HHsearch 1.5 NAME c5e7tA_ FAM FILE c5e7tA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5e7tA_.a3m DATE Sat Jan 2 08:11:30 2016 LENG 129 match states, 129 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.3 EVD 0.4302 0.4015 SEQ >ss_dssp CCCEEEEEEESCSSCCEEEEEEEESCTTCCTTSTTCSSSTTCSCCEEECCEEEEETTEEEEEECGGGCCCCEEEECSSEEEEEETTEEEEEEEESSCEEE EEECCSCCCCCCEEESCCSSCCEEECCCC >sa_dssp EEBBBABACBECDEEBDBEBCCCDBBEEBBEEDEDDCEDEDCDEEEEBEDECDCEECDACACADDEDDBEDEDCDDCECABACDECCBACACBEECDBEE CCCCEECEEEDEEECEEEEEDEDDDEEEC >ss_pred CCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEEEEEEEECCEEEEEEEEEEECCCEEEEEECCEEEEEEEECCEEEH HHEEECCCCCCEEEEEECCCEEEEEECCC >ss_conf 9851999941776477058898732435433575668742672687420013555233565322346640006731876999828718999960635640 00020478641477510144035553159 >Consensus pxgfxxvxehdseyqpxvkvtxyknxigtexxgfxtgpxfggexiynxxxxlsyxxxkixvexpxxyxxagevixxxnxllxingxxixxfxxxgaxitk gyvekvkpptnlivsdvtstsakisweng >c5e7tA_ PSGFNVVIEHDSEYQPDVKVTYYKNSIGTEANGFDTGPVFGGERIYNLASSLSYIRNKINVELPSVYAMAGEVVNNGNELLLINGTEIMRFVIEGATITK GYVEKVKPPTNLIVSDVTSTSAKISWENG >UniRef50_A6MAD2(193-295:299) Gp067 n=3 Tax=Caudovirales RepID=A6MAD2_9CAUD E=9e-30 s/c=1.26 id=59% cov=80% PAGFKFVLEHDSEYQPEVKVTSYKNAIGTETDGFGTGPSFGGETIYNVPIRLSYDLQKVYVEMPISYQLAGEVtITVDNTLLIINGPQVLCFNMTGAKIT KGY--------------------------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * P 1 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1321 0 0 S 2 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 2 0 * * * * * * 1321 0 0 G 3 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1321 0 0 F 4 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1321 0 0 N 5 * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1321 0 0 V 6 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * 6 0 * * * * * * 1321 0 0 V 7 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 7 0 * * * * * * 1321 0 0 I 8 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1321 0 0 E 9 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1321 0 0 H 10 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1321 0 0 D 11 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1321 0 0 S 12 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 12 0 * * * * * * 1321 0 0 E 13 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1321 0 0 Y 14 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 14 0 * * * * * * 1321 0 0 Q 15 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 15 0 * * * * * * 1321 0 0 P 16 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1321 0 0 D 17 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1321 0 0 V 18 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 18 0 * * * * * * 1321 0 0 K 19 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1321 0 0 V 20 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 20 0 * * * * * * 1321 0 0 T 21 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 21 0 * * * * * * 1321 0 0 Y 22 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 22 0 * * * * * * 1321 0 0 Y 23 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 23 0 * * * * * * 1321 0 0 K 24 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1321 0 0 N 25 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1321 0 0 S 26 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 26 0 * * * * * * 1321 0 0 I 27 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1321 0 0 G 28 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1321 0 0 T 29 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 29 0 * * * * * * 1321 0 0 E 30 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1321 0 0 A 31 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 31 0 * * * * * * 1321 0 0 N 32 * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1321 0 0 G 33 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1321 0 0 F 34 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1321 0 0 D 35 * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1321 0 0 T 36 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 36 0 * * * * * * 1321 0 0 G 37 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1321 0 0 P 38 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1321 0 0 V 39 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * 39 0 * * * * * * 1321 0 0 F 40 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1321 0 0 G 41 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1321 0 0 G 42 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1321 0 0 E 43 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1321 0 0 R 44 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * 44 0 * * * * * * 1321 0 0 I 45 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1321 0 0 Y 46 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 46 0 * * * * * * 1321 0 0 N 47 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1321 0 0 L 48 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 48 0 * * * * * * 1321 0 0 A 49 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1321 0 0 S 50 * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * 50 0 * * * * * * 1321 0 0 S 51 * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * 51 0 * * * * * * 1321 0 0 L 52 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1321 0 0 S 53 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 53 0 * * * * * * 1321 0 0 Y 54 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 54 0 * * * * * * 1321 0 0 I 55 * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1321 0 0 R 56 * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * 56 0 * * * * * * 1321 0 0 N 57 * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * 57 0 * * * * * * 1321 0 0 K 58 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1321 0 0 I 59 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 59 0 * * * * * * 1321 0 0 N 60 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 60 0 * * * * * * 1321 0 0 V 61 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 61 0 * * * * * * 1321 0 0 E 62 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1321 0 0 L 63 * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1321 0 0 P 64 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1321 0 0 S 65 * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * 65 0 * * * * * * 1321 0 0 V 66 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * 66 0 * * * * * * 1321 0 0 Y 67 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 67 0 * * * * * * 1321 0 0 A 68 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 68 0 * * * * * * 1321 0 0 M 69 * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1321 0 0 A 70 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1321 0 0 G 71 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1321 0 0 E 72 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1321 0 0 V 73 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 73 1000 1000 * 0 * * * 1321 1000 0 V 74 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 74 0 * * * * * * 1321 0 0 N 75 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * 75 0 * * * * * * 1321 0 0 N 76 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * 76 0 * * * * * * 1321 0 0 G 77 * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1321 0 0 N 78 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1321 0 0 E 79 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 79 0 * * * * * * 1321 0 0 L 80 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1321 0 0 L 81 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1321 0 0 L 82 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1321 0 0 I 83 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1321 0 0 N 84 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1321 0 0 G 85 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1321 0 0 T 86 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * 86 0 * * * * * * 1321 0 0 E 87 * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 87 0 * * * * * * 1321 0 0 I 88 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 88 0 * * * * * * 1321 0 0 M 89 * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1321 0 0 R 90 * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * 90 0 * * * * * * 1321 0 0 F 91 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1321 0 0 V 92 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * 92 0 * * * * * * 1321 0 0 I 93 * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1321 0 0 E 94 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 94 0 * * * * * * 1321 0 0 G 95 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1321 0 0 A 96 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1321 0 0 T 97 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * 97 0 * * * * * * 1321 0 0 I 98 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1321 0 0 T 99 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 99 0 * * * * * * 1321 0 0 K 100 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1321 0 0 G 101 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1321 0 0 Y 102 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 102 0 * * * * * * 1321 0 0 V 103 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 E 104 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 K 105 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 V 106 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 K 107 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 P 108 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 P 109 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 T 110 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 N 111 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 L 112 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 I 113 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 V 114 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 S 115 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 D 116 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 V 117 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 T 118 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 S 119 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 T 120 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 S 121 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 A 122 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 K 123 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 I 124 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 S 125 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 W 126 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 E 127 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 N 128 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 G 129 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 129 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //