HHsearch 1.5 NAME c4yjwA_ FAM FILE c4yjwA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c4yjwA_.a3m DATE Sat Mar 21 09:10:55 2015 LENG 153 match states, 153 columns in multiple alignment FILT 5 out of 9 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.1 EVD 0.3978 -1.1721 SEQ >ss_dssp CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHTCTTSCGGGCCCCCCCCCCHHHHHHHHSCCTTSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHTTHHHHTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >sa_dssp EDDDEDBDCBCDACDCADEAAEEBADDECBEDACDCBDEECECEDBCECEDCECDEECCDCACEACECBDEECDDCADDBADDACEBADCAADCAEDACD BBCEECCEEDECDDADEBCEDAEEBBECADECBDCACDCADECBDDBDEDCEE >ss_pred CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC >ss_conf 9643456658888745899999994221089999998506874025664045311235234644634489788999999999999999999963999997 44333321345444776213788998766778999999975776200120489 >Consensus xxxiexAxeVikYYnTSlxilKxlVxexdvnavlxYMeqxgkxxxxxxvixpvvsxkDsaxvxnPGxxFxexxrxnLkqnyxxlFqxxxxfYaNfxxYxs yxkxxxxKxxnxxxadklxxxxxxLsxxmsexkqxIfdiLsPxxexAxxvlxx >c4yjwA_ SXSVENANEVXKYYDTSLKILKDLVNENEIKAVLGYLDQKXPVDSLPVVSQPVVSVQDTVFVSNPGNYFSENDRQNLKENYGRLFRSISAFYENYKTYRL YXQDQSYKKDNNALADKIRKEELLLSIALSEYKQVIFDILTPIVEGAKITLTP >UniRef50_B0NM18(31-176:292) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Bacteroides stercoris ATCC 43183 RepID=B0NM18_BACSE E=7e-17 s/c=0.60 id=35% cov=96% --GLEEANEVISYYNTSIDITKKMVDMGEISKIIDYMQKNGKTLVAPVVIRTPVSATDTTALLNPGDCFPSSAADSLKMYYRRFFDVSKRLYANYDAYRA YIKAEDYKDDNYAKGNEICKEEKELAEQIPGLRSQIYALLTPYADKAE----- >UniRef50_B7ADC0(39-184:291) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Bacteroides eggerthii DSM 20697 RepID=B7ADC0_9BACE E=1e-50 s/c=1.37 id=41% cov=96% AAEVEQAGQVMKYYNTSLALLKNLVLEKDVNSILGYMEQGGNAPMLATVIPPVFSQKDSASVVNPGTYFDEEARRNLKQNFMQLFQTRRQFYTNFNQYLS L-----LKVKNKIAADKLLPANYRLSVEMAEYKENILDVLSPFAEGAQKVL-- >UniRef50_Q5LA60(35-178:286) Putative exported protein n=13 Tax=Bacteroides RepID=Q5LA60_BACFN E=3e-49 s/c=1.35 id=46% cov=95% --DIENAAEVIKYYNTSLGVLKDMVKEKDVNAVLDYMEQKGKTPALSAIVPPAVVSKDSAIVLNPGNCFNEETRRNLKQNYTGLFQARTEFYANFDTYLS Y-----LKKKDVTNAKKLLDVNYQLSTQMSEYKQNIFDILSPFTEQAELVL-- >UniRef50_B3CII5(124-267:374) Putative uncharacterized protein n=3 Tax=Bacteroides RepID=B3CII5_9BACE E=7e-47 s/c=1.30 id=42% cov=95% --EIADAGQVVKYYDTSLALLKNLVKERDVNAVLGYMEQQAKVQMFSHIMSPVISKKDSAAVIQPGDYFGDDVRQNLIQNYTELFQSRGQFYANFNKYLS LLKE----KKTEGIAD-LLNDNYELGVEMSECKQNIFDILSPIVAQAQQVL-- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 1010 * * * * * * * * * * * * * * 990 * * * * 1 0 * * * * * * 1461 0 0 X 2 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 S 3 * * 2561 1467 * 1900 * * * * * * * * * 2317 * * * * 3 0 * * * * * * 2203 0 0 V 4 * * * * * * * 1502 * 1900 * * * * * * * 1400 * * 4 0 * * * * * * 2203 0 0 E 5 2446 * * 293 * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 2203 0 0 N 6 * * 2446 1900 * * * * * * * 1434 * 2488 * * * * * * 6 0 * * * * * * 2203 0 0 A 7 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 2203 0 0 N 8 2561 * * * * 1467 * * * * * 1093 * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 2203 0 0 E 9 * * * 648 * * * * * * * * * 1467 * * * * * * 9 0 * * * * * * 2203 0 0 V 10 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 10 0 * * * * * * 2203 0 0 X 11 * * * * * * * 853 * * 2197 * * * * * * 2131 * * 11 0 * * * * * * 2021 0 0 K 12 * * * * * * * * 450 * * * * * * 1900 * * * * 12 0 * * * * * * 2203 0 0 Y 13 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 13 0 * * * * * * 2203 0 0 Y 14 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 14 0 * * * * * * 2203 0 0 D 15 * * 1380 * * * * * * * * 700 * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 2203 0 0 T 16 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 16 0 * * * * * * 2203 0 0 S 17 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 17 0 * * * * * * 2203 0 0 L 18 * * * * * * * 1900 * 450 * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 2203 0 0 K 19 1467 * 1900 * * 2561 * * 2317 * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 2203 0 0 I 20 * * * * * * * 1093 * 1467 * * * * * * * 2561 * * 20 0 * * * * * * 2203 0 0 L 21 * * * * * * * * * 450 * * * * * * 1900 * * * 21 0 * * * * * * 2203 0 0 K 22 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 2203 0 0 D 23 * * 1434 * * * * * 1900 * * 1467 * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 2203 0 0 L 24 * * * * * * * * * 830 1193 * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 2203 0 0 V 25 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 25 0 * * * * * * 2203 0 0 N 26 * * 1900 * * * * * 1502 2488 * 2317 * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 2203 0 0 E 27 * * * 450 * * * * * * 1900 * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 2203 0 0 N 28 * * * * * 1900 * * 1524 * * 2317 * * 2446 * * * * * 28 0 * * * * * * 2203 0 0 E 29 * * 913 1093 * * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 2203 0 0 I 30 * * * * * * * 1093 * * * * * * * * * 913 * * 30 0 * * * * * * 2203 0 0 K 31 * * * * * * * * 2317 * * 913 * * * 1900 * * * * 31 0 * * * * * * 2203 0 0 A 32 853 * * * * * * * 1900 * * * * * * 2488 * * * * 32 0 * * * * * * 2203 0 0 V 33 * * * * * * * 1164 * * * * * * * * * 853 * * 33 0 * * * * * * 2203 0 0 L 34 * * * * * * * 1900 * 450 * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 2203 0 0 G 35 * * 1193 * * 830 * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 2203 0 0 Y 36 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 36 0 * * * * * * 2203 0 0 L 37 * * * * * * * * * 2317 323 * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 2203 0 0 D 38 * * 2317 913 * * * * * * * * * 1900 * * * * * * 38 0 * * * * * * 2203 0 0 Q 39 * * * * * * * * 1900 * * * * 450 * * * * * * 39 0 * * * * * * 2203 0 0 K 40 * * * * * 2488 * * 1434 * * 1900 * 2446 * * * * * * 40 0 * * * * * * 2203 0 0 X 41 2131 * * * * 374 * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 2021 0 0 P 42 * * * * * * * * 687 * * 2488 2317 * * * * * * * 42 0 * * * * * * 2203 0 0 V 43 2488 * * * * * * * * * * * * * * * 1193 1380 * * 43 0 * * * * * * 2203 0 0 D 44 * * 2317 * * * * * * 1900 * * 1524 2446 * * * * * * 44 0 * * * * * * 2203 0 0 S 45 2561 * * * * * * * * * 1467 * * * * 2317 * 1900 * * 45 0 * * * * * * 2203 0 0 L 46 1900 * * * 2446 * * * * 866 * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 2203 0 0 P 47 2488 * * * * * * * * * * * 1093 * * 1502 * * * * 47 0 * * * * * * 2203 0 0 V 48 2561 * * * * * 2446 * * * * * * * * * 2488 1093 * * 48 0 * * * * * * 2203 0 0 V 49 * * * * * * * 1502 * * * * * * * * * 628 * * 49 0 * * * * * * 2203 0 0 S 50 * * * * * * * 1164 * * 2446 * * * * 2317 * 2561 * * 50 0 * * * * * * 2203 0 0 Q 51 * * * * * * * * * * * * 1524 2317 1900 2446 * * * * 51 0 * * * * * * 2203 0 0 P 52 * * * * * * * * * * * * 450 * * * 1900 * * * 52 0 * * * * * * 2203 0 0 V 53 2561 * * * * * * * * * * * 1900 * * * * 830 * * 53 0 * * * * * * 2203 0 0 V 54 * * * * 2488 * * 2446 * * * * * * * * * 648 * * 54 0 * * * * * * 2203 0 0 S 55 * * * * * * * * * * * * * * * 268 * 2561 * * 55 0 * * * * * * 2203 0 0 V 56 1900 * * * * * * * 2446 * * * * 2488 * 2561 * 2317 * * 56 0 * * * * * * 2203 0 0 Q 57 * * * * * * * * 913 * * * * 2317 * * 1900 * * * 57 0 * * * * * * 2203 0 0 D 58 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 2203 0 0 T 59 * * * * * * * * * * * * * * * 913 1093 * * * 59 0 * * * * * * 2203 0 0 V 60 913 * * * * * * * * * * * * * * * 1900 2317 * * 60 0 * * * * * * 2203 0 0 F 61 1147 * * * 2317 * * 2561 * * * * * * * 2488 * * * * 61 0 * * * * * * 2203 0 0 V 62 * * * * * * * * * 1900 * * * * * * * 450 * * 62 0 * * * * * * 2203 0 0 S 63 * * * * * * * 2446 * 1193 * * * * * 2317 * 2488 * * 63 0 * * * * * * 2203 0 0 N 64 * * * * * * * * * * * 293 * 2446 * * * * * * 64 0 * * * * * * 2203 0 0 P 65 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 65 0 * * * * * * 2203 0 0 G 66 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 2203 0 0 N 67 * * 1147 * * * * * * * * 1434 * * * * 2488 * * * 67 0 * * * * * * 2203 0 0 Y 68 * 1193 * * * * * * * * * * * * * * * * * 830 68 0 * * * * * * 2203 0 0 F 69 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 2203 0 0 S 70 * * 2488 * * 2446 * * * * * 2561 1900 * * 2317 * * * * 70 0 * * * * * * 2203 0 0 E 71 * * 2446 866 * * * * * * * * * * * 1900 * * * * 71 0 * * * * * * 2203 0 0 N 72 * * 2446 1524 * * * * * * * 2317 * * * 1900 * * * * 72 0 * * * * * * 2203 0 0 D 73 1164 * 2317 * * * * * * * * * * * * * 2561 2446 * * 73 0 * * * * * * 2203 0 0 R 74 1900 * * * * * * * * * * * * * 450 * * * * * 74 0 * * * * * * 2203 0 0 Q 75 * * 1900 * * * * * * * * * * 1380 1524 * * * * * 75 0 * * * * * * 2203 0 0 N 76 * * * * * * * * * * * 450 * * * 1900 * * * * 76 0 * * * * * * 2203 0 0 L 77 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 2203 0 0 K 78 * * * * * * * 2446 293 * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 2203 0 0 E 79 * * * 2317 * * * * * * 1900 * * 913 * * * * * * 79 0 * * * * * * 2203 0 0 N 80 * * * * * * * * * * * 450 * * * * * * * 1900 80 0 * * * * * * 2203 0 0 Y 81 * * * * 2488 * * * * * * * * * * * * * * 283 81 0 * * * * * * 2203 0 0 G 82 * * * * * 2317 * * * * 2488 * * * 1900 * 1502 * * * 82 0 * * * * * * 2203 0 0 R 83 * * * 2446 * 2561 * * * * * * * 2488 1093 * * * * * 83 0 * * * * * * 2203 0 0 L 84 * * * * 1900 * * * * 450 * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 2203 0 0 F 85 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 2203 0 0 R 86 * * 1900 * * * * * * * * * * 913 2317 * * * * * 86 0 * * * * * * 2203 0 0 S 87 2561 * * * * * * * * * * * * * * 1380 2488 1900 * * 87 0 * * * * * * 2203 0 0 I 88 * * * * * * * 2317 * * * * * * 913 1900 * * * * 88 0 * * * * * * 2203 0 0 S 89 * * * * * 2446 * * 1900 * * * * * 2488 2317 2561 * * * 89 0 * * * * * * 2203 0 0 A 90 2317 * * 2561 * * * * * * * * * 1467 1900 * * * * * 90 0 * * * * * * 2203 0 0 F 91 * * * * 450 * * * * 1900 * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 2203 0 0 Y 92 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 92 0 * * * * * * 2203 0 0 E 93 687 * * 2317 * * * * * * * * * * * * 2488 * * * 93 0 * * * * * * 2203 0 0 N 94 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 2203 0 0 Y 95 * * * * 913 * * * * * * * * * * * * * * 1093 95 0 * * * * * * 2203 0 0 K 96 * * 1193 * * * * * 2317 * * 1467 * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 2203 0 0 T 97 1900 * * * * * * * 2446 * * * * 2488 * * 1434 * * * 97 0 * * * * * * 2203 0 0 Y 98 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 98 0 * * * * * * 2203 0 0 R 99 * * * * * * * * * 913 * * * * 1093 * * * * * 99 0 * * * * * * 2203 0 0 L 100 1900 * * * * * * * * 2317 * * * * * 913 * * * * 100 0 * * * * * * 2203 0 0 Y 101 * * * * * * * * * 1467 * * * * * * * * * 648 101 616 * 1524 * * * * 2203 0 0 X 102 * * * * * * * 951 * 1050 * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * 0 1677 0 1341 Q 103 * * * * * * * * 527 * * * * 1709 * * * * * * 103 0 * * * * * 0 1952 0 1341 D 104 1457 * 1709 1600 * * * * * * * * * * * * * * * * 104 578 * 1600 * * * 0 1952 0 1341 Q 105 * * * 971 * * * * * * * * * 1030 * * * * * * 105 0 * * * * * 0 1540 0 1515 S 106 * * 971 * * * * * * * * * * * * 1030 * * * * 106 0 * * * * 596 1563 1540 0 1515 Y 107 * * * * * * * * * 1140 * * * * * * * * * 872 107 0 * * * * * 0 2065 0 1000 K 108 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * 0 * 2065 0 1000 K 109 * * 1900 * * * * * 853 * * * * * * * * 2488 * * 109 0 * * * * * * 2203 0 0 D 110 * * 1093 * * * * * 913 * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 2203 0 0 N 111 * * 2561 * * * * * * * * 628 * * * * 2446 * * * 111 0 * * * * * * 2203 0 0 N 112 * * * 2446 * * * * 2488 * * 2317 * * * * * 2561 * 1900 112 0 * * * * * * 2203 0 0 A 113 1093 * * * * 2446 * 2488 * * * * * * * * 2561 * * * 113 0 * * * * * * 2203 0 0 L 114 2488 * * * * * * 2446 1900 2317 * 2561 * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 2203 0 0 A 115 450 * * * * 1900 * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 2203 0 0 D 116 * * 830 * * * * * 2561 * * 1900 * * * * * * * * 116 293 * 2446 * * * * 2203 0 0 K 117 * * * 1711 * * * * 526 * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * 0 * 2065 0 1000 I 118 * * * * * * * 1093 * 913 * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 2203 0 0 R 119 * 1900 * * * * * * * 913 * * * * 2317 * * * * * 119 0 * * * * * * 2203 0 0 K 120 * * 2561 * * * * * 1093 * * 2446 2488 * * * * * * * 120 0 * * * * * * 2203 0 0 E 121 2488 * 2446 1093 * * * * * * * * * * * * * 2561 * * 121 0 * * * * * * 2203 0 0 E 122 * * * 1093 * * * * * * * 913 * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 2203 0 0 L 123 * * * * * * * * 1900 2317 * * * * * * * * * 913 123 0 * * * * * * 2203 0 0 L 124 * * * 1147 * * * * * 2317 * * * 2561 2488 * * * * * 124 0 * * * * * * 2203 0 0 L 125 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 2203 0 0 S 126 1900 * * * * 2446 * * * * * * * * * 866 * * * * 126 0 * * * * * * 2203 0 0 I 127 * * * 1900 * * * 2317 * * * * * * * * 2561 1467 * * 127 0 * * * * * * 2203 0 0 A 128 2317 * * 1467 * * * * * * * * * 1193 * * * * * * 128 0 * * * * * * 2203 0 0 L 129 * * * * * * * 1900 * 2317 913 * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 2203 0 0 S 130 2488 * * * * * * * * * * * 1900 * * 853 * * * * 130 0 * * * * * * 2203 0 0 E 131 * * * 450 * 1900 * * * * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 2203 0 0 Y 132 * 2446 * * * * * * * 1900 * * * * * * * * * 866 132 0 * * * * * * 2203 0 0 K 133 * * * * * * * * 450 * * * * * 1900 * * * * * 133 0 * * * * * * 2203 0 0 Q 134 * * * 2488 * * * * * * * * * 853 * 1900 * * * * 134 0 * * * * * * 2203 0 0 V 135 * * * * * * * * * * * 913 * 1900 * * * 2317 * * 135 0 * * * * * * 2203 0 0 I 136 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 2203 0 0 F 137 * * * * 853 * * * * 2488 * * * * * * * * * 1900 137 0 * * * * * * 2203 0 0 D 138 1900 * 450 * * * * * * * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 2203 0 0 I 139 * * * * * * * 853 * 1900 * * * * * * * 2488 * * 139 0 * * * * * * 2203 0 0 L 140 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 2203 0 0 T 141 * * * * * * * * * * * * * * * 913 1093 * * * 141 0 * * * * * * 2203 0 0 P 142 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 142 0 * * * * * * 2203 0 0 I 143 * * * * 1524 * * 1380 * * * * * * * * * * * 1900 143 0 * * * * * * 2203 0 0 V 144 1164 * * * * * * * * * * * * * * * 2561 1380 * * 144 0 * * * * * * 2203 0 0 E 145 2446 * 1900 866 * * * * * * * * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 2203 0 0 G 146 * * * * * 1400 * * 1900 * * * * 1502 * * * * * * 146 0 * * * * * * 2203 0 0 A 147 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 2203 0 0 K 148 * * * 1193 * * * * 2317 * * * * 1467 * * * * * * 148 0 * * * * * * 2203 0 0 I 149 * * * * * * * 1771 2090 2111 * * * 2056 * * * * * * 149 0 * * * * * * 1796 0 0 T 150 * * * * * * * * * * * * * * * * 1771 500 * * 150 0 * * * * * * 1796 0 0 L 151 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1796 0 0 T 152 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 152 0 * * * * * * 1000 0 0 P 153 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 153 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //