HHsearch 1.5 NAME c5e7tI_ FAM FILE c5e7tI_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5e7tI_.a3m DATE Sat Jan 2 08:12:58 2016 LENG 172 match states, 172 columns in multiple alignment FILT 4 out of 8 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.2 EVD 0.4081 -0.8197 SEQ >ss_dssp CCCCCCCTTCTTHHHHHHHHHHHHHHHSCCSSSCCCCCSCCCCSSCCCCCSCCCCTTHHHHHEEEEECSSSSSCEEEECSSSEEEEEEEECEEEETTSSC EEEEECCCTTCEEEEEECEEECSCTTSCEECCEEEEEEEECTTCEEEECEEEEEECEEEECSCEEEEEEEEC >sa_dssp EEDDEDDEECEDCEECDEDBEDCDEEEDEDEEEEDEDEEEEEEEEEEEEEEEEEDEEDDECDCBECDCEEDACCAEBDADBDACACACADBDACAEECCE BCAAACDCEEBECDECEDBDBECCDEEDDDBDBDADACDADEEEEBDADCDDDEDEDDCDEECDACACADDE >ss_pred CCHHHHHHHHHHCHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCEEEEEEEEHHHHHHHEEEEEECCCCCCEEEEECCCCCCEEEEEEEEECCCCCCE EEEEEECCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEEECC >ss_conf 9178988766403324310165540687763277420110220267389500543542001000123068885689951556512368888520466860 577752631123233221656777653120316999987742423799864057889986584899987359 >Consensus AELTKIYRGMqNGAETIdDNfxKiNtevVhkTGDEtIaGkKTFtxdvxVxgxxtxkkfadsyvaffankgsgntvtftapwdctaevelfyhgwgysgge weigittpsgltqiyeatgytnghdnqaismptkaiysglkkglqytfdirdangrgggpkhpmmivklyrn >c5e7tI_ AELTKITRGMQNGAETINDNLNKLNTITVQKTGDETIAGKKTFSGDVSVDGDFTMKKFADSYVAFFANKGSGNTVTFTAPWDCTAEVELFYHGWGYSGGE WEIGITTPSGLTQIYEATGYTNGHDNQAISMPTKAIYSGLKKGLQYTFDIRDANGRGGGPKHPMMIVKLYRN >UniRef50_Q9G096(2-62:163) BPP n=2 Tax=root RepID=Q9G096_9CAUD E=2e-11 s/c=1.16 id=61% cov=33% ASIKKVYRGMKNGAETINDDLEAINSEltsggnVVHKTGDETIAGKKTFTGNVEVNGSLTL--------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------ >UniRef50_Q8LTP7(2-57:165) Structural protein n=2 Tax=Lactococcus phage ul36 RepID=Q8LTP7_9CAUD E=2e-06 s/c=0.97 id=52% cov=29% AELTKIYRGMQNGAETIDNNFSKMNTemkqtadASVKMTGNQDVSGVKNFKDGIKI-------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------- >UniRef50_A6MAD3(2-56:452) Gp068 n=2 Tax=Lactococcus phage KSY1 RepID=A6MAD3_9CAUD E=2e-06 s/c=0.98 id=52% cov=29% AELTKIYEGIDNGVQITDDNFGKINAEltsggnVVHKTGDESIGGRKTFTTDMTV--------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------ # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * A 1 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1815 0 0 E 2 * * * 405 * * * * * * * * * * * 2030 * * * * 2 0 * * * * * * 1815 0 0 L 3 * * * * * * * 2030 * 405 * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1815 0 0 T 4 * * * * * * * * 2030 * * * * * * * 405 * * * 4 0 * * * * * * 1815 0 0 K 5 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1815 0 0 I 6 * * * * * * * 405 * * * * * * * * * 2030 * * 6 0 * * * * * * 1815 0 0 T 7 * * * * * * * * * * * * * * * * 2200 * * 354 7 0 * * * * * * 1815 0 0 R 8 * * * 1952 * * * * * * * * * * 431 * * * * * 8 0 * * * * * * 1815 0 0 G 9 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1815 0 0 M 10 * * * * * * * 1952 * * 431 * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1815 0 0 Q 11 * * 1952 * * * * * 2030 * * * * 1010 * * * * * * 11 0 * * * * * * 1815 0 0 N 12 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1815 0 0 G 13 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1815 0 0 A 14 431 * * * * * * * * * * * * * * * * 1952 * * 14 0 * * * * * * 1815 0 0 E 15 * * * 431 * * * * * * * * * 1952 * * * * * * 15 0 * * * * * * 1815 0 0 T 16 * * * * * * * 1952 * * * * * * * * 431 * * * 16 0 * * * * * * 1815 0 0 I 17 * * * * * * * 431 * * * * * * * * 1952 * * * 17 0 * * * * * * 1815 0 0 N 18 * * 896 * * * * * * * * 1112 * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1815 0 0 D 19 * * 472 * * * * * * * * 1842 * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1815 0 0 N 20 * * 2030 * * * * * * * * 405 * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1815 0 0 L 21 * * * * 896 * * * * 1112 * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1815 0 0 N 22 * * * 2030 * 1952 * * * * * 2200 * * * 1842 * * * * 22 0 * * * * * * 1815 0 0 K 23 2030 * * * * * * * 405 * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1815 0 0 L 24 * * * * * * * 990 * 2200 1842 * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1815 0 0 N 25 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1815 0 0 T 26 1952 * * * * * * * * * * * * * * 2030 1010 * * * 26 472 1842 * 2807 222 * * 1815 1000 0 I 27 1842 * * 990 * * * 2200 * * * * * * * * * * * * 27 1010 990 * 2585 263 * * 1815 1404 0 T 28 * * * * * * * * * * * * * * * 1842 2200 990 * * 28 0 * * * * * * 1815 0 0 V 29 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 29 0 * * * * * * 1815 0 0 Q 30 * * * * * * 990 * 1842 * * * * 2200 * * * * * * 30 0 * * * * * * 1815 0 0 K 31 * * * * * * * * 472 * 1842 * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1815 0 0 T 32 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 32 0 * * * * * * 1815 0 0 G 33 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1815 0 0 D 34 * * 472 * * * * * * * * 1842 * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1815 0 0 E 35 * * * 472 * * * * * * * * * 1842 * * * * * * 35 0 * * * * * * 1815 0 0 T 36 * * 1842 * * * * * * * * * * * * 1952 1112 * * * 36 0 * * * * * * 1815 0 0 I 37 * * * * * * * 472 * * * * * * * * * 1842 * * 37 0 * * * * * * 1815 0 0 A 38 1112 * * * * 1952 * * * * * * * * * 1842 * * * * 38 0 * * * * * * 1815 0 0 G 39 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1815 0 0 K 40 * * * * * * * * 1112 * * * * * 1952 * * 1842 * * 40 0 * * * * * * 1815 0 0 K 41 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1815 0 0 T 42 * * * * * * * * * * * 1842 * * * * 472 * * * 42 0 * * * * * * 1815 0 0 F 43 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1815 0 0 S 44 * * * * * * * * 1842 * * * * * * 2200 990 * * * 44 0 * * * * * * 1815 0 0 G 45 * * 1842 * * 1112 * * * * * * * * * * 1952 * * * 45 0 * * * * * * 1815 0 0 D 46 * * 1070 * * 1842 * * * * * 2030 * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1815 0 0 V 47 * * * * * * * 1842 * * 1952 * * * * * * 1112 * * 47 0 * * * * * * 1815 0 0 S 48 * * * 2030 * * * * 1842 * * * * * * 2200 1952 * * * 48 0 * * * * * * 1815 0 0 V 49 * * * * * * * 1842 * * * * * * * * * 472 * * 49 0 * * * * * * 1815 0 0 D 50 * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1303 0 0 G 51 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1303 0 0 D 52 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 52 0 * * * * * * 1303 0 0 F 53 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1303 0 0 T 54 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 54 0 * * * * * * 1303 0 0 M 55 * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1303 0 0 K 56 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 K 57 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 F 58 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 A 59 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 D 60 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 S 61 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 62 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 62 0 * * * * * * 1000 0 0 V 63 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 A 64 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 F 65 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 F 66 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 A 67 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 N 68 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 K 69 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 G 70 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 S 71 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 G 72 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 N 73 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 T 74 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 V 75 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 T 76 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 F 77 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 T 78 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 A 79 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 P 80 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 W 81 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 D 82 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 C 83 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 T 84 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 A 85 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 E 86 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 V 87 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 E 88 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 L 89 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 F 90 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 91 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 91 0 * * * * * * 1000 0 0 H 92 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 G 93 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 W 94 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 G 95 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 96 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 96 0 * * * * * * 1000 0 0 S 97 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 G 98 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 G 99 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 E 100 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 W 101 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 E 102 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 I 103 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 G 104 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 I 105 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 T 106 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 T 107 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 P 108 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 S 109 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 G 110 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 L 111 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 T 112 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 113 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 I 114 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 115 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 115 0 * * * * * * 1000 0 0 E 116 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 A 117 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 T 118 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 G 119 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 120 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 120 0 * * * * * * 1000 0 0 T 121 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 N 122 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 G 123 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 H 124 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 D 125 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 N 126 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 127 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 A 128 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 I 129 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 S 130 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 M 131 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 P 132 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 T 133 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 K 134 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 A 135 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 I 136 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 137 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 137 0 * * * * * * 1000 0 0 S 138 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 G 139 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 L 140 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 K 141 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 K 142 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 G 143 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 L 144 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 145 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 146 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 146 0 * * * * * * 1000 0 0 T 147 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 147 0 * * * * * * 1000 0 0 F 148 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1000 0 0 D 149 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1000 0 0 I 150 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1000 0 0 R 151 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 151 0 * * * * * * 1000 0 0 D 152 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 152 0 * * * * * * 1000 0 0 A 153 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 153 0 * * * * * * 1000 0 0 N 154 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 154 0 * * * * * * 1000 0 0 G 155 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 155 0 * * * * * * 1000 0 0 R 156 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 156 0 * * * * * * 1000 0 0 G 157 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 157 0 * * * * * * 1000 0 0 G 158 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 158 0 * * * * * * 1000 0 0 G 159 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 159 0 * * * * * * 1000 0 0 P 160 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 160 0 * * * * * * 1000 0 0 K 161 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 161 0 * * * * * * 1000 0 0 H 162 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 162 0 * * * * * * 1000 0 0 P 163 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 163 0 * * * * * * 1000 0 0 M 164 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 164 0 * * * * * * 1000 0 0 M 165 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 165 0 * * * * * * 1000 0 0 I 166 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 166 0 * * * * * * 1000 0 0 V 167 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 167 0 * * * * * * 1000 0 0 K 168 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 168 0 * * * * * * 1000 0 0 L 169 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 169 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 170 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 170 0 * * * * * * 1000 0 0 R 171 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 171 0 * * * * * * 1000 0 0 N 172 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 172 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //