HHsearch 1.5 NAME c5b52B_ FAM FILE c5b52B_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c5b52B_.a3m DATE Fri Feb 10 02:25:56 2017 LENG 60 match states, 60 columns in multiple alignment FILT 5 out of 9 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.1 EVD 0.4809 2.7548 SEQ >ss_dssp CCTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTCCHHHHHHHHCTTC >sa_dssp DEEEEDDDEEDEDEDEDDDDDEEEEDDEEEEDDEEEEDCDECEEEEDDEEDCDDEEDEEE >ss_pred CHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCC >ss_conf 902451689999999999998642487899865899999999970737999999757589 >Consensus rlxEfxaxEqxLxxqxxxLealkxdxxLkxElEFexKLxxLmxeYxkSlrdiIxiLDPqx >c5b52B_ RLAEFAAAEKALQEQMAQLEALKKDAGLKREIEFEQKLVGLMKSYDKSLRDIIAILDPKL >UniRef50_A4VIQ5(14-70:135) Transcriptional regulator MvaT, P16 subunit n=35 Tax=Proteobacteria RepID=A4VIQ5_PSEU5 E=7e-08 s/c=1.03 id=52% cov=97% -INEYRATEEAIKELQERLKSLSEDDKLKKELEFEGKLRELMGEYQKSLRDIIALLDP-- >UniRef50_UPI0001AF601E(3-57:117) hypothetical protein Psyrpo1_17368 n=1 Tax=Pseudomonas syringae pv. oryzae str. 1_6 RepID=UPI0001AF601E E=8e-06 s/c=0.94 id=54% cov=93% RLVEFRALEQKLAAQLIKLEALKGSSELQKEIEFEGKLHELVSHYGFSLRDIINI----- >UniRef50_Q3ZMA9(1-55:115) Putative transcriptional regulator (Fragment) n=1 Tax=Cellulomonas flavigena RepID=Q3ZMA9_9CELL E=3e-12 s/c=1.32 id=48% cov=93% ----FPTPEQQLAQQLAELEAMKGDSAIKAEMEFEEKLRALLGEYGYTLRDVINILDPQ- >UniRef50_Q1QX03(4-61:125) H-NS family protein MvaT n=9 Tax=Gammaproteobacteria RepID=Q1QX03_CHRSD E=8e-09 s/c=1.06 id=42% cov=98% -LSEYMKKEQLLKQLSEELQQLEKDQRLTSELEFKEKLEALMKEYDKSPAAVIEMLDPQ- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * R 1 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 1 0 * * * * * * 1370 0 0 L 2 * * * * * * * 2054 * 397 * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 2018 0 0 A 3 2130 * * * * * * * * * * 2054 * * * 1848 * 1982 * * 3 0 * * * * * * 2018 0 0 E 4 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 2018 0 0 F 5 * * * * 800 * * * * * * * * * * * * * * 1232 5 0 * * * * * * 2161 0 0 A 6 2444 * * * * * * * * * 2127 * 2337 * 1361 * * * * * 6 0 * * * * * * 2161 0 0 A 7 803 * * * * * * * 2127 * * * * * * * 2337 * * * 7 0 * * * * * * 2161 0 0 A 8 2444 * * * * * * * 2127 2377 * * 2337 * * * 2345 * * * 8 0 * * * * * * 2161 0 0 E 9 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 2161 0 0 K 10 * * * 2345 * * * * 2444 * * * * 691 * * * * * * 10 0 * * * * * * 2161 0 0 A 11 1394 * * * * * * * 2377 2127 * * * 2337 * * * * * * 11 0 * * * * * * 2161 0 0 L 12 * * * * * * * 2345 * 316 * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 2161 0 0 Q 13 1357 * * * * * * * 1232 * * * * 2444 * * * * * * 13 0 * * * * * * 2161 0 0 E 14 2377 * * 1394 * * * * * * * * * 1228 * * * * * * 14 0 * * * * * * 2161 0 0 Q 15 * * * * * * * * * 1232 * * * 800 * * * * * * 15 0 * * * * * * 2161 0 0 M 16 * * * * * * * * * 1357 2444 * * 2345 * 2127 * * * * 16 0 * * * * * * 2161 0 0 A 17 1389 * * 1232 * * * 2377 * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 2161 0 0 Q 18 * * * 1228 * * * * 2377 * * * * 2444 2345 * * * * * 18 0 * * * * * * 2161 0 0 L 19 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 2161 0 0 E 20 * * * 800 * * * * 2345 * * * * 2127 * * * * * * 20 0 * * * * * * 2161 0 0 A 21 800 * * * * * * * * * * * * 2127 * 2345 * * * * 21 0 * * * * * * 2161 0 0 L 22 * * * * * * * * * 318 2337 * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 2161 0 0 K 23 * * * 2127 * * * * 800 * * * * * * 2345 * * * * 23 0 * * * * * * 2161 0 0 K 24 * * * 2345 * 1357 * * 1277 * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 2161 0 0 D 25 * * 308 * * * * * * * * * * * * 2377 * * * * 25 0 * * * * * * 2161 0 0 A 26 2444 * 2345 * * * * * * * * * * 2127 * 1357 * * * * 26 0 * * * * * * 2161 0 0 G 27 2337 * * 2377 * 2444 * * 2345 * * * * * 2127 * * * * * 27 0 * * * * * * 2161 0 0 L 28 * * * * * * * 2337 * 318 * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 2161 0 0 K 29 * * * * * * * * 789 * * * * 2377 * * 2127 * * * 29 0 * * * * * * 2161 0 0 R 30 2337 * * * * * * * 1361 * * * * * 2444 2127 * * * * 30 0 * * * * * * 2161 0 0 E 31 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 2161 0 0 I 32 * * * * * * * 1410 * 1232 2337 * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 2161 0 0 E 33 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 2161 0 0 F 34 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 2161 0 0 E 35 * * * 375 * * * * 2127 * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 2161 0 0 Q 36 * * * 1228 * 1361 * * * * * * * 2444 * * * * * * 36 0 * * * * * * 2161 0 0 K 37 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 2161 0 0 L 38 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 2161 0 0 V 39 * * * 2127 * * 2377 * * * * * * * 1341 * * 2444 * * 39 0 * * * * * * 2161 0 0 G 40 1228 * * 1361 * 2444 * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 2161 0 0 L 41 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 2161 0 0 M 42 * * * * * * * * * 2337 714 * * * * * * 2377 * * 42 0 * * * * * * 2161 0 0 K 43 * * * * * 1341 * * 1277 * * * * * * 2377 * * * * 43 0 * * * * * * 2161 0 0 S 44 * * * 681 * * 2377 * * * * * * * * 2444 * * * * 44 0 * * * * * * 2161 0 0 Y 45 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 45 0 * * * * * * 2161 0 0 D 46 * * 1277 * * 1357 * * * * * * * 2345 * * * * * * 46 0 * * * * * * 2161 0 0 K 47 * * * * 2377 * * * 714 * * * * * * * * * * 2337 47 0 * * * * * * 2161 0 0 S 48 * * * * * * * * * * * * * * * 318 2337 * * * 48 0 * * * * * * 2161 0 0 L 49 * * * * * * * * * 375 * * 2127 * * * * * * * 49 0 * * * * * * 2161 0 0 R 50 2127 * * * * * * * * * * * * * 375 * * * * * 50 0 * * * * * * 2161 0 0 D 51 2127 * 375 * * * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 2161 0 0 I 52 * * * * * * * 803 * * * * * * * * * 1228 * * 52 0 * * * * * * 2161 0 0 I 53 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 2161 0 0 A 54 1394 * * 2127 * * * * * * * 1357 * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 2161 0 0 I 55 * * * * * * * 800 * 2345 2127 * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 2161 0 0 L 56 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1945 0 0 D 57 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1945 0 0 P 58 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1945 0 0 K 59 * * * * * * * * 1611 * * * * 572 * * * * * * 59 0 * * * * * * 1758 0 0 L 60 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 60 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //