HHsearch 1.5 NAME c5dggB_ FAM FILE c5dggB_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5dggB_.a3m DATE Sat Sep 19 08:13:12 2015 LENG 176 match states, 176 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.3 EVD 0.3731 -2.3923 SEQ >ss_dssp CCCCCHHHHHHHSCCCBTTEEECCCEESSCTTTTTTTHHHHHHHHTCTTCCEEEEEEESSSCEEEEEECCCEEEEECTTCHHHHGGGHHHHHHHHHHTTC CGGGCEEEEECCSSCCCCGGGHHHHHHHHHHHHHHHTTCCGGGSCHHHHHHHHHHTTGGGHHHHHHHHHHHHHHHC >sa_dssp EEDBEDECADDBBBDDDEDBCBBECACCEDEECBEECBEDACDBAEDEEBDCAABABACCCABABABCCECCAAAAABDBDECADEBCECBCDABDDBEB CDEEBECDDCCBEDDCDDDBAAAAAAAABABCAADEBDBDEEBCCDDABDBBCEDAAEEDCABDBBDDCCECDEEE >ss_pred CCCCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEECCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC CHHHEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9620014511773136785899984012353038999988877632866558998526873223874186012431576840378899999999986399 9656666405899976665232340320004678851786443333689998735770134554447888875219 >Consensus rdqxqdhdmxllmpksqgxixvxaxxnrxdsxsxxxixexxasxxxnxxvxxixipvgpghwrgvylskpyxlelfdpygpxgaxxxxxxxlxllxxcgv xxxxvxixxtgpxhpqxdxyxcgdftcayshkkxkefgaxegxynxxlixxlxxxgnxxxxlrxttxxxtxxlvdk >c5dggB_ RDQMQDHDMTLLMPKSQGRIVVMAVLNRYDSHSANAIIETLASDVFNPEVHYIMIPVGPGHWRGVYLSKPYDLELFDPYGPEGAAVLDDYVLDLLNQCGV PKELVNIRHTGPKHPQGDAYSCGDFTCAYSHKKMKEFGAPEGSYNPILIDTLDNLGNEDNVLRMTTREETRALVDK >UniRef50_C6N2M3(98-273:370) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Legionella drancourtii LLAP12 RepID=C6N2M3_9GAMM E=3e-51 s/c=1.15 id=55% cov=97% RDQLQDHDMNLLMPKSQGNIEVLAPVNRFD-RSTEVVQEGIATALKNKDINHIVIPIGPGHWRGIYLTKPvdvnskYQLELFDPYGPIGADTIKKTTLNL LQKCGINENQITIKTTGPTHPQQDGYACGDFTCAYSHKKIKEFGAT--VYNQNLITALEHQGNKEDSLRHTSHKVSQTL--- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * R 1 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 1 0 * * * * * * 1356 0 0 D 2 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1356 0 0 Q 3 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 3 0 * * * * * * 1356 0 0 M 4 * * * * * * * * * 1025 975 * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1356 0 0 Q 5 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 5 0 * * * * * * 1356 0 0 D 6 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1356 0 0 H 7 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1356 0 0 D 8 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1356 0 0 M 9 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1356 0 0 T 10 * * * * * * * * * * * 1025 * * * * 975 * * * 10 0 * * * * * * 1356 0 0 L 11 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1356 0 0 L 12 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1356 0 0 M 13 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1356 0 0 P 14 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1356 0 0 K 15 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1356 0 0 S 16 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 16 0 * * * * * * 1356 0 0 Q 17 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 17 0 * * * * * * 1356 0 0 G 18 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1356 0 0 R 19 * * * * * * * * * * * 1025 * * 975 * * * * * 19 0 * * * * * * 1356 0 0 I 20 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1356 0 0 V 21 * * * 1025 * * * * * * * * * * * * * 975 * * 21 0 * * * * * * 1356 0 0 V 22 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 22 0 * * * * * * 1356 0 0 M 23 * * * * * * * * * 1025 975 * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1356 0 0 A 24 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1356 0 0 V 25 * * * * * * * * * * * * 1025 * * * * 975 * * 25 0 * * * * * * 1356 0 0 L 26 * * * * * * * * * 975 * * * * * * * 1025 * * 26 0 * * * * * * 1356 0 0 N 27 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1356 0 0 R 28 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 28 0 * * * * * * 1356 0 0 Y 29 * * * * 1025 * * * * * * * * * * * * * * 975 29 0 * * * * * * 1356 0 0 D 30 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 30 975 * 1025 * * * * 1356 0 0 S 31 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 31 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 H 32 * * * * * * 975 * * * * * * * 1025 * * * * * 32 0 * * * * * * 1356 0 0 S 33 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 33 0 * * * * * * 1356 0 0 A 34 975 * * * * * * * * * * * * * * * 1025 * * * 34 0 * * * * * * 1356 0 0 N 35 * * * 1025 * * * * * * * 975 * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1356 0 0 A 36 975 * * * * * * * * * * * * * * * * 1025 * * 36 0 * * * * * * 1356 0 0 I 37 * * * * * * * 975 * * * * * * * * * 1025 * * 37 0 * * * * * * 1356 0 0 I 38 * * * * * * * 975 * * * * * 1025 * * * * * * 38 0 * * * * * * 1356 0 0 E 39 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1356 0 0 T 40 * * * * * 1025 * * * * * * * * * * 975 * * * 40 0 * * * * * * 1356 0 0 L 41 * * * * * * * 1025 * 975 * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1356 0 0 A 42 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1356 0 0 S 43 * * * * * * * * * * * * * * * 975 1025 * * * 43 0 * * * * * * 1356 0 0 D 44 1025 * 975 * * * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1356 0 0 V 45 * * * * * * * * * 1025 * * * * * * * 975 * * 45 0 * * * * * * 1356 0 0 F 46 * * * * 975 * * * 1025 * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1356 0 0 N 47 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1356 0 0 P 48 * * * * * * * * 1025 * * * 975 * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1356 0 0 E 49 * * 1025 975 * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1356 0 0 V 50 * * * * * * * 1025 * * * * * * * * * 975 * * 50 0 * * * * * * 1356 0 0 H 51 * * * * * * 975 * * * * 1025 * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1356 0 0 Y 52 * * * * * * 1025 * * * * * * * * * * * * 975 52 0 * * * * * * 1356 0 0 I 53 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1356 0 0 M 54 * * * * * * * * * * 975 * * * * * * 1025 * * 54 0 * * * * * * 1356 0 0 I 55 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1356 0 0 P 56 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1356 0 0 V 57 * * * * * * * 1025 * * * * * * * * * 975 * * 57 0 * * * * * * 1356 0 0 G 58 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1356 0 0 P 59 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1356 0 0 G 60 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1356 0 0 H 61 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1356 0 0 W 62 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 62 0 * * * * * * 1356 0 0 R 63 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 63 0 * * * * * * 1356 0 0 G 64 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1356 0 0 V 65 * * * * * * * 1025 * * * * * * * * * 975 * * 65 0 * * * * * * 1356 0 0 Y 66 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 66 0 * * * * * * 1356 0 0 L 67 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1356 0 0 S 68 * * * * * * * * * * * * * * * 975 1025 * * * 68 0 * * * * * * 1356 0 0 K 69 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1356 0 0 P 70 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 70 975 1025 * 2585 263 * * 1356 1000 0 Y 71 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 71 0 * * * * * * 1356 0 0 D 72 * * 975 * * * * * * * * * * 1025 * * * * * * 72 0 * * * * * * 1356 0 0 L 73 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1356 0 0 E 74 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1356 0 0 L 75 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1356 0 0 F 76 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1356 0 0 D 77 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1356 0 0 P 78 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1356 0 0 Y 79 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 79 0 * * * * * * 1356 0 0 G 80 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1356 0 0 P 81 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1356 0 0 E 82 * * * 975 * * * 1025 * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1356 0 0 G 83 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1356 0 0 A 84 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1356 0 0 A 85 975 * 1025 * * * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1356 0 0 V 86 * * * * * * * * * * * * * * * * 1025 975 * * 86 0 * * * * * * 1356 0 0 L 87 * * * * * * * 1025 * 975 * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1356 0 0 D 88 * * 975 * * * * * 1025 * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1356 0 0 D 89 * * 975 * * * * * 1025 * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1356 0 0 Y 90 * * * * * * * * * * * * * * * * 1025 * * 975 90 0 * * * * * * 1356 0 0 V 91 * * * * * * * * * * * * * * * * 1025 975 * * 91 0 * * * * * * 1356 0 0 L 92 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1356 0 0 D 93 * * 975 * * * * * * * * 1025 * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1356 0 0 L 94 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1356 0 0 L 95 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1356 0 0 N 96 * * * * * * * * * * * 975 * 1025 * * * * * * 96 0 * * * * * * 1356 0 0 Q 97 * * * * * * * * 1025 * * * * 975 * * * * * * 97 0 * * * * * * 1356 0 0 C 98 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1356 0 0 G 99 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1356 0 0 V 100 * * * * * * * 1025 * * * * * * * * * 975 * * 100 0 * * * * * * 1356 0 0 P 101 * * * * * * * * * * * 1025 975 * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1356 0 0 K 102 * * * 1025 * * * * 975 * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1356 0 0 E 103 * * * 975 * * * * * * * 1025 * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1356 0 0 L 104 * * * * * * * * * 975 * * * 1025 * * * * * * 104 0 * * * * * * 1356 0 0 V 105 * * * * * * * 1025 * * * * * * * * * 975 * * 105 0 * * * * * * 1356 0 0 N 106 * * * * * * * * * * * 975 * * * * 1025 * * * 106 0 * * * * * * 1356 0 0 I 107 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1356 0 0 R 108 * * * * * * * * 1025 * * * * * 975 * * * * * 108 0 * * * * * * 1356 0 0 H 109 * * * * * * 975 * * * * * * * * * 1025 * * * 109 0 * * * * * * 1356 0 0 T 110 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 110 0 * * * * * * 1356 0 0 G 111 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1356 0 0 P 112 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1356 0 0 K 113 * * * * * * * * 975 * * * * * * * 1025 * * * 113 0 * * * * * * 1356 0 0 H 114 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1356 0 0 P 115 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1356 0 0 Q 116 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 116 0 * * * * * * 1356 0 0 G 117 * * * * * 975 * * * * * * * 1025 * * * * * * 117 0 * * * * * * 1356 0 0 D 118 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1356 0 0 A 119 975 * * * * 1025 * * * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1356 0 0 Y 120 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 120 0 * * * * * * 1356 0 0 S 121 1025 * * * * * * * * * * * * * * 975 * * * * 121 0 * * * * * * 1356 0 0 C 122 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1356 0 0 G 123 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1356 0 0 D 124 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1356 0 0 F 125 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1356 0 0 T 126 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 126 0 * * * * * * 1356 0 0 C 127 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1356 0 0 A 128 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1356 0 0 Y 129 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 129 0 * * * * * * 1356 0 0 S 130 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 130 0 * * * * * * 1356 0 0 H 131 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1356 0 0 K 132 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1356 0 0 K 133 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1356 0 0 M 134 * * * * * * * 1025 * * 975 * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1356 0 0 K 135 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1356 0 0 E 136 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1356 0 0 F 137 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1356 0 0 G 138 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1356 0 0 A 139 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1356 0 0 P 140 * * * * * * * * * * * * 975 * * * 1025 * * * 140 975 * 1025 * * * * 1356 0 0 E 141 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * 0 1000 0 1000 G 142 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 S 143 * * * * * * * * * * * * * * * 975 * 1025 * * 143 0 * * * * * * 1356 0 0 Y 144 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 144 0 * * * * * * 1356 0 0 N 145 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1356 0 0 P 146 * * * * * * * * * * * * 975 1025 * * * * * * 146 0 * * * * * * 1356 0 0 I 147 * * * * * * * 975 * * * 1025 * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1356 0 0 L 148 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1356 0 0 I 149 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1356 0 0 D 150 * * 975 * * * * * * * * * * * * * 1025 * * * 150 0 * * * * * * 1356 0 0 T 151 1025 * * * * * * * * * * * * * * * 975 * * * 151 0 * * * * * * 1356 0 0 L 152 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 152 0 * * * * * * 1356 0 0 D 153 * * 975 1025 * * * * * * * * * * * * * * * * 153 0 * * * * * * 1356 0 0 N 154 * * * * * * 1025 * * * * 975 * * * * * * * * 154 0 * * * * * * 1356 0 0 L 155 * * * * * * * * * 975 * * * 1025 * * * * * * 155 0 * * * * * * 1356 0 0 G 156 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 156 0 * * * * * * 1356 0 0 N 157 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 157 0 * * * * * * 1356 0 0 E 158 * * * 975 * * * * 1025 * * * * * * * * * * * 158 0 * * * * * * 1356 0 0 D 159 * * 975 1025 * * * * * * * * * * * * * * * * 159 0 * * * * * * 1356 0 0 N 160 * * 1025 * * * * * * * * 975 * * * * * * * * 160 0 * * * * * * 1356 0 0 V 161 * * * * * * * * * * * * * * * 1025 * 975 * * 161 0 * * * * * * 1356 0 0 L 162 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 162 0 * * * * * * 1356 0 0 R 163 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 163 0 * * * * * * 1356 0 0 M 164 * * * * * * 1025 * * * 975 * * * * * * * * * 164 0 * * * * * * 1356 0 0 T 165 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 165 0 * * * * * * 1356 0 0 T 166 * * * * * * * * * * * * * * * 1025 975 * * * 166 0 * * * * * * 1356 0 0 R 167 * * * * * * 1025 * * * * * * * 975 * * * * * 167 0 * * * * * * 1356 0 0 E 168 * * * 975 * * * * 1025 * * * * * * * * * * * 168 0 * * * * * * 1356 0 0 E 169 * * * 975 * * * * * * * * * * * * * 1025 * * 169 0 * * * * * * 1356 0 0 T 170 * * * * * * * * * * * * * * * 1025 975 * * * 170 0 * * * * * * 1356 0 0 R 171 * * * * * * * * * * * * * 1025 975 * * * * * 171 0 * * * * * * 1356 0 0 A 172 975 * * * * * * * * * * * * * * * 1025 * * * 172 0 * * * * * * 1356 0 0 L 173 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 173 0 * * * * * * 1356 0 0 V 174 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 174 0 * * * * * * 1000 0 0 D 175 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 175 0 * * * * * * 1000 0 0 K 176 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 176 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //