 N 27 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 G 28 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 T 29 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 L 30 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 31 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 T 32 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 R 33 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 N 34 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 35 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 35 0 * * * * * * 1000 0 0 G 36 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 K 37 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 V 38 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 39 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 39 0 * * * * * * 1000 0 0 V 40 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 A 41 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 G 42 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 43 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 G 44 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 T 45 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 S 46 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 D 47 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 S 48 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 E 49 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 L 50 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 V 51 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 K 52 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 K 53 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 K 54 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 G 55 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 D 56 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 I 57 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 I 58 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 L 59 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 T 60 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 S 61 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 L 62 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 L 63 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 G 64 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 D 65 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 G 66 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 D 67 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 H 68 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 T 69 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 L 70 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 N 71 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 V 72 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 N 73 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 K 74 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 A 75 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 E 76 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 S 77 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 K 78 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 E 79 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 L 80 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 E 81 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 L 82 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 83 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 83 0 * * * * * * 1000 0 0 A 84 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 R 85 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 V 86 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 87 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 87 0 * * * * * * 1000 0 0 N 88 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 N 89 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 T 90 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 K 91 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 R 92 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 D 93 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 I 94 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 T 95 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 V 96 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 D 97 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 S 98 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 V 99 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 S 100 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 L 101 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 S 102 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 P 103 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 G 104 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 L 105 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 N 106 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 A 107 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 T 108 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 G 109 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 R 110 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 E 111 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 F 112 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 S 113 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 A 114 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 N 115 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 K 116 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 F 117 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 V 118 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 L 119 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 120 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 120 0 * * * * * * 1000 0 0 F 121 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 K 122 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 P 123 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 T 124 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 V 125 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 L 126 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 K 127 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 K 128 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 N 129 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 R 130 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 I 131 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 N 132 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 T 133 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 L 134 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 V 135 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 F 136 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 G 137 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 A 138 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 T 139 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 F 140 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 D 141 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 E 142 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 D 143 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 I 144 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 D 145 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 D 146 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 T 147 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 147 0 * * * * * * 1000 0 0 N 148 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1000 0 0 R 149 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 149 0 * * * * * * 1000 0 0 H 150 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 151 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 151 0 * * * * * * 1000 0 0 L 152 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 152 0 * * * * * * 1000 0 0 L 153 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 153 0 * * * * * * 1000 0 0 S 154 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 154 0 * * * * * * 1000 0 0 M 155 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 155 0 * * * * * * 1000 0 0 R 156 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 156 0 * * * * * * 1000 0 0 F 157 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 157 0 * * * * * * 1000 0 0 S 158 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 158 0 * * * * * * 1000 0 0 P 159 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 159 0 * * * * * * 1000 0 0 G 160 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 160 0 * * * * * * 1000 0 0 N 161 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 161 0 * * * * * * 1000 0 0 D 162 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 162 0 * * * * * * 1000 0 0 L 163 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 163 0 * * * * * * 1000 0 0 F 164 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 164 0 * * * * * * 1000 0 0 K 165 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 165 0 * * * * * * 1000 0 0 V 166 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 166 0 * * * * * * 1000 0 0 G 167 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 167 0 * * * * * * 1000 0 0 E 168 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 168 0 * * * * * * 1000 0 0 K 169 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 169 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //