HHsearch 1.5 NAME c5d5pC_ FAM FILE c5d5pC_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5d5pC_.a3m DATE Thu Feb 9 17:33:07 2017 LENG 157 match states, 157 columns in multiple alignment FILT 5 out of 9 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.1 EVD 0.3685 -2.3800 SEQ >ss_dssp CCHHHHHHHHHHHHHTTCCCSCCHHHHHHHHHHHHTCSEEEESCCCHHHHHHHHHHHTTTCCCEEEECCSCCGGGGGSSSHHHHHHHHHHHHSCCSEEEE EEESSSTTSCEEEEEEETTSCEEEEEEECCTTTSCCCHHHHHHHHHHHHHHTTTCCC >sa_dssp EDBDDCCEDBEDCDEEECCEDEDEEBCDACCDCADEBECABBBBDDEECCECBBDAADEBBEBECDCBEDECEEBDEDEDAACDCACCABEDDEBCAABA BBCDCEEEDBCBABAABEECCEBBBBEBDCEEEDECEDCDBADEAACDAADEBEBED >ss_pred CCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHEEECCCEEEEE ECCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEECCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC >ss_conf 9889999999886440233473089999999984055569987598327999999998628964269970477744346823544421034058607996 033368888618999907862886237823532010089999999999999617549 >Consensus mxxeexikkAxxeSxnxxRxGDxxeExxxiqeyiksaxxixVxtxnxxKxxvinxvlxrxxlpxaxmlxIpTnxaDxtrxPAxxKalmaldvxdADlvIa RGRLGxPGSGsmlvxmDxkgRiLTaslSPshxihxxxixxavxxExxeALxriGixx >c5d5pC_ MNIENTIKSAYEESLNNARFGDKIEEIDAIQSTIKSAKNVTVATSNEKKFKVVSDIISRITDANISMLEIPTNSADLTRMPALNKGLIAVDSSDADLIIT RGRLGIPGSGSLLLIMDKKGRILTGSVSPSSIIHKNPIDKTVELELITALERIGIVV >UniRef50_A5UKQ1(1-155:159) Putative uncharacterized protein n=3 Tax=Methanobrevibacter smithii RepID=A5UKQ1_METS3 E=2e-30 s/c=0.86 id=45% cov=99% MAFEEMIKKALDESRNNCRLGDTLEEVREIQNYIKNAEKIYIPNKNGIKVDVLNKVLREYNLPSAKILQINTNEADSNRSPAFAKAIMALDVCDADLIIA RGRLGLPGSGSLLLFVDNKGRILTCGTSPSHAISQKTLEDAVYEEANEALQKIG--- >UniRef50_Q8TZB7(2-154:160) Uncharacterized protein conserved in archaea n=1 Tax=Methanopyrus kandleri RepID=Q8TZB7_METKA E=1e-25 s/c=0.76 id=36% cov=98% --LKETLLKAWWESWEGTRRGDEEREVEGLREYLTSADRLAVVTGNEDKLRAVNKVLRRFGLPEAEMIRVPTEMADATPCPAIFKAIMGVQVSDADVVIA RGRLGVPGSGAMTVFMDARCRLLTAALSPPHVLHEMSVKEAMEREAEEALRRLGM-- >UniRef50_A2SU94(5-157:163) Uncharacterized protein-like protein n=2 Tax=Euryarchaeota RepID=A2SU94_METLZ E=2e-57 s/c=1.45 id=45% cov=98% -SIDCCVSSAYSQSLNGTRLGDTAEETMSIREYIKSSRHIVVPNHDDRKIAVINSVLSSFGLPRAVHLCIPTNSPDLTRTPAVSKALMALDITGADLVIA RGRLGVPGSGSMLVIMDSRGRILSASLSPSHLYHAKSISDAVTHEMEEALVRVG--- >UniRef50_Q57912(4-158:158) Uncharacterized protein MJ0488 n=13 Tax=Euryarchaeota RepID=Y488_METJA E=6e-51 s/c=1.30 id=59% cov=99% --MEEIIKKAFIESINNIRRGDKEEELKKIQEKIVNAKKIVVATNNQKKFKVIRDIMLRVCNAEIKMLDIDTRFADLTRMPALTKGLIALDIEKADLYIA RGRLGAPGSGSMLVILDEKGRVLTASLSPSSVIHKEDIEERIKKELIEALSRIGISI # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1459 0 0 N 2 1590 * * * * * * * * * * 1569 * * * 1597 * * * * 2 0 * * * * * * 1744 0 0 I 3 * * * * 2317 * * 1370 * 2148 2420 * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 2134 0 0 E 4 * * 2350 790 * * * * 2148 * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 2134 0 0 N 5 * 2350 * 706 * * * * * * * 2390 * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 2134 0 0 T 6 * 2350 * * * * * 2420 * * 2317 * * * * * 1264 * * * 6 0 * * * * * * 2134 0 0 I 7 * * * * * * * 790 * 2148 * * * * * * * 2350 * * 7 0 * * * * * * 2134 0 0 K 8 * * * * * * * * 790 2148 * * * * * 2350 * * * * 8 0 * * * * * * 2134 0 0 S 9 * * * * * * * * 706 * * * * * * 1370 * * * * 9 0 * * * * * * 2134 0 0 A 10 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 2134 0 0 Y 11 * * * * 2420 * * * * 2317 * * * * * * * * 2148 1370 11 0 * * * * * * 2134 0 0 E 12 * * 2317 2390 * * * 2420 * * * * * * * 2350 * * 2148 * 12 0 * * * * * * 2134 0 0 E 13 * * * 315 * * * * * * * * * 2350 * * * * * * 13 0 * * * * * * 2134 0 0 S 14 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 14 0 * * * * * * 2134 0 0 L 15 * * * * * * * 2420 * 1370 * * * * 2317 * * * 2148 * 15 0 * * * * * * 2134 0 0 N 16 * * * 2148 * * * * * * * 369 * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 2134 0 0 N 17 * * * * * 1246 * * * * * 790 * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 2134 0 0 A 18 2390 2317 * * * * * 2420 * * * * * * * * 1246 * * * 18 0 * * * * * * 2134 0 0 R 19 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 19 0 * * * * * * 2134 0 0 F 20 * * * * 2390 * * * * 1334 * * * * 1278 * * * * * 20 0 * * * * * * 2134 0 0 G 21 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 2134 0 0 D 22 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 2134 0 0 K 23 * * * 2148 * * * * 1405 * * * * * * * 1334 * * * 23 0 * * * * * * 2134 0 0 I 24 2350 * * 1278 * * * 2390 * 2317 * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 2134 0 0 E 25 * * * 369 * * * * * * * * * * 2148 * * * * * 25 0 * * * * * * 2134 0 0 E 26 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 2134 0 0 I 27 * * * * * * * 2390 * 2420 * * * * * * 2350 1230 * * 27 0 * * * * * * 2134 0 0 D 28 * * 2390 2148 * * * * 2420 * 2350 * * * 2317 * * * * * 28 0 * * * * * * 2134 0 0 A 29 2390 * * 2317 * 2148 * * 2420 * * * * * * 2350 * * * * 29 0 * * * * * * 2134 0 0 I 30 * * * * * * * 369 * 2148 * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 2134 0 0 Q 31 * * * * * * * * * * * * * 790 1246 * * * * * 31 0 * * * * * * 2134 0 0 S 32 * * * 716 * * * * * * * 2317 * * * 2390 * * * * 32 0 * * * * * * 2134 0 0 T 33 * * * * * * * * 2420 * * * * * * * 2390 * * 684 33 0 * * * * * * 2134 0 0 I 34 * * * * * * * 369 * 2148 * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 2134 0 0 K 35 * * * * * * * * 767 * * * * * * * 2148 2420 * * 35 0 * * * * * * 2134 0 0 S 36 * * * * * * * * * * * 1368 * * * 707 * * * * 36 0 * * * * * * 2134 0 0 A 37 315 * * * * * * * * * * * * * * 2350 * * * * 37 0 * * * * * * 2134 0 0 K 38 * * 2148 2317 * * * * 1405 * * * * * 2350 * * * * * 38 0 * * * * * * 2134 0 0 N 39 * * * * * * 2350 * 1368 * * 2390 * * 2148 * * * * * 39 0 * * * * * * 2134 0 0 V 40 * * * * * * * 777 * 2148 * * * * * * * 2390 * * 40 0 * * * * * * 2134 0 0 T 41 2148 * * * * * * * * * * * * * * * 2390 1385 * 2317 41 0 * * * * * * 2134 0 0 V 42 * * * * * * * 2317 * * * * * * * * * 323 * * 42 0 * * * * * * 2134 0 0 A 43 1405 * * * * * * * * * * * 1334 * * * * 2148 * * 43 0 * * * * * * 2134 0 0 T 44 * * * * * * * * * * * 1334 * * * * 729 * * * 44 0 * * * * * * 2134 0 0 S 45 * * * * * 2148 2350 * 2317 * * 2420 * * * 2390 * * * * 45 0 * * * * * * 2134 0 0 N 46 * * 2350 * * * * * * * * 315 * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 2134 0 0 E 47 * * 2350 1264 * 2317 * * * * * * * 2420 * * * * * * 47 0 * * * * * * 2134 0 0 K 48 * * 2148 * * * * 2317 1405 * * * * * 2350 * * * * * 48 0 * * * * * * 2134 0 0 K 49 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 2134 0 0 F 50 * * * * 1405 * * 2350 * 2148 * * * * * * * 2317 * * 50 0 * * * * * * 2134 0 0 K 51 2350 * 2317 * * * * * 1405 * * * * * 2148 * * * * * 51 0 * * * * * * 2134 0 0 V 52 2148 * * * * * * * * * * * * * * * * 369 * * 52 0 * * * * * * 2134 0 0 V 53 * * * * * * * 1385 * 2317 * * * * * * * 1264 * * 53 0 * * * * * * 2134 0 0 S 54 * * * * * * * * * * * 684 * * 2420 2390 * * * * 54 0 * * * * * * 2134 0 0 D 55 * * 1405 * * * * * 1230 * * * * * * 2350 * * * * 55 0 * * * * * * 2134 0 0 I 56 * * * * * * * 1405 * * * * * * * * * 684 * * 56 0 * * * * * * 2134 0 0 I 57 * * * * * * * 2390 * 684 2420 * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 2134 0 0 S 58 * * * * * * * * * 2420 * * * * 1230 1370 * * * * 58 0 * * * * * * 2134 0 0 R 59 * * * 2317 * * * * * * * * * * 729 2350 * * * * 59 0 * * * * * * 2134 0 0 I 60 * * * * 1246 * * 2390 * * * * * * * * * 2420 * 2317 60 0 * * * * * * 2134 0 0 T 61 * 2420 * * * 1246 * * * * * 2317 * * * * 2390 * * * 61 0 * * * * * * 2134 0 0 D 62 * * 2390 * * * * * * 684 * 2420 * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 2134 0 0 A 63 1405 * * * * * * * * * * * 684 * * * * * * * 63 0 * * * * * * 2134 0 0 N 64 * * * 1278 * * * * * * * 2390 * * 2350 2317 * * * * 64 0 * * * * * * 2134 0 0 I 65 684 * * * * * * 1405 * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 2134 0 0 S 66 * * * 2148 * * * * 1368 * * * * * * 2390 * 2350 * * 66 0 * * * * * * 2134 0 0 M 67 * * * * * * 2350 2317 * * 729 * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 2134 0 0 L 68 * * * * * * * 2148 * 369 * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 2134 0 0 E 69 * 2350 2420 2390 * * * * * * * * * 2317 2148 * * * * * 69 0 * * * * * * 2134 0 0 I 70 * * * * * * * 369 * * * * * * * * * 2148 * * 70 0 * * * * * * 2134 0 0 P 71 * * 2420 * * * * * * * * 2317 707 * * * * * * * 71 0 * * * * * * 2134 0 0 T 72 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 72 0 * * * * * * 2134 0 0 N 73 * * * 2148 * * * * * * * 767 * * 2420 * * * * * 73 0 * * * * * * 2134 0 0 S 74 * * * 2317 2420 * * * * * 2148 * * * * 1370 * * * * 74 0 * * * * * * 2134 0 0 A 75 315 * * * * * * * * * * * 2350 * * * * * * * 75 0 * * * * * * 2134 0 0 D 76 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 2134 0 0 L 77 2148 * * * * * * * * 801 * * * * * 2317 * * * * 77 0 * * * * * * 2134 0 0 T 78 * * * * * * * * * * * 2317 * * * * 323 * * * 78 0 * * * * * * 2134 0 0 R 79 * * * * * * * * * * * * 2148 * 369 * * * * * 79 0 * * * * * * 2134 0 0 M 80 * 2148 * * * * * * * * 1405 * * * * 2317 2350 * * * 80 0 * * * * * * 2134 0 0 P 81 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 81 0 * * * * * * 2134 0 0 A 82 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 2134 0 0 L 83 * * * * 2317 * * 2148 * 1405 * * * * * * * 2350 * * 83 0 * * * * * * 2134 0 0 N 84 2317 * * * 2148 * * * * * * 2390 * * * 2350 2420 * * * 84 0 * * * * * * 2134 0 0 K 85 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 2134 0 0 G 86 684 * * * * 1405 * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 2134 0 0 L 87 * * * * * * * 1230 * 801 * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 2134 0 0 I 88 * * * * * * * 1405 * * 684 * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 2134 0 0 A 89 369 * * * * 2148 * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 2134 0 0 V 90 * * * * * * * * * 777 * * * * * * * 1264 * * 90 0 * * * * * * 2134 0 0 D 91 * * 369 * * * * * * * * * * 2148 * * * * * * 91 0 * * * * * * 2134 0 0 S 92 * * * * * * * 1385 * * * * * * * 2390 * 1230 * * 92 0 * * * * * * 2134 0 0 S 93 * 2317 * 2420 * * * * * * * * * * * 1264 2350 * * * 93 0 * * * * * * 2134 0 0 D 94 * * 697 * * 2350 * * 2420 * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 2134 0 0 A 95 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 2134 0 0 D 96 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 2134 0 0 L 97 * * * * * * * * * 369 * * * * * * * 2148 * * 97 0 * * * * * * 2134 0 0 I 98 * * * * * * * 1353 * * * * * * * * * 1246 * 2420 98 0 * * * * * * 2134 0 0 I 99 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 2134 0 0 T 100 305 * * * * * * * * * * * * * * * 2390 * * * 100 0 * * * * * * 2134 0 0 R 101 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 101 0 * * * * * * 2134 0 0 G 102 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 2134 0 0 R 103 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 103 0 * * * * * * 2134 0 0 L 104 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 2134 0 0 G 105 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 2134 0 0 I 106 2420 * * * * * * 2390 * 2317 * * * * * * * 1246 * * 106 0 * * * * * * 2134 0 0 P 107 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 107 0 * * * * * * 2134 0 0 G 108 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 2134 0 0 S 109 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 109 0 * * * * * * 2134 0 0 G 110 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 2134 0 0 S 111 2148 * * * * * * * * * * * * * * 369 * * * * 111 0 * * * * * * 2134 0 0 L 112 * * * * * * * * * 1353 716 * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 2134 0 0 L 113 * * * * * * * * * 369 * * * * * * 2148 * * * 113 0 * * * * * * 2134 0 0 L 114 * * * * * * * * * 1353 * * * * * * * 716 * * 114 0 * * * * * * 2134 0 0 I 115 * * * * 1230 * * 801 * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 2134 0 0 M 116 * * * * * * * * * 2420 707 * * * * * * 2317 * * 116 0 * * * * * * 2134 0 0 D 117 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 2134 0 0 K 118 2148 * * 2420 * * * * 2390 * * 2317 * * * 2350 * * * * 118 0 * * * * * * 2134 0 0 K 119 * * * * * * * * 790 * * * * * 1246 * * * * * 119 0 * * * * * * 2134 0 0 G 120 * 2148 * * * 369 * * * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 2134 0 0 R 121 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 121 0 * * * * * * 2134 0 0 I 122 * * * * * * * 767 * 2148 * * * * * * * 2420 * * 122 0 * * * * * * 2134 0 0 L 123 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 2134 0 0 T 124 * * * * * * * * * * * * * * * 2350 315 * * * 124 0 * * * * * * 2134 0 0 G 125 716 2317 * * * 2390 * * * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 2134 0 0 S 126 2148 * * * * 2317 * * * * * * * * * 801 * * * * 126 0 * * * * * * 2134 0 0 V 127 * * * * * * * * * 716 * * * * * * 2317 2390 * * 127 0 * * * * * * 2134 0 0 S 128 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 128 0 * * * * * * 2134 0 0 P 129 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 129 0 * * * * * * 2134 0 0 S 130 * * * * * * * * * * * * 2148 * * 369 * * * * 130 0 * * * * * * 2134 0 0 S 131 * * * * * * 684 * * * * * * * * 1405 * * * * 131 0 * * * * * * 2134 0 0 I 132 2317 * * * * * * 2390 * 2350 * * * * * * * 1278 * * 132 0 * * * * * * 2134 0 0 I 133 * * * * * * * 790 * 2148 * * * * * * * * * 2350 133 0 * * * * * * 2134 0 0 H 134 * * * * * * 323 * * * * * * * * 2317 * * * * 134 0 * * * * * * 2134 0 0 K 135 2350 * * 2148 * * * * 1405 * * * * 2317 * * * * * * 135 0 * * * * * * 2134 0 0 N 136 * * * 2420 * * * * 1334 * 2148 2390 * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 2134 0 0 P 137 * * 2420 * * * * * * * * * 2390 * * 1246 2317 * * * 137 0 * * * * * * 2134 0 0 I 138 * * * * * * * 801 * 2317 * * * * * * * 2148 * * 138 0 * * * * * * 2134 0 0 D 139 * * 2390 1368 * * * * 2148 * * * * * * 2350 * * * * 139 0 * * * * * * 2134 0 0 K 140 * * 1334 1278 * * * * 2390 * * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 2134 0 0 T 141 684 * * * * * * * * * * * * * 2420 * 2390 * * * 141 0 * * * * * * 2134 0 0 V 142 * * * * * * * 2420 * * 2148 * * * * * * 767 * * 142 0 * * * * * * 2134 0 0 E 143 * * * 1264 * * * * 2420 * * * * * * * 2350 * * 2317 143 0 * * * * * * 2134 0 0 L 144 * * * 2317 * * 2350 * 2420 2390 * * * * 2148 * * * * * 144 0 * * * * * * 2134 0 0 E 145 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 2134 0 0 L 146 1230 * * * * * * * * 1405 2350 * * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 2134 0 0 I 147 * * * 1246 * * * 1405 * * * 2317 * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 2134 0 0 T 148 * * * 305 * * * * * * * * * * * * 2390 * * * 148 0 * * * * * * 2134 0 0 A 149 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 2134 0 0 L 150 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 2134 0 0 E 151 * * * 2390 * * * * * * * * * 2317 2148 2420 * 2350 * * 151 0 * * * * * * 2134 0 0 R 152 * * * * * * * * 2317 * * * * * 323 * * * * * 152 0 * * * * * * 2134 0 0 I 153 * * * * * * * 790 * 2148 * * * * * * * 2350 * * 153 0 * * * * * * 2134 0 0 G 154 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 154 0 * * * * * * 2134 0 0 I 155 * * * * * * * 670 * * 1429 * * * * * * * * * 155 0 * * * * * * 1760 0 0 V 156 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * 156 0 * * * * * * 1325 0 0 V 157 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 157 0 * * 0 * * * 1325 0 0 //