HHsearch 1.5 NAME c5fldA_ FAM FILE c5fldA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5fldA_.a3m DATE Sat Jul 2 09:01:26 2016 LENG 124 match states, 124 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4315 -0.1274 SEQ >ss_dssp CCEEEEEEECTTSCEEEEEEEEETTEEEEEECSSCEEEGGGSSSCBCCSEEEEECBCSSCCCCCCEEEEEEEECSSCEEEEEEEEEEEECTTSCEEEEEE CSCCCSSBCSEEEEEEECCEEEEC >sa_dssp EDDDECDADBEDECDAEBDCCEDEECBCADBDEDBDADBEAAEDDCACDDACACBEDEDDADBDDBDACACACBEEDECECEBDACADCDEEEDBBABAD BEDDCECDADDACBDECECADBEE >ss_pred CCCCCCCEEEECCCEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEECCEEEEECCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEE ECCCCCCEEEEEEEEEEEEEEECC >ss_conf 9523651672048565665215657874867302022056533333320256431231685058770499999522888999999997314788489999 636753048899889862113209 >Consensus vsysdghfltksggvinfrktrvtsititilgefltfkgadfksstlkdelliplegavqlntapstalcifittdhvyrelcmmqfltdvdktpflvvl rseskhetiqymhivtvhpflslt >c5fldA_ VSYSDGHFLTKSGGVINFRKTRVTSITITILGEFLTFKGADFKSSTLKDELLIPLEGAVQLNTAPSTALCIFITTDHVYRELCMMQFLTDVDKTPFLVVL RSESKHETIQYMHIVTVHPFLSLT # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * V 1 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 S 2 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 3 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 3 0 * * * * * * 1000 0 0 S 4 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 D 5 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 G 6 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 H 7 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 F 8 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 L 9 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 T 10 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 K 11 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 S 12 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 G 13 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 G 14 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 V 15 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 I 16 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 N 17 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 F 18 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 R 19 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 K 20 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 T 21 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 R 22 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 V 23 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 T 24 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 S 25 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 I 26 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 T 27 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 I 28 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 T 29 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 I 30 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 L 31 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 G 32 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 E 33 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 F 34 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 L 35 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 T 36 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 F 37 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 K 38 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 G 39 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 A 40 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 D 41 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 F 42 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 K 43 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 S 44 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 S 45 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 T 46 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 L 47 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 K 48 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 D 49 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 E 50 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 L 51 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 L 52 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 I 53 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 P 54 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 L 55 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 E 56 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 G 57 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 A 58 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 V 59 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 60 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 L 61 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 N 62 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 T 63 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 A 64 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 P 65 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 S 66 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 T 67 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 A 68 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 L 69 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 C 70 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 I 71 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 F 72 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 I 73 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 T 74 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 T 75 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 D 76 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 H 77 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 V 78 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 79 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 79 0 * * * * * * 1000 0 0 R 80 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 E 81 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 L 82 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 C 83 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 M 84 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 M 85 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 86 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 F 87 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 L 88 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 T 89 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 D 90 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 V 91 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 D 92 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 K 93 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 T 94 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 P 95 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 F 96 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 L 97 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 V 98 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 V 99 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 L 100 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 R 101 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 S 102 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 E 103 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 S 104 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 K 105 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 H 106 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 E 107 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 T 108 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 I 109 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 110 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 111 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 111 0 * * * * * * 1000 0 0 M 112 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 H 113 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 I 114 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 V 115 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 T 116 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 V 117 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 H 118 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 P 119 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 F 120 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 L 121 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 S 122 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 L 123 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 T 124 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 124 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //