HHsearch 1.5 NAME c5d5zE_ FAM FILE c5d5zE_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5d5zE_.a3m DATE Sat Jan 2 08:13:40 2016 LENG 49 match states, 49 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.3 EVD 0.4875 1.5506 SEQ >ss_dssp CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC >sa_dssp EEEEECCEDEDEEDEDEEDDDDDEEDEDEDEEDEEEDDEDDDEDEEEEE >ss_pred CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9404777887779999999999999998987446999999989998429 >Consensus xxqqixxlseslxatqxqxqalqxqxxelxxtnxxlvxevxslqkmvxa >c5d5zE_ SQQQIAALSESLQATQQQLQALQQQCYELEKTNRLLVSEVMTLQKMVKA >UniRef50_D1ZTI4(139-187:664) Whole genome shotgun sequence assembly, scaffold_108 n=1 Tax=Sordaria macrospora RepID=D1ZTI4_SORMA E=4e-10 s/c=1.34 id=62% cov=102% ASQQIVVLSESLTATQHQIQALQEQYFELAQTNKVLVNEVISLQKMVRA # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1 0 * * * * * * 1290 0 0 Q 2 * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * 2 0 * * * * * * 1290 0 0 Q 3 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 3 0 * * * * * * 1290 0 0 Q 4 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 4 0 * * * * * * 1290 0 0 I 5 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1290 0 0 A 6 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 6 0 * * * * * * 1290 0 0 A 7 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 7 0 * * * * * * 1290 0 0 L 8 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1290 0 0 S 9 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 9 0 * * * * * * 1290 0 0 E 10 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1290 0 0 S 11 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 11 0 * * * * * * 1290 0 0 L 12 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1290 0 0 Q 13 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * 13 0 * * * * * * 1290 0 0 A 14 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1290 0 0 T 15 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 15 0 * * * * * * 1290 0 0 Q 16 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 16 0 * * * * * * 1290 0 0 Q 17 * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * 17 0 * * * * * * 1290 0 0 Q 18 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 18 0 * * * * * * 1290 0 0 L 19 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1290 0 0 Q 20 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 20 0 * * * * * * 1290 0 0 A 21 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1290 0 0 L 22 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1290 0 0 Q 23 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 23 0 * * * * * * 1290 0 0 Q 24 * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 24 0 * * * * * * 1290 0 0 Q 25 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 25 0 * * * * * * 1290 0 0 C 26 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 26 0 * * * * * * 1290 0 0 Y 27 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 27 0 * * * * * * 1290 0 0 E 28 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1290 0 0 L 29 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1290 0 0 E 30 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1290 0 0 K 31 * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * 31 0 * * * * * * 1290 0 0 T 32 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 32 0 * * * * * * 1290 0 0 N 33 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1290 0 0 R 34 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 34 0 * * * * * * 1290 0 0 L 35 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 35 0 * * * * * * 1290 0 0 L 36 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1290 0 0 V 37 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 37 0 * * * * * * 1290 0 0 S 38 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 38 0 * * * * * * 1290 0 0 E 39 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1290 0 0 V 40 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 40 0 * * * * * * 1290 0 0 M 41 * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1290 0 0 T 42 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 42 0 * * * * * * 1290 0 0 L 43 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1290 0 0 Q 44 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 44 0 * * * * * * 1290 0 0 K 45 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1290 0 0 M 46 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1290 0 0 V 47 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 47 0 * * * * * * 1290 0 0 K 48 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 48 0 * * * * * * 1290 0 0 A 49 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * 0 * * * 1290 0 0 //