HHsearch 1.5 NAME c4wriA_ FAM FILE c4wriA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c4wriA_.a3m DATE Sat May 30 08:10:24 2015 LENG 171 match states, 171 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4301 0.4049 SEQ >ss_dssp CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCEECTTTCCHHHHHHCCGGGTTCCCHHHHHHHHHHTTSTTCCCTTCCEEHHHHHHHHHHHTTSTTHHHHCCHHHHH HHHHCCCCEECCCCCCHHHHCCTTCCCSHHHHHCCCCSCEEHHHHCCHHHHHHCCSCCSSGGGGTTSSCCC >sa_dssp EEBCECACDAACBAACDBBECDEEEDACDEBBEABEDCDECECBEEDEBEEDCDDCBCDCABDDEDEEECEADCEDABDBABDBCDCEEBEECBEECDCC BEBBCEEEEBDEEBDCCDDDCCEEBECDBCECBBEEDEDBCBECCDBCCCABDCCEDDECCCACCDAECCE >ss_pred CCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECHHHEECEEEEEEECCCCCHHHHHHHHH HHCCCCCCCEECCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHCCC >ss_conf 9732478887676436310368871114989977885213845583156666665452203643144750602222001026888755610001000335 30223252010100234785088731125764302276267231042120354388874704454321159 >Consensus lepsahwcrkmrtvfrpwdveggsgyvteevfdgvqrrlefpelaptdmyershrhwvnhcnlgvmpegyrltesqyvqnawllihspdfeaslessqtf wegidregyiteeatlgirvtdpnlstgifeamdentgritfedtlaqlffftdqdntthpfnyvrgalvd >c4wriA_ LEPSAHWCRKMRTVFRPWDVEGGSGYVTEEVFDGVQRRLEFPELAPTDMYERSHRHWVNHCNLGVMPEGYRLTESQYVQNAWLLIHSPDFEASLESSQTF WEGIDREGYITEEATLGIRVTDPNLSTGIFEAMDENTGRITFEDTLAQLFFFTDQDNTTHPFNYVRGALVD # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * L 1 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 E 2 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 P 3 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 S 4 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 A 5 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 H 6 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 W 7 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 C 8 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 R 9 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 K 10 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 M 11 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 R 12 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 T 13 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 V 14 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 F 15 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 R 16 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 P 17 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 W 18 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 D 19 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 V 20 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 E 21 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 G 22 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 G 23 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 S 24 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 G 25 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 26 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 26 0 * * * * * * 1000 0 0 V 27 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 T 28 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 E 29 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 E 30 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 V 31 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 F 32 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 D 33 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 G 34 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 V 35 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 36 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 R 37 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 R 38 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 L 39 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 E 40 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 F 41 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 P 42 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 E 43 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 L 44 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 A 45 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 P 46 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 T 47 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 D 48 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 M 49 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 50 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 50 0 * * * * * * 1000 0 0 E 51 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 R 52 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 S 53 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 H 54 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 R 55 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 H 56 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 W 57 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 V 58 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 N 59 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 H 60 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 C 61 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 N 62 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 L 63 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 G 64 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 V 65 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 M 66 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 P 67 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 E 68 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 G 69 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 70 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 70 0 * * * * * * 1000 0 0 R 71 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 L 72 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 T 73 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 E 74 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 S 75 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 76 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 77 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 77 0 * * * * * * 1000 0 0 V 78 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 79 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 N 80 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 A 81 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 W 82 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 L 83 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 L 84 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 I 85 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 H 86 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 S 87 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 P 88 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 D 89 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 F 90 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 E 91 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 A 92 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 S 93 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 L 94 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 E 95 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 S 96 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 S 97 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 98 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 T 99 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 F 100 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 W 101 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 E 102 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 G 103 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 I 104 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 D 105 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 R 106 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 E 107 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 G 108 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 109 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 109 0 * * * * * * 1000 0 0 I 110 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 T 111 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 E 112 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 E 113 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 A 114 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 T 115 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 L 116 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 G 117 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 I 118 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 R 119 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 V 120 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 T 121 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 D 122 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 P 123 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 N 124 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 L 125 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 S 126 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 T 127 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 G 128 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 I 129 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 F 130 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 E 131 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 A 132 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 M 133 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 D 134 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 E 135 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 N 136 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 T 137 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 G 138 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 R 139 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 I 140 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 T 141 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 F 142 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 E 143 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 D 144 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 T 145 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 L 146 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 A 147 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 148 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 148 0 * * * * * * 1000 0 0 L 149 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1000 0 0 F 150 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1000 0 0 F 151 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1000 0 0 F 152 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 152 0 * * * * * * 1000 0 0 T 153 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 153 0 * * * * * * 1000 0 0 D 154 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 154 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 155 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 155 0 * * * * * * 1000 0 0 D 156 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 156 0 * * * * * * 1000 0 0 N 157 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 157 0 * * * * * * 1000 0 0 T 158 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 158 0 * * * * * * 1000 0 0 T 159 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 159 0 * * * * * * 1000 0 0 H 160 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 160 0 * * * * * * 1000 0 0 P 161 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 161 0 * * * * * * 1000 0 0 F 162 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 162 0 * * * * * * 1000 0 0 N 163 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 163 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 164 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 164 0 * * * * * * 1000 0 0 V 165 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 165 0 * * * * * * 1000 0 0 R 166 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 166 0 * * * * * * 1000 0 0 G 167 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 167 0 * * * * * * 1000 0 0 A 168 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 168 0 * * * * * * 1000 0 0 L 169 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 169 0 * * * * * * 1000 0 0 V 170 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 170 0 * * * * * * 1000 0 0 D 171 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 171 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //