HHsearch 1.5 NAME c4ye7A_ FAM FILE c4ye7A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c4ye7A_.a3m DATE Sat Mar 12 08:31:10 2016 LENG 108 match states, 108 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.2 EVD 0.4314 0.8755 SEQ >ss_dssp CCSCCCEEEEEEETTEEEEEEECCCTTCCCEEEHHHHHHHHTCCGGGGGGSCGGGEEEHHHHSTTCTTSCTTCEEEEHHHHHHHHHHHTCSCHHHHHHHH HHHHHHHC >sa_dssp EEEEEDDDBDBECEECDABABCCCEEEDECCAAACCAAECCECDEEDCEDBCEECCDDADEBAEECEECEDEBCAABDEAADDBBDECEDEDCEDBDEBB EDADEECE >ss_pred CCCCCEEEEEEECCCCCCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCEEEEECCCCCCCHHHHHHHH HHHHHHHC >ss_conf 9764115776412785344473067888851349999998447630044455035677876188987658110032100037675221133068888879 98998739 >Consensus gaxssrlifstrvdgtdvpvfxxgxxxdkpyvgvsellxilghsxthadefprsetklwxelapxdttxxxnklfttevgfavyfgktklxnwaxfkrmf dtixxyix >c4ye7A_ GAXSSRLIFSTRVDGTDVPVFYSGVAGDRPYVGVSELLSILGHSNTHADEFPRSETKLWAELAPNDTTYSANKLFTTEVGFAVYFGKTKLCNWASFKRXF DTIAAYIA >UniRef50_Q9WHF1(2-105:350) ORF19 n=6 Tax=Betabaculovirus RepID=Q9WHF1_GVAS E=2e-56 s/c=2.11 id=83% cov=97% ----ARLIFSTRVDGTDVPVFYGGAPGDKPYVGVAELLNILGHSKTHADEFPRSETKLWQDLAPNDSTYPPNKLFTTEVGFAVYFGKTKLTNWAAFKRMF DTIAQYIA >UniRef50_Q9JGV2(2-188:320) PxORF21 peptide n=3 Tax=Betabaculovirus RepID=Q9JGV2_9BBAC E=1e-63 s/c=0.68 id=80% cov=97% ----SRLIFSTRVDGTDVPVFFGGAPTDKPYVGVSELLNILGHSKSHAEEFPRSETKLWSELAPGDTTFPANKLFTTEVGFAVYFGKTKLNNWACFKRMF DTIESYIL # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * G 1 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 A 2 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 X 3 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 3 * * * * * * * 1000 0 0 S 4 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 S 5 1595 * * * * * * * * * * * * * * 580 * * * * 5 0 * * * * * * 1179 0 0 R 6 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 6 0 * * * * * * 1179 0 0 L 7 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1179 0 0 I 8 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1179 0 0 F 9 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1179 0 0 S 10 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 10 0 * * * * * * 1179 0 0 T 11 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 11 0 * * * * * * 1179 0 0 R 12 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 12 0 * * * * * * 1179 0 0 V 13 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 13 0 * * * * * * 1179 0 0 D 14 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1179 0 0 G 15 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1179 0 0 T 16 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 16 0 * * * * * * 1179 0 0 D 17 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1179 0 0 V 18 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 18 0 * * * * * * 1179 0 0 P 19 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1179 0 0 V 20 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 20 0 * * * * * * 1179 0 0 F 21 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1179 0 0 Y 22 * * * * 1564 * * * * * * * * * * * * * * 595 22 0 * * * * * * 1179 0 0 S 23 * * * * * 580 * * * * * * * * * 1595 * * * * 23 0 * * * * * * 1179 0 0 G 24 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1179 0 0 V 25 580 * * * * * * * * * * * * * * * * 1595 * * 25 0 * * * * * * 1179 0 0 A 26 1595 * * * * * * * * * * * 580 * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1179 0 0 G 27 * * * * * 595 * * * * * * * * * * 1564 * * * 27 0 * * * * * * 1179 0 0 D 28 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1179 0 0 R 29 * * * * * * * * 580 * * * * * 1595 * * * * * 29 0 * * * * * * 1179 0 0 P 30 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1179 0 0 Y 31 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 31 0 * * * * * * 1179 0 0 V 32 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 32 0 * * * * * * 1179 0 0 G 33 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1179 0 0 V 34 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 34 0 * * * * * * 1179 0 0 S 35 1595 * * * * * * * * * * * * * * 580 * * * * 35 0 * * * * * * 1179 0 0 E 36 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1179 0 0 L 37 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1179 0 0 L 38 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1179 0 0 S 39 * * * * * * * * * * * 580 * * * 1595 * * * * 39 0 * * * * * * 1179 0 0 I 40 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1179 0 0 L 41 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1179 0 0 G 42 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1179 0 0 H 43 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1179 0 0 S 44 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 44 0 * * * * * * 1179 0 0 N 45 * * * * * * * * 580 * * 1595 * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1179 0 0 T 46 * * * * * * * * * * * * * * * 1564 595 * * * 46 0 * * * * * * 1179 0 0 H 47 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1179 0 0 A 48 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1179 0 0 D 49 * * 595 1564 * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1179 0 0 E 50 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1179 0 0 F 51 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1179 0 0 P 52 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1179 0 0 R 53 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 53 0 * * * * * * 1179 0 0 S 54 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 54 0 * * * * * * 1179 0 0 E 55 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1179 0 0 T 56 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 56 0 * * * * * * 1179 0 0 K 57 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1179 0 0 L 58 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1179 0 0 W 59 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 59 0 * * * * * * 1179 0 0 A 60 1595 * * * * * * * * * * * * 1595 * 1564 * * * * 60 0 * * * * * * 1179 0 0 E 61 * * 1595 580 * * * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1179 0 0 L 62 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1179 0 0 A 63 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1179 0 0 P 64 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1179 0 0 N 65 * * * * * 1564 * * * * * 595 * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1179 0 0 D 66 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1179 0 0 T 67 * * * * * * * * * * * * * * * 1595 580 * * * 67 0 * * * * * * 1179 0 0 T 68 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 68 0 * * * * * * 1179 0 0 Y 69 * * * * 1564 * * * * * * * * * * * * * * 595 69 0 * * * * * * 1179 0 0 S 70 * * * * * * * * * * * * 580 * * 1595 * * * * 70 0 * * * * * * 1179 0 0 A 71 580 * * * * * * * * * * * 1595 * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1179 0 0 N 72 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1179 0 0 K 73 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1179 0 0 L 74 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1179 0 0 F 75 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1179 0 0 T 76 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 76 0 * * * * * * 1179 0 0 T 77 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 77 0 * * * * * * 1179 0 0 E 78 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1179 0 0 V 79 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 79 0 * * * * * * 1179 0 0 G 80 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1179 0 0 F 81 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1179 0 0 A 82 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1179 0 0 V 83 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 83 0 * * * * * * 1179 0 0 Y 84 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 84 0 * * * * * * 1179 0 0 F 85 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1179 0 0 G 86 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1179 0 0 K 87 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1179 0 0 T 88 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 88 0 * * * * * * 1179 0 0 K 89 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1179 0 0 L 90 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1179 0 0 C 91 * 1595 * * * * * * * * * 1564 * * * * 1595 * * * 91 0 * * * * * * 1179 0 0 N 92 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1179 0 0 W 93 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 93 0 * * * * * * 1179 0 0 A 94 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1179 0 0 S 95 1595 1564 * * * * * * * * * * * * * 1595 * * * * 95 0 * * * * * * 1179 0 0 F 96 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1179 0 0 K 97 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1179 0 0 R 98 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 98 0 * * * * * * 1179 0 0 X 99 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1120 0 0 F 100 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1179 0 0 D 101 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1179 0 0 T 102 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 102 0 * * * * * * 1179 0 0 I 103 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1179 0 0 A 104 595 * * 1564 * * * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1179 0 0 A 105 1595 * * * * * * * * * * * * 1595 * 1564 * * * * 105 0 * * * * * * 1179 0 0 Y 106 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 106 0 * * * * * * 1179 0 0 I 107 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1179 0 0 A 108 595 * * * * * * * * 1564 * * * * * * * * * * 108 0 * * 0 * * * 1179 0 0 //