HHsearch 1.5 NAME c4ygtA_ FAM FILE c4ygtA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c4ygtA_.a3m DATE Sat Mar 21 08:16:15 2015 LENG 148 match states, 148 columns in multiple alignment FILT 4 out of 8 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.9 EVD 0.3909 -1.4805 SEQ >ss_dssp CHHHHHHHHHHHHHHTTTCCSGGGTTCCTTTSBHHHHHHHHCSCSBCSBTTBCSEEECCBTTBCEEEEEECTTSBEEEEEEEECSTTGGGTGGGCCHHHH HHHHCSCSEEEECTTSSCEEEEEEETTEEEEEEECSSSSEEEEEEEEC >sa_dssp EEDABDCADDACEBADDABABEDAEDBBAEEBCCDDACEECDEBEDDDEEEBEBACBEDEEEDBAAAAACDEEEBACBACBCABDEECDDBACCACCEBA DECCCECEDEDECEEDECDBCABCADEBBABAAABEDDCACBABADDE >ss_pred CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECEEECCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCEECCCCCCCHHHH HHHCCCCCCEEEEECCCEEEEEEEECCEEEEEEECCCCCCCCEEEECC >ss_conf 9757899998854553477854100225324314679986168667888855225320558998536651014540000000268400113267259999 974488521466201210367986176699999758888310001049 >Consensus xxxaxxxlxxxYxxAxkGqxPxxxxGltIgxsTkxdVxxaxGepexPxxxxxxFDxYhxxmGxPGyafsYxkxxkIxEiRYFGTnVErqtNlGGitxxxL xkxxgxxxxxxtixxTxexkxxYxxGxYeLeFixgtxxxxxHiNLxxk >c4ygtA_ NQSAAELVKNLYNTAYKGEXPQQAQGLTINKSTKGDVHAAFGEPERPVGGDNRFDLYHWNXGQPGYGFSYHKDXTISEIRYFGTGVERQLNLGGVTPEVL QKQLGPVNRVLTVPFTDEIDYVYDTGRYELHFVIGTDQTADHVNLKAK >UniRef50_UPI0001787E0E(8-198:198) hypothetical protein GYMC10_2328 n=1 Tax=Geobacillus sp. Y412MC10 RepID=UPI0001787E0E E=2e-23 s/c=0.49 id=42% cov=100% AEHALKTLNSFYKPALKGQFPGAVSGLTIGKSTKQDVYKAIGEPSVPGKDADAFDVYGANMGNPGYAFSY-KLNKIREMRYFGTNVERQTNIGGITMKML KKNWFAPDATTTFKngKTKQTKLTYHRGAYKLEFIFNSSTDLDHINLLKK >UniRef50_B4AHW8(1-192:195) YjgB n=2 Tax=Bacillus pumilus RepID=B4AHW8_BACPU E=2e-64 s/c=1.14 id=47% cov=99% PQGPKTALNNIYELAHKGQMPYYAKGLKIGVQTKMDVHHKLGNP-YPETGQSSFDLYHAEMGNPGFAFHYDAKGKIDEIRYFGTNVEKETNIGGMTPSLL KKQLGQADSVSTIPQTKEKKYVYRTGDYELEFIVGHDPDINqqklivlHINLVK- >UniRef50_C6D3T6(5-193:196) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Paenibacillus sp. JDR-2 RepID=C6D3T6_PAESJ E=5e-56 s/c=1.09 id=39% cov=99% HAKAFETLMSFYKPALNGQFP-NFHGFTIGSTTHESVIKAIGEAESPAKDSDDFDVYHSEMGHPGYAISY-KLGKIKEMRYFGTNVERQTNLGGISVKML VQHWGTPNESVQIKsgKTVQKKITYVRGKYQLEFIFdGTNGTnLNHINLVNK # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * N 1 2088 * * * * * 2020 * * * * 1936 1961 * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1917 0 0 Q 2 2020 * * 2088 * * * * * * * * * 949 * * * * * * 2 0 * * * * * * 1917 0 0 S 3 * * * * * 1961 2088 * 2020 * * * * * * 1936 * * * * 3 0 * * * * * * 1917 0 0 A 4 428 * * * * * * * * * * * 1961 * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1917 0 0 A 5 1936 * * * 2020 * * * 1961 2088 * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1917 0 0 E 6 * * * 977 * * * * 2088 * * * * * * * 1961 * * * 6 0 * * * * * * 1917 0 0 L 7 1961 * * * * * * * * 1936 * * * * * * 1053 * * * 7 0 * * * * * * 1917 0 0 V 8 * * * * * * * * * 437 * * * * * * * 1936 * * 8 0 * * * * * * 1917 0 0 K 9 * * * * * * * * 1936 * 2020 1023 * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1917 0 0 N 10 * * * * * * * * * * * 949 * * * 1053 * * * * 10 0 * * * * * * 1917 0 0 L 11 * * * * 1053 * * 1961 * 1936 * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1917 0 0 Y 12 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 12 0 * * * * * * 1917 0 0 N 13 * * * 1961 * * * * 1053 * * 1936 * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1917 0 0 T 14 * * * * * * * * * 1961 * * 1053 * * * 1936 * * * 14 0 * * * * * * 1917 0 0 A 15 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1917 0 0 Y 16 * * * * * * 1961 * * 1053 * * * * * * * * * 1936 16 0 * * * * * * 1917 0 0 K 17 * * * * * * * * 408 * * 2020 * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1917 0 0 G 18 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1917 0 0 E 19 * * * 1936 * * * * * * * * * 437 * * * * * * 19 0 * * * * * * 1917 0 0 X 20 * * * * 649 * * * * * 1465 * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1663 0 0 P 21 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 21 409 * 2020 * * * * 1917 0 0 Q 22 * * * * * 1553 * * * * * * * 1590 * * * * * 1612 22 0 * * * * 0 * 1736 0 1000 Q 23 2088 * * * * * * * * * * 2020 * 1936 * * * * * 1961 23 0 * * * * * * 1917 0 0 A 24 949 * * * 2020 * * * * * * * * * * * * 2088 * * 24 0 * * * * * * 1917 0 0 Q 25 * * * * * * 2020 * 1961 * * * * 1936 * 2088 * * * * 25 0 * * * * * * 1917 0 0 G 26 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1917 0 0 L 27 * * * * 2020 * * * * 408 * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1917 0 0 T 28 * * * * * * * * 1961 * * * * * * * 428 * * * 28 0 * * * * * * 1917 0 0 I 29 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1917 0 0 N 30 * * * * * 437 * * * * * 1936 * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1917 0 0 K 31 * * * * * * * * 1010 * * * * * * 2020 * 1961 * * 31 0 * * * * * * 1917 0 0 S 32 * * * * * * * * * * * * * 1961 * 1010 2020 * * * 32 0 * * * * * * 1917 0 0 T 33 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 33 0 * * * * * * 1917 0 0 K 34 * * * * * * 2020 * 408 * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1917 0 0 G 35 * * * 2020 * 1936 * * * * 1961 * * 2088 * * * * * * 35 0 * * * * * * 1917 0 0 D 36 * * 408 * * * * * * * * * * * * 2020 * * * * 36 0 * * * * * * 1917 0 0 V 37 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 37 0 * * * * * * 1917 0 0 H 38 * * * * * * 949 2020 * * * * * * * * * * * 2088 38 0 * * * * * * 1917 0 0 A 39 1936 * * * * * 1961 * 1053 * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1917 0 0 A 40 428 * * * * * * * 1961 * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1917 0 0 F 41 * * * * 1936 * * 1053 * 1961 * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1917 0 0 G 42 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1917 0 0 E 43 * * * 428 * * * * * * * 1961 * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1917 0 0 P 44 2020 * * * * * * * * * * * 408 * * * * * * * 44 428 * 1961 * * * * 1917 0 0 E 45 * * * 551 * * * * * * * * * * * 1655 * * * * 45 0 * * * * 0 * 1691 0 1000 R 46 * * * * * * * * * * * * * * 1936 2020 * 2088 * 1961 46 0 * * * * * * 1917 0 0 P 47 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1917 0 0 V 48 2020 * * 1961 * 2088 * * * * * * * * * * * 1936 * * 48 0 * * * * * * 1917 0 0 G 49 * * * * * 1936 * * 1053 * * * * * * * 1961 * * * 49 0 * * * * * * 1917 0 0 G 50 * * 1053 * * 949 * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1917 0 0 D 51 2088 * 1936 * * * * * * * * * * 1961 * 2020 * * * * 51 0 * * * * * * 1917 0 0 N 52 * * 1053 * * * * * * * * 1936 * * * 1961 * * * * 52 0 * * * * * * 1917 0 0 R 53 2088 * 2020 * * * * * * * * * * * 1936 1961 * * * * 53 0 * * * * * * 1917 0 0 F 54 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1917 0 0 D 55 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1917 0 0 L 56 * * * * * * * * * 949 * * * * * * * 1053 * * 56 0 * * * * * * 1917 0 0 Y 57 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 57 0 * * * * * * 1917 0 0 H 58 * * * * * 2088 387 * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1917 0 0 W 59 1023 * * * * * * * * * * * * * * 2020 * * 1936 * 59 0 * * * * * * 1917 0 0 N 60 * * * 990 * * * * * * * 1010 * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1917 0 0 X 61 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1663 0 0 G 62 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1917 0 0 Q 63 * * * * * * 2020 * * * * 1023 * 1936 * * * * * * 63 0 * * * * * * 1917 0 0 P 64 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1917 0 0 G 65 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1917 0 0 Y 66 * * * * 1961 * * * * * * * * * * * * * * 428 66 0 * * * * * * 1917 0 0 G 67 437 * * * * 1936 * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1917 0 0 F 68 * * * * 408 * * 2020 * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1917 0 0 S 69 * * * * * * 1961 * * * * * * * * 428 * * * * 69 0 * * * * * * 1917 0 0 Y 70 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 70 949 * 1053 * * * * 1917 0 0 H 71 * * 980 * * * 1020 * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * 0 * 1417 0 1315 K 72 1961 * * * * * * * 428 * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1917 0 0 D 73 * * 1936 * * * * * 1961 1053 * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1917 0 0 X 74 * * * * * 541 * * * * * 1676 * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1663 0 0 T 75 * * * * * * * * 437 * * * * * * * 1936 * * * 75 0 * * * * * * 1917 0 0 I 76 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1917 0 0 S 77 * * 1961 * * * * * 2020 * * * * * 2088 1936 * * * * 77 0 * * * * * * 1917 0 0 E 78 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1917 0 0 I 79 * * * * * * * 949 * * 1053 * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1917 0 0 R 80 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 80 0 * * * * * * 1917 0 0 Y 81 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 81 0 * * * * * * 1917 0 0 F 82 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1917 0 0 G 83 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1917 0 0 T 84 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 84 0 * * * * * * 1917 0 0 G 85 * * * * * 1936 * * * * * 437 * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1917 0 0 V 86 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 86 0 * * * * * * 1917 0 0 E 87 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1917 0 0 R 88 * * * * * * * * 1961 * * * * * 428 * * * * * 88 0 * * * * * * 1917 0 0 Q 89 * * * 1961 * * * * * * * * * 428 * * * * * * 89 0 * * * * * * 1917 0 0 L 90 * * * * * * * * * 1936 * * * * * * 437 * * * 90 0 * * * * * * 1917 0 0 N 91 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1917 0 0 L 92 * * * * * * * 1023 * 977 * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1917 0 0 G 93 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1917 0 0 G 94 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1917 0 0 V 95 * * * * * * * 1053 * * 1961 * * * * * * 1936 * * 95 0 * * * * * * 1917 0 0 T 96 * * * * * * * * * * * * * * * 2020 408 * * * 96 0 * * * * * * 1917 0 0 P 97 * * * * * * * * * * 2088 * 949 * * * * 2020 * * 97 0 * * * * * * 1917 0 0 E 98 * * * 1936 * * * * 1053 * * * * * * 1961 * * * * 98 0 * * * * * * 1917 0 0 V 99 * * * * * * * * * 1961 1053 * * * * * * 1936 * * 99 0 * * * * * * 1917 0 0 L 100 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1917 0 0 Q 101 * * * * * * * * 1023 * * * * 1936 * * * 2020 * * 101 0 * * * * * * 1917 0 0 K 102 * * * * * * * * 408 * * * * 2020 * * * * * * 102 0 * * * * * * 1917 0 0 Q 103 * * * * * * 2020 * * * * 2088 * 949 * * * * * * 103 0 * * * * * * 1917 0 0 L 104 * * * * * * * * * 949 * * * * * * * * 1053 * 104 0 * * * * * * 1917 0 0 G 105 * * * * 2088 387 * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1917 0 0 P 106 2088 * * * * * * * * * * * 1936 1961 * * 2020 * * * 106 0 * * * * * * 1917 0 0 V 107 1961 * * * * * * * * * * * 1053 * * * * 1936 * * 107 0 * * * * * * 1917 0 0 N 108 * * 1023 * * * * * * * * 977 * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1917 0 0 R 109 2088 * * 2020 * * * * * * * * * * 1936 1961 * * * * 109 0 * * * * * * 1917 0 0 V 110 * * * * * * * * * * * * * * * 2020 2088 949 * * 110 0 * * * * * * 1917 0 0 L 111 * * * * * * * * * 1936 * * * * * 1961 2088 2020 * * 111 0 * * * * * * 1917 0 0 T 112 * * * * * * * * * * * * * 2020 * * 408 * * * 112 0 * * * * * * 1917 0 0 V 113 * * * * 2088 * * 990 * * * * * * * * * 1936 * * 113 0 * * * * * * 1917 0 0 P 114 * * * * * * * * 1053 * * * 949 * * * * * * * 114 949 1053 * 1000 1000 * * 1917 1314 0 F 115 * * * * 1936 * * * 1053 * * * * 1961 * * * * * * 115 0 * * * * * * 1917 0 0 T 116 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 116 0 * * * * * * 1917 0 0 D 117 * * 1936 * * * * * 1023 * * * * * * * * 2020 * * 117 0 * * * * * * 1917 0 0 E 118 * * * 949 * * * * * * * * * 1053 * * * * * * 118 0 * * * * * * 1917 0 0 I 119 * * * * * * * 1936 990 * * * * * * * 2088 * * * 119 0 * * * * * * 1917 0 0 D 120 * * 1936 * * * * * 437 * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1917 0 0 Y 121 * * * * * * * 2020 * 2088 * * * * * * * * * 949 121 0 * * * * * * 1917 0 0 V 122 * * * * * * * * * * * * * * * * 1053 949 * * 122 0 * * * * * * 1917 0 0 Y 123 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 123 0 * * * * * * 1917 0 0 D 124 * * 1936 * * * 2088 * * * * * * * 1961 * * 2020 * * 124 0 * * * * * * 1917 0 0 T 125 * * * * * * * * * * * * * * 1053 * 949 * * * 125 0 * * * * * * 1917 0 0 G 126 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1917 0 0 R 127 2088 * 1961 * * * * * 2020 * * * * * 1936 * * * * * 127 0 * * * * * * 1917 0 0 Y 128 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 128 0 * * * * * * 1917 0 0 E 129 * * * 949 * * * * 2088 * * * * 2020 * * * * * * 129 0 * * * * * * 1917 0 0 L 130 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1917 0 0 H 131 * * * 437 * * 1936 * * * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1917 0 0 F 132 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1917 0 0 V 133 * * * * * * * 437 * * * * * * * * * 1936 * * 133 0 * * * * * * 1917 0 0 I 134 * * * * 1053 * * 1936 * * * * * * * * * 1961 * * 134 409 2020 * 0 * * * 1917 1000 0 G 135 * * * * * 387 * * * * * 2088 * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1917 0 0 T 136 * * * * * * 1961 * * * * * * * * 2088 977 * * * 136 0 * * * * * * 1917 0 0 D 137 * * 949 * * * * * * * * 2020 * * * 2088 * * * * 137 0 * * * * * * 1917 0 0 Q 138 * * * * * 2020 * * * * * * 1961 1936 * * 2088 * * * 138 0 * * * * * * 1917 0 0 T 139 * * 1023 * * * * * * * * * * * * * 977 * * * 139 409 2020 * 0 * * * 1917 1000 0 A 140 1936 * * * * * * 1961 * 1053 * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1917 0 0 D 141 * * 1010 * * * * * * * * 990 * * * * * * * * 141 428 1961 * 2807 222 * * 1917 1000 0 H 142 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1917 0 0 V 143 * * * * * * * 437 * * * * * * * * * 1936 * * 143 0 * * * * * * 1917 0 0 N 144 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1917 0 0 L 145 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1917 0 0 K 146 * * * * * * * * 1936 2088 * * * * * * * 990 * * 146 0 * * * * * * 1917 0 0 A 147 1936 * * * * * * * 1023 * * 2020 * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1917 0 0 K 148 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 148 0 * * 0 * * * 1691 0 0 //