HHsearch 1.5 NAME c5bndA_ FAM FILE c5bndA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5bndA_.a3m DATE Sat Jul 9 08:30:45 2016 LENG 179 match states, 179 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.6 EVD 0.3890 -1.7882 SEQ >ss_dssp CCEEEEEEEECCSSCEEEBSSSCEEECTTCEEEEEEEETTEEEEEETTEEEEEEGGGSEEECTTSCCEECCSTTTGGGBCHHHHTTHHHHHTTTTCBHHH HTTTSCCSSCCSSEEECTTSSCEEEECGGGBEEEEEEEBCCHHHHHTTTTCCSSEEEEEETTEEEEEETTTTEEEEECC >sa_dssp ECEECEBCAAABECDBDADDEEDCEACCBABABABACCEECBBADBDEEEBBACCEDBCCADCECECDECDCEDACDBBDDDABEEBEDACEBBDCDAEE ACEEAECEEDDDBBADBDEDDADAAABDECDABAABABBCDCEDACEDBEAEDECABADBEEBBAAABBEDDCAABABE >ss_pred CCCCEEEEEEEECCCEEEECCCEEECCCCCEEEEEECCCCEEEEEEEEEEEEEECCEEEEECHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHH HHHCCCCCCCCEEEEEECCCEEEEEECCCCCEEEEEEEEECHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCEEEEEECCCCCEEEEEC >ss_conf 9530257877406715640442221367426999734981799986433688403238998313522200066653666504475999987640002321 1000054787649999506608999767641101787631478886421545127999808803776506662899979 >Consensus xxxEKxAxGxxxxxxxxLxGxxxxKxPxxxxxTItxxxxxxYrVxxxxrxxxVxxxxvxYxNPAxLYxxxTxxxLxxYxxxNYSxxxExFNxxLxxxHxx vxxxLxPxxxxkxxvxiTxxxIxmxFxDxDxlxGxxxPxxNxxxLkxxFNItxxxWIxKxxxGYxIADxxxxxWixIxl >c5bndA_ TYEEKLAYGLALDGSVTLNGSKDLKVPKYSLITITGENNKRYRVEMNQRRYSVSKNQVFYFNPAGLYESHTFKKLSPYIKSNYSTYVEYFNSHLHQKHDK VTETLRPDKDKKYVVPITQQPIKMIFGDNDKLSGFVIPMTNKTELKKTFNITKDVWITKSGSGYFIADMKEEKWIYIEL >UniRef50_B9E7Z1(333-509:509) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Macrococcus caseolyticus JCSC5402 RepID=B9E7Z1_MACCJ E=1e-24 s/c=0.64 id=30% cov=99% -FREKYAIGVT-NKPTELQGEQKVKLPAGHTMTISSIGDETYKVDYQKKTMEVKQQDIIYINPAALYDEYTLSELEDYMYDNYSNFREFFNGYLGKHHSV INKELYPESNDRFKIKLTKNEIYLHFNDYDIMNGISFPIVNEEKLRQKFNISTEQWIIKLDDGYAIADFSKGEWLIIQM # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * T 1 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 2 * * * * 1008 * * * * * * * * * * * * * * 992 2 0 * * * * * * 1614 0 0 E 3 * * * 992 * * * * * * * * * * 1008 * * * * * 3 0 * * * * * * 1614 0 0 E 4 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1614 0 0 K 5 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1614 0 0 L 6 * * * * * * * * * 992 * * * * * * * * * 1008 6 0 * * * * * * 1614 0 0 A 7 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1614 0 0 Y 8 * * * * * * * 1008 * * * * * * * * * * * 992 8 0 * * * * * * 1614 0 0 G 9 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1614 0 0 L 10 * * * * * * * * * 992 * * * * * * * 1008 * * 10 0 * * * * * * 1614 0 0 A 11 992 * * * * * * * * * * * * * * * 1008 * * * 11 992 * 1008 * * * * 1614 0 0 L 12 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 12 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 D 13 * * 992 * * * * * * * * 1008 * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1614 0 0 G 14 * * * * * 992 * * 1008 * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1614 0 0 S 15 * * * * * * * * * * * * 1008 * * 992 * * * * 15 0 * * * * * * 1614 0 0 V 16 * * * * * * * * * * * * * * * * 1008 992 * * 16 0 * * * * * * 1614 0 0 T 17 * * * 1008 * * * * * * * * * * * * 992 * * * 17 0 * * * * * * 1614 0 0 L 18 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1614 0 0 N 19 * * * * * * * * * * * 992 * 1008 * * * * * * 19 0 * * * * * * 1614 0 0 G 20 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1614 0 0 S 21 * * * 1008 * * * * * * * * * * * 992 * * * * 21 0 * * * * * * 1614 0 0 K 22 * * * * * * * * 992 * * * * 1008 * * * * * * 22 0 * * * * * * 1614 0 0 D 23 * * 992 * * * * * 1008 * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1614 0 0 L 24 * * * * * * * * * 992 * * * * * * * 1008 * * 24 0 * * * * * * 1614 0 0 K 25 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1614 0 0 V 26 * * * * * * * * * 1008 * * * * * * * 992 * * 26 0 * * * * * * 1614 0 0 P 27 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1614 0 0 K 28 1008 * * * * * * * 992 * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1614 0 0 Y 29 * * * * * 1008 * * * * * * * * * * * * * 992 29 0 * * * * * * 1614 0 0 S 30 * * * * * * 1008 * * * * * * * * 992 * * * * 30 0 * * * * * * 1614 0 0 L 31 * * * * * * * * * 992 * * * * * * 1008 * * * 31 0 * * * * * * 1614 0 0 I 32 * * * * * * * 992 * * 1008 * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1614 0 0 T 33 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 33 0 * * * * * * 1614 0 0 I 34 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1614 0 0 T 35 * * * * * * * * * * * * * * * 1008 992 * * * 35 0 * * * * * * 1614 0 0 G 36 * * * * * 992 * * * * * * * * * 1008 * * * * 36 0 * * * * * * 1614 0 0 E 37 * * * 992 * * * 1008 * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1614 0 0 N 38 * * * * * 1008 * * * * * 992 * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1614 0 0 N 39 * * 1008 * * * * * * * * 992 * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1614 0 0 K 40 * * * 1008 * * * * 992 * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1614 0 0 R 41 * * * * * * * * * * * * * * 992 * 1008 * * * 41 0 * * * * * * 1614 0 0 Y 42 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 42 0 * * * * * * 1614 0 0 R 43 * * * * * * * * 1008 * * * * * 992 * * * * * 43 0 * * * * * * 1614 0 0 V 44 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 44 0 * * * * * * 1614 0 0 E 45 * * 1008 992 * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1614 0 0 M 46 * * * * * * * * * * 992 * * * * * * * * 1008 46 0 * * * * * * 1614 0 0 N 47 * * * * * * * * * * * 992 * 1008 * * * * * * 47 0 * * * * * * 1614 0 0 Q 48 * * * * * * * * 1008 * * * * 992 * * * * * * 48 0 * * * * * * 1614 0 0 R 49 * * * * * * * * 1008 * * * * * 992 * * * * * 49 0 * * * * * * 1614 0 0 R 50 * * * * * * * * * * * * * * 992 * 1008 * * * 50 0 * * * * * * 1614 0 0 Y 51 * * * * * * * * * * 1008 * * * * * * * * 992 51 0 * * * * * * 1614 0 0 S 52 * * * 1008 * * * * * * * * * * * 992 * * * * 52 0 * * * * * * 1614 0 0 V 53 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 53 0 * * * * * * 1614 0 0 S 54 * * * * * * * * 1008 * * * * * * 992 * * * * 54 0 * * * * * * 1614 0 0 K 55 * * * * * * * * 992 * * * * 1008 * * * * * * 55 0 * * * * * * 1614 0 0 N 56 * * * * * * * * * * * 992 * 1008 * * * * * * 56 0 * * * * * * 1614 0 0 Q 57 * * 1008 * * * * * * * * * * 992 * * * * * * 57 0 * * * * * * 1614 0 0 V 58 * * * * * * * 1008 * * * * * * * * * 992 * * 58 0 * * * * * * 1614 0 0 F 59 * * * * 992 * * 1008 * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1614 0 0 Y 60 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 60 0 * * * * * * 1614 0 0 F 61 * * * * 992 * * 1008 * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1614 0 0 N 62 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1614 0 0 P 63 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1614 0 0 A 64 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1614 0 0 G 65 1008 * * * * 992 * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1614 0 0 L 66 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1614 0 0 Y 67 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 67 0 * * * * * * 1614 0 0 E 68 * * 1008 992 * * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1614 0 0 S 69 * * * 1008 * * * * * * * * * * * 992 * * * * 69 0 * * * * * * 1614 0 0 H 70 * * * * * * 992 * * * * * * * * * * * * 1008 70 0 * * * * * * 1614 0 0 T 71 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 71 0 * * * * * * 1614 0 0 F 72 * * * * 992 * * * * 1008 * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1614 0 0 K 73 * * * * * * * * 992 * * * * * * 1008 * * * * 73 0 * * * * * * 1614 0 0 K 74 * * * 1008 * * * * 992 * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1614 0 0 L 75 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1614 0 0 S 76 * * * 1008 * * * * * * * * * * * 992 * * * * 76 0 * * * * * * 1614 0 0 P 77 * * 1008 * * * * * * * * * 992 * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1614 0 0 Y 78 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 78 0 * * * * * * 1614 0 0 I 79 * * * * * * * 992 * * 1008 * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1614 0 0 K 80 * * * * * * * * 992 * * * * * * * * * * 1008 80 0 * * * * * * 1614 0 0 S 81 * * 1008 * * * * * * * * * * * * 992 * * * * 81 0 * * * * * * 1614 0 0 N 82 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1614 0 0 Y 83 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 83 0 * * * * * * 1614 0 0 S 84 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 84 0 * * * * * * 1614 0 0 T 85 * * * * * * * * * * * 1008 * * * * 992 * * * 85 0 * * * * * * 1614 0 0 Y 86 * * * * 1008 * * * * * * * * * * * * * * 992 86 0 * * * * * * 1614 0 0 V 87 * * * * * * * * * * * * * * 1008 * * 992 * * 87 0 * * * * * * 1614 0 0 E 88 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1614 0 0 Y 89 * * * * 1008 * * * * * * * * * * * * * * 992 89 0 * * * * * * 1614 0 0 F 90 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1614 0 0 N 91 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1614 0 0 S 92 * * * * * 1008 * * * * * * * * * 992 * * * * 92 0 * * * * * * 1614 0 0 H 93 * * * * * * 992 * * * * * * * * * * * * 1008 93 0 * * * * * * 1614 0 0 L 94 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1614 0 0 H 95 * * * * * 1008 992 * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1614 0 0 Q 96 * * * * * * * * 1008 * * * * 992 * * * * * * 96 0 * * * * * * 1614 0 0 K 97 * * * * * * 1008 * 992 * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1614 0 0 H 98 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1614 0 0 D 99 * * 992 * * * * * * * * * * * * 1008 * * * * 99 0 * * * * * * 1614 0 0 K 100 * * * * * * * * 992 * * * * * * * * 1008 * * 100 0 * * * * * * 1614 0 0 V 101 * * * * * * * 1008 * * * * * * * * * 992 * * 101 0 * * * * * * 1614 0 0 T 102 * * * * * * * * * * * 1008 * * * * 992 * * * 102 0 * * * * * * 1614 0 0 E 103 * * * 992 * * * * 1008 * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1614 0 0 T 104 * * * 1008 * * * * * * * * * * * * 992 * * * 104 0 * * * * * * 1614 0 0 L 105 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1614 0 0 R 106 * * * * * * * * * * * * * * 992 * * * * 1008 106 0 * * * * * * 1614 0 0 P 107 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1614 0 0 D 108 * * 992 1008 * * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1614 0 0 K 109 * * * * * * * * 992 * * * * * * 1008 * * * * 109 0 * * * * * * 1614 0 0 D 110 * * 992 * * * * * * * * 1008 * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1614 0 0 K 111 * * 1008 * * * * * 992 * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1614 0 0 K 112 * * * * * * * * 992 * * * * * 1008 * * * * * 112 0 * * * * * * 1614 0 0 Y 113 * * * * 1008 * * * * * * * * * * * * * * 992 113 0 * * * * * * 1614 0 0 V 114 * * * * * * * * 1008 * * * * * * * * 992 * * 114 0 * * * * * * 1614 0 0 V 115 * * * * * * * 1008 * * * * * * * * * 992 * * 115 0 * * * * * * 1614 0 0 P 116 * * * * * * * * 1008 * * * 992 * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1614 0 0 I 117 * * * * * * * 992 * 1008 * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1614 0 0 T 118 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 118 0 * * * * * * 1614 0 0 Q 119 * * * * * * * * 1008 * * * * 992 * * * * * * 119 0 * * * * * * 1614 0 0 Q 120 * * * * * * * * * * * 1008 * 992 * * * * * * 120 0 * * * * * * 1614 0 0 P 121 * * * 1008 * * * * * * * * 992 * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1614 0 0 I 122 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1614 0 0 K 123 * * * * * * * * 992 * * * * * * * * * * 1008 123 0 * * * * * * 1614 0 0 M 124 * * * * * * * * * 1008 992 * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1614 0 0 I 125 * * * * * * 1008 992 * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1614 0 0 F 126 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1614 0 0 G 127 * * * * * 992 * * * * * 1008 * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1614 0 0 D 128 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1614 0 0 N 129 * * * * * * * * * * * 992 * * * * * * * 1008 129 0 * * * * * * 1614 0 0 D 130 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1614 0 0 K 131 * * * * * * * 1008 992 * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1614 0 0 L 132 * * * * * * * * * 992 1008 * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1614 0 0 S 133 * * * * * * * * * * * 1008 * * * 992 * * * * 133 0 * * * * * * 1614 0 0 G 134 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1614 0 0 F 135 * * * * 992 * * 1008 * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1614 0 0 V 136 * * * * * * * * * * * * * * * 1008 * 992 * * 136 0 * * * * * * 1614 0 0 I 137 * * * * 1008 * * 992 * * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1614 0 0 P 138 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1614 0 0 M 139 * * * * * * * 1008 * * 992 * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1614 0 0 T 140 * * * * * * * * * * * * * * * * 992 1008 * * 140 0 * * * * * * 1614 0 0 N 141 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1614 0 0 K 142 * * * 1008 * * * * 992 * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1614 0 0 T 143 * * * 1008 * * * * * * * * * * * * 992 * * * 143 0 * * * * * * 1614 0 0 E 144 * * * 992 * * * * 1008 * * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1614 0 0 L 145 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1614 0 0 K 146 * * * * * * * * 992 * * * * * 1008 * * * * * 146 0 * * * * * * 1614 0 0 K 147 * * * * * * * * 992 * * * * 1008 * * * * * * 147 0 * * * * * * 1614 0 0 T 148 * * * * * * * * 1008 * * * * * * * 992 * * * 148 0 * * * * * * 1614 0 0 F 149 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1614 0 0 N 150 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1614 0 0 I 151 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1614 0 0 T 152 * * * * * * * * * * * * * * * 1008 992 * * * 152 0 * * * * * * 1614 0 0 K 153 * * * * * * * * 992 * * * * * * * 1008 * * * 153 0 * * * * * * 1614 0 0 D 154 * * 992 1008 * * * * * * * * * * * * * * * * 154 0 * * * * * * 1614 0 0 V 155 * * * * * * * * * * * * * 1008 * * * 992 * * 155 0 * * * * * * 1614 0 0 W 156 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 156 0 * * * * * * 1614 0 0 I 157 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 157 0 * * * * * * 1614 0 0 T 158 * * * * * * * 1008 * * * * * * * * 992 * * * 158 0 * * * * * * 1614 0 0 K 159 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 159 0 * * * * * * 1614 0 0 S 160 * * * * * * * * * 1008 * * * * * 992 * * * * 160 0 * * * * * * 1614 0 0 G 161 * * 1008 * * 992 * * * * * * * * * * * * * * 161 0 * * * * * * 1614 0 0 S 162 * * 1008 * * * * * * * * * * * * 992 * * * * 162 0 * * * * * * 1614 0 0 G 163 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 163 0 * * * * * * 1614 0 0 Y 164 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 164 0 * * * * * * 1614 0 0 F 165 1008 * * * 992 * * * * * * * * * * * * * * * 165 0 * * * * * * 1614 0 0 I 166 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 166 0 * * * * * * 1614 0 0 A 167 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 167 0 * * * * * * 1614 0 0 D 168 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 168 0 * * * * * * 1614 0 0 M 169 * * * * 1008 * * * * * 992 * * * * * * * * * 169 0 * * * * * * 1614 0 0 K 170 * * * * * * * * 992 * * * * * * 1008 * * * * 170 0 * * * * * * 1614 0 0 E 171 * * * 992 * * * * 1008 * * * * * * * * * * * 171 0 * * * * * * 1614 0 0 E 172 * * * 992 * 1008 * * * * * * * * * * * * * * 172 0 * * * * * * 1614 0 0 K 173 * * * 1008 * * * * 992 * * * * * * * * * * * 173 0 * * * * * * 1614 0 0 W 174 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 174 0 * * * * * * 1614 0 0 I 175 * * * * * * * 992 * 1008 * * * * * * * * * * 175 0 * * * * * * 1614 0 0 Y 176 * * * * * * * 1008 * * * * * * * * * * * 992 176 0 * * * * * * 1614 0 0 I 177 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 177 0 * * * * * * 1614 0 0 E 178 * * * 992 * * * * * * * * * 1008 * * * * * * 178 0 * * * * * * 1614 0 0 L 179 * * * * * * * * * 992 1008 * * * * * * * * * 179 0 * * 0 * * * 1614 0 0 //